DNMT3B基因启动子区-579G>T多态性与江苏宿迁地区人群胃癌易感性的分析

目的分析DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)基因启动子区-579GT单核苷酸多态性(SNP)与江苏宿迁地区汉族人群胃癌(GC)易感性的关系。方法病例组为233例胃癌患者,对照组为208例体检健康者。提取外周血基因组DNA,利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测DNMT3B启动子区-579GT位点的基因频率分布。结果 TT基因型与GT+GG基因型频率在胃癌组和对照组中差异有统计学意义(χ~2=6.517,P0.05)。按年龄分组后,年龄≥60岁的胃癌组和对照组人群间比较,TT与GT+GG基因型频率差异有统计学意义(χ~2=4.728,P0.05)。按性别分组后,2组间基因型频率差异均无统计学意义(χ~2=3.541,P0.05;χ~2=3.676,P0.05)。结论 DNMT3B-579GT与胃癌的遗传易感性有关联,可作为胃癌遗传易感性风险因素。     

江苏宿迁地区汉族人群DNMT3B基因启动子区-149C>T和-579G>T多态性与食管癌易感性的分析

目的 分析江苏宿迁地区汉族人群DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)基因启动子区-149C>T和-579G>T单核苷酸多态性(SNP)与食管癌(EC)易感性的关系。方法 利用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术分析246例食管癌患者及240例健康对照者的DNMT3B启动子区-149C>T和-579G>T位点的基因型。结果 在-149C>T位点中,食管癌组和对照组的基因型TT与CT比较差异无统计学意义(χ2=0.089,P>0.05)。在-579G>T位点中,食管癌组和对照组的基因型TT与GT+GG比较差异无统计学意义(χ2=0.649,P>0.05)。在年龄和性别分组中,两位点在食管癌组和对照组间基因型频率差异均无统计学意义(χ2=0.044～0.876,P值均>0.05)。结论 DNMT3B基因启动子区-149C>T和-579G>T与食管癌遗传易感性无相关性。     

DNMT3 B基因异常表达与肝癌发生的相关性研究

目的 探讨DNMT3B和肝癌发生的关系.方法 用实时荧光定量RT-PCR方法分析正常肝细胞系、肝癌癌旁细胞系及肝癌癌细胞系中DNMT1、DNMT3A、DNMT3B的表达谱,以及DNMT3B表达抑制后在肝癌细胞系SMMC-7721中出现表达上调的与肿瘤发生相关的基因PDCD4和MBD3的表达.结果 DNMT1,DNMT3A,DNMT3B在肝癌细胞系中存在高表达的趋势,表达水平一致性的明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞系,提示这些酶与肝癌的发生相关.结论 DNMT3B表达抑制后肝癌细胞系SMMC-7721中与肝癌发生相关的MBD3和PDCD4基因表达水平上调,表明DNMT3B沉默后,诱导了下游肿瘤抑制基因的过表达,推测DNMT3B在肝癌发生中通过某种机制调控下游肿瘤抑制基因的表达.     

DNMT3A基因突变对急性髓系白血病预后影响的Meta分析

目的采用Meta分析评估DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)基因突变对急性髓系白血病(AML)患者预后情况的影响。方法检索中国生物医学文献数据库、中国知识资源总库、维普资讯网、万方数据知识服务平台,纳入国内关于DNMT3A基因突变和AML预后水平的相关临床对照研究,检索时限为2008-2017年。剔除不符合要求的文献,计算入选文献的异质性,漏斗图检验偏倚。采用Revman5.3软件进行Meta分析。结果共纳入11项研究,1 323例患者。Meta分析结果显示,AML患者DNMT3A基因突变组第一疗程缓解率和总生存率较之未突变组更低,差异有统计学意义(OR=0.67,95%CI:0.46～0.99,P=0.04和OR=0.44,95%CI:0.27～0.72,P=0.001);AML患者DNMT3A基因突变组完全缓解与未突变组差异无统计学意义(OR=0.75,95%CI:0.45～1.24,P=0.26)。结论 DNMT3A基因突变是AML患者第一疗程缓解率和总体生存率的危险因素,但DNMT3A基因突变对AML患者的完全缓解率无明显影响。     

IL-1B和TNFα基因多态性与胃癌易感性的关系

目的探讨汉族人群中白介素1B-511、-31两个位点（IL-1B-511、IL-1B-31）和肿瘤坏死因子-308位点（TNFα-308）基因多态性与胃癌易感性之间的关系。方法采用荧光定量PCR方法，对178名胃癌患者及196名健康人进行基因分型，评价胃癌患者和健康对照组之间的基因分型。结果IL-1B的-511，-31两个位点基因多态性在胃癌患者和正常人之间的分布有明显差异（P=0.027），胃癌患者IL-1B-511T型增加，IL-1B-31C型增加。TNFα-308位点胃癌患者和健康对照组的基因型均以G型为主，基因型分布无明显差异（P〉0.05）。结论IL-1B-511位点T型或IL-1B-31位点C型会增加患胃癌的机率（OR=1．38），而TNFα-308基因型不会增加胃癌的发病风险。     

Let-7家族启动子区多态性与胃癌的关联研究

目的探讨let-7i启动子区rs10877887和let-7a-1/let-7f-1/let-7d簇启动子区rs13293512多态性与胃癌发生的关系。方法采用TaqMan探针法检测172例胃癌患者和224例健康对照中rs10877887和rs13293512的分布频率,运用χ2检验分析其与胃癌的相关性。结果胃癌患者中rs10877887CC、CT/CC基因型和C等位基因频率明显高于健康对照组(20.9%vs.13.4%,63.4%vs.53.1%,42.2%vs.33.3%),调整优势比(OR)分别为1.98、1.53和1.46(P=0.02、0.04和0.01)。rs13293512位点在胃癌组和健康对照组中的分布差异无统计学意义(P0.05)。结论 let-7i启动子区rs10877887多态性与中国汉族人群胃癌的发病有关。     

北京地区汉族人群胃癌发生与EBVA73基因外显子区A157154C多态性的相关性研究

目的 探讨北京地区EBV A73基因外显子区A157154C多态性与胃癌的相关性。方法 采用病例-对照研究方法,以聚合酶链反应(PCR)联合DNA测序检测29例EBV IgM+胃癌患者和40例同期健康体检者EBV A73基因外显子157154 nt位点的基因型和等位基因频率。结果 胃癌组A157154C C等位基因频率和CC基因型频率明显高于对照组(χ²=8.997,P=0.003; χ²=6.801,P=0.033)。C等位基因携带者患胃癌的风险是A等位基因携带者的2.95倍(OR=2.95,95% CI=1.44～6.04)。胃癌组男性患者C等位基因频率显著高于女性患者(χ²=5.392,P= 0.020)。两组间比较显示A157154C不同基因型与年龄、性别、吸烟、饮酒和临床分期均无相关性。结论 EBV A73基因A157154C CA+CC基因型可能是中国北方地区汉族人群胃癌发病的危险因素。     

LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感性的研究

目的通过对江西地区汉族胃癌患者和正常人群中淋巴毒素-α（LTA）基因单核苷酸多态（single nucleotide polymorphism,SNP）位点rs909253基因型的检测,探讨rs909253位点与胃癌患者易感性的关系。方法利用Sequenom-MassArray-IPLEX检测194例胃癌和250例对照LTA基因多态位点rs909253的基因分型,并利用非条件logistic回归对检测结果进行相关统计。结果 LTA rs909253多态位点GG、GA、AA三种基因型在胃癌的频率分别为26.4%、52.0%和21.6%,与对照组（35.6%、46.4%和18.0%）相比,统计学上无显著意义（χ2=4.403,P=0.111）;但胃癌组和正常组的等位基因频率分布差异临近显著,P值达0.059;对年龄和性别进行校正后,携带等位基因G的胃癌发病风险有所增加（OR=1.315,95%CI：1.001~1.728）。结论江西汉族人群胃癌的遗传易感性可能与LTA基因rs909253位点的单核苷酸多态性有关,G等位基因为其发病的危险因素。     

Runx3基因启动子区甲基化与胃癌的关系

目的通过检测胃癌Runx3基因启动子区域甲基化状态，来探讨Runx3基因启动子区域甲基化在胃癌发生和发展过程中的临床意义。方法采用DNA甲基化特异性PCR（MSP）技术对37例胃癌患者手术切除肿瘤组织及其癌旁组织Runx3基因启动子区域甲基化进行检测。结果Runx3基因在37例胃癌及其癌旁组织中甲基化率分别为40．5％（15／37）和8％（3／37）。结论Runx3基因启动子区甲基化可能是肿瘤特异性的（P＜0．05），可作为胃癌早期诊断的分子标记物。     

调控miRNA成熟通路的相关基因多态性与四川汉族人群胃癌的相关性研究

目的探讨调控微小RNAs(miRNAs)成熟通路相关基因与四川汉族人群胃癌易感的相关性。方法纳入207名四川汉族胃癌患者(病例组)和219名性别与年龄和病例组匹配的四川汉族人群(健康对照组)。运用高分辨率熔点曲线法(HRM)做基因分型,分别检测探讨调控mi RNAs成熟通路相关基因的2个SNP位点(DGCR8基因内的rs3757 G/A和AGO1基因内的rs636832A/G)的基因型和等位基因,比较2组人群基因及等位基因频率分布。结果病例组与对照组的基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡;2个位点的基因型频率在病例组和对照组之间无明显差异:rs3757G/A为χ2=4.31,P=0.12;rs636832A/G为χ2=0.65,P=0.72。同时,这2个位点的等位基因频率在2组之间亦无明显差异:rs3757G/A为χ2=1.22,P=0.27,OR=1.22,95%CI为0.85-1.77;rs636832A/G为χ2=0.65,P=0.42,OR=0.88,95%CI=0.65为1.19。结论本组数据并未发现调控mi RNA成熟通路的相关基因的rs3757G/A和rs636832A/G位点的基因多态性与四川汉族人群胃癌的易感相关。     

DNA修复基因多态性与胃癌易感性的关系

目的分析中国西南地区人群DNA修复基因XRCCl和XPD基因多态性分布,探讨XRCCl和XPD基因多态性与胃癌发病风险的关系。方法采用1：1病例对照研究方法,采用基因测序法检测160例胃癌患者及160例正常人外周血GSTPl基因XPDAsp312Asn,XRCClArgl94Trp,和XRCClArg280His多态性,进行胃癌风险分析。结果胃癌组与正常对照组相比,XPD312、XRCCl280位点的多态性分布频率无明显差异,而XRCCl194Trp的分布频率在病例组和对照组中分别为17．2％和7．3％,具有统计学差异。XRCCl194Trp等位基因的个体其胃癌风险增高（OR=2．72,95％CI=1．04~7．24,P=0．027）。结论XRCClArgl94Trp基因多态性可增加人群患胃癌的风险,XPDAsp312Asn、XRCClArg280His基因多态性与胃癌易感性无关联。     

单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性

目的 探讨单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性.方法 应用基因测序仪对120例胃癌患者与112例健康对照者的血样EZH2rs734004、r734005、rs2072407、rs6464926及rs12670401多态性进行测序,再应用组织芯片技术与免疫组化检测80例同一来源胃癌组织与24例癌旁正常胃黏膜组织EZH2蛋白的表达情况.结果 rs12670401最小等位基因C与rs6464926最小等位基因T增加,其胃癌发生风险较大(OR＞1),而其余三种多态性则会降低胃癌发生风险.经Codominant模型、Dominant模型及Recessive模型分析,rs12670401CC与rs6464926TT构成比显著高于对照组,可增加胃癌的发生风险(OR＞1),胃癌患者中杂合基因rs2072407TC、rs734005TC及rs734004CG构成比均显著低于对照组,可降低胃癌的发生风险(OR＜1).结论 EZH2基因单核苷酸多态性与胃癌易感性存在较为紧密的关系,且不同SNP等位基因对胃癌发生具有不同影响.     

汉族人群CNOT6基因多态性与胃癌易感性的关系

目的探讨汉族人群中CNOT6基因3'UTR区 +3908 C>T多态与胃癌易感性的关系。方法本病例对照研究人群为年龄和性别匹配的960例经手术病理证实的胃癌患者和972例对照健康者。采用聚合酶链式反应限制性片段长度多态性(PCR RFLP)分析个体CNOT6基因3'UTR区 +3908 C>T多态的基因型。以比值比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval,CI)表示相对危险度。以logistic回归模型计算各基因型的OR及其95%CI。结果对于rs10069多态,TT/CT基因型携带者患胃癌的风险比CC基因型携带者显著降低(OR=0.74; 95%CI=0.60~0.93), 在<56岁患者中关联更显著。并且,CC基因型和幽门螺杆菌感染对胃癌发病风险存在累积作用(OR=2.32; 95%CI=1.41~3.82)。结论CNOT6基因+3908 C>T多态与胃癌易感性相关。     

细胞程序性死亡-配体1基因启动子区rs10815225多态性与结直肠癌的关联研究

目的探讨位于细胞程序性死亡-配体1(PD-L1)基因启动子区的rs10815225多态性与结直肠癌的相关性。方法直接测序法分析215例结直肠癌患者和236例体检健康者rs10815225多态性,定量PCR检测65例结直肠癌组织中PD-L1 mRNA的表达变化。结果与GG基因型相比,CG基因型显著降低了结直肠癌的发病风险(OR=0.48,95%CI 0.28~0.83,P=0.01)。双荧光素酶报告基因结果显示,与rs10815225G等位基因相比,rs10815225C对应的荧光素酶活性显著降低(P<0.05)。基因型—表型结果显示,携带rs10815225CG基因型结直肠癌患者中PD-L1 mRNA表达明显低于GG基因型携带者(P<0.05)。结论PD-L1基因启动子区rs10815225CG基因型可能通过降低基因转录活性和PD-L1 mRNA表达,从而降低中国汉族人群结直肠癌的发病风险。     

硒蛋白S基因多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性

目的探讨硒蛋白S(SelS)基因rs34713741位点多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性。方法用聚合酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)检测119例结直肠癌患者及144例体检健康者SelS基因型和等位基因频率,并经测序验证,分析体检健康者与结直肠癌患者SelS基因rs34713741位点基因型频率、等位基因频率的差异,并对结直肠癌进行分层分析。结果 SelS基因rs34713741位点CC、CT和TT基因型及C、T等位基因在结直肠癌患者和健康对照者间差异有统计学意义(χ2分别为7.598,7.134,P均0.05),中国人群中CT基因型患结直肠癌的风险是CC基因型的1.597倍(OR=1.597,95%CI:1.096~2.326)。对结直肠癌组分层分析发现,与CC基因型比较,CT基因型和TT基因型在55岁组(OR=1.870,95%CI:1.123~3.313,P0.05),女性组(OR=1.953,95%CI:1.076~3.545,P0.05),远侧结直肠癌组(OR=1.617,95%CI:1.060~2.466,P0.05),中分化腺癌组(OR=2.070,95%CI:1.274~3.361,P0.05)分布频率明显升高。结论 SelS基因rs34713741位点多态性与结直肠癌的发病有关,T等位基因可能是中国人群结直肠癌发病的危险因素之一。