基于网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎机制

目的 运用网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎(AS)的关键靶点和分子机制。方法 利用TCMSP数据库检索杜仲-牛膝药对的活性成分,预测其对应靶点;利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、PharmGkb数据库检索AS疾病相关靶点,利用Uniprot数据库将预测靶点和疾病靶点名称标准化后筛选出交集靶点,利用Cytoscape3.9.1绘制并分析中药-成分-靶点-疾病网络图。将共同靶点导入STRING数据库获得蛋白质互作网络并利用CytoNCA筛选出核心靶点。将共同靶点导入富集分析库(Metascape)数据库进行GO、KEGG富集分析。利用Auto Dock Tools1.5.7软件进行分子对接。结果 杜仲-牛膝有效活性成分35个,预测对应靶点150个,疾病相关靶点1914个,主要活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、汉黄芩素,核心靶点为白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、C-X-C基序趋化因子配体8(CXCL8)。富集分析方面：...     

基于网络药理学探讨杜仲-牛膝治疗股骨头坏死的分子机制

目的:探讨"杜仲-牛膝"药对治疗股骨头坏死(osteonecrosis of the femoral head,ONFH潜在有效成分和作用分子机制。方法:利用中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)完成对"杜仲-牛膝"药对的活性成分和药物活性成分靶点的收集、筛选和预测;通过疾病数据库收集股骨头坏死相关的作用靶点;将获得的关键靶点基因上传至STRING数据库进行分析,并通过可视化软件构建分析蛋白相互作用网络(protein-protein interaction,PPI)对关键靶点蛋白进行富集分析。结果:共获得杜仲、牛膝共同主要有效活性成分45个、140个药物靶点蛋白和1159个股骨头坏死相关基因;药物与疾病共有靶点47个;PPI网络分析IL-6、TNF、TP53、MAPK1、VEGFA、EGF、JUN、EGFR、NOS3、CCL2等可能是"杜仲-牛膝"治疗ONFH的潜在关键靶点;其通过参与成骨成血管、细胞的分化与凋亡、炎症反应及全身应激反应等主要作用通路以调控ONFH疾病的治疗过程。结论":杜仲-牛膝"药对治疗股骨头坏死的作用具有多成分、多靶点、多功能、多调控通路的特点。初步揭示了其作用的关键靶点、主要信号通路和涉及的生物学过程,为机制的后续研究及实验验证提供了明确的依据与方向。     

基于网络药理学和分子对接探讨“杜仲-牛膝”药对治疗骨质疏松的分子机制

目的:运用网络药理学和分子对接的方法探讨“杜仲-牛膝”药对治疗骨质疏松的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选杜仲、牛膝含有的活性成分及作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET和CTD数据库收集骨质疏松（OP）相关靶点基因;采用Cytoscape 3.8.0软件和STRING数据库进行“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建与分析;FunRich3.1.3软件DAVID数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG） 富集分析（P<0.05）;运用Maestro version 11.5对主要活性成分及靶点蛋白进行分子对接。结果:获得“杜仲-牛膝”药对治疗OP的活性成分共42个和133个有效靶点;获得251条GO生物过程和90条相关信号通路,涉及PI3K-AKT、TNF、Wnt、HIF-1、MAPK信号通路等。结论:“杜仲-牛膝”药对可能通过调控细胞增殖、分化与凋亡、骨代谢来治疗OP,具有多成分、多靶点、多系统的特点,为系统阐明“杜仲-牛膝”药对主要成分治疗OP的分子机制提供了参考。     

基于网络药理学探讨“杜仲-牛膝”治疗腰椎间盘突出症的分子机制

目的 探讨“杜仲-牛膝”治疗腰椎间盘突出症（LDH）的潜在有效成分和分子作用机制。方法 利用TCMSP和PharmMapper完成对“杜仲-牛膝”药对有效成分和有效成分靶点的筛选预测；通过相关疾病数据库获取LDH相关的作用靶点；利用Venny分析获取此药对治疗LDH的潜在靶点，将获得的潜在治疗靶点基因上传至STRING数据库进行分析，并通过可视化软件分析蛋白相互作用网络（PPI），获得药物治疗疾病的关键靶点；利用DAVID数据库对关键靶点蛋白进行生物富集分析。结果 获得“杜仲-牛膝”的有效成分共45个，其中共同有效成分3个，有效成分作用靶点共287个；LDH疾病靶点基因506个，药物作用于疾病的可能潜在靶点62个；PPI网络分析表明IL6、TNF、IL1B、ALB、FN1、MMP9、AKT1、JUN、PTGS2、TP53等可能是“杜仲-牛膝”治疗LDH的核心靶点；主要通过RNA聚合酶II启动子转录正调控、调节炎症及免疫反应、调节细胞增殖和细胞凋亡、调节血管生成及对缺氧反应等生物学进程，参与TNF信号通路、Toll样受体信号通路、破骨细胞分化、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路。结论 “杜仲-牛膝”治疗LDH主要通过以TNF、Toll样受体、破骨细胞分化、PI3K-Akt、MAPK等为主的多条信号通路下的靶基因，对炎症反应、氧化应激、细胞增殖分化及细胞凋亡等生物学进程产生调控作用，进而达到治疗LDH的目的。     

基于网络药理学探讨牛膝治疗骨关节炎的分子机制

目的基于网络药理学探讨牛膝可能的物质基础,分析牛膝治疗骨关节炎可能的分子机制。方法通过TCMSP数据库挖掘获取牛膝的活性成分、作用靶点,GeneCards和OMIM数据库预测和筛选牛膝活性成分治疗骨关节炎的作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String 10.0构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,最后通过GO分析和KEGG通路富集分析牛膝防治骨关节炎的作用机制。结果共筛选得到牛膝180个活性成分,涉及1035个作用靶点。结论网络分析结果表明,牛膝主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路来发挥治疗骨关节炎作用。研究体现了牛膝多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展牛膝治疗骨关节炎作用机制的研究提供了新的思路与方法。     

基于网络药理学和分子对接探讨威灵仙-牛膝药对治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接技术，探讨威灵仙-牛膝药对有效活性成分、潜在靶点及其治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 TCMSP数据库检索威灵仙-牛膝药对活性成分及作用靶点，GeneCards、DisGeNET数据库检索RA相关靶点，得出交集靶点，运用Cytoscape 3.7.1软件，构建“疾病-药物-有效成分-靶点”网络图，构建PPI网络并进行GO和KEGG分析，并运用Auto Dock软件进行分子对接。结果 得到威灵仙-牛膝药对有效活性成分19个，对应靶点94个，RA相关靶点5589个，交集靶点72个；主要作用靶标有CAS P3、TP 53、CCND1等；涉及PI3K-Akt、MAPK及p53通路等。结论 本研究以网络药理学和分子对接技术为基础，阐明了威灵仙-牛膝药对通过多成分、多靶点、多通路治疗RA的作用机制。     

基于网络药理学探讨牛膝-钩藤药对治疗糖尿病合并高血压的作用机制

目的：基于网络药理学技术研究牛膝-钩藤药对治疗糖尿病合并高血压的作用机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索牛膝、钩藤的活性成分及相关作用靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点”相互作用网络图;在人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)、人类基因数据库(GeneCards)、DrugBank数据库及疗效药靶数据库(therapeutic target database, TTD)中筛选糖尿病、高血压的相关靶点,与活性成分靶点进行映射,并绘制“活性成分-疾病”交集靶点韦恩图。利用STRING在线分析平台分析交集靶点的相互作用关系,利用CentiScaPe 2.2插件进行网络拓扑分析,筛选出牛膝-钩藤治疗糖尿病合并高血压的潜在核心靶点。采用基因注释和资源分析数据库(Metascape)对潜在核心靶点进行基因本...     

基于网络药理学探讨杜仲治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨杜仲治疗类风湿关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选杜仲的活性成分及其作用靶点;利用GeneCards及OMIM数据库检索RA相关靶点基因,并借助String数据库、Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、活性成分-靶点网络;通过David数据库进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:筛选后得到杜仲活性成分28个、作用靶点181个、RA相关靶点4822个、杜仲治疗RA的潜在作用靶点135个。包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt serine/Threonine kinase1,AKT1)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、IL-1β等。GO富集分析获得生物过程561条,细胞组分60条和分子功能117条。KEGG富集分析得到156条通路,涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGEs)-晚期糖基化终末产物受体(Receptor of AGEs,RAGE)信号通路、脂质和动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、IL-17信号通路、缺氧诱导因子-1(Hypoxia Inducible Factor-1,HIF-1)信号通路等。结论:杜仲通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗作用,为临床应用提供理论依据。     

基于网络药理学探讨山茱萸治疗骨质疏松症的作用机制

目的:基于网络药理学方法分析山茱萸治疗骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的药理机制.方法:通过中医药系统药理学平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)数据库及相关文献获取...     

糖皮质激素性骨质疏松症的预防

目的 研究鲑鱼降钙素注射液对糖皮质激素性骨质疏松症的预防作用.方法 采集来我院就诊的由于慢性疾病使用糖皮质激素导致的糖皮质激素性骨质疏松症患者65名,年龄在70～85岁之间.按照性别随机分为两组:治疗组和对照组.治疗组给予鲑鱼降钙素注射液治疗,对照组不给药.结果 实验组的骨密度大于对照组,经统计学检验,P<0.05,结果有统计学意义.表明鲑鱼降钙素注射液能够预防糖皮质激素性骨质疏松.结论 鲑鱼降钙素注射液可以预防糖皮质激素性骨质疏松症.     

基于网络药理学探究杜仲治疗高血压作用机制

目的采用网络药理学方法探究杜仲治疗高血压的作用机制。方法利用TCMSP数据库,对影响杜仲吸收、分布、代谢和排泄行为的活性成分进行筛选,并运用Uniport数据库预测作用靶点,利用GeneCards数据库获取高血压作用靶点;采用Cytoscape3.6.1软件将药物作用靶点和疾病靶点进行映射,运用STRING11.0数据库构建映射靶点蛋白互作网络;最后利用R软件进行GO功能富集分析和KEGG通路分析。结果通过对杜仲活性成分、作用靶点查找与筛选,获得杜仲有脂醇二葡萄糖苷、槲皮素、山奈酚、β-胡萝卜素、β-谷甾醇等27个主要活性成分,作用靶点181个,并绘制出杜仲的活性成分-作用靶点网络图;用GeneCards数据库获取高血压相关靶点703个,经在线工具分析,获取75个杜仲的活性成分与高血压共同作用靶点;GO和KEGG富集分析提示:杜仲参与多种生物学过程调控,其可能通过抑制cAMP活性和钙离子内部流量、调节NO和肾素-血管紧张素系统,舒张血管并增加冠脉流量来发挥降压活性。结论杜仲可通过多成分协同作用,实现多通路、多靶点的降血压作用。     

中药治疗糖皮质激素性骨质疏松症的药理研究进展

正糖皮质激素(Glucocorticoid,GC)具备免疫抑制及抗炎效果,被广泛应用于抗移植免疫排斥、自身免疫疾病、感染及肿瘤等治疗。但长期或大剂量使用GC,50%以上的患者会发生骨量流失,是引发继发性骨质疏松症(Osteoporosis,OP)即医源性OP最主要的原因~([1])。中医学认为激素是外源性"纯阳""邪热"之品~([2]),长期大量作用于人体后导致肾失封藏,肾之阴阳失衡,肾精耗损,肾精亏虚无以充实骨骼,骨失濡养而致OP,属中医"肾虚骨痿""骨痹"范畴。糖皮质激素性骨质疏     

基于网络药理学探讨牛膝-王不留行治疗糖尿病勃起功能障碍大鼠的机制研究

目的 为了探索牛膝-王不留行治疗糖尿病勃起功能障碍大鼠的靶点、机制。方法 通过TCMSP数据库收集牛膝-王不留行活性成分及潜在靶点;通过GeneCards数据库和DisGeNET数据库收集糖尿病勃起功能障碍相关的疾病靶点,并与药物活性成分靶点取交集得到共同靶点,进行PPI分析;使用Cytoscape构建可视化“药物-靶点-疾病”网络并进行分析,通过R语言对共同靶点进行GO富集与KEGG富集分析。通过腹腔注射链脲佐菌素（STZ）溶液（55 mg·kg^-1）构建糖尿病大鼠模型,予以阿扑吗啡（APO）皮下注射（100 ug·kg^-1）筛选糖尿病勃起功能障碍（DMED）模型。造模成功后予以牛膝-王不留灌胃干预。通过APO诱导来评估大鼠勃起功能,运用HE染色观察大鼠阴茎海绵体组织结构变化,采用PCR和Western blotting方法检测组织相关蛋白及mRNA的表达,以验证牛膝-王不留行对DMED治疗作用及机制。结果 网络药理学研究结果表明ICAM-1和NOS是牛膝-王不留行在治疗DMED中的关键靶点。实验结果表明牛膝-王不留行可以明显的改善DMED大鼠的勃起功能,同时可以明显改善阴茎海绵体组织结构结构。与模型组相比,药对可以抑制大鼠阴茎组织中ICAM-1蛋白及mRNA的表达,并促进NOS蛋白及mRNA的表达。结论 牛膝-王不留行通过抑制ICAM-1和促进NOS蛋白及mRNA的表达,进而改善阴茎海绵体组织结构,从而调节DMED的大鼠的勃起功能。     

基于网络药理学的牛膝防治骨质疏松潜在分子机制研究

目的通过网络药理学方法探讨牛膝防治骨质疏松(Osteoporosis)潜在的分子生物学机制。方法从文献资料及中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取牛膝相关活性成分及靶点;通过Therapeutic Target Database、DrugBank以及DisGeNET数据库查找与Osteoporosis相关的靶点,并将牛膝及Osteoporosis靶点通过基因标准化后进行映射;利用STRING数据库筛选核心靶点,通过Cytoscape软件进行靶蛋白之间可视化分析;利用DAVID数据库对核心靶点蛋白进行GO及KEGG通路富集分析,并构建牛膝-成分-靶点-信号通路多维网络。结果共得到牛膝21个活性成分,主要成分有β-蜕皮甾酮、黄连碱、小檗碱、β-谷甾醇、黄连素、黄芩苷等;211个牛膝相关靶点,主要包括SELE、VCAM1、ICAM1、ESR1、AR、IL6、IL1B、MYC等;485个Osteoporosis相关靶点,主要包括VDR、ESR1、AR、PGR、CALCR、SOST、SHBG等。映射结果通过STRING筛选出TNF、ESR1、AR、IL6、IL1B等共35个核心靶点。GO注释分析筛选出280个生物学过程,包括对雌二醇的反应、血管内皮生长因子产生的正调控、细胞增殖的正调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、血管生成等过程;20个细胞组分主要涉及线粒体、细胞器膜、蛋白质复合物等;50个分子功能主要包括蛋白质结合、维生素D24羟化酶活性、雌激素受体活性、血红素结合、铁离子结合等。KEGG富集分析结果有87条信号通路,主要涉及破骨细胞分化、NF-κB信号通路、MAPK信号通路、雌激素信号通路、肌萎缩侧索硬化(ALS)、造血细胞系等。结论牛膝是通过多成分、多靶点、多途径相互作用,从而达到防治骨质疏松的目的。     

基于网络药理学牛膝对成骨细胞影响的潜在分子机制研究

目的:基于网络药理学的方法研究牛膝对成骨细胞的干预机制。方法:使用TCMSP、OMIM等数据库检索并得到牛膝的活性化合物、作用靶点和成骨细胞相关基因。利用String和DAVID数据库对潜在疾病靶点进行分析,最终构建"化学成分-成骨细胞-代谢通路"综合网络。结果:在牛膝中发现了20种活性化学成分,10个与成骨细胞功能相关的关键靶点;富集分析得到牛膝可能通过DNA模板转录、信号传导、转录正调控等生物过程,在质膜、细胞核、核质等处影响蛋白质结合、酶结合、ATP结合等功能来实现作用,涉及MAPK、肿瘤坏死因子、Pl3K-Akt等多条信号通路。结论:运用网络药理学的方法,研究了牛膝多成分、多靶点、多信号通路协同影响成骨细胞功能的分子机制,为生物实验提供了理论基础。     

杜仲治疗股骨头坏死分子机制的网络药理学研究

目的:基于中药网络药理学理论与生物信息学研究方法,探讨杜仲治疗股骨头坏死的潜在分子作用机制.方法:通过中药系统药理学成分分析平台BATMAN-TCM预测杜仲的活性成分及治疗作用靶点,与GeneCards、Gene、GAD等人类基因数据库获取的股骨头坏死作用靶点取交集,获得最终的靶标基因,通过STRING构建靶标基因间蛋...     

基于网络药理学和分子对接探析淫羊藿-牛膝药对治疗股骨头坏死的作用机制

目的:基于网络药理学方法探析淫羊藿-牛膝药对治疗股骨头坏死的药效物质基础与潜在的分子作用机制.方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)挖掘中药淫羊...     

基于网络药理学探讨菟丝子治疗骨质疏松症的作用机制

摘 要：目的：采用网络药理学的方法探讨菟丝子治疗骨质疏松症可能的作用机制。方法：通过检索TCMSP、TCMID、SymMap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子的全部成分，并筛选菟丝子活性成分以及治疗骨质疏松症的靶标；采用Cytoscape3.6.0构建菟丝子的“活性成分-靶标”网络并结合数据库String和Cytoscape3.6.0绘制所得靶标间相互作用关系；最后利用DAVID数据库对靶标基因进行GO功能分析与KEGG富集分析。结果：检索TCMSP、TCMID、Symmap、BATMAN-TCM、ETCM以及查阅文献获取菟丝子全部成分，进一步筛选出的与骨质疏松症相关的活性成分有14个，包括槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等；活性成分发挥作用的潜在靶标有83个，主要有白细胞介素6（IL-6）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、骨分化特异性转录分子2（RUNX2）、雌激素受体α（ESR1）等；KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有PI3K/Akt、MAPK、TNF信号通路等。结论：中药菟丝子中槲皮素、芹菜素，金丝桃苷等活性成分可能通过PI3K/Akt、MAPK、TNF等信号通路实现对骨质疏松症的防治。     

糖皮质激素性骨质疏松症的中西医研究进展

糖皮质激素广泛应用于炎性和自身免疫性疾病的临床治疗,其所导致的糖皮质激素性骨质疏松症(glucocorticoid-induced osteoporosis,GIO)是亟待解决的医学问题。中医药治疗GIO具有疗效确定、不良反应小等优势,从中医角度对GIO的病因病机、治疗经验、现代客观化研究等方面对中医治疗GIO进行归纳总结,为中医辨证分型及治疗规范GIO提供依据。     

基于网络药理学探讨葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制

目的：通过网络药理学研究葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台中检索葶苈子的有效成分及相关靶点;在Gene Cards数据库、OMIM数据库中检索骨质疏松症的疾病基因靶点;通过Perl脚本找到葶苈子与骨质疏松症的共同基因,使用String网站构建葶苈子与骨质疏松症之间蛋白质-蛋白质相互作用的关系网络;最后利用R软件对葶苈子与骨质疏松症交集基因进行基因本体论（GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从葶苈子中筛选出9个有效成分,作用于骨质疏松症127个靶点。蛋白质-蛋白质相互作用网络中的核心蛋白有蛋白激酶B(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素（Interleukin,IL）-6、血管内皮生长因子（Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF）A、JUN蛋白、IL-1β。基因KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有晚期糖基化终末产物（Advanced Glycation End Products,AGE）-晚期糖基化终末产物受体（A...