基于网络药理学对桂枝茯苓丸治疗放射性肺炎的潜在作用机制初探

目的 运用网络药理学初步探索经典名方桂枝茯苓丸治疗放射性肺炎的潜在机制.方法 通过利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选桂枝茯苓丸的活性成分和作用靶点,检索GeneCard和OMIM数据库收集放射性肺炎靶点(2021年5月31日更新检索).应用Cytoscape构建网络关系图,通过String数据库...     

基于网络药理学和分子对接探索桂枝茯苓丸治疗卵巢癌的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探索桂枝茯苓丸治疗卵巢癌的主要活性成分和作用机制.方法:使用TCMSP数据库检索并筛选桂枝茯苓丸中每味中药的活性成分,在Uniprot数据库找出药物活性成分的作用靶点,通过Cytoscape软件的Network Analyzer功能筛选出药物的主要活性成分及靶点.使用Genecards...     

基于网络药理学探讨桂枝茯苓汤治疗子宫肌瘤的活性成及分子机制

目的:采用网络药理学方法研究桂枝茯苓汤治疗子宫肌瘤的活性成分及作用机制.方法:基于中药药理学系统数据库分析平台(TCMSP)与文献资料检索筛选出桂枝茯苓汤活性成分,运用Swiss Target Prediction预测药物靶点,从Gene Cards数据库中预测子宫肌瘤疾病靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构...     

基于网络药理学的桂枝甘草汤抗失眠作用的潜在机制研究

目的利用网络药理学技术对桂枝甘草汤抗失眠的潜在作用机制进行探讨研究。方法首先,利用TCMSP、Swiss、SuperPred和Stitch数据库寻找与桂枝甘草汤方中2味中药材有关的化学成分及其可能的作用靶点,并设定OB≥30%、DL≥0.18为阈值对化学成分进行筛选,再利用文献检索加以补充;同时,通过OMIM、TTD、Gene Card、Pharm Gkb等数据库获取与失眠症相关的靶标,并进一步建立桂枝甘草汤抗失眠作用的靶点;然后,利用DAVID数据库对失眠症相关的作用靶点进行GO及KEGG富集分析;最后,采用Cytoscape软件构建"单味药-活性成分-作用靶点"相互作用网络并进行度值和介数值分析,确认关键靶点和关键通路。结果在桂枝甘草汤中,共筛选出101个与失眠相关的潜在活性成分,主要涉及MAPT、ESR1、CYP19A1等85个潜在作用靶点;GO生物功能分析共包含293条富集结果,主要涉及蛋白结合、质膜等;KEGG富集分析得到18条代谢通路,主要包括神经活性配体-受体相互作用通路、钙信号通路、5-羟色胺能突触通路等。结论本研究揭示了桂枝甘草汤治疗失眠症的"多成分-多靶点-多途径"的作用特点,并预测了其可能的活性成分、关键靶点和作用通路,为其药效物质基础和作用机制研究提供了理论基础。     

基于网络药理学探讨半夏治疗直肠癌的作用机制

[目的]分析半夏的有效活性化合物及其对直肠癌靶点的作用机制。[方法]应用中药系统药理数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出半夏中的潜在化学活性物质及相关靶点蛋白,采用基因组注释数据库平台(genome annotation database platform,Gene Cards)预测直肠癌的作用靶点,并运用Uniprot数据库查询与之相对应的基因名称,借助Cytoscape 3.7.2软件,构建“药物-疾病-靶点”的网络图,通过String数据库平台构建蛋白间相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,再利用Bioconductor平台和R语言(The R programming language)进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。[结果]通过筛选,共获得半夏的有效化学成分13个,与直肠癌相关的关键化学成分10个,半夏-直肠癌的共同靶点32个,获得15个PPI核心基因;获得GO生物学过程66条和KEGG相关信号通路104条,涉及乙肝通路、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染通路、小细胞肺癌通路、细胞凋亡通路、麻疹通路、人类免疫缺陷病毒1感染通路、大肠癌通路、EB病毒感染通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、p53信号通路、铂剂耐药通路、白细胞介素-17(interleukin-17, IL-17)信号通路、前列腺癌通路等。[结论]半夏可以通过多种途径对直肠癌产生疗效,此为未来提取半夏治疗直肠癌的有效成分奠定了基础。     

鱼腥草治疗角膜炎的网络药理学分析

目的：为探究“鱼腥草-靶点-角膜炎”的网络关系,应用网络药理学分析方法,分析探讨鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用及分子机制。方法：以鱼腥草为研究对象,借助DisGeNET、STRING、中药系统药理学分析(TCMSP)平台、SwissADME、SwissTargetPridictiont等各在线数据库提供的数据信息,查询角膜炎相关蛋白及其互作网络、鱼腥草化学成分与活性成分、鱼腥草活性成分的预测靶点蛋白的相关数据,应用Cytoscape软件的可视化与网络合并功能,依次拟构角膜炎相关蛋白质互作网络、鱼腥草活性成分-预测靶点网络、鱼腥草活性成分-潜在靶点网络,整合分析上述拟构的网络,得到“鱼腥草活性成分-靶点-通路”网络,分析预测鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用靶点及其在信号通路中的作用,探究鱼腥草治疗角膜炎的潜在作用机制。结果：共搜索到72个已分离鉴定的鱼腥草化学成分,角膜炎相关靶点65个,鱼腥草治疗角膜炎的潜在靶点50个,包含9个直接作用靶点。50个潜在靶点可被注释入303项GO术语中,由263项生物过程、18项细胞组分、22项分子功能所组成,显著富集于与炎症、感染（细菌、寄生虫）、免疫相关的通路上...     

基于网络药理学和体内实验研究桂枝解热的作用机制

目的：运用生物信息技术分析探讨广西“桂十味”之一桂枝解热的关键靶点及相关信号通路作用机制,同时采用动物实验加以验证。方法：利用TCMSP筛选桂枝的主要活性成分,PharmMapper反向对接预测活性成分的作用靶点;通过Gene Cards、CTD和OMIM数据库预测发热相关靶点;通过交集映射得到桂枝和发热的共同靶点,利用Cytoscape 3.8.0软件建立调控网络和蛋白互作网络;对交集靶点进行GO生物功能注释和KEGG通路富集分析。最后通过整体动物、生化、ELISA法验证网络药理学富集分析结果。结果：筛选出桂枝8个活性成分及其228个预测靶点,发热相关靶点12 882个,共同靶点213个,包括ALB、AKT1、SRC、EGFR、HSP90AA1等,KEGG分析结果富集出花生四烯酸代谢信号通路、PPAR信号通路、NF-κB信号通路等。验证性实验结果表明,桂枝对酵母诱导发热6～8 h大鼠的体温变化值（△T）、最大发热净增值（△Tmax）及8 h体温反应指数（TRI8h）降低（均P<0.05）;呈剂量依赖性显著降低因酵母诱导发热大鼠血清中IL-1β、TNF-α、IL-6和PGE2等外...     

依达拉奉治疗急性脑梗死的疗效分析

目的研究并分析依达拉奉治疗急性脑梗死的效果。方法收集急性脑梗死患者共66例,根据计算机简单随机化分组原则将其分为对照组(33例)和观察组(33例)。两组均接受常规治疗,观察组同时加用依达拉奉。观察两组用药后神经功能的改善情况,并对其临床疗效及hs-CRP水平等指标进行比较。结果相较于对照组,观察组的治疗总有效率更高;在神经功能缺损评分及hs-CRP水平方面,观察组显著低于对照组(P0.05)。结论在急性脑梗死患者的治疗过程中,依达拉奉能使患者获得更加理想的效果,改善其神经功能缺损程度,使其预后更佳,值得推广应用。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气活血方治疗糖尿病肾病的作用机制

探讨运用网络药理学与分子对接技术,分析自拟益气活血方治疗糖尿病肾病（DN）的有效成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过多个公共数据库获得益气活血方中活性成分的潜在靶点及DN的疾病靶点,并获得交集靶点,对交集靶点进行GO和KEGG分析,蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析与网络构建;利用Autodock vina软件对重要成分及关键靶点进行分子对接。结果 网络药理学分析获得有效活性成分78个、成分靶点223个、疾病靶点1002个、交集靶点81个、关键靶点15个。富集的 KEGG 通路有胰岛素抵抗、 PI3K-Akt 信号通路等。分子对接结果显示山柰酚、木樨草酸等成分对大部分靶点具有亲和力。结论 益气活血方可能通过调节炎症与细胞自噬、促进ECM蛋白的降解、调节外周组织对胰岛素的敏感性及胰腺β细胞的增殖和凋亡等作用机制达到治疗DN的作用     

基于网络药理学预测沙苑子的抗炎作用机制

目的 预测沙苑子的活性化学成分和作用靶点,揭示沙苑子抗炎作用的分子机制。 方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药台湾数据库(TDT)和中药中医药综合数据库(TCMID)检索沙苑子的所有化学成分,以药代动力(ADME)参数(OB≥30%和DL≥0.15)为标准,筛选沙苑子的活性化学成分,然后通过中药靶标数据库、TCMSP 数据库和中医分子机制生物信息学分析数据库(BATMAN-TCM),查找活性化学成分的作用靶点,建立靶点数据集;使用 Cytoscape 3.6.1软件构建“成分-靶点-疾病”复杂网络关系图;利用蛋白互作(PPI)网络分析—STRING数据库,构建沙苑子作用靶点和炎症作用靶点的PPI关系网络;利用生物学信息注释数据库(DAVID)进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;将沙苑子与炎症相关联的潜在靶点导入KEGG Pathway数据库中,验证沙苑子的抗炎机制。 结果 共检索出41个化合物,其中以kaempferid、formononetin、calycosin-7-O-beta-D-glucopyranoside等11个化合物作为活性化合物;共检索出414个作用靶点,筛选出50个潜在作用靶点与沙苑子的抗炎作用机制最为密切,进而分析出261个生物过程和80条信号通路参与沙苑子的抗炎作用。与沙苑子抗炎最密切的信号通路包括RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症反应、I-κB激酶/NF-κB信号通路的正调控、NF-κB转录因子活性的正调控、细胞对脂多糖的反应、细胞增殖调节、依赖TRIF的Toll样受体信号通路等,其主要涉及的生物过程包括TNF信号通路、细胞凋亡、Toll样受体信号通路、NF-κB信号通路、RIG-I样受体信号通路、NOD样受体信号通路等。 结论 通过网络药理学预测了沙苑子的11个活性化学成分、50个潜在作用靶点及相关信号通路,发挥多成分、多靶点、多途径抗炎的生物学效应。     

Mechanism of Pinelliae rhizoma-Arisaematis rhizoma in treatment of lung cancer based on network pharmacology

Objective: The study was designed to explore the mechanism of Pinelliae Rhizoma- Arisaematis Rhizoma (PR-AP) in treatment of lung cancer based on network pharmacology. Methods: The active components and their targets of Pinelliae Rhizoma- Arisaematis Rhizoma were screened out from TCMSP database. The cytoscape3.7.0 software was used to construct the drug-active component-targets network. Searched the DisGeNet database to obtain lung cancer related targets. Bisogenet was used to construct PPI network of active component target and PPI network of lung cancer target, and the intersection of the two networks was taken and the target was screened. AutoDockTools software was used to dock the key active ingredients with the key targets. David database was used to perform Go biological process enrichment analysis and KEGG pathway enrichment analysis. Results: A total of 15 active components were collected, including beta-sitosterol, baicalein, Stigmasterol, Cavidine, coniferin, etc. These active components mainly act on 95 key targets such as ESR1 and CDK2, which enriched in multiple lung cancer related signaling pathways, such as PI3K-Akt、MAPK、HIF-1、FoxO、TGF-β、Hippo、TNF、Notch、VEGF、cAMP, etc. The results of molecular docking showed that the active components could regulate the core targets (ESR1 and CDK2). Conclusion: The effect of Pinelliae Rhizoma- Arisaematis Rhizoma in the treatment of lung cancer embodies the characteristics of multi-component, multi-target and multi-pathway of traditional Chinese medicine. Its mechanism of action may be to play a role in the treatment of lung cancer by regulating cell cycle, angiogenesis, tumor stem cells, etc. This research can provide ideas and references for further research.     

基于网络药理学探讨清胰汤治疗急性胰腺炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨清胰汤（QYT）治疗急性胰腺炎（AP）的作用机制,并结合动物实验验证。方法:通过BATMAN数据库检索QYT中8味中药化合物的作用靶点,Gene Cards数据库检索AP的基因靶点,筛选得到药物与疾病的交集靶点。利用STRING和Cytoscape将交集靶点进行蛋白互作分析,推测核心靶点,构建“中药材-活性化学成分-靶点”网络,并对“药物-疾病”靶点进行GO和KEGG富集分析,得到QYT在治疗AP过程中所涉及的相关重要靶点及通路。利用实验验证QYT在治疗AP中对自噬过程的调控作用。结果:分析发现QYT所含化合物共214种,对AP有效的活性化合物121种,活性化合物对应蛋白靶点删除重复值后得到1 853个,AP疾病靶点1 000个,“药物-疾病”靶点145个,GO功能富集分析1 310条,KEGG通路富集67条（均P<0.05）,主要涉及坏死、凋亡、炎症反应、自噬等生物学进程;实验结果证实QYT减轻了AP的病理损害,同时减轻了自噬进程。结论:网络药理学揭示QYT主要通过减少自噬,调节炎症因子,改善微循环障碍和肠屏障损伤等方式治疗AP,具有多靶点、多组分的潜在机制。经动物实验验证,QYT可能通过调控自噬发挥效用。     

基于网络药理学与分子对接的蒺藜皂苷D抗肺纤维化的作用机制研究*

目的: 采用网络药理学和分子对接技术探讨蒺藜皂苷D治疗肺纤维化可能的分子机制。方法: 采用SwissTargetPrediction数据库收集蒺藜皂苷D靶点,通过UniProt数据库将相应靶点蛋白名称进行标准化;通过DrugBank数据库、GeneCards数据库和OMIM数据库检索“pulmonary fibrosis”,获取肺纤维化疾病靶点;通过韦恩图获取蒺藜皂苷D和肺纤维化的共同靶点,并进行蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析、基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。利用分子对接技术验证蒺藜皂苷D与核心靶点的结合能力。结果: 获取蒺藜皂苷D 43个潜在靶点,肺纤维化疾病1 492个相关靶点,蒺藜皂苷D与肺纤维化共同靶点17个,PPI网络中自由度排名前8个靶点分别为MAPK3、PPARG、IL6、TNF、VEGFA、TGFβ1、FGF2和STAT3;GO功能富集注释得到生物学过程(BP)条目418条,细胞组成(CC)条目22条,分子功能(MF)条目29条;KEGG通路分析得到69条信号通路;分子对接提示MAPK3、FGF2、STAT3、IL6、PPARG与蒺藜皂苷D的结合能均≤-5.0 kcal/mol。结论: 蒺藜皂苷D通过多靶点、多途径的效应发挥治疗肺纤维化的生物活性,其可能通过MAPK3、FGF2、STAT3、IL6和PPARG等靶点调控MAPK信号通路和PI3K-Akt信号通路治疗肺纤维化。     

尤瑞克林、丁苯酞和阿司匹林联合治疗急性脑梗死的临床研究

目的探讨研究尤瑞克林联合丁苯酞治疗急性脑梗死的临床疗效和安全可行性。方法我院神经内科收治80例72h发病的急性脑梗死患者,随机分成治疗组和常规组,各40例,两组给予相同的基础治疗（降压、降糖、调血脂、抗血小板聚集或抗凝药物、改善脑循环、营养脑细胞药物）,但治疗组加用尤瑞克林0．15PNA单位静脉滴注,每131次,连用1～2周,丁苯酞软胶囊每次2片（0．1g,粒）．每日3次于治疗前后评定患者神经功能缺损程度、日常生活活动能力及不良反应事件。结果两组治疗前后3d、7d、14d、28d、90d的神经功能缺损评分以及90d后两组的神经功能缺损、日常生活活动能力均有所改善,与治疗前相比差异具有统计学意义（P〈0．05）;治疗组改善程度更明显,与常规组相比差异有统计学意义（P〈0．05）;治疗组较常规组不良反应无明显增加。结论尤瑞克林治疗能降低脑卒中发病率,有利于急性脑梗死患者神经功能恢复、提高日常生活活动能力,安全性可以肯定。     

基于网络药理和实验验证探究中药通过健脾作用治疗白细胞减少症的作用机制

摘要 目的 运用数据挖掘、网络药理学和实验验证探讨中药通过健脾作用治疗白细胞减少症的用药规律、药效物质基础及潜在的作用机制。方法 在中国知网、万方数据知识服务平台、维普网和PubMed数据库中检索健脾中药复方治疗白细胞减少症的临床文献,运用古今医案云平台在线分析软件和SPSS Modeler 18 统计分析软件寻求核心药物组;利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）、GeneCards数据库、OMIM数据库检索、Cytoscape3.7.2软件、STRING数据库获取关键基因和主要有效成分,利用Metascape进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;采用MTT法检测细胞增殖率,采用qPCR法检测关键基因信使核糖核酸（mRNA）水平表达。结果 共筛选得到90篇有效文献,共计91首中药复方,党参-当归-黄芪为核心药物组合。肿瘤坏死因子（TNF）、白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-1β（IL-1β）、白细胞介素-10（IL-10）、JUN为核心靶点,槲皮素、木犀草素、山奈酚、芒柄花素、豆甾醇为主要有效成分,其主要作用机制可能通过癌症的途径、TNF信号通路、p53信号通路等来实现。健脾中药黄芪、党参、当归提取物和有效成分芒柄花素、槲皮素对人单核细胞白血病细胞（THP-1）具有促进增殖作用,芒柄花素对化疗诱导的THP-1细胞生长具有促进增殖的作用,芒柄花素能够抑制炎症细胞因子IL-6、IL-1β、TNF-α和刺激抗炎因子IL-10、原癌基因JUN的分泌。结论 初步揭示黄芪等多种中药通过多成分、多靶点发挥健脾作用,参与抗肿瘤、抗炎、免疫调节等相关信号通路,治疗白细胞减少症。     

急性脑梗死溶栓治疗的临床研究

应用大剂量国产尿激酶静脉溶栓治疗急性脑梗死发病6h内病人20例,平均年龄(56.7±8.21)岁,治疗前与治疗后2h、1天、2天、3天、7天和14天6个时间段神经功能缺损积分差分别为15.27±7.37、8.95±7.45、7.1±7.49、5.5±4.74、4.85±6.64、3.55±5.81、4.0±7.53,经t检验均有显著差异,显效率90％。结果显示尿激酶溶栓治疗急性脑梗死效果显著。     

依达拉奉对急性脑梗死患者血清c反应蛋白的影响

目的通过分析依达拉奉对急性脑梗死患者血清C反应蛋白（CRP）水平的影响及患者预后脑神经功能缺损状况,探究其临床药用价值。方法178例急性脑梗死患者随机均分成两组,对照组行基础治疗,观察组除基础治疗外加用依达拉奉,分别对两组患者治疗前及治疗后7d、14d血清CRP水平及神经功能缺损情况对比分析。结果两组患者疗程结束后血清CRP水平及神经功能缺损情况较治疗前差异均有统计学意义（P〈0．05）,7d时观察组血清CRP水平明显低于对照组（P〈0．01）,14d时治疗组神经功能缺损情况明显低于对照组（P〈0．01）。结论依达拉奉可有效地降低急性脑梗死患者血清CRP水平及神经功能损伤程度,改善患者预后机体机能。