侵袭性非伤寒沙门菌血清型和耐药性分析

目的分析7株侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的血清型和耐药性。方法针对收集的7株iNTS菌株,开展血清学鉴定、药物敏感性实验以及全基因组测序,并对血清型、MLST型和耐药基因进行鉴定、注释和分析。结果7株iNTS菌株中,包含1株鼠伤寒血清型和2株Ⅰ4,[5],12:i:-(ST34型)、2株肠炎血清型、1株科瓦利斯血清型和1株未知血清型Ⅰ4,[5],12:d:-(ST279型),其中6株为单相菌,沙门菌二相鞭毛基因缺失或假基因化可能有助于增强沙门菌侵袭性。未发现替加环素、氨曲南、阿米卡星及头孢类、碳青霉烯类抗生素耐药株,存在1株八重耐药鼠伤寒沙门菌。耐药基因与耐药表型基本相符。结论本研究中的iNTS菌株存在八重耐药株,整体耐药水平尚低但不可忽视。     

玉林市婴幼儿腹泻感染非伤寒沙门菌分子分型和耐药情况分析

目的了解婴幼儿感染的非伤寒沙门菌的分子分型和耐药情况。方法收集了2018年玉林市中医医院综合儿科门诊3岁以下腹泻患儿401份粪便标本,按照《2018年食源性疾病监测工作手册》进行沙门菌增菌、分离鉴定、分子分型及药物敏感试验。同时,把检出优势的非伤寒沙门菌血清型通过脉冲场凝胶电泳分析技术(PFGE)进行分子分型;把优势血清型与其他血清型沙门菌的药敏结果进行比对来了解其不同之处。结果腹泻患者共分离出29株非沙伤寒沙门菌,检出率为7.2%(29/401)。血清型主要为鼠伤寒沙门菌,占非伤寒沙门菌总数的62.1%(18/29)。18株鼠伤寒沙门菌可分为17个PFGE型别,其中2株为同一PFGE型,4株PFGE带型相近。药敏结果显示所有非伤寒沙门菌菌株均对亚胺硫霉素、头孢西丁、环丙沙星、氨苄西林/舒巴坦、阿奇霉素敏感,对其余9种抗菌药物产生不同程度的耐药。29株非伤寒沙门菌总体耐药率为96.6%(28/29),其中氨苄西林耐药率为86.2%(25/29),四环素为75.9%(22/29),氯霉素为69.0%(20/29),甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲噁唑为62.1%(18/29)。鼠伤寒沙门菌四环素耐药...     

龙岩市不同来源的肠炎沙门菌耐药性分析

目的了解龙岩市不同来源的肠炎沙门菌抗生素耐药情况,为感染患者治疗及畜禽防疫和治疗提供参考。方法收集2016年至2017年2月,临床分离的肠炎沙门菌13株,食物中毒分离的肠炎沙门菌25株和食品污染物监测分离的肠炎沙门菌8株。选择上海星佰生物技术有限公司生产的革兰阴性需氧菌药敏监测板(适用于肠道菌群的96孔板)来检测肠炎沙门菌MIC值。结果除1株食物中毒分离的肠炎沙门菌对16种抗生素敏感外,其余45株不同来源的肠炎沙门菌都有1种以上至6种抗生素耐药。临床分离株和食物中毒分离株3种耐药分别为69.2%和76.0%;食品污染物监测分离株3种耐药也占25.0%。46株不同来源肠炎沙门菌对所测抗生素完全敏感的有:多黏菌素B、阿奇霉素、复方磺胺、头孢西丁、头孢他啶,对其他11种抗生素均有一定的耐药性。而共同耐药性最强的分别是萘啶酸、氨苄西林和链霉素。中介耐药主要为环丙沙星和头孢唑林。结论龙岩市3种不同来源的肠炎沙门菌耐多种抗生素趋势严峻,应建立临床抗生素使用管理的控制体系,强化耐药性监测网络,指导沙门菌感染的治疗,提高疫情处置的应对能力。同时加强对畜禽养殖业抗生素使用的管理,引导抗生素在养殖业疫病防治的合理使用。     

浙江省伤寒副伤寒沙门菌耐药及分子分型

目的了解浙江省伤寒副伤寒沙门菌耐药及分子分型特点,为伤寒副伤寒防制工作提供依据。方法采用WHO推荐的改良K-B纸片法,对209株甲型副伤寒沙门菌和5株伤寒沙门菌进行14种抗生素敏感性试验;运用脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)方法对119株甲型副伤寒沙门菌进行分子分型及流行病学特征分析。结果209株甲型副伤寒沙门菌对红霉素、萘啶酸和利福平100%耐药,对阿米卡星100%敏感,对环丙沙星的敏感率仅为58%;5株伤寒沙门菌对红霉素和利福平100%耐药,对头孢噻吩、头孢噻肟、庆大霉素、环丙沙星、氨苄西林、阿米卡星和阿莫西林/克拉维酸100%敏感;不同地区间的甲型副伤寒沙门菌对大部分药物敏感率一致,只有多西环素存在较大差异;119株甲型副伤寒沙门菌共产生20种PFGE带型,并主要集中在2种同源性较高的型别。结论2008年浙江省伤寒副伤寒以甲型副伤寒菌株为优势株,不同地区甲型副伤寒沙门菌对大部分抗生素敏感率一致;高发地区(台州)的菌株PFGE带型比较分散,可能与菌株变异有关。     

余姚市鼠伤寒沙门菌耐药性分析

目的了解余姚市鼠伤寒沙门菌耐药性和相关耐药基因特征,为鼠伤寒沙门菌的流行研究和防控提供依据。方法于2015—2017年采集余姚市主城区河水、食品、食源性疾病患者粪便标本,分离、鉴定鼠伤寒沙门菌,选用9类21种抗生素进行药敏试验及相关耐药基因检测;选取2016年食源性疾病患者粪便分离株进行脉冲场凝胶电泳分型。结果2015—2017年检测标本1 594份,检出沙门菌277株;其中鼠伤寒沙门菌118株,占42.60%。118株鼠伤寒沙门菌对利福平、四环素、氨苄西林和哌拉西林的耐药率较高,分别为98.31%、94.07%、87.29%和61.02%;对诺氟沙星均敏感;对哌拉西林/他唑巴坦、氧氟沙星、环丙沙星和亚胺培南均有1株耐药;耐多药89株,占75.42%,以青霉素、四环素、利福平三重耐药的最多,有34株。OXA基因的检出率为17.80%,TEM基因检出率为44.07%,CTX-M基因检出率为27.12%,Ⅰ类整合子基因检出率为57.63%。结论余姚市流行的沙门菌优势血清型以鼠伤寒为主,有较高的耐药率,携带多种耐药基因。     

江苏省伤寒沙门菌噬菌体分型与耐药性监测报告

伤寒是我省常见和重点控制的肠道传染病.为掌握伤寒流行规律,为伤寒防治提供依据,我们在省内设立监测点开展了伤寒病原学噬菌体分型及耐药性监测.现将1995～2000年结果报告如下.     

深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌耐药性及脉冲场电泳分子分型研究

目的了解深圳市龙岗区近年伤寒沙门菌的耐药性和同源性。方法收集深圳市龙岗区2004—2007年肠道传染病和食物中毒样品中的伤寒沙门菌并用生化和血清学方法进行鉴定,采用改良K-B法进行药敏试验,伤寒沙门菌基因组经限制性内切酶XbaI酶切后,采用脉冲场电泳（PFGE）获得电泳图谱,再利用BioNumerics软件对电泳图谱进行同源性分析。结果共分离到17株伤寒沙门菌,所有菌株均对青霉素和苯唑西林耐药,对第3代头孢菌素、氨基糖苷类、氟喹诺酮类、氯霉素和复方新诺明敏感。64.7%的菌株对3种或以上抗生素中度耐药或耐药。BioNumerics分析结果显示,共有14个不同的PFGE带型出现,除2株以外其余15株分布于3个相似性在85%以上的簇内。结论深圳市龙岗区伤寒沙门菌的耐药已经成为一种非常普遍的现象,需加强监测。氟喹诺酮类和第3代头孢菌素类抗生素在临床上治疗伤寒沙门菌感染仍然可以取得满意效果。深圳市龙岗区可能存在3个伤寒沙门菌的流行克隆,其传播可能是该区伤寒沙门菌发生的主要原因。     

肠炎沙门菌PFGE分子分型及耐药性研究

目的：对本地区及相邻地区2004～2007年分离的肠炎沙门菌菌株的分子分型及耐药性进行分析。方法：采用PFGE进行分子分型,利用药敏卡通过仪器对分离菌株进行药敏检测。结果：5起肠炎沙门菌食物中毒分离的菌株分成3型,其中2型之间存在3条带的差异,菌株间有相近关系。结论：PFGE是一种非常有效的分子分型方法,建立细菌PFGE指纹图谱数据库及PulseNet,对于控制食源性疾病非常重要。     

不同来源的沙门菌耐药性监测及结果分析

目的 对不同来源的沙门菌分离株的耐药状况进行监测,掌握吉林省沙门菌的耐药趋势和耐药谱,为指导抗生素在人类临床和动物饲养中的合理应用,控制耐药菌株的传播提供重要的参考性数据.方法 近4年食品中检出的沙门菌和病人粪便中分离出的沙门菌,利用微量肉汤稀释法,用含有14种抗生素的药敏板进行耐药性最低抑菌浓度(MIC)检测.结果 ...     

辽宁省肠炎沙门菌耐药性及分子分型特征

目的分析近年辽宁省腹泻病例中检出的肠炎沙门菌血清型、耐药性及分子分型。方法对辽宁地区50株沙门菌临床分离株进行血清型分型;采用微量肉汤法,进行16种抗菌药物的药敏试验;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对选取的16株肠炎沙门菌株进行基因分型。结果肠炎沙门菌是沙门菌中的优势血清型。所有菌都对链霉素耐药。16株肠炎沙门菌分成7种型别,其中6个PFGE型别间仅有1条~3条带的差异,相似度在78.68%~100%,菌株间具有很近的亲缘关系。结论辽宁省感染性腹泻病例中沙门菌感染率较低。PFGE分子分型较多,无明显聚集性。     

2008—2013年北京市17株伤寒和副伤寒沙门菌耐药和分子分型研究

目的分析2008—2013年北京市17株伤寒、副伤寒沙门菌耐药及分子分型。方法对2008-2013年通过对北京市肠道门诊监测系统分离到的17株伤寒、副伤寒沙门菌进行生化鉴定、血清分型并运用纸片法进行药敏检测;利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型。结果 17株伤寒、副伤寒沙门菌对三代头孢菌素类药物头孢他啶敏感率达100%,头孢噻肟和头孢曲松敏感率均为93.75%,对氟喹诺酮类药物环丙沙星敏感率为93.75%,萘啶酸耐药率达31.25%。其中16株伤寒、副伤寒沙门菌可分为15种PFGE带型,带型分布较分散。结论北京市伤寒、副伤寒沙门菌分离株对3代头孢类抗生素及环丙沙星敏感;PFGE分子型别较多,无聚集性。     

2018—2021年北京市大兴区腹泻患者沙门菌分子分型及耐药性分析

目的 了解北京市大兴区肠道门诊腹泻患者沙门菌的感染情况、流行病学和病原学特征及耐药状况,为沙门菌防控及临床治疗提供依据。方法 2018—2021年收集大兴区3家哨点医院肠道门诊腹泻患者的粪便标本进行沙门菌检测,对分离到的沙门菌开展血清分型、脉冲场凝胶电泳分型分析及药敏实验。结果 4年共检测粪便标本1 499件,检出沙门菌65株（4.34%）,肠炎沙门菌（53.85%）为主要流行血清型;不同年龄组人群中沙门菌检出率差异有统计学意义（P<0.01）,其中1～<11岁检出率最高（10.30%）;不同性别及职业人群沙门菌检出率差异均无统计学意义（均P>0.05）。药敏结果显示,沙门菌耐药程度差异较大,除对头孢西丁、美罗培南和阿奇霉素完全敏感外,对其他抗菌药物均有一定的耐药性。35株肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳后出现20种带型,其中B8和B10带型为优势带型,菌株之间的相似系数为40.6%～98.7%。结论 北京市大兴区沙门菌的优势血清型为肠炎沙门菌,PFGE带型呈高度多态性,耐药性较强,临床治疗时需合理使用抗菌药物。     

舟山市2018—2020年肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌 PFGE分子分型特征分析

目的 了解舟山市肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型特征,为聚集性暴发事件溯源追踪提供依据。方法 用Pulse Net网络实验室标准方法对肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌进行PFGE分子分型,并进行聚类分析。结果 舟山市2018—2020年分离到106株肠炎沙门菌和60株鼠伤寒沙门菌,性别比1.1∶1和0.9∶1,集中于每年6～8月(78.3%和80.0%),主要以0～5岁年龄组居多(37.7%和66.7%)。106株肠炎沙门菌分12种带型,菌株间条带相似度84.0%～100.0%;优势带型为P1、P6和P7。60株鼠伤寒沙门菌分53种带型,菌株间条带相似度56.0%～100.0%;各带型包含1～4株菌,B1为优势带型。结论 舟山市肠炎沙门菌PFGE分子分型有明显优势带型,遗传同源性较高;鼠伤寒沙门菌PFGE分子型别众多,条带分散,呈遗传多样性。     

伤寒与甲型副伤寒沙门菌基因分型与耐药性研究

目的:通过追溯菌株的流行优势型,了解菌株的耐药性,分析流行因素,为查明宁波地区伤寒、副伤寒疫情回升原因提供科学依据。方法:水产品检测采用GB、PCR和mini VIDAS联合检测方法;病人、从业人员检测采用全国临床操作规程或GB方法;菌株鉴定采用VITEK、ATP方法;药物敏感试验采用K-B纸片扩散法;基因分型采用PFGE方法。结果:从11类1500份海产品中检出6株沙门菌,检出率为0.40%,其中甲型副伤寒沙门菌2株,检出率为0.13%,肠炎等沙门菌3株,检出率为0.20%,伤寒沙门菌1株,检出率为0.07%;住院病人及暴发疫情标本中分离到沙门菌593株,其中伤寒沙门菌25株,占4.22%,乙型副伤寒沙门菌1株,占0.17%,甲型副伤寒沙门菌567株,占95.62%;食品、公共场所从业人员检出甲型副伤寒沙门菌2株;病人胆汁中分离到甲型副伤寒沙门菌1株。182株甲型副伤寒沙门菌和3株伤寒沙门菌药敏试验显示,大多数菌株对常用多种抗生素均敏感,其中1株分离于水产品伤寒沙门菌出现多重耐药。14株伤寒沙门菌可分为3个PFGE型,364株甲型副伤寒沙门菌可分为12个PFGE型。结论:宁波地区伤寒、副伤寒疫情回升与食源性有关,同源性试验提示菌株来是同一克隆系的可能性较大,优势流行型为PFGE 2型,且发现宁波地区副伤寒疫情的流行强度与此型细菌相关。检出的伤寒、副伤寒沙门菌对氧哌嗪青霉素、妥布霉素及头孢哌酮等第3代头孢菌素药物显示良好的敏感性,可作为当前预防和治疗的首选药物。伤寒出现多重耐药株,应引起我们的关注。PFGE分型有助于病原的追溯,分析菌株的变迁,为流行病学进一步分析病因提供支持,在确定传播途径等方面具有重要意义。     

广东省佛山市鼠伤寒沙门菌分子分型及其多重耐药分析

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2016年江阴市伤寒沙门菌耐药监测及分子分型分析

目的分析江阴市2016年伤寒沙门菌的耐药状况及同源性,为伤寒的临床用药和防控提供科学依据。方法按照WS 280-2008《伤寒和副伤寒诊断标准》对江阴市伤寒监测哨点医院的患者进行诊断,按照GB/T 4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门氏菌检验》对患者样本进行分离鉴定。选择10种常见抗菌药物,运用K-B法对从伤寒患者体内分离到的73株伤寒沙门菌进行耐药性试验,并运用脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Eletrophoresis,PFGE)对16株有代表性的伤寒沙门菌进行分子同源性分析。结果江阴市2016年报告伤寒发病率6.56/10万,共分离伤寒沙门菌77株。对73株菌株进行耐药试验,所有菌株对萘啶酸和利福平100.00%耐药,对阿莫西林、头孢噻吩和头孢噻肟100.00%敏感,菌株多重耐药率为39.72%,多重耐药谱为:萘啶酸-利福平-甲氧苄啶。16株菌株经PFGE聚类分析后,呈现4种不同型别,其相似度均>80.00%,其中13株菌株相似度为100.00%。结论江阴市伤寒沙门菌耐药形势严峻,萘啶酸和利福平不再适合用于伤寒治疗,头孢菌素类及青霉素类抗菌药物为孕妇及儿童感染伤寒沙门菌时的首选。PFGE显示13份伤寒菌株与XQ镇井水中分离到的伤寒菌株同源,结合流行病学分析后,确认为暴发菌株。     

腹泻儿童非伤寒沙门菌感染的病原学及耐药性分析

目的探究苏州地区腹泻儿童非伤寒沙门菌(NTS)感染的病原学特征及耐药性变迁。方法回顾性收集2016年至2021年苏州大学附属儿童医院收治的1265例NTS感染相关腹泻患儿的临床数据并进行统计分析。结果本研究共分离得到1265株NTS,平均检出率为11.79%,主要以5岁以下低龄儿童为主,夏季为高发流行季节(20.00%),优势血清群为B群(63.95%)和D群(17.00%),其中以鼠伤寒沙门菌(54.47%)和肠炎沙门菌(15.18%)为主;药敏结果显示,苏州地区腹泻患儿分离得到的NTS对广谱合成类青霉素敏感性较低(耐药率均>70%),而对含酶抑制剂的青霉素复合制剂较为敏感(耐药率均<10%),对三代头孢菌素及其复合制剂、碳青霉烯类抗生素敏感性也较好;不同血清型沙门菌的耐药性也存在差异,D群沙门菌环丙沙星和复方新诺明总体耐药率均低于其他血清群(χ²值分别为20.71、147.24,P<0.05);2020—2021年分离的NTS对三代头孢菌素和氟喹诺酮类药物的耐药率较往年明显下降(χ²值分别为29.02、11.55,P<0.05)。结论NTS是导致苏州地区儿童感染性腹泻的主要病原菌,临床医生应认识到NTS的病原学特征及耐药性改变,帮助早期诊断和合理使用抗菌药物,延缓耐药菌株的产生。     

南宁市腹泻患者非伤寒沙门菌血清分型及药敏分析

目的分析南宁市腹泻患者非伤寒沙门菌的血清型分布和药敏特征,为临床用药和制定防控策略提供参考。方法根据WS 271—2007《感染性腹泻诊断标准》,进行菌株的鉴定和血清分型;采用微量肉汤法进行药物敏感性试验,根据最低抑菌浓度(MIC)进行药敏结果分析和判读。结果南宁市腹泻患者非伤寒沙门菌分离株以B群为优势群(62/86,72.09%),鼠伤寒沙门菌(31.40%)、德尔卑沙门菌(16.28%)为主要血清型。86株菌对碳青霉烯类抗生素亚胺培南100%敏感,对其他类型的抗生素均有一定程度的耐药,对磺胺甲恶唑的耐药率最高,达76.74%,对四环素类抗生素、青霉素类抗生素的耐药率达55%。菌株的总体耐药率为87.21%(75/86),多重耐药现象严重,4种及4种以上抗生素的耐药率为58.14%(50/86),不同血清型的4重及以上多重耐药率差异无统计学意义(χ2=1.032,P0.05)。结论南宁市引起腹泻的非伤寒沙门菌血清型众多,耐药严重,需继续加强耐药监测,同时共同努力规范抗生素的使用。     

上海市鼠伤寒沙门菌流行特征及分子分型研究

[目的]研究上海市2006—2007年鼠伤寒沙门菌腹泻病例株的分子流行病学特征。[方法]追溯2002—2007年食品中分离的鼠伤寒沙门菌来源,比较鼠伤寒沙门菌食源株与腹泻株的抗生素耐药性;对全球沙门菌监测(GSS)病例和食品中分离的鼠伤寒沙门菌进行血清、耐药表型和脉冲凝胶电泳(PFGE)分子分型。[结果]经培养确认的鼠伤寒沙门菌腹泻病例数,在2006—2007年本市非伤寒沙门菌型病例构成中仅次于肠炎沙门菌,食品菌株多源于禽(64.4%)和畜肉制品(17.8%),其多重耐药菌株显著高于腹泻株(P0.05)。PFGE将7株食品株和44株腹泻株分为23种带型,优势型为1型(8株)、2型(6株)、29型(4株)、49型(8株)和6型(4株),与食源菌株完全匹配的仅有49型、6型共7个病例(15.9%,7/44)。PFGE-1型腹泻株在2006和2007年分别为2例和6例,2型分别为4例和2例。[结论]上海市鼠伤寒沙门菌腹泻病例存在高度散发和分散爆发的流行特征,没有与本地食品菌株相匹配的优势克隆型分别是PFGE 2型和1型,与市售生鲜类肉食品污染株之间的遗传同源性低。推测传染源可能由输入性传染源对食品等媒介形成二次污染所致。建议加强流行病学调查,以揭示潜在的传染源和传播途径。     

2008-2009年北京市沙门菌流行特征和分子分型

目的 分析2008-2009年北京市沙门菌流行特征及脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型. 方法 对2008-2009年通过WHO全球沙门菌监测系统及北京市肠道门诊监测系统分离到的137株沙门菌进行生化鉴定、血清分型和相关流行病学分析;利用PFGE进行分子分型. 结果 北京市2008-2009年沙门菌的流行具有明显季节性,6-9月份高发,共分离菌株84株,占64.1%(84/131);患者年龄多为18～40岁,占46.1%(58/128);男性80例,女性51例,男女比例为1.57:1.137株沙门菌分属于20种血清型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势菌型,分别占46.7%(64/137)和17.5%(24/137).共分71种PFGE带型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌都有16种PFGE型别.肠炎沙门菌的4种PFGE型别(JEGX01.CN0001、JEGX01.CN0003、JFGX01.CN0002、JEGX01.CN0019)和鼠伤寒沙门菌的JPXX01.CN0001为优势分子型别. 结论 2008-2009年北京市沙门菌的流行具有性别、年龄和季节性分布特征;PFGE分子型别较多,且存在差异明显的多个克隆系.

Abstract：

Objective To study the epidemiological characteristics and molecular phenotypes of Salmonella by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) in Beijing from 2008 to 2009. Methods A total of one hundred thirty-seven isolates recovered from the WHO Global Samonella Surveillance system and entero clinic surveillance system were identified by biochemical tests and serotyping.The related epidemiological informations were also analyzed.The isolates were further typed by PFGE. Results The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed obvious seasonal character.High incidence occurred from June to September,and 64.1% (84/131) isolates were recovered in this period.Patients of 18-40 year-old were 46.1% (58/128) and 80 patients were male and 40 patients were female with the ratio of 1.57:1.These 137 Salmonella isolates belonged to 20 serotypes,including Enteritidis (46.7%,64/137) and Typhimurium (17.5%,24/137) as the dominant serotype.In total,71 PFGE profiles were identified.Four PFGE patterns of S.Enteritidis isolates (JEGX01.CN0001,JEGX01.CN0003,JEGXO1.CN0002,JEGX01.CN0019) and S.Typhimurium pattern of JPXX01.CN0001 were dominant patterns. Conclusion The prevalence of Salmonella from 2008 to 2009 showed distribution characteristics of sex,age and seasons.The numerous PFGE patterns of Salmonella showed diversity of these isolates and different clones existed in Beijing.