HIV-1耐药基因检测的研究进展

HIV-1耐药是影响艾滋病抗病毒治疗效果的主要因素。随着抗病毒疗法的普及和接受治疗者的增多,HIV-1耐药的问题日益凸显,使艾滋病治疗面临巨大的挑战。因此,了解各抗病毒药物治疗引起的HIV-1耐药突变位点并及时采用有效方法进行耐药基因检测对临床治疗具有重要指导意义。HIV-1耐药位点基因型检测方法因其快速准确的特点,目前是HIV-1耐药检测最常用也是最有前景的方法。本文对HIV-1耐药位点和耐药基因检测的研究进展做简单综述。     

广西南宁市注射吸毒人群HIV-1感染者基因亚型及耐药分析

目的 分析广西南宁市注射吸毒人群中HIV-1分子基因亚型及耐药的特征。方法 2017—2019年在南宁市连续收集感染HIV-1的注射吸毒人群样本225份,通过巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因,基于最适基因距离构建分子传播网络,并分析入网率、耐药情况及其相关影响因素。结果 163份样本获得 HIV-1 pol区序列,检测到4种HIV-1基因型,其中以CRF08_BC（55.2%,90/163）和CRF01_AE（35.6%,58/163）为主。共有83条序列入网,入网率50.9%（83/163）,形成19个分子传播簇,其中有1个传播簇包含19个节点。163条序列进行耐药分析,共出现24例HIV-1耐药株,NRTIs、NNRTIs和PIs的耐药率分别为2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）、10.4%（17/163,95% CI:5.7%~15.2%）和2.5%（4/163,95% CI:0.1%~4.9%）。83条未治疗序列中获得4条治疗前耐药株,其中1例出现PIs低度耐药,2例出现NNRTIs高度耐药,1例同时产生NRTIs和NNRTIs耐药突变。结论 南宁市IDU HIV-1感染者中病毒基因亚型呈现多样性,其中以 CRF08_BC占优势,并出现超级传播者。抗病毒治疗耐药情况较为严峻,以NNRTIs耐药为主,原发性耐药处于较低水平,一线抗病毒疗法仍有效,但要密切关注耐药监测,防止多重和交叉耐药毒株的流行。     

昆明市VCT人群中的HIV-1亚型和耐药基因型调查

摘要:目的　了解昆明市艾滋病自愿咨询检测（VCT）人群中的艾滋病病毒（HIV）的HIV-1亚型和耐药基因型分布情况。方法　于2013年11-12月在云南省疾病预防控制中心VCT门诊对就诊人群进行调查,并采样进行HIV抗体、CD4细胞、新发感染检测和HIV亚型和耐药基因型检测。结果　610例VCT样本中有96例为HIV抗体阳性（15.7%,96/610）,其中95例（99.0%,95/96）获得亚型分析结果,分别有CRF08_BC（40.0%,38/95）、CRF07_BC（27.4%,26/95）、CRF01_AE（27.4%,26/95）、C（4.2%,4/95）和B（1.1%,1/95）5种亚型。89例样本（92.7%,89/96）获得耐药基因型分析结果,有21例（23.6%,21/89）发生基因突变,有1例出现耐药传播突变位点（1.12％,1/89）。结论　VCT人群中的艾滋病病毒亚型以重组流行型为主,包括CRF08_BC、CRF07_BC和CRF01_AE。耐药毒株在该人群中为低流行。     

HIV-1基因亚型分布及流行现状

正自1981年首次文献报道艾滋病以来,三十五年来人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)在全球持续蔓延,根据联合国艾滋病规划署(UNAIDS)公布的数字显示[1],截止2015年底全球存活的HIV/AIDS高达3 600多万,当年新感染者180万,死亡94万,艾滋病成为威胁人类健康的首要传染病。随着艾滋病的全球流行,HIV病毒亚型和亚亚型不断增加,各种新型流行重组株(circulating recombinants forms,CRFs)和涉及两     

杭州市2020—2021年男男性行为人群HIV-1感染者分子网络及治疗前耐药特征

目的了解杭州市男男性行为人群(men who have sex with men, MSM)HIV-1感染者的分子网络及治疗前耐药特征。方法收集杭州市2020—2021年新确证HIV-1感染且未经抗病毒治疗的MSM病例血样, 扩增HIV-1pol区基因并测序。使用MEGA6.0软件构建系统进化树判断亚型, 通过Cytoscape3.7.0软件绘制分子传播网络图。使用美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线分析耐药情况。结果共获得1 158条pol基因序列和9种HIV-1亚型, 以CRF07_BC(49.9%, 573/1 158)和CRF01_AE (36.7%, 425/1 158)为主。初始CD4+T淋巴细胞个数在不同亚型间的差异有统计学意义(χ2=37.02, P<0.001)。以1.0%基因距离阈值绘制HIV-1分子传播网络, 形成104个传播簇(簇内病例数2～72例), 入网率34.7%(402/1 158);发现一个包含72例患者的CRF07_BC活跃传播簇。治疗前耐药株流行率为7.5%(87/1 158);对蛋白...     

广东省艾滋病患者HIV-1基因亚型分析

目的 了解目前广东省HIV/AIDS患者HIV-1基因型的流行状况.方法 用套式PCR对222例HIV/AIDS患者外周血单核细胞(PBMC)中HIV前病毒DNA膜蛋白env基因C2-V4区及其邻近区域片段进行扩增,并对片段进行序列测定,与国际HIV-1标准毒株序列进行比较,依据同源性确定基因型.结果 222例患者中,...     

2018年珠海市HIV-1基因型及耐药分析

目的 了解2018年广东省珠海市新确诊且未接受抗病毒治疗的HIV-1抗体阳性病例不同感染途径病毒亚型分布和耐药情况。 方法 收集研究对象血浆标本207份,提取病毒RNA,采用巢氏RT-PCR扩增HIV -1多聚酶pol区,测序定型和耐药分析。 结果 在男男性行为者中流行基因型为CRF07_BC(43.3%)、CRF01_AE(36.1%)和CRF55_01B(13.4%);在异性性感染人群优势基因型为CRF01_AE(52.5%)、CRF07_BC(31.1%)和CRF08_BC(6.6%);在3例注射吸毒感染人群检出CRF01_AE;有1例血源性感染病例检测基因型为H亚型;在MSM和异性性感染人群产生低度耐药,低度耐药率分别为4.1%和4.9%;在注射吸毒和血源性传播感染人群未检出耐药病例。 结论 在经性传播途径感染HIV-1多种基因型共同流行,以CRF01_AE和CRF07_BC基因型为主;在四类人群未检出低度以上耐药病例,总体传播性耐药呈低度流行。     

德宏傣族景颇族自治州2017年HIV-1感染者抗病毒治疗前耐药和病毒基因亚型研究

目的 了解德宏傣族景颇族自治州（德宏州）抗病毒治疗（ART）前的HIV-1感染者基因型和耐药株的流行水平。方法 2017年1-6月在德宏州收集初始ART的HIV-1感染者170例,扩增pol基因,进行HIV-1基因分型和基因型耐药分析。结果 147份样品获得了pol基因,通过进化分析,发现12种HIV-1基因型,居于前3位包括C亚型（29.9%,44/147）、独特型重组形式（URFs）（27.2%,40/147）和CRF01_AE（19.7%,29/147）,还检测到了近年该地区新鉴定出的流行重组形式（CRFs）,包括CRF62_BC、CRF64_BC、CRF86_BC和CRF96_cpx。基因型在异性性传播和注射吸毒传播人群中的分布差异有统计学意义。发现耐药突变的比例为8.8%（13/147）。注射吸毒的HIV-1感染者中耐药株的比例（25.0%,8/32）,高于异性性传播的HIV-1感染者（4.6%,5/109）（χ²=10.166,P=0.002）。结论 2017年德宏州初始ART的HIV-1感染者中病毒基因型高度复杂,HIV-1耐药株的流行达中度水平。     

自愿咨询检测门诊艾滋病恐惧者流行病学特征

目的了解常州市新北区艾滋病自愿咨询检测(VCT)门诊艾滋病恐惧者的流行病学特征,为更好地制定心理干预措施提供依据。方法对2015年VCT就诊的艾滋病恐惧症患者进行问卷调查,并对其特征进行流行病学分析。结果问卷调查40名恐艾者,以青年男性为主,90%有高危行为,多为异性性行为。多因素logistic回归分析显示,年龄与频繁进行HIV检测有统计学关联。近3个月内自诉出现症状较多,艾滋病知识知晓率为85.0%,不同问题间知晓率差异有统计学意义(P<0.05)。结论开展自愿咨询检测工作的过程中,应对恐艾者提供必要的心理支持,并对其开展有针对性的健康教育。     

艾滋病自愿咨询检测门诊求询者情况分析

[目的]分析2008年艾滋病自愿咨询检测（VCT）门诊求询者基本情况及检测结果,为进一步提升VCT工作质量提供依据。[方法]面对面保密咨询,用统一的《检测咨询个案登记表》收集资料,SPSS 11.5软件包统计分析。[结果]946名求询者中,男752人,女194人;求询者类型中性接触占77.3%。有833人接受HIV检测,新发现HIV感染25例,其中22例为性接触传播。[结论]扩大宣传并结合外展服务,提高VCT覆盖面,加强早期检测及经性传播干预力度对艾滋病防控能起重要作用。     

性病门诊就诊者艾滋病自愿咨询检测情况分析

[目的]分析性病门诊就诊者艾滋病自愿咨询检测资料。[方法]对到性病门诊求诊性病者提供免费艾滋病自愿咨询检测服务。[结果]有422名就诊者接受了检测前咨询，就诊的主要原因是有性病症状和性接触。417人接受了检测，HIV抗体阳性4例，阳性率0.96%，男、女阳性率分别为0.96%、0.97%，差异无统计学意义；男性梅毒抗体阳性率（5.41%）低于女性（11.65%）（P﹤0.05）；接受检测后咨询比率男女分别为68.79%和75.73%（P﹥0.05）；患有性病者的检测后咨询率（77.83%）高于未患性病者64.66%（P﹤0.05）。[结论]在性病门诊就诊者中开展VCT服务，对于提高HIV感染的发现率，增强干预效果，节约资源有重要意义。     

凉山彝族自治州HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素分析

目的 了解凉山彝族自治州（凉山州）HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药情况及其影响因素,为预防HIV-1耐药毒株的传播提供参考依据。方法 分别于2017年1月1日至6月30日、2018年1月1日至6月30日在凉山州开展HIV/AIDS抗病毒治疗前HIV-1耐药的横断面调查。提取获得HIV-1 pol基因区序列,根据2014年WHO耐药监测指南的推荐标准,应用HyPhy 2.2.4和Cytoscape 3.6.1软件进行HIV-1耐药毒株传播网络分析。结果 研究对象464例HIV/AIDS,HIV-1毒株为CRF07_BC亚型的占88.6%（411/464）,总的HIV-1耐药率为9.9%（46/464）,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTI）、核苷类反转录酶抑制剂（NRTI）和蛋白酶抑制剂（PI）耐药率分别为6.7%（31/464）、1.9%（9/464）和0.4%（2/464）;有1组HIV-1新型重组毒株URF_01BC亚型独立成簇并携带相关耐药突变位点;多因素logistic回归分析结果显示,与异性性传播人群相比,注射吸毒人群的HIV-1耐药风险较高（aOR=3.03,95% CI：1.40～6.54）。结论 凉山州HIV/AIDS抗病毒治疗前的HIV-1耐药率较高,且有新型重组毒株URF_01BC亚型携带相关耐药突变位点的成簇传播,建议加强HIV-1耐药毒株传播的预防工作。     

宁波市男男同性恋人群中HIV-1感染者免疫状况和亚型分布研究

目的研究宁波市男男同性恋(MSM)人群中HIV-1感染者的免疫状况和HIV毒株的亚型分布特点。方法收集宁波市13名已经被确认为HIV-1型阳性的MSM的全血样品,对CD4+T淋巴细胞进行绝对数计数,运用套式PCR方法扩增病毒膜蛋白env基因的C2-V3区并进行序列测定。应用DNASTAR软件对序列和参考序列进行比对分析,确定基因亚型。结果成功获得11条env基因序列,确定1株为B亚型,4株为01_AE流行重组型,6株为07_BC流行重组型。该11例HIV-1阳性全血的CD4+T淋巴细胞绝对数最低106个/μl,最高649个/μl,平均350个/μl。结论本研究表明,宁波市MSM人群中存在多种HIV-1亚型,近半数的感染者免疫状况低下需要抗病毒治疗,流行形势严峻,应加强对该人群免疫状况和HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。     

同性和异性传播感染人群的HIV-1亚型分布和特征分析

目的了解河北省男男同性传播和异性传播人群HIV-1亚型分布和特征。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,逆转录后采用套式PCR扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,确定基因型并进行系统进化树分析。结果同性传播的52例HIV-1感染者中,发现了3种HIV-1亚型和重组型,以CRF01-AE为主,占65.4%(34/52),其次为B亚型占30.8%(16/52);异性传播的60例HIV-1感染者中,存在6种亚型和重组型,以B亚型为主占43.3%(26/60),其次是CRF01-AE占30.0%(18/60),CRF07-BC占15%(9/60);两类人群的亚型分布差异有统计学意义(P<0.001)。异性感染人群的各亚型组内基因距离均大于同性感染人群。结论在河北省同性传播人群和异性传播人群中HIV-1亚型分布不均衡。     

华阴市艾滋病自愿咨询检测门诊求询者情况分析

目的 分析2010年华阴市艾滋病自愿咨询检测(VCT)门诊求询者基本情况及检测结果,为进一步提升VCT工作质量提供依据.方法 面对面保密咨询,用统一的<检测咨询个案登记表>收集资料,SPSS11.5R软件包统计分析.结果 946名求询者中,男752,女194人;求询者类型中性接触占77.3 %.有833人接受HIV检测...     

性病门诊开展艾滋病自愿咨询检测效果分析

[目的]了解性病门诊开展艾滋病自愿咨询检测（VCT）情况,为求询者提供干预措施,降低感染危险,完善VCT服务质量。[方法]对2009年～2010年到普洱市疾控中心性病门诊寻求者自愿咨询检测个案资料进行统计分析。[结果]咨询586人,其中男性337人,占57．51％（337／586）;女性249人,占42．49％（249／586）;年龄以20岁～30岁青壮年为主,占44．88％（263／586）,咨询后进行HIV抗体检测426人,发现艾滋病病毒（HIV）感染55例,阳性率12．91％（55／426）,有72．69％的求询者接受咨询检测,99．30％的检测者接受了检测后告知和转介服务。求询者HIV阳性率单因素分析显示,年龄、婚姻状况、文化程度、求询类型、既往检测、检测年份等因素与HIV阳性率有关。[结论]在性病门诊开展VCT服务,高危人群易接受咨询检测,能及早发现艾滋病毒感染者,但应加强对高危人群检测咨询后的行为转变的健康教育。     

某铁路辖区门诊艾滋病自愿咨询检测结果分析

目的了解柳州铁路辖区门诊艾滋病自愿咨询检测(VCT)情况,为铁路艾滋病防治工作提供科学依据。方法收集柳州铁路VCT门诊95例求询者情况及HIV抗体检测结果,利用EXCEL进行统计学分析。结果 95例求询者男性占66.3%,20~40岁间的青壮年占76.3%,平均年龄(32.4±9.7)岁。求询原因为有非婚异性性接触史(56.5%)、注射毒品史(13.0%)、配偶或固定性伴HIV阳性(9.8%)。有79例求询者进行HIV抗体检测,检出5例,检出率为6.3%。结论某铁路辖区门诊VCT人群HIV检出率较高,但参与人数较少,铁路VCT工作有待加强。     

上城区艾滋病自愿咨询检测门诊求询者特征及HIV感染情况分析

目的 分析2016-2019年杭州市上城区艾滋病自愿咨询检测(VCT)门诊求询者特征及HIV感染情况,为当地艾滋病防控提供依据.方法 收集2016-2019年上城区疾病预防控制中心VCT门诊求询者的人口学信息、求询原因和HIV抗体检测资料,分析不同人群求询原因及HIV感染情况.结果 共纳入2 205名求询者,男性1 9...