靶向人BRG1基因的慢病毒载体构建及效率验证

目的:构建靶向人BRG1基因的短发夹RNA(shRNA)慢病毒载体并验证其沉默效率。方法:设计3个针对人BRG1基因的特异性shRNA序列(shBRG1),构建于pLKO.1慢病毒载体中,并与psPAX2和pMD2.G质粒共同转染293T细胞以包装成慢病毒颗粒。将包装好的慢病毒感染人主动脉平滑肌细胞(HASMC),应用实时荧光定量PCR和western blot检测BRG1 mRNA和蛋白表达水平,判断其沉默效率。结果:3种shBRG1干扰序列均成功插入慢病毒载体中且测序正确,3种慢病毒均可有效降低BRG1 mRNA表达水平(P均0.01)。其中shBRG1-3的沉默效率最高,其感染HASMC后BRG1蛋白表达水平较对照组显著下降(P0.01)。结论:靶向人BRG1基因的shRNA慢病毒表达载体构建成功,shBRG1-3慢病毒能够有效降低BRG1 mRNA和蛋白表达水平。     

慢病毒介导的shRNA干扰人HepG2.2.15细胞Akt2基因表达的研究

目的针对Akt2基因构建shRNA慢病毒干扰载体并评价慢病毒介导的RNA干扰在人HepG2.2.15中的基因沉默效应。方法设计Akt2的RNAi寡聚核苷酸序列,利用慢病毒载体构建Akt2的shRNA载体,转染入大肠埃希菌并观察重组表达状况,利用293T细胞包装得到重组腺病毒,以绿色荧光蛋白(GFP)作为标记,逐孔稀释法确定转染效率及滴度,以实时荧光定量法比较各组对Akt2 mRNA的干扰效果。结果筛选了所构建的3个Akt2靶向序列,包装shRNA慢病毒后转染HepG2.2.15细胞,慢病毒转染后的沉默效率可达85%,比较得出沉默效率最高的靶序列和工作条件。结论本研究成功构建并筛选了针对Akt2的shRNA慢病毒载体,有效抑制HepG2.2.15细胞中Akt2 mRNA的表达。     

大鼠叉头蛋白转录因子O1基因的shRNA慢病毒载体构建与RNA干扰效率的鉴定

目的 构建针对大鼠又头蛋白转录因子哦O1（FoxO1）基因的shRNA慢病毒载体,并在大鼠系膜细胞（RMCs）上鉴定其沉默效率。方法利用四质粒合成法合成慢病毒载体。分别用阴性对照慢病毒载体（LV-shNC-GFP组）、shRNA慢病毒载体（LV-shRNA-FoxO1组）和感染增强剂（NC组）处理RMCs。72h后,采用流式细胞仪检测绿色荧光蛋白（GFP）阳性表达率。采用荧光定量PCR检测Fox01mRNA表达情况。15d后,采用蛋白免疫印迹法检测Fox01蛋白的表达情况。结果Lv_shNc_GFP、LV-shRNA-Fox01组GFP阳性表达率分别为87．4％、95．8％;Lv-shRNA-FoxO1组FoxO1的mRNA与蛋白表达量较NC、LV-shNC-GFP组均降低（P〈0.05）。其mRNA及蛋白抑制率分别达到86．2％和77．3％,而Lv_shNC-GFP、Lv_shRNA-FoxO1组FoxO1的mRNA及蛋白表达量差异无统计学意义（P〉0．05）。结论成功构建大鼠FoxO1基因的shRNA慢病毒载体能高效、稳定地抑制FoxO1的表达,为进一步研究FoxO1的功能和作用机制奠定研究基础。     

RNAi沉默HMGN5基因对肺癌A549细胞增殖的影响

目的构建HMGN5基因的shRNA慢病毒载体,并在肺癌A549细胞上鉴定其沉默效率,观察其对细胞增殖能力的影响。方法筛选HMGN5基因特异性siRNA靶点,合成短发卡结构shRNA,与LentiLox3.7慢病毒载体重组形成shRNA表达载体,包装shRNA慢病毒颗粒,感染肺癌A549细胞,设阴性组及干涉组,应用Real-time PCR和Western印迹的方法检测HMGN5在mRNA和蛋白水平的沉默效率,MTT和克隆形成实验观察HMGN5基因沉默对A549细胞增殖的影响。结果构建的shRNA慢病毒颗粒感染A549细胞后,干涉组HMGN5基因的mRNA表达量较阴性对照载体慢病毒感染组下降了71.7%,显著抑制其蛋白表达;MTT结果表明细胞增殖能力明显降低,干涉组克隆形成能力较阴性组明显减弱。结论成功构建了HMGN5基因的shRNA慢病毒表达载体,其能够在肺癌A549细胞上有效沉默靶基因。HMGN5基因具有影响肺癌细胞恶性增殖的能力,为肺癌的基因治疗奠定了实验基础。     

大鼠PAX2基因RNA干扰慢病毒载体的构建及沉默效果

目的构建PAX2特异性shRNA干扰慢病毒载体并观察其对大鼠肾小管上皮细胞(NRK52E)中PAX2基因的沉默效果。方法采用PAX2基因RNAi靶点序列合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与pGCSIL-GFP载体连接产生shRNA慢病毒载体,经PCR筛选阳性克隆进行DNA测序鉴定。用脂质体转染法将质粒共转染293T细胞,将包装产生的慢病毒颗粒感染NRK52E细胞,RT-PCR、Western印迹检测PAX2 mRNA和蛋白的表达。结果 PCR与DNA测序证实合成的含PAX2 shRNA慢病毒载体寡核苷酸链插入正确。经RNA干扰后的靶细胞PAX2 mRNA及蛋白表达水平明显降低。结论成功构建人PAX2基因RNA干扰慢病毒载体,为以PAX2基因为靶点的梗阻性肾病基因治疗研究奠定了基础。     

大鼠CREB结合蛋白RNA干扰重组慢病毒载体的构建与鉴定

目的构建大鼠CREB结合蛋白(CREB binding protein,CBP)基因RNA干扰(RNAi)慢病毒载体,并观察该载体对大鼠血管平滑肌细胞(vascular smooth muscle cells,VSMCs)CBP表达的沉默效应。方法设计合成4条CBP基因的siRNA序列,将筛选确定的CBP RNAi有效靶序列与pFU-GW-iRNA载体连接产生CBP shRNA慢病毒表达载体,转化、PCR筛选阳性克隆及测序鉴定。脂质体2000将CBP shRNA慢病毒载体和慢病毒包装质粒共转染293T细胞,完成慢病毒颗粒包装及滴度测定。包装产生的重组慢病毒感染大鼠VSMCs,实时定量RT-PCR检测CBP mRNA的表达,并与未转染及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞进行比较。结果 PCR扩增和测序结果证实,成功构建大鼠CBP shRNA慢病毒载体。经包装产生的慢病毒滴度为2×10~9 TU/ml,与未转染慢病毒及转染阴性对照shRNA慢病毒的细胞比较,CBP shRNA慢病毒转染可使VSMCs的CBP mRNA分别下降88.5%和92.7%。结论成功构建CBP基因RNAi慢病毒表达载体,对VSMCs的CBP表达具有良好沉默作用,为后期基因治疗血管增殖性疾病奠定基础。     

人PETA-3/CD151基因RNAi慢病毒载体的构建及沉默效应鉴定

目的构建PETA-3/CD151shRNA慢病毒表达载体,并在人乳腺癌细胞株MCF-7细胞鉴定其转染及基因沉默效果。方法应用基因工程技术,构建4条针对PETA-3基因的RNAi靶序列,分别与慢病毒载体Pg LV3连接,构建重组慢病毒表达载体PETA-3-shRNA-1~4;将连接产物转化到Top10感受态细胞,经筛选阳性克隆、测序鉴定。应用脂质体法转染293FT细胞,进行病毒包装及滴度测定。将包装产生的4种重组慢病毒分别感染MCF-7细胞,实时定量PCR和Western印迹检测MCF-7细胞PETA-3 mRNA和蛋白的表达。根据筛选的结果,选取最有效的载体进行病毒的大量包装。结果 4个慢病毒载体PCR和测序结果与预期结果一致,感染MCF-7细胞96 h后,PETA-3-shRNA-2 mRNA和蛋白的表达量与未感染慢病毒的细胞组及空载体感染组相比均明显下降,其中mRNA表达下降85%,蛋白表达下降84%(均P<0.05)。shRNA-2病毒载体大量包装后其滴度为1×109TU/ml。结论成功构建针对PETA-3基因的慢病毒载体PETA-3-RNAi-LV3,体外感染MCF-7细胞后可有效抑制PETA-3基因和蛋白的表达。     

shRNA介导mcl-1基因沉默对人肝癌细胞HepG2凋亡的影响

目的观察shRNA介导mcl-1基因沉默对肝癌细胞HepG2的凋亡作用。方法构建靶向mcl-1基因的shRNA表达载体，经脂质体介导将其转入HepG2细胞内，48h后利用RT—PCR和Westernblot检测mcl-1mRNA和蛋白水平，Hoechst染色进行凋亡形态学观察，流式细胞仪检测细胞凋亡率。结果所构建的shRNA表达载体能明显降低HepG2细胞内mcl-1mRNA和蛋白水平。转染shRNA表达载体的细胞经Hoechst染色出现明显凋亡核形态学表现。经流式检测，shRNA组的凋亡率明显高于阴性对照组（7．74％±0．97％vs2．81％±0．46％，P=0．001）。结论shRNA介导mcl-1基因沉默可导致HepG2细胞凋亡，靶向mcl-1基因的RNA干扰可能是肝癌治疗的有效途径之一。     

慢病毒载体介导的结缔组织生长因子基因沉默对下游基因的影响

目的利用RNA干扰技术,以慢病毒为载体,介导结缔组织生长因子(CTGF)基因沉默,并观察其对下游基因表达的影响。方法用构建的CTGF小干扰RNA(siRNA)慢病毒转移质粒与包装质粒、包膜蛋白质粒共转染293T细胞,包装成介导CTGF基因沉默的慢病毒载体;感染肝星状细胞系HSC-T6,应用Real-time PCR和Western免疫印迹法筛选基因沉默效率最高的慢病毒载体;再根据绿色荧光蛋白(GFP)表达水平检测感染效率;应用Real-time PCR法检测CTGF基因沉默后HSC-T6中金属蛋白酶组织抑制剂-1(TIMP-1)、TIMP-2和I型胶原mRNA表达水平。结果包装的慢病毒载体感染HSC-T6细胞的效率高于50%;感染HSC-T6细胞后,CTGF的表达在mRNA和蛋白水平均受到明显抑制,其中TS1具有最佳的抑制效率;HSC-T6细胞CTGF基因沉默后,其TIMP-1、TIMP-2和I型胶原mRNA水平也显著降低。结论包装的慢病毒载体在HSC-T6中具有较好的感染效率和CTGF基因沉默效果,基因沉默后可进一步抑制HSC-T6细胞TIMP-1、TIMP-2和I型胶原的基因表达,这在抗纤维化的研究中具有积极的意义。     

靶向大鼠Smad3基因的siRNA筛选及其shRNA重组慢病毒的构建

目的设计并筛选针对大鼠Smad3基因的siRNA,构建靶向Smad3基因的shRNA重组慢病毒。方法针对大鼠Smad3基因设计并合成6对siRNA（siRNA001～006）及1对无关对照siRNA,转染大鼠肝细胞株BRL-3A,应用Western Blot检测各siRNA对SMAD3蛋白表达的抑制作用,挑选抑制效率高的siRNA。依据所得的序列合成并克隆到pLL3.7载体中,与包装质粒pRSV-rev、pMDLg-pRRE和VSV-G共转染293FT细胞获得靶向Smad3的慢病毒。通过流式细胞仪绿色荧光蛋白（GFP）荧光计数来检测病毒滴度。结果 Western Blot检测证实siRNA001、siRNA005、siRNA006对SMAD3蛋白表达的抑制作用明显,抑制率分别可达83.36%、86.99%及64.88%,而对照siRNA无明显作用。酶切和测序结果显示Smad3 shRNA及对照shRNA重组载体质粒pLL3.7-shRNA构建成功,将构建的质粒进行慢病毒包装可产生有感染活性的慢病毒颗粒。结论筛选出针对大鼠Smad3基因有明显抑制作用的3对siRNA,并成功构建表达相应shRNA的4种重组慢病毒,为研究调控Smad3的表达对肝再生或肝纤维化的影响提供了实验条件。     

敲低ABCG1慢病毒表达载体的构建及功能检测

目的为探讨人急性单核细胞白血病细胞系(THP-1)中胆固醇转运相关的ABCG1基因的表达对动脉粥样硬化发生发展的作用,构建ABCG1慢病毒干扰载体,并验证干扰效果、进行功能检测。方法针对人ABCG1的cDNA序列,设计两个RNA干扰的寡核苷酸单链DNA。将其插入到慢病毒表达载体上;将构建的载体和包装质粒共转染293T细胞;通过实时荧光定量PCR及蛋白质免疫印迹检测干扰载体对ABCG1表达水平的影响;通过检测外流率进行功能验证。结果构建的ABCG1基因的小干扰RNA慢病毒表达载体感染THP-1细胞可以有效地抑制ABCG1 mRNA和蛋白表达水平,且减少ABCG1介导的胆固醇外流,感染组外流率小于对照组(23.87%±0.45%比30.57%±1.00%,P<0.001)。结论慢病毒表达载体成功敲低THP-1细胞的ABCG1,并为后续的ABCG1在巨噬细胞中生物学作用的研究创造条件。     

靶向PCSK9基因shRNA慢病毒载体的构建及其对PCSK9基因表达的沉默

目的设计以PCSK9基因为靶点的短发夹状RNA（shRNA）,构建重组慢病毒载体并鉴定此RNA干扰体系对PCSK9基因表达的影响。方法将3条人PCSK9基因的shRNA片段插入至慢病毒载体pLentilox3．7,与pCDNA3-hPCSK9．FLAG质粒用Lipofectamine2000共转染293细胞,Western blotting法鉴定出最有效的shRNA。此重组质粒与pCre—VSV-G、pLoxp．CMV—R8．91经293细胞包装后,产生的重组慢病毒感染293细胞,48h后转染pCDNA3．hPCSK9-FLAG质粒,Western blotting法检测人PCSK9基因表达的情况。结果经双酶切鉴定,构建了PCSK9shRNA慢病毒载体pLentilox—hPC—SK9,鉴定出hshRNA-2为最有效的shRNA。重组的慢病毒能明显的抑制人PCSK9的表达。结论慢病毒介导的shRNA干扰技术可特异性的阻断PCSK9的表达,为进一步探讨PCSK9特异性的shRNA治疗脂代谢异常疾病奠定了基础。     

胰腺癌CFPAC1细胞增殖诱导配体基因shRNA慢病毒表达载体的构建

目的 构建针对人胰腺癌细胞株CFPAC1增殖诱导配体(a proliferation-inducing ligand,APRIL)基因的shRNA慢病毒表达载体.方法 应用基因工程技术,筛选出针对APRIL基因的RNAi靶序列,与pGCL-GFP载体连接,构建慢病毒表达载体LV-shAPRIL;将连接产物转化到DHSα感受态细胞,经PCR筛选阳性克隆、测序鉴定.再用LV-shAPRIL、pHelper 1.0、pHelper 2.0共转染293T细胞,包装产生慢病毒颗粒.重组慢病毒感染CFPAC1细胞,实时定量PCR和Western blotting检测CFPAC1细胞APRIL mRNA和蛋白的表达.结果 PCR和测序结果与构建的慢病毒载体的预期结果一致,经包装产生的病毒滴度为5×107TU/ml.构建的慢病毒载体感染CFPAC1细胞后第4天、第4周和第8周,APRIL mRNA表达量较空载体慢病毒感染组分别下降了73%、70%和71%;APRIL蛋白表达量分别下降了66%、63%和62%(P＜0.05).而各时间段未感染慢病毒的细胞组与空载体组相比无明显差异(P＞0.05).结论 成功构建了APRIL基因的shRNA慢病毒表达载体LV-shAPRIL.     

细胞外基质金属蛋白酶诱导因子RNAi慢病毒载体的构建

目的构建人细胞外基质金属蛋白酶诱导因子（EMMPRIN）RNA干扰（RNAi）慢病毒载体。方法参照文献设计RNAi靶点序列,合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与经AgeⅠ和EcoRⅠ酶切后的pGCSIL-GFP载体连接产生RNAi慢病毒载体pGC-LV。PCR鉴定阳性克隆并测序,将测序正确的pGC-LV、pHelper 1.0和pHelper 2.0质粒经脂质体2000共转染293T细胞,获得重组慢病毒,用逐孔稀释法测定病毒滴度。结果合成的含EMMPRIN vshRNA慢病毒载体寡核苷酸链插入正确;病毒包装后滴度为1×109 TU/ml。结论应用基因工程技术成功构建了可供感染的EMMPRIN基因RNAi慢病毒载体,此为进一步研究EMMPRIN在急性白血病中的作用奠定了实验基础。     

siRNA靶向抑制HDGF基因对人肝癌细胞株增殖和侵袭力的影响

背景：肝癌衍生生长因子（HDGF）分离自人肝癌细胞株,其功能特性与多种肿瘤的生长、侵袭、转移和预后相关。目的：观察以小干扰RNA（siRNA）靶向抑制HDGF基因对人肝癌细胞株增殖和侵袭力的影响。方法：以逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测人肝癌细胞株HepG2HDGFmRNA表达。构建靶向HDGF的短发夹RNA（shRNA）慢病毒表达载体．转染HepG2细胞．建立稳定表达siRNA-HDGF的HepG2细胞株。蛋白质印迹法检测siRNA—HDGF的干扰效率。MTT实验和软琼脂集落形成实验检测细胞增殖情况,Boyden小室体外侵袭实验检测细胞侵袭情况。结果：HepG2细胞中HDGFmRNA表达明显。蛋白质印迹法筛选出的干扰效率为75-3％的HepG2细胞株．生长速度较转染阴性对照载体和未转染载体的细胞显著减慢（P〈0．05）,在软琼脂上形成的集落数减少（9．64±1．62对36．41±1．68和35．50±3．27,P〈0．05）,穿过Boyden小室Matrigel基质胶的细胞数亦显著减少（51．27±6．53对153．80±10．04和154．33±10．23,P〈0．05）。结论：以siRNA靶向抑制HDGF基因能显著抑制人肝癌细胞株的增殖和侵袭力．HDGF可能成为肝癌基因治疗的重要靶标。     

MCFP慢病毒干涉载体及HepG2稳定细胞系的构建

目的:研究线粒体转运蛋白质超家族新成员SLC25A40(MCFP)RNA干扰(RNAi)慢病毒表达载体对人肝癌细胞系HepG2细胞中MCFP基因的沉默效果.方法:通过RNAi序列设计软件进行MCFP干涉片段设计,筛选出MCFP基因的RNAi有效靶序列,进一步合成靶序列的Oligo DNA,构建pSiCoR-MCFP慢病...