应用低严格度—单引物聚合酶链反应对问号钩体中国参考株的…

Ｇ１、Ｇ２引物是对问号钩体具有特异性引物。分别用Ｇ１或Ｇ２单引物对问号钩体中国参考株进行前４个低严格度循环的ＰＣＲ扩增，扩增带谱显示赖型、犬型、致热型、秋季型、澳洲型、临海型、乌尔夫型、溶血型为一类，而爪哇型、拜伦型、波摩那型、七日热型、巴叶赞型塔拉索夫型、曼耗Ⅱ型是不与以上赖型等血清型本为一类，双曲钩体ａｔｏｃ型及伊利尼细丝体伊利尼型的扩增带谱与问号钩体截然不同。应用苯酚法提取的高纯度钩体ＤＮＡ     

问号钩体血清型参考株16S rRNA基因的PCR－SSCP分析

利用１６ＳｒＲＮＡ基因引物扩增了我国致病性钩体１４群１５型参考株及赖型０１７株ＤＮＡ，通过非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳，对各参考株的ＰＣＲ产物单链构象多态性进行了对比。结果显示在不同浓度凝胶及电泳条件下，１６株产物均有明显的２条单链，其中爪哇型、拜伦型、塔拉索夫型和曼耗Ⅱ型的国内参考株有相同的带型，而另１１型１２株的带型一致。此结果与Ｙａｓｕｄａ等（１９８７）和Ｒａ－ｍａｄａｓｓ等（１９９２）遗传学分种基本相符。     

早期钩体病患者血清钩体DNA聚合酶链反应和地高辛—硷性磷酸酶发光体探针杂交分析

作者从已建立的问号钩体基因文库中筛选合成一对引物G_1G_2,中国四川14份早期钩体病患者血清中的DNA经硫酸氰胍、二氧化硅和蛋白酶K纯化后,在G_1G_2引导下行聚合酶链反应(PCB),并以地高辛标记的同源探针行DNA印迹杂交,全部血清样品均获得确切地阳性结果。用地高辛—硷性磷酸酶发光体标记PCR扩增的同源DNA探针,与16株Yasuda基因组钩体作DNA印迹分析,其中8株存在同源单拷贝序列,它们皆为我国常见和流行的优势致病菌株,本研究结果表明:引物G_1G_2可用于四川钩体PCR检测和分析,PCR常规结合同源DNA探针杂交识别,能提高其敏感性和可靠性;地高辛—硷性磷酸酶发光体配合PCR等方法,可使微量DNA的检测和分析更趋完善。同时,本研究还提供了有价值的钩体DNA同源序列资料。     

PCR扩增52株钩体23S rRNA基因及其临床应用55例分析

采用犬型钩端螺旋体(以下简称钩体)Moulton株23SrRNA基因273-293位点和376—396位点的引物A和B,即5＇GATCTAATTCGCTGTAGCAGG~(3＇)及~(5＇)ACTTTCACCCTCTAT-GGTCGG~(3＇),对52株钩体进行PCR扩增。结果表明49型50株问号状钩体均发生特异性扩增,而双曲钩体patoc型PatocⅠ株及细螺旋illini型3055株钩体不出现特异性扩增。用引物A和B对1992年从井研、西昌两地收集的早期钩体病患者的早晚期血清进行PCR扩增,结果第一次血清55份(发病后1～5天),PCR阳性51例(92.72％),第二次血清55份(发病后6～60天),PCR阳性41例(74.55％)。由此表明PCR不仅可广泛用于钩体病的临床早期诊断,而且可用于检测不同病程患者血中钩体DNA。     

聚合酶链反应检测175例早期钩端螺旋体病患者血清钩体DNA的研究

作者设计并合成了钩端螺旋体(简称钩体)犬群大型Moulton株23S rRNA基因的一对引物,即引物A_1 5'GAT CTA ATT CGC TGT AGC AGG~3'及引物B_1 5'ACT TTC ACCCTC TAT GGT CGG~3'用于聚合酶链反应(PCR)检测不同群型的问号状钩体,结果该引物不能使双曲钩体、细螺旋体和其它致病微生物及人白细胞DNA等扩增特异性片段,并用该对引物扩增早期钩体病患者和正常人及其它疾病患者的血清标本(以临床确诊、血培养及MAT阳性为金标准),检测结果表明:PCR诊断钩体病的敏感性为92.00％,特异性为94.35％,准确性为92.54％,阳性预测值为98.17％,阴性预测值为78.13％,阳性拟然比为16.25,阴性拟然比为0.0848。由此表明PCR扩增钩体235 rRNA基因,是早期钩体病诊断的一种敏感、特异、快速而简便的方法。     

聚合酶链反应检测致病性钩端螺旋体微量DNA的研究

作者通过对黄疸出血群钩端螺旋体DNA的分子克隆和筛选,获得了两个重组DNA片段,其中一个具有广泛针对各群致病性构体的特性,另一个仅对黄疸出血群钩体起杂交反应。经DNA序列分析和限制性谱测定,分别合成两对聚合酶链反应寡核苷酸引物——引物B1、2和引物B3、4。以该引物对各群、型钩体微量DNA(0.1 ng)行聚合酶链扩增反应,引物B1、2能引导扩增全部致病性钩体DNA,引物B3、4则特异性地扩增黄疸出血群钩体DNA,非致病性钩体和其他微生物DNA均无扩增反应。结果表明,聚合酶链反应是一种灵敏度极高、针对性很强的DNA扩增技术,可用于钩体病早期诊断和流行病学分类鉴定。     

序列特异性引物多聚酶链反应方法进行大样本多基因的多态性鉴定(英文)

目的建立多个基因同时进行多态性分析的序列特异性引物多聚酶链反应(PCR-SSP)方法,以满足其在临床检验中进行基因多态性鉴定时的应用。方法应用优化后的PCR-SSP的方法分析以下基因的多态性:TNF-α-308A/G和-238G/A变异、IL-6-174G/C变异、CYP2D6*10B外显子第188位的C/T变异。结果应用同一个PCR扩增程序,可同时对多个基因、多个临床样本的基因多态性同时进行分析,基因型清晰,而且基因分型快速、准确。结论优化后的PCR-SSP适合对大样本、多个基因的单核苷酸位点变异进行多态性分析,值得在临床检验的应用中推广。     

66例早期钩体病患者血和尿标本的聚合酶链反应及生物素分子杂交分析

采用国际通用引物Ｇ１Ｇ２对６６例发病在一周内钩体病患者的血和尿标本进行了ＰＣＲ检测及生物素－链霉抗生素蛋白碱性磷酸酶体系标记的重组ＤＮＡ探针杂交分析。结果表明，ＰＣＲ技术结合生物素分子杂交分析，不仅排除了非特异性扩增，增加了可靠性，同时也提高了检测的敏感性（从７１．３％升至８６．１％）；经统计学分析发现早期尿标本的ＰＣＲ检测阳性率与同期血标本的ＰＣＲ检测阳性率没有统计学差别，由于尿标本易于收集和处理，所以对尿标本进行ＰＣＲ检测对钩体病的早期诊断和后期监测更值得重视和推广。     

聚合酶链反应-限制性片段长度多态性检测载脂蛋白E基因多态性及初步应用

目的 :建立聚合酶链反应—限制性片段长度多态性 (PCR- RFL P)分析结合 DNA直接银染技术检测载脂蛋白 E基因多态性。方法 :选择江苏地区汉族健康人 16 8例及冠心病 6 3例 ,PCR扩增 Apo E基因第 4外显子包含编码第 112位和第 15 8位氨基酸残基的基因序列 ,cfo I限制性内切酶酶切后电泳 ,银染色后分析 Apo E基因型。结果 :汉族健康人群及冠心病人群 Apo E基因型频率分别为 :ε2 /2 0 .6 % ,0 ;ε2 /3 11.9% ,14.3% ;ε2 /4 1.2 % ,4.8% ;ε3/4 10 .7% ,17.5 % ;ε3/3 75 .0 % ,6 1.9% ;ε4/4 0 .6 % ,1.6 % ;Apo E等位基因频率分别为 :ε2 7.14% ,9.5 2 % ;ε386 .31% ,77.78% ;ε46 .5 5 % ,12 .70 %。结论 :PCR- RFL P方法快速、简便、准确性和可靠性高 ,适合普通实验室开展及大规模研究     

赖型钩端螺旋体基因文库的构建及重组质粒pDC38的初步研究

应用质粒载体ｐＵＣ１８购建了黄疸出血群赖型钧体的基因文库，重组率８６％，重组子约１２０００个。以ＯｍｐＬ１基因片断作探针从该基因文库中筛出１０个阳性克隆，其中重组质粒ｐＤＣ３８与７型８株致病钩体（黄疸出血群赖型、大型、致热型、秋季型、澳大利亚型、波摩那型、流感伤寒群临海型）ＤＮＡ杂交有杂交信号；与非致病的双曲钩体、细丝体，大肠杆菌和２型问号钩体（爪哇型、拜伦型）ＤＮＡ无杂交信号。     

阳春砂实时荧光定量PCR内参基因的筛选

【目的】筛选稳定表达的内参基因,用于阳春砂不同发育时期的果皮和种子团中基因表达量实时荧光定量PCR(qRTPCR)检测的校正。【方法】以阳春砂3个不同发育时期的果实(分为果皮和种子团)为材料,根据高通量测序得到的转录组和表达谱数据,选择5个表达稳定的常用内参基因β-actin、EF-1α、GAPDH、PGK和TUA作为候选基因,并利用qPCR技术检测它们在不同样品中表达水平的变化,使用GeNorm和NormFinder软件对基因的稳定性进行分析。【结果】5个内参基因在不同发育时期的果皮和种子团中的表达稳定性有明显的差异,其中GeNorm分析得到的内参基因的稳定顺序为:EF-1α=TUAPGKGAPDHβ-actin,NormFinder的分析结果中稳定性最好的是EF-1α,其次为TUA,其他3个内参基因稳定性的排列顺序与GeNorm软件的结果一致。【结论】可选用EF-1α和TUA作为阳春砂果实发育过程中基因表达量差异分析的双内参基因。     

定量PCR分析人肺癌细胞NCI-H1299基因表达的内参基因选择

目的 评价实时荧光定量PCR分析人肺癌细胞NCI-H1299中Merml/Wbscr22基因表达时6个候选内参基因表达的稳定性,筛选最适的内参基因.方法 选择ACTB、B2M、GAPD、HPRT1、RPL32及TBP作为候选内参基因,利用geNorm,NormFinder及RefFinder程序分析实时荧光定量PCR数据,评价6个候选内参基因在NCI-H1299细胞株中的表达稳定性,筛选最适内参基因,同时观察选用不同内参基因对目的基因相对表达量分析的影响.结果 6个候选内参基因在NCI-H1299细胞株中的表达稳定性由强至弱排序为:RPL32＞ HPRTl＞ GAPD＞ ACTB＞ TBP＞ B2M,选择不同内参基因影响目的基因Merml/Wbscr22的相对表达量.结论 RPL32+ HPRT1是实时荧光定量PCR分析人肺癌细胞NCI-H1299中Merml/Wbscr22基因表达的最适内参基因组合.     

胚胎发育早期转基因的PCR检测研究

转基因在受精卵中的整合时间对于转基因动物的建立十分重要。采用ＷＡＰ基因调控序列指导的人Ｇ－ＣＳＦ基因为构件，对小鼠受精卵进行显微注射。对培养至１细胞期、２细胞期和８细胞期的胚胎进行ＰＣＲ检测。结果表明，三个时期转基因的检出率分别为１００％、７７．７７％和４４．４４％。说明随着培养时间的增加，转基因逐渐丢失。     

近交系小鼠H-2基因的PCR检测方法

目的建立快速、灵敏、简便的H-2基因检测方法。方法针对近交系小鼠的H-2D区和H-2K区序列,设计两对特异性引物,分别进行DNA扩增,扩增产物通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,确定H-2基因型。结果通过PCR反应扩增小鼠H-2D区和H-2K区的基因产物,可以区分不同的近交系小鼠的H-2基因型,进而可以区分出不同品系的近交系小鼠。结论利用分子生物学方法进行近交系小鼠遗传学检测,弥补了过去各种方法的不足,并且PCR方法还具备快速、简便、成本低廉、便于普遍推广并易于和国际接轨等优点。所以通过PCR方法可以进行小鼠H-2基因型检测。     

湖北地区汉族人群IL-1RN第2号外显子T+8006C位点多态性分布的研究

目的 探讨湖北地区汉族健康人群白细胞介素-1受体拮抗剂基因(IL-1RN)第2号外显子T+8006C位点多态性的分布。方法 采用聚合酶链反应和限制片段长度多态性(PCR—RFLP)方法检测了251名湖北地区汉族健康人群IL-1RN(+8006)位点多态性,并结合文献进行不同种族间的比较分析。结果 湖北地区汉族健康人群基因型以TT型最为常见,其次为TC型,CC型较为罕见,其频率依次为82.9％、16.7％、0.4％;其等位基因以T型最为常见,其次为C型。与美国、德国、日本等国家人群相比,该位点多态性均存在极显著性差异(P<0.005)。结论 湖北地区汉族人群IL-1RN第2号外显子+8006位点存在T/C多态性,其在不同种族间的分布可能存在显著性差异。     

2例猪弓形虫病的特异PCR诊断与虫株分离

目的应用特异PCR方法诊断猪弓形虫病并通过动物接种的方法分离弓形虫虫株。方法用涂片镜检、特异PCR方法检测病料,用经PCR方法检测为阳性的病料接种小白鼠,经连续传代分离弓形虫虫株。结果病例1的肺及肺门淋巴结涂片镜检见有少量的弓形虫滋养体,但病例2的颌下淋巴结及肺门淋巴结涂片镜检未见有弓形虫滋养体。用特异PCR方法检测两个病例的上述病料,均得到弓形虫的特异条带。小白鼠接种试验从每个病例均分离出一个弓形虫虫株。结论特异PCR诊断方法能较快速、准确地检测猪弓形虫病,小白鼠接种试验是一种较好的弓形虫虫株分离方法。     

运用TaqMan探针实时荧光PCR技术检测AKAP10基因2073A/G单核苷酸多态性

目的 建立一套以TaqMan探针实时荧光PCR技术为基础的单核苷酸多态性(SNP)检测平台,并用于AKAP10基因2073A/G SNP的检测. 方法 设计一对TaqMan探针加入到PCR反应系统中,并设立阴阳对照,对AKAP10基因2073A/G SNP进行分型.同时验证部分样本PCR产物的直接测序结果 . 结果 运用TaqMan探针实时荧光PCR技术对AKAP10基因2073A/G SNP检测结果 准确,与PCR产物的直接测序结果 完全一致.AKAP10基因2073A/G多态性分布与性别年龄无关(P>0.05).非条件logistic回归分析提示,AKAP10基因2073A/G突变型(AG+GG)与野生型AA相比增加结直肠癌的发生风险(OR=1.52, 95% CI:1.07～2.15, P=0.019). 结论 通过合理设计TaqMan探针,设立阴阳性对照,应用TaqMan探针实时荧光PCR技术成功建立起一套SNP检测平台.AKAP10基因2073A/G多态性与结直肠癌发病存在显著相关性.