基于网络药理学和实验验证探讨升降散治疗急性肺损伤作用及机制

目的 基于网络药理学和动物实验探究升降散治疗急性肺损伤（ALI）的作用机制。方法 在中药系统药理学分析平台数据库（TCMSP）和Swiss Target Prediction数据库中检索升降散的成分及靶点,在基因数据库（Gene Cards）中检索ALI的疾病靶点。将药物与疾病交集靶点上传至STRING数据平台进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析,运用DAVID网站进行基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。体内实验,除对照组外,升降散各给药组分别ig给药20 mL·kg^-1药液（散剂、水煎液高、低剂量分别为175、350 mg·kg^-1）,每天早晚各1次,共连续给药14 d;地塞米松组第12天开始ip地塞米松（5 mg·kg^-1）,连续给药3 d;除对照组外,其余各组第15天分别向气管内滴注1 mg·mL^-1脂多糖（5 mg·kg^-1）进行造模,观察肺组织病理损伤情况,ELISA法检测白细胞介素-6（IL-6）、白细胞介素-1β（IL-1β）、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）水平,实时荧光半定量聚合酶链式反应（qRT-PCR）法检测Toll样受体4 （TLR4）、磷酸化-丝裂原活化蛋白激酶p38 （p38-MAPK）、细胞外调节蛋白激酶（ERK）、c-Jun氨基末端激酶（JNK-1） mRNA表达量,Western blotting法检测核因子κB（NF-κB）和人核因子κB抑制蛋白α（IκBα）表达量。结果 网络药理学预测出升降散活性成分32个,关键靶点292个,ALI疾病靶点有1 454个,两者交集靶点95个;升降散治疗ALI的关键靶点主要参与NF-κB、MAPK等信号通路。通过ALI小鼠模型实验结果显示,升降散能够显著减轻ALI小鼠肺部组织炎症,改善肺泡间隔及肺泡壁增厚程度;降低血清中炎症因子IL-6、IL-1β、TNF-α的水平（P＜0.05、0.01）;下调TLR4、p38-MAPK、ERK、JNK-1 mRNA的表达量（P＜0.05、0.01）;Western blotting结果表明升降散可通过抑制NF-κB蛋白磷酸化水平（P＜0.01）,激活IκBα蛋白（P＜0.01）,缓解ALI。结论 升降散能够基于多成分、多靶点、多通路的特点相互协同治疗ALI,其机制可能与NF-κB、MAPK等信号通路有关,且散剂治疗ALI的作用优于水煎液。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨凉膈散抑制急性肺损伤细胞因子风暴的机制

目的:利用网络药理学和分子对接技术,探讨凉膈散抑制急性肺损伤(acute lung injury,ALI)细胞因子风暴的作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台中筛选凉膈散活性成分和作用靶点;通过人类孟德尔遗传综合数据库、Gene Cards等医学数据库获得ALI疾病靶点.利用Uniprot数据库查询靶点对应的...     

基于网络药理学二黄汤治疗急性肺损伤的作用机制研究

基于中药复方网络药理学方法探讨二黄汤(Erhuang decoction,EhD)治疗急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的多成分-多靶点-多通路作用机制.以EhD体内入血成分为研究对象,利用SwissTargetPrediction、DisGeNET、Therapeutic Target Data...     

基于网络药理学和分子对接探讨抗血小板药物治疗急性肺损伤的作用机制研究

目的 基于网络药理学的策略来探究抗血小板药物治疗急性肺损伤的机制。方法 通过SwissTargetPrediction平台预测抗血小板药物的靶点,用GeneCards和OMIM数据库获取急性肺损伤的相关靶点。通过STRING平台构建蛋白互作网络,用Cytoscape软件中CytoHubba和MCODE插件,筛选出治疗急性肺损伤的核心靶点和高度连接的靶点簇,使用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因百科全书(KEGG)基因富集分析,最后利用AutoDockTools软件进行分子对接验证。结果 总共筛选出20个抗血小板药物治疗急性肺损伤的核心靶点,其中度值排名前3位的核心靶点是原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC),磷脂酰肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)和信号转导与转录激活因子3(STAT3)。抗血小板药物可能通过调控表皮生长因子受体(ErbB)信号通路、程序性死亡受体-1 (PD-1)/程序性死亡受体配体-1 (PD-L1)信号通路、酪氨酸蛋白激酶信号转导与转录激活因子(JAK-STAT)来发挥治疗急性肺损伤的作用,分子对接结果进一步表明,抗血小板药物可以与核心靶...     

基于网络药理学探讨麻杏石甘汤治疗急性肺损伤的机制

目的 借助网络药理学的方法研究麻杏石甘汤(MXSGD)的主要成分及其相应的靶点和对应的通路,预测MXSGD治疗急性肺损伤(acute lung injury, ALI)的作用机制。方法 首先在TCMSP数据库中检索MXSGD的成分和靶点。用Cytoscape绘制药物有效成分及其相应靶点相互关联的网络图。在GeneCard数据库中检索ALI的疾病靶点,将药物与疾病的靶点信息在韦恩图中得到两者共有的部分,最后将两者共有的部分在DAVID数据库中进行gene ontology(GO)富集分析和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路分析。为了进一步探明MXSGD对ALI的作用,建立了大鼠ALI模型,并进行了肺组织切片观察、炎症因子检测和Western blot检测。结果 预测出MXSGD有134种成分以及1 742个基因,急性肺损伤的治疗靶点有1 701个,将两者取交集得到潜在靶点136个。DAVAD结果表明,MXSGD治疗ALI的关键靶点主要参与乙型肝炎通路、TNF信号通路、甲型流感通路、HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路、T细胞受体信号通路、PI3K-Akt信号通路和甲状腺激素信号通路等。MXSGD能够降低ALI大鼠体内炎症因子的含量,减轻肺部损伤的严重性。Western blot实验结果显示,MXSGD可以上调PI3KAKT蛋白的表达。结论 借助网络药理学揭示了MXSGD是通过多种成分、多个靶点和多条通路相互作用的机制治疗ALI。     

基于网络药理学研究当归芍药散防治阿尔茨海默病的作用机制

目的 探究当归芍药散防治阿尔茨海默病的作用机制。方法 选取当归芍药散中的当归、白芍、白术、川芎、茯苓、泽泻为研究对象,应用TCMSP数据库对6味中药主要化学成分进行筛选;使用TCMSP数据库,对筛选出的化合物及阿尔茨海默病进行靶点预测,选取当归芍药散与阿茨海默病一致的6个靶点蛋白作为后续研究对象,通过生物分子功能注释系统（MAS 3.0）及KEGG通路数据库进行通路注解及分析,得到当归芍药散治疗阿茨海默病的相关靶点通路预测图及相关信号通路。结果 从当归芍药散中筛选出35个化合物,可作用于阿尔茨海默病6个潜在的蛋白靶点,找出靶点的相关通路22条。作用通路涉及阿尔茨海默病发病机制相关的钙信号途径、炎症、免疫调节、细胞与细胞之间的信号交流、肌动蛋白细胞骨架的调节等各个环节,6味中药既有共同的成分及作用靶点、通路,又各有偏重,各通路间通过共有靶点连接,显示出不同成分间的多靶点、多途径的协同作用。结论 预测出当归芍药散治疗阿尔茨海默病可能与其调节炎症、免疫系统、钙信号、细胞与细胞之间的信号交流等机制有关。     

基于UPLC-Q-TOF-MS/MS和网络药理学研究连翘治疗急性肺损伤的作用机制

目的: 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术分析连翘的入血成分,并结合网络药理学研究连翘治疗急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的作用机制。方法: 使用脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)建立ALI大鼠模型,采用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术鉴定连翘的入血成分,结合PharmMapper、GeneCards和Disgenet数据库筛选连翘入血成分治疗ALI的潜在作用靶点,String平台绘制蛋白互作(PPI)网络图,Cytoscape软件做网络拓扑分析并筛选核心靶点,通过David数据库对核心靶点富集分析,使用Autodock Vina和PyMol软件对相关入血成分与核心靶点进行分子对接。结果: 肺组织切片结果显示ALI大鼠模型制备成功;得到37个连翘入血成分;连翘治疗ALI核心靶点70个,涉及PI3K/Akt、MAPK和Ras等152个相关通路;agatholic acid、无梗五加苷B、连翘苷、连翘酯苷A和芦丁5个入血成分与核心靶点JAK2和JAK3分子对接的结合能均小于-4.25 kJ·mol^-1,对接结果良好。结论: 该研究明确了连翘的入血成分,网络药理学预测agatholic acid、无梗五加苷B、连翘苷、连翘酯苷A和芦丁可能为连翘防治ALI的主要成分,其作用机制可能与靶向JAK2和JAK3调控PI3K/Akt信号通路有关。     

王不留行黄酮苷对脓毒症小鼠急性肺损伤保护作用及机制研究

目的 基于网络药理学和动物实验探究王不留行黄酮苷（VAC）对脓毒症小鼠急性肺损伤的保护作用机制。方法 通过 Swiss Target Prediction数据库收集 VAC的潜在作用靶点;利用 GeneCards数据库检索肺脓毒症相关的疾病靶点;运用Draw Venn Diagram 软件构建 VAC 和疾病的共同靶点;利用 STRING 11.5数据库和 Cytoscape 3.10.0软件构建共同靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用 Metascape 数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。采用 ip 给予脂多糖（LPS）构建脓毒症模型,造模同时给予 VAC（1、5 mg·kg^-1）或地塞米松干预,取各组小鼠肺组织及血清,苏木精-伊红（HE）、Masson 及 TUNEL 染色观察肺组织形态变化、纤维化及细胞凋亡情况,ELISA 法和实时荧光定量 PCR（qRT-PCR）法分别检测血清和肺组织中炎症因子水平,免疫组织化学法和 Western blotting法检测肺组织炎症通路相关蛋白表达。结果 VAC和肺脓毒症共同靶点有44个;GO富集分析涉及生物过程（BP）823个条目、细胞组分（CC）52个条目和分子功能（MF）49个条目;KEGG分析筛选出癌症通路、PI3K-Akt、JAK-STAT信号通路等 20 条信号通路。验证实验结果显示,与对照组相比,模型组小鼠肺组织损伤且纤维化严重,肺脏指数显著增加（P＜0.05）,血清及肺组织中相关炎症因子表达升高（P＜0.01、0.001）。与模型组相比,VAC及地塞米松组肺组织病理形态得到改善,纤维化程度减轻,肺脏指数显著降低（P＜0.05）,血清中肿瘤坏死因子（TNF-α）、白细胞介素-1β（IL-1β）、白细胞介素6（IL-6）水平、肺组织炎症蛋白表达量及细胞凋亡数量降低,PI3K、Akt蛋白表达升高（P＜0.05、0.01、0.001）。动物实验结果与网络药理学结果一致。结论 VAC 对脓毒症小鼠急性肺损伤具有一定的保护作用,其机制可能与调控 PI3K-Akt、NLRP3/TNF-α等通路抑制炎症的发展有关,为VAC抗炎作用机制的深入研究提供了依据。     

肺血管内皮细胞结构功能变化与急性肺损伤

急性肺损伤(acute lung injury,ALI)/急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)时血管内皮细胞既是受损的主要靶器官,还是活跃的效应细胞,有研究显示肺血管内皮细胞(pulmonary vasculary endothelial cell,PVEC)的改变在急性肺损伤中十分重要[1]。肺血管内皮细胞在细菌内毒素     

贝母瓜蒌散治疗支气管扩张症作用机制的网络药理学预测

目的运用网络药理学分析方法预测贝母瓜蒌散治疗支气管扩张症的潜在机制。方法运用TCMSP数据库检索贝母瓜蒌散中6味中药的化学成分和相关靶点蛋白。通过DisGeNet和GeneCards数据库确定支气管扩张症相关治疗靶点。合并化学成分靶点和治疗靶点并去重,运用Cytoscape 3.7.1软件建立化合物-靶点-疾病网络。依据拓扑学参数,基于STRING数据库分析上述靶点的相关性并进一步确认关键靶点。为推测贝母瓜蒌散治疗支气管扩张症的分子机制,运用DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路分析。最后运用SystemsDock数据库与AutoDock软件进行虚拟分子对接,从而验证化合物与关键靶点之间的亲和力。结果检索得到385个贝母瓜蒌散的药物靶点和51个支气管扩张症的治疗靶点。根据度(degree)、紧密度(closeness)、中心度(betweenness)等拓扑学参数筛选出18个位于关键节点的基因。通过GO分析预测得到与贝母瓜蒌散治疗支气管扩张症相关的454个生物学过程、33个细胞成分和18个分子功能三个维度的生物学功能指标。通过KEGG富集分析得到27个相关信号通路。最终通过分子对接可视化验证贝母瓜蒌散活性成分和主要靶点的结合力。结论运用网络药理学和可视化分子对接方法揭示了贝母瓜蒌散治疗支气管扩张的潜在机制,为深入实验研究奠定预测基础。     

基于指纹图谱及网络药理学探究胃宁散抗胃溃疡药效关联物质及作用机制

目的 根据指纹图谱及网络药理学探讨胃宁散(Weining San,WNS)抗胃溃疡(gastric ulcer,GU)的药效关联物质及作用机制。方法 采用HPLC建立12批WNS指纹图谱,并进行方法学考察,结合对照品指认特征峰,筛选药效关联物质,进行网络药理学分析。利用TCMIP、Swiss Target Prediction数据库检索成分靶点;利用OMIM、Gene Cards和Drugbank数据库检索GU疾病靶点,取成分与疾病的交集靶点,采用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并进行拓扑学参数分析;采用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分-疾病-靶点”网络图;采用Metascape网站对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。随后采用灌胃无水乙醇的方式建立酒精性GU小鼠模型,对网络药理学预测的结果进行验证。结果 HPLC指纹图谱方法学考察的精密度、稳定性、重复性均良好。经对照品比对及综合分析,确定三七皂苷R₁、人参皂苷Rg₁、1,4-二[4-(葡萄糖氧)苄基]-2-异丁基苹果酸酯、人参皂苷Rb₁...     

基于网络药理学研究琥珀散治疗子宫内膜异位症的作用机制

摘要：目的:应用网络药理学研究琥珀散治疗子宫内膜异位症的作用靶点、活性成分、信号通路等,从而探讨琥珀散治疗子宫内膜异位症的作用机制。方法:应用中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库及文献检索对琥珀散中10味中药主要化学成分进行筛选。采用Pubchem、HIT、SwissTargetPrediction、SEA数据库,对筛选出的化合物进行靶点预测。用DisGeNET、Drugbank、TTD、GSE6364、GSE7305数据库,对子宫内膜异位症进行靶点预测。将药物靶点与疾病靶点进行交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白。运用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络模型;用Cytoscape 3.7.2软件分别绘制中药-成分网络、成分-靶点网络,进一步筛选核心网络,进行拓扑分析;利用生物信息注释数据库（DAVID）进行基因本体（GO）功能注释富集分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Cytoscape软件构建琥珀散"有效成分-药物靶点-疾病靶点-信号通路"拓扑网络,确认可能的关键靶点和主要通路。结果:从琥珀散中筛选出190个化合物成分,与子宫内膜异位症关联最强的11个核心靶点;同时筛选出与琥珀散关键成分相关的主要信号通路7条;在此基础上构建了琥珀散的成分-靶点、成分-子宫内膜异位症靶点及相关信号通路的共同表达网络,发现琥珀散可能通过抗黏附、侵袭、种植等多靶点、多途径发挥对子宫内膜异位症的治疗作用。结论:从多角度探索了琥珀散治疗子宫内膜异位症的作用机制,揭示了琥珀散的药理作用,为其后续的实验研究及临床疗效指标的筛选提供了方向。     

地榆皂苷Ⅰ对脓毒症大鼠急性肺损伤的保护作用及机制研究

目的 基于网络药理学方法探讨地榆皂苷Ⅰ对脓毒症大鼠急性肺损伤的保护作用及机制,并通过实验进行验证。方法使用网络药理学方法预测地榆皂苷Ⅰ治疗脓毒症急性肺损伤的潜在靶点。采用盲肠结扎穿孔术复制大鼠脓毒症模型进行实验验证。将192只SD大鼠按随机数字表法分为假手术组（Sham组）、脓毒症组（Sep组）、常规治疗组（CT组）和地榆皂苷Ⅰ治疗组（ZgⅠ组）。Sham组、Sep组给予无菌生理盐水,CT组和ZgⅠ组大鼠给予相应剂量的林格氏液和地榆皂苷Ⅰ。观察各组大鼠动脉血气、血清炎症因子、肺湿/干质量比、肺组织病理变化、肺血管通透性、肺静脉紧密连接蛋白1(ZO-1)和血管内皮钙黏蛋白（VEcadherin）蛋白表达、72 h存活情况。结果 网络药理学结果显示,地榆皂苷Ⅰ治疗脓毒症的潜在靶点有47个,基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析结果显示,其机制可能与活性氧族代谢正向调控（positive regulation of reactive oxygen species metabolic process）、损伤修复（would healing）、内皮细胞增殖调控（regulat...     

谷氨酰胺对急性肺损伤的保护作用及机制

谷氨酰胺被称为"非必需氨基酸",但是在应激和危重状态下,则成为必需氨基酸。谷氨酰胺除做为主要氮源物质外,还对多种组织器官具有保护作用,因此引起人们越来越多的关注,对谷氨酰胺的研究不断深入。本文从谷氨酰胺的生理功能、药理作用、对肺脏的保护作用及其在临床应用中的前景等方面进行综述。     

基于网络药理学和分子对接探讨鼻炎数据挖掘核心方苍耳子散作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探究苍耳子散（CRZS）治疗异质性鼻炎的作用机制以及“多成分-多靶点-多通路”的整体药理作用特征。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索CRZS的活性成分及靶点;从GeneCards、DisGeNET、Phenopedia、TTD和PharmGKB数据库获取相关鼻炎的基因。通过STRING数据库与Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用STRING数据库对核心基因进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过Cytoscape软件构建“中药成分-靶点-信号通路”网络并筛选核心靶点;采用AutoDock软件对筛选得到的关键通路靶点进行分子对接。结果 CRZS有131个核心基因,鼻炎相关靶点756个,交集靶点41个。GO生物富集条目2005条,KEGG通路富集条目151条,HIF-1、Lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis等通路最具连接可能。分子对接显示,CEZS靶点的有效成分与3...     

急性肺损伤肺保护性通气及CVVH干预的临床研究

目的评价肺保护性通气及CVVH干预在控制急性肺损伤（ALI）和防治多器官功能障碍综合征（MODS）及降低其病死率中的作用。方法60例ALI患者随机分为肺保护性通气组（A组）和肺保护性通气及CVVH干预组（B组）各30例，比较两组患者呼吸力学、动脉血气及血流动力学的变化，观察两组患者肺及肺外器官功能改善率、机械通气并发症发生率、ICU病死率及其死亡原因等。结果两组患者的年龄和APACHE11评分比较差异无统计学意义（P〉0．05）；A组及B组对ALI患者的呼吸力学、动脉血气及血流动力学的影响均优于A组；肺保护性通气及B组对肺及肺外器官功能改善率明显优于A组，另外，机械通气所致肺损伤的发生率、机械通气相关心肌缺血和心律失常的发生率也均明显下降；B组因多器官功能衰竭（MOF）的ICU病死率为13．33％，明显优于A组（46．64％，P〈0．05）。结论肺保护性通气及CVVH干预能改善ALI患者的呼吸力学、动脉血气及血流动力学，能降低其呼吸机所致肺损伤（VILI）、机械通气相关心肌缺血和心律失常的发生率，在防治MODS及降低ALI患者病死率上有显著的临床效果。     

基于网络药理学红花三味散治疗非酒精性脂肪肝病的作用机制

目的 探讨红花三味散主要活性成分的作用靶点,通过其多成分-多靶点-多通路探讨治疗非酒精性脂肪肝病(NAFLD)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索收集红花三味散的活性成分,并经口服生物利用度(OB)和类药性(DL)筛选活性成分,依据反向药效团匹配方法和药物相似性方法预测化合物潜在靶点,...     

三氟醚对内毒素性急性肺损伤大鼠肺组织的保护作用

目的探讨七氟醚对内毒素性急性肺损伤大鼠肺组织的保护作用。方法选择12只雄性SD大鼠，随机分为两组各6只。观察组使用吸入七氟醚1．5％-2．0％，对照组仅单纯吸人氧气，比较两组大鼠DAD各项目评分以及白细胞计数、肿瘤坏死因子-α（TNF-α）水平。结果观察组白细胞计数显著低于对照组（P〈0．05），TNF-α水平低于对照组（P〈0．05），观察组肺泡纤维素渗出、肺泡出血、肺间质水肿、肺泡和肺间质中性粒细胞聚集评分均显著低于对照组（P〈0．05）。结论七氟醚能减少急性肺损伤大鼠的炎症反应，降低体内白细胞数量，具有一定的肺保护作用。     

益气活血中药防治急性肺损伤的作用机制研究

目的探究对急性肺损伤患者应用益气活血中药防治的作用机制。方法对近年来相关临床研究资料以回顾性的方法进行分析,归纳总结益气活血中药对此类患者的医疗机制。结果对急性肺损伤患者,益气活血中药的作用机制主要有抑制炎性反应、调节免疫功能、抗氧化作用以及调节凝血和纤溶系统异常等。结论对急性肺损伤患者应用中医方法进行治疗在当前已经取得了令人满意的效果,而随着科学技术的不断发展,对急性肺损伤患者的治疗将更具有特异性,最大程度保障患者身体健康以及生活质量,需要不断研究。