志贺菌主动外排泵调控基因marOR突变与泵表达水平的关系

目的 了解临床分离志贺菌调控基因marOR的突变情况,并探讨其与主动外排泵表达水平的关系.方法 对100株临床分离志贺菌和本实验室筛选的敏感菌及标准株的marOR基因进行聚合酶链反应(PCR),对扩增产物进行限制性内切酶酶切与单链构象多态性(SSCP)分析,对marOR基因突变株进行测序,利用RT-PCR测定其泵基因acrA、acrB和tolC的表达水平,并对其进行四环素、氯霉素、氨苄青霉素、庆大霉素、诺氟沙星、复方新诺明等6种药物的药敏试验.结果 100株临床分离志贺菌、敏感株及标准株均扩增出marOR基因,未发现该基因缺失株;SSCP分析发现marOR基因的突变率为23%;随机选择11株marOR基因突变株和1株敏感株及标准株进行测序,其中有9株存在4个碱基的缺失和3个位点的碱基突变,RT-PeR分析表明11株marOR基因突变株的acrAB-tolC主动外排泵表达水平高于敏感株和标准株,且该11株均为多蕈耐药株.结论 在该实验中志贺菌marOR基因突变率较高,其突变株的acrAB-tolC主动外排泵基因高表达,可能增加耐多药性.     

志贺菌主动外排泵调控基因marOR突变与耐药的关系

目的 探讨临床分离志贺菌调控基因marOR的突变对细菌耐药性的影响.方法 利用重叠延伸PCR扩增4个碱基缺失的marOR基因,与T载体连接后转入DH5α,得到4个碱基缺失的marOR基因克隆株;4个碱基缺失联合3个点突变的marOR基因克隆株是扩增具有该突变菌株的marOR基因,然后与T载体连接后转入DH5α所得;通过凝胶电泳图谱和核酸序列分析证实克隆成功与否;检测DH5α、转入T载体后的DH5α[DH5α(T)]、完整marOR基因克隆株[DH5α(marOR)]、4个碱基缺失的marOR基因克隆株[DH5α(marOR-ACTT)]及4个碱基缺失联合3个点突变的marOR基因克隆株[DH5α(marOR-CATT+3m)]对多种抗生素的耐药性,并进行比较.结果 按抑菌环直径相差5 mm以上为抗生素耐药性有差别:与DH5α(T)比较,DH5α(marOR-ACTT)对链霉素、妥布霉素、先锋V、头孢氨苄的耐药性增加,DH5α(marOR-ACTT+3m)对链霉素和四环素的耐药性增加;与DH5α(marOR)比较,DH5α(marOR-ACTT)和DH5α(marOR-ACTT+3m)对链霉素、四环素、氯霉素、先锋V、左氟沙星、环丙沙星和氟哌酸的耐药性增加;DH5o(marOR-CATT)与DH5α(marOR-CATT+3m)相比对除甲氧苄啶外的试验所用抗生素的抑菌环直径无明显差异.结论 marOR基因第1376～1379处的4个碱基缺失,使志贺菌对部分抗生素的耐药性增加;marOR基因第1411、1417、1435处的点突变对志贺菌的耐药性的影响较小.     

幽门螺杆菌耐甲硝唑基因分型与序列分析

目的 探讨幽门螺杆菌（Helicobacter pylori,Hp)rdxA基因型及其与甲硝唑耐药性的关系及耐药的分子机制。方法 对54例包括胃炎、消化性溃疡、胃癌患者的Hp分离株进行甲硝唑敏感实验，得到敏感株和耐药株；提取Hp基因组DNA，PCR扩增rdxA基因，并进行限制性片段长度多态性（RFLP）分型；统计学分析基因型和耐药性关系；对1株敏感株和2株耐药株rdxA基因测序分析突变情况。结果 rdxA基因可分为两型：Ⅰ型和Ⅱ型。Ⅰ型中的敏感株和耐药株所占比例为56%和44%，Ⅱ型中的敏感株占16％，耐药株占84％。经统计学分析，rdxA基因Ⅱ型与耐药性有相关性。rdxA基因测序分析显示耐药株存在编码区碱基置换及插入造成的移码突变；非编码区亦存在单个碱基缺失及置换突变。结论 rdxA基因Ⅱ型与Hp的甲硝唑耐药性密切相关，耐甲硝唑株主要表现为Ⅱ型。rdxA基因突变是耐甲硝唑的主要原因。     

结核分枝杆菌临床分离株异烟肼耐药相关基因突变的分子特征

目的 阐明结核分枝杆菌异烟肼（INH）耐药相关基因突变特征.方法 对137株结核分枝杆菌临床分离株（耐异烟肼菌株87株,异烟肼敏感菌株90株）的9个结构基因furA、katG、inhA、kasA、Rv0340、iniB、iniA、iniC和efpA以及两个调控区oxyR-ahpC基因间隔区和mabA-inhA启动子进行DNA片段扩增及序列分析.结果 82株（94.3%）INH耐药分离株的katG基因存在突变,其中katGSer315Thr突变占优势（55.2%）.50株INH敏感的分离菌katG的463密码子没有突变.35株（40.2%）INH耐药的分离株katG的463有突变.87株INH耐药株中,20株（23.0%）的katG基因存在两重突变.13株（14.9%）分离菌inhA基因的启动子区存在突变,4.6%的分离菌有inhA结构基因突变,11.5%oxyR-ahpC基因间区存在突变.iniBAC区域和efpA中发现耐药性关联突变.结论 研究证实多个基因突变与异烟肼耐药之间的关系,并且为阐明结核分枝杆菌耐药机制提供线索.     

大肠埃希菌尿液分离株中检出gyrA基因新变异株

目的 调查大肠埃希菌尿液分离株中喹诺酮类耐药相关基因的存在与变化状况.方法 收集宁波市第一医院2008年10月到2009年3月患者尿液标本中分离的大肠埃希菌共28株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析1种染色体介导的喹诺酮类耐药相关基因(gyrA基因)和5种质粒介导的喹诺酮类耐药相关基因[qnrA、qnrB、qnrS、aac(6＇)-Ⅰb、qepA].结果 28株大肠埃希菌检测到1株aac(6＇)-Ⅰb-Cr基因阳性株(经测序比对证实),qnrA、qnrB、qnrS、qepA基因均未检出.gyrA基因83位密码子28株菌都有突变(100.0%),其突变方式为TCG-83→HTG,导致氨基酸从丝氨酸(S)-83→亮氨酸(L);87位密码子22株菌(78.6%)有突变,可分为两种突变方式:21株(75.0%)突变方式为GAC-87→AAC,导致氨基酸从天冬氨酸(D)-87→天冬酰胺(N);5号株gyrA基因(3.6%)为新亚型,其突变方式为GAC-87→TAC,导致氨基酸从天冬氨酸(D)-87→脯氨酸(Y),另6株菌87位密码子无突变.结论 本组大肠埃希菌gyrA基因突变率为100.0%,是喹诺酮类耐药的主要原因.其他耐药相关基因阳性率很低.     

环丙沙星药敏检测在大肠埃希菌graA基因突变关系研究

为了解3株3次环丙沙星药敏检测结果不一致的大肠埃希菌gyrA基因基因突变状况，本文对该3株菌和另3株3次环丙沙星药敏检测均为耐药的大肠埃希菌进行了gyrA基因基因喹诺酮耐药区（QRDR）PCR扩增和产物DNA测序。结果为3株3次环丙沙星药敏检测结果不一致的和另3株3次检测均为耐药的大肠埃希菌均存在gyrA基因基因第83和第87位氨基酸密码子的突变（TCG→TTG，GAC→AAC）。     

一种导致完全性雄激素不敏感综合征的AR基因移码突变的鉴定

目的 对1个男性假两性畸形完全性雄激素不敏感综合征的家系雄激素受体(androgen receptor,AR)基因进行突变检测,并分析其致病原因.方法 用PCR扩增及DNA测序等技术分析男性假两性畸形先证者候选基因AR的外显子及外显子内含子接头序列,根据检测到的突变位点情况,检测患者及其家系其他成员的相应DNA区段的碱基序列.结果 先证者及其家庭成员共3例患者均为AR基因1910delA的移码突变.其母亲为AR基因突变杂合子,是此疾病的携带者.该突变导致AR基因的N637I(AAU→AUC)、L638*(CTG→TGA)改变,导致AR蛋白283个氨基酸的截短.正常人群未发现该移码突变,该突变尚未见文献报道.结论 基因水平确定了该家系为AR基因突变引起的完全性雄激素不敏感综合征男性假两性畸形家系,同时发现了1种AR基因病理性新突变.     

碳青霉烯类抗生素诱导耐药铜绿假单胞菌外膜蛋白D2表达与编码基因多点突变

目的 探讨对碳青霉烯类抗生素耐药的铜绿假单胞菌编码外膜蛋白D2(OprD2)基因变异与OprD2表达的关系.方法 由临床分离敏感铜绿假单胞菌,使用不同浓度亚胺培南与美罗培南含药琼脂平板法筛选耐药菌株.应用十二烷基磺酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)、凝胶成像系统分析OprD2.应用聚合酶链反应及测序分析OprD2基因编码区.结果 人工诱导能产生出与临床分离株一样的对碳青霉烯类抗生素耐药的菌株.在SDS-PAGE图谱上亚胺培南与美罗培南耐药株与同源敏感株相比均有OprD2的减少.测序结果显示在多株耐药菌中,OprD2基因编码区3个基因位点同时出现碱基突变:在+84位点产生突变,胞嘧啶突变为胸腺嘧啶(C→T);在+401位点突变(C→A),造成第134位氨基酸苏氨酸突变为天冬氨酸(Thr→Asp);在+959位点突变(A→G),造成第320位氨基酸赖氨酸突变为精氨酸(Lys→Arg).结论 同时出现3个或更多的碱基点突变可能导致铜绿假单胞萧OprD2缺失或表达减少,可能是对碳青霉烯类抗生素产生耐药性的原因.     

深圳地区结核分枝杆菌耐药分离株分子特征与表型特征相关性研究

目的 研究深圳地区2007-2008年分离的结核分枝杆菌耐药株分子特征与表型特征的相关性.方法 参照WHO/IUATLD标准,使用L-J药敏培养基,1%比例法药敏试验筛选针对异烟肼、利福平、链霉素、氧氟沙星、卡那霉素5种药物耐药或敏感的临床分离株,通过PCR扩增经筛选菌株的rpoB、katG、rpsL、rrs1、gyrAB、rrs2基因的相关序列,运用DNAStar和BLASTN进行序列分析,应用二倍稀释法测定其表型最低抑菌浓度(MIC)值.结果 筛得实验菌株123株,其中耐药株73株,全敏感株50株.异烟肼耐药株katG基因突变率为84.6%,突变位点全部为S315T或S315N.利福平耐药株rpoB基因突变率为93.6%,突变位点主要集中在S531L(30/44,68.2%)和H526D(9/44,20.5%)或H526R(1/44,2.3%).链霉素耐药株以rpsl基因突变为主,突变位点为K43R(19/27,70.4%)和K88Q(6/27,22.2%);rrs1基因突变较少见,仅491C→T(2/27,7.4%)及513A→C(1/27,3.7%);2个基因突变率合计为65.9%.氧氟沙星耐药株突变率为100%,以gyrA基因突变为主,突变位点包括D94A(2/11,18.2%)、S91P(4/11,36.4%)和A90V(3/11,27.3%),3个突变位点总突变率为81.8%(9/11);S95T存在于所有氧氟沙星耐药株及部分全敏感株gyrA基因中;gyrB未发现突变.卡那霉索耐药株rrs2基因突变率为61.1%;突变位点为1400 A→C(9/11,81.8%)和1483 G→T(2/11,18.2%).其他突变位点在全敏感株中未发现.临床耐药株同一耐药组别所包含耐药类型不同,相关耐药基因的突变位点相同,其MIC值基本一致;相关耐药基因突变位点不同,其MIC值存在明显差异.结论 结核分枝杆菌耐药基因突变存在一定的地域特性,表型特征因耐药基因突变位点不同存在耐药程度差异.     

肝癌高发区广西隆安县乙型肝炎病毒株全基因序列分析

目的 探讨肝癌高发区广西隆安县乙型肝炎病毒(HBV)株的全基因序列是否存在地域特殊性。方法 用套式PCR(nPCR)扩增该县HBV无症状携带者血清HBV全基因，用克隆测序法测序并做同源性对比。结果 本病毒株共3215个碱基，基因型为C，血清型为adw。其P基因区有40处发生碱基点突变，导致11个氨基酸改变；S基因区的前S1、前S2和S基因分别有11、2和3个碱基点突变，分别导致3、1、1氨基酸改变，未发现“a”区突变；X基因区共有6个碱基点突变，导致4个氨基酸改变，其中出现能影响e抗原表达的双突变(nt1762A→T、1764G→A)；未发现前C区基因突变，C基因有13个碱基发生突变，导致2个氨基酸改变。本病毒株与越南北部病毒株高于同为C基因型的上海株、北京株、西藏株。结论 未发现肝癌高发区的本例HBV基因C型的隆安株，基因虽有肝癌高发性，但无地域特殊性。     

应用反向线性杂交技术快速检测结核分枝杆菌利福平耐药性研究

探讨反向线性杂交技术(reverse line blot assay,RLB)在结核分枝杆菌利福平(RFP)耐药性快速检测中的应用价值.采用RLB将包含rpoB基因核心区的扩增产物与标记特异性探针的膜进行杂交,共对121株结核分枝杆菌进行RFP耐药性检测,并将结果与常规药敏实验进行比较.结果发现,121株中有71株对RFP耐药,56株为多重耐药株;采用RLB共检测到65株RFP耐药株rpoB基因核心区存在突变,其灵敏度为91.5%(65/71);50株RFP敏感株中均未检测到突变,则特异性为100%(51/51);56株多耐药菌株中,92.9%(52/56)存在rpoB基因核心区突变.因此,用RLB检测结核分枝杆菌RFP耐药株具有快速,高效,特异性和灵敏度高的优点,且可用于多耐药菌株的筛选,具有推广和潜在的临床应用价值.     

湖南省铜绿假单胞菌四种外排泵在多重耐药菌株中表达的分布及作用

目的 探讨湖南省多重耐药(multi-drug resistance,MDR)铜绿假单胞菌(Pseudomonasaeruginosa,Pa)中4种外排泵表达的分布和作用,以及相关调控基因的突变情况.方法 收集2008年湖南省临床首次分离非重复多重耐药Pa株40株,以外排泵抑制剂苯丙氨酸-精氨酸-β萘酰胺及4种药敏纸片进行外排泵表型初步筛选,PCR扩增膜融合蛋白基因及相关外排泵调控基因并测序;以18组非多重耐药菌株为对照研究分析Pa外排泵基因表达在多重耐药中的作用.结果 表型筛选MDR组菌株MexAB-OprM、MexCD-OprJ、MexEF-oprN、MexXY-OprM阳性率分别为45.0%(18/40)、30.0%(12/40)、42.5%(17/40)、12.5%(5/40);RT-PCR显示mexA、mexC、mexE和mexX表达阳性率分别为100%(58/58)、22.5%(9/40),45.0%(18/40)和22.5%(9/40).Real-time PCR半定量分析菌株超表达mexA和mexX阳性率分别为55.0%(22/40)和22.5%(9/40).非多重耐药组中,mexA与mexX real-time PCR超表达阳性率均为0(0/18).mexC和mexE RT-PCR表达阳性率分别为11.1%(2/18)、38.9%(7/18).两组相比,mexA与mexX超表达差异有统计学意义(P<0.001,P=0.045).随机挑选超表达mexA菌株Pa20出现mexR的164GTG→GAG、126Val→Gh替代;超表达mexX菌株Pa34出现mexZ的164GCG→GAG、55Ala→Glu.结论 湖南省多重耐药Pa株大多存在主动外排的耐药机制,其耐药与外排基因Mex-AB-OprM和MexXY-OprM超表达有关.主动外排泵MexAB-OprM和MexXY-OprM超表达大多存在其调控基因突变.     

Detection of mutations in mtrR gene in quinolone resistant strains of N.gonorrhoeae isolated from India

Background and Objectives: Emergence of multi-drug resistant Neisseria gonorrhoeae resulting from new genetic mutation is a serious threat in controlling gonorrhea. This study was undertaken to identify and characterise mutations in the mtrR genes in N.gonorrhoeae isolates resistant to six different antibiotics in the quinolone group. Materials and Methods: The Minimum inhibitory concentrations (MIC) of five quinolones for 64 N.gonorrhoeae isolates isolated during Jan 2007–Jun 2009 were determined by E-test method. Mutations in MtrR loci were examined by deoxyribonucleic acid (DNA) sequencing. Results: The proportion of N.gonorrhoeae strains resistant to anti-microbials was 98.4% for norfloxacin and ofloxacin, 96.8% for enoxacin and ciprofloxacin, 95.3% for lomefloxacin. Thirty-one (48.4%) strains showed mutation (single/multiple) in mtrR gene. Ten different mutations were observed and Gly-45 → Asp, Tyr-105 → His being the most common observed mutation. Conclusion: This is the first report from India on quinolone resistance mutations in MtrRCDE efflux system in N.gonorrhoeae. In conclusion, the high level of resistance to quinolone and single or multiple mutations in mtrR gene could limit the drug choices for gonorrhoea.     

Detection of Shigella gyrA mutations and correlations between gyrA mutations and quinolones resistance

Bacterial DNAgyrase is constituted by 2 A-sub-units and 2 B-subunits ,whichare encoded bygy-rAgene andgyrBgene ,respectively. Resistanceto quinolones in bacteriais mainly due tothe vari-ations of the bacterial DNAtopoisomerases ,typeⅡ(including DNAgyrase andtopoisomeraseⅣ) .This is because quinolones exert their antibacterialactivity by approachingthe bacterial DNAtopoiso-merases ,type Ⅱand disturbingtheir physiologicalfunctions. As variations occur in the bacterialDNA topoisomerase…     

Detecting drug resistant genetic mutation among pneumoconiosis patients complicated with tuberculosis in Mycobacterium tuberculosis L-forms application of PCR-SSCP technique in Huainan mining district

Objective: To study the relationship between drug resistant genetic mutation and drug resistance in Mycobacterium tuberculosis L-form, discuss the internal relationship between drug resistances and drug-resistant related genes and explore the value of PCRSSCP to clinical application. Methods: A total of 52 clinically isolated strains of tuberculosis L-form were collected among 97pneumoconiosis patients complicated with tuberculosis. The gene mutations of katG, rpoB and rpsL were detected by PCR-SSCP,and the results were compared with those analyzed by traditional antimicrobial susceptibility test(AST). Results: The gene mutation rates of katG, rpoB and rpsL by PCR-SSCP were respectively 57.70% (30/52), 65.38% (32/52) and 40.38% (21/52). The rate of reversion was 78.85%(41/52) and the result of drug-resistant genes was invariable. The results of AST showed that there were 40 (76.92%) multi-drug resistant strains in 52 clinically isolated strains. The number for three-drug resistant strain was 21(40.38%) and that of two-drug resistant was 19(36.54%), but only 12 (23.08%) strains were one drug resistant. The rate of total drug-resistance was 100%, but there were 15 strains of allied mutation of three genes, 16 of two mutations and 6 of only one by PCR-SSCP. The coincidences were respectively 71.43%, 84.12% and 50.00%. Then there was no significant difference between the allied mutations of multi-drug resistant gene and the mutations of only one drug resistant gene (P ＞ 0.05). Conclusion: PCRSSCP technique has a higher sensibility and specificity to detect the genes of katG, rpoB and rpsL in tuberculosis L-form among pneumoconiosis complicated with tuberculosis,and the detecting rate of two drug resistant strains and three drug resistant strains was higher. The combined application of PCR-SSCP and AST has advantages at earlier diagnosis and guidance of clinical medications.     

Mutations in the rpoB gene of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from China

Mutations in the 81-bp rifampin resistance determining region (RRDR) and mutation V176F locating at the beginning of the ropB gene were analyzed by DNA sequencing of 86 Mycobacterium tuberculosis clinical isolates (72 resistant and 14 sensitive) from different parts of China. Sixty-five mutations of 22 distinct kinds, 21 point mutations, and 1 insertion were found in 65 of 72 resistant isolates. The most common mutations were in codons 531 (41%), 526 (40%), and 516 (4%). Mutations were not found in seven (10%) of the resistant isolates. Six new alleles within the RRDR, along with five novel mutations outside the RRDR, are reported. None of isolates contained the V176 mutation.