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相似文献
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1.
糖尿病肾病肾阳虚证DNA消减文库的构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:采用抑制性消减杂交技术(suppression subtractire hybridization,SSH)构建汉族人糖尿病肾病(dialbetic nephropth1y,DN)肾阳虚证DNA消减文库。方法:选择汉族人DN且中医辨证为肾阳虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和反向消减杂交。用硅胶法抽提血白细胞DNA,用RsaI酶切基因组DNA成大小不等的片段,分别与两种不同的接头连接,进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将PCR产物与U载体连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建DN肾阳虚证DNA消减文库。结果:用SSH方法筛选出了DN肾阳虚证的差异DNA片段,得到600个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了DN肾阳虚证的DNA消减文库。结论:SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建。DN肾阳虚证DNA消减文库,为进一步筛选和克隆DN肾阳虚证相关基因奠定了基础。  相似文献   

2.
狼疮性肾炎肾阴虚证DNA消减文库的构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:采用抑制性消减杂交技术(Suppression subtractive hybridization,SSH)构建狼疮性肾炎(lupus nephritis,LN)肾阴虚证DNA消减文库。方法:选择汉族人LN中医辨证为肾阴虚证患者以及正常人作为其对照组,用硅胶法抽提血白细胞DNA,经过酶切、接头连接、两次抑制性消减杂交及抑制、巢式PCIR后,将PCIR产物与A载体连接,经蓝白斑筛选,再用PCIR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建LN肾阴虚证DNA消减文库。结果:用SSH方法筛选出了LN肾阴虚证的差异DNA片段,得到581个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了DN肾阳虚证的DNA消减文库。结论:SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建LN肾阴虚证DNA消减文库,为进一步筛选和克隆LN肾阴虚证相关基因奠定了基础,亦为寻找肾虚证相关基因提供重要线索。  相似文献   

3.
慢性肾炎肾阳虚证cDNA消减文库的构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:采用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建汉族人慢性肾炎(chronic glomemlonephritisCGN)肾阳虚证cDNA消减文库。方法:选择汉族人CGN且中医辨证为肾阳虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和反向消减杂交。采用Trizol一步法提取总RNA。用SMART(Switch Mechanism At 5end of RNA Template)技术逆转录并扩增总cDNA,用RsaI酶切基因组cDNA成大小不等的片断,分别与两种不同的接头连接,进行2次消减杂交及两交抑制性PCR,建立抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH),在SSH基础上进行镜像选择(mirror orientation selection,MOS),将PCR产物与U载本连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建CGN肾阳虚证消减文库。结果:用SSH方法筛选出了CGN肾阳虚证的差异cDNA片段。得到了443个白色克隆,再经PcR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了CGN肾阳虚证的cDNA消减文库。结论:SSH技术能够快速有效地分离差异cDNA片段以构建CGN肾阳虚证cDNA消减文库,为进一步筛选和克隆CGN肾阳虚证相关基因奠定了基础。  相似文献   

4.
糖尿病肾病肾阴虚证DNA消减文库的构建   总被引:5,自引:0,他引:5  
在多年糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾虚证的研究中,结果发现血管紧张素Ⅰ转换酶(angiotensin Ⅰ-converting enzyme,ACE)基因多态性与肾阴虚证密切相关[1].这提示肾阴虚证存在其相关基因.目前克隆疾病的相关基因有多种方法,其中抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)对研究复杂基因组的差异基因具有一定的优越性.目的:采用抑制性消减杂交技术(suppression sub-tractive hybridization,SSH)构建汉族人糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证DNA消减文库.方法:选择汉族DN且中医辨证为肾阴虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和反向消减杂交.用硅胶法抽提血白细胞DNA,用RsaⅠ酶切基因组DNA成大小不等的片段,分别与两种不同的接头连接,进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将PCR产物与U载体连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建DN肾阴虚证DNA消减文库.结果:用SSH方法筛选出了DN肾阴虚证的差异DNA片段,得到586个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了DN肾阴虚证的DNA消减文库.结论:SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建DN肾阴虚证DNA消减文库,为进一步筛选和克隆DN肾阴虚证相关基因奠定了基础.  相似文献   

5.
糖尿病肾病肾阴虚证DNA消减文库的构建   总被引:2,自引:0,他引:2  
在多年糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾虚证的研究中,结果发现血管紧张素Ⅰ转换酶(angiotensin Ⅰ—converting enzyme.ACE)基因多态性与肾阴虚证密切相关。这提示肾阴虚证存在其相关基因。目前克隆疾病的相关基因有多种方法,其中抑制性消减杂交(suppression subtractiv ehybridization。SSH)对研究复杂基因组的差异基因具有一定的优越性。目的:采用抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridiration,SSH)构建汉族人糖尿病肾病(diabetic nephropathy,DN)肾阴虚证DNA消减文库。方法:选择汉族DN且中医辨证为肾阴虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和反向消减杂交。用硅胶法抽提血白细胞DNA。用Rsa Ⅰ酶切基因组DNA成大小不等的片段,分别与两种不同的接头连接.进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将PCR产物与U载体连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建DN肾阴虚证DNA消减文库。结果:用SSH方法筛选出了DN肾阴虚证的差异DNA片段,得到586个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了DN肾阴虚证的DNA消减文库。结论:SSH技术能够快速有效地分离差异DNA片段以构建DN肾阴虚证DNA消减文库.为进一步筛选和克隆DN肾阴虚证相关基因奠定了基础。  相似文献   

6.
狼疮性肾炎肾阴虚证cDNA消减文库的构建   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:采用抑制性消减杂交(suppression subtractive hybridization,SSH)技术构建汉族人狼疮性肾炎(LupusNephritis LN)肾阴虚证cDNA消减文库。方法:选择汉族人LN且中医辨证为肾阴虚证的患者以及正常人作为其对照组,进行正向和消减杂交。采用Trizol一步法提取总RNA,用SMART(Switch Mechanism At 5 end of RNA Template)技术逆转录并扩增总cDNA,用RsaI酶切基因组cDNA成大小不等的片段,分别与两种不同的接头连接,进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将PCR产物与U载体连接,经蓝白斑筛选后,再用PCR方法插入片段筛选出阳性重组质粒,构建LN肾阴虚证消减文库。结果:用SSH方法筛选出了LN肾阴虚证的差异cDNA片段,得到了450个白色克隆,再经PCR方法快速筛选出阳性重组质粒,从而成功地构建了LN肾阴虚证的cDNA消减文库。结论:SSH技术能够快速有效地分离差异cDNA片段以构建LN肾阴虚证cDNA消减文库,为进一步筛选和克隆LN肾阴虚证相关基因奠定了基础。  相似文献   

7.
连作地黄cDNA消减文库的构建及分析   总被引:3,自引:2,他引:1  
目的:通过构建连作地黄cDNA消减文库,探讨地黄连作障碍的分子机制.方法:利用抑制性消减杂交(SSH)技术构建连作地黄的正反消减文库,通过蓝白斑筛选、PCR的方法鉴定出阳性克隆,并对其进行测序和生物信息学分析.结果:连作地黄cDNA消减文库构建成功,正向和反向消减文库均筛选了300个阳性克隆.测序结果表明:正库、反库分别获得232条、214条特异的EST序列;经NCBI数据库分析,正库、反库中分别有200,195条EST序列的基因具有蛋白功能注释;COG基因功能预测结果表明,正库、反库中分别有60,61条EST序列具有相应的的基因功能分类,涉及21个代谢途径.结论:差异表达基因的功能注释表明,连作对地黄体内的基因表达具有深刻的影响.本研究筛选地黄响应连作的关键基因,为揭示地黄连作障碍的分子机制奠定了基础.  相似文献   

8.
刘清华  周岱翰 《中医药学刊》2010,(12):2539-2543
目的:构建脾虚痰湿型肺癌肿瘤相关消减cDNA文库,以寻找脾虚痰湿型肺癌证候特异基因。方法:以原发性肺癌脾虚痰湿型的患者肿瘤组织及瘤旁正常组织为材料,分离Poly(A)RNA,反转录合成单链及双链cDNA,经Rsa I酶切,将肿瘤组织cDNA分成两组,分别与两种不同的接头连接,再与正常肺组织cDNA进行两次消减杂交和两次抑制性PCR扩增,将第两次PCR产物与pGEM-T载体连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞进行文库扩增,构建了消减cDNA文库,同法建立反向消减cDNA文库。对经反向斑点杂交验证,从cDNA文库中随机挑选的200个含差异片段的克隆,碱裂解法提取DNA,从克隆5’端进行单向测序。EST测序序列行生物信息学分析,所有基因聚类用BLASTX(E values〈10-5)和BLASTN(E values〈10-10)搜索GenBank的非冗余核酸序列数据库及蛋白质库予以注释。结果:经文库扩增,随机挑选克隆进行PCR鉴定,插入片段主要分布在250~1000bp之间,并以反向斑点杂交法进一步验证其阳性克隆,最终获得251个阳性克隆,其中正向消减文库获得165个阳性克隆,反向消减文库获得86个阳性克隆。测序发现了正向消减文库差异基因22个,反向消减文库差异基因6个。结论:成功构建脾虚痰湿型肺癌肿瘤相关消减cDNA文库,发现了那些有明确生物学功能的证候相关基因,其基因表达及分布特征初步反映了肺癌脾虚痰湿型在分子层面的证候特点。  相似文献   

9.
基于PCR的抑制消减杂交(SSH PCR)是目前用于差异cDNA序列的检测,以及构建基因组差异DNA文库最有效、并且应用最广泛的方法之一.虽然这种方法有很多优点,但仍存在一定的局限性,具有一些不可避免的缺陷.从四个方面讨论SSH在植物功能基因研究中的应用,进而探讨SSH PCR方法在植物基因克隆方面遇到的问题及解决对策.  相似文献   

10.
李标  唐坤  张岗  郭顺星 《中国药学杂志》2012,47(22):1790-1795
 目的 构建菌根真菌共生诱导的铁皮石斛根的差减cDNA文库,从中筛选出差异表达基因。方法 采用SMARTer PCR cDNA合成方法直接以总RNA为模板合成并富集稀少cDNA,再利用抑制消减杂交(SSH)方法构建受菌根真菌共生诱导铁皮石斛根的差减cDNA文库。结果 成功构建了受菌根真菌诱导铁皮石斛根的差减cDNA文库,共获得1 975个阳性克隆。经检测,90%以上克隆能扩增出有效产物,其插入片段大小在150~1 000 bp之间。随机挑取了20个克隆菌液测序并进行了比对分析,大部分为植物应对环境胁迫防御性基因。结论 该技术体系所构建的差减cDNA文库质量较好,操作方便,尤其适用于珍稀濒危的植物材料。  相似文献   

11.
注射用丹参分子排阻色谱及指纹图谱差减分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 探讨注射用丹参质量差异的分析方法.方法 取临床不良反应有差异的不同批号的样品进行平行比对试验,分别应用凝胶分子排阻色谱、碳十八反相液相色谱进行指纹图谱分析,通过综合差减分析揭示非小分子酚酸类成分信息.结果 注射用丹参的凝胶分子排阻色谱有显著的批间差异,非小分子酚酸类成分批间差异显著,与豚鼠急性毒性反应程度相对应.结论 非小分子酚酸类成分应作为丹参系列注射剂质量控制的重点.提出谱毒学研究是中药注射剂安全性研究的重要方向之一.  相似文献   

12.
目的:系统评价六味地黄丸(汤)及其加减方治疗糖尿病肾脏病(DKD)的疗效及安全性。方法:计算机检索Cochrane图书馆临床对照试验库、MEDLINE、中国期刊全文数据库(CNKI),中国生物医学文献数据库和中文科技期刊全文数据库等。收集六味地黄丸(汤)及其加减方治疗糖尿病肾脏病的随机或半随机对照试验。由两名研究者独立选择试验、提取资料,并按照Cochrane系统评价的方法评价纳入研究的质量和提取有效数据,而后应用RevMan5.0.24软件进行Meta分析。结果:共纳入20篇文献,共计1318例患者。大部分试验方法质量学较低且样本含量小。"漏斗图"呈不对称分布,提示可能存在发表偏倚及试验方法质量低下,发表偏倚提示阴性结果的试验可能未发表。结论:六味地黄丸(汤)及其加减方可能是一种相对安全和有效治疗糖尿病肾脏病的药物。由于纳入试验方法质量低下和可能存在发表偏倚,使本系统评价的证据强度不足,有待进一步进行大样本、高质量的多中心随机双盲对照试验来证实。  相似文献   

13.
The nature and effect of the changes in mean arterial pressure (MAP) of albino normotensive rats through i.v. injection of aqueous extracts of green bean, common rue and kelp were studied with emphasis on possible interactions among these extracts. All extracts were hypotensive, contained bioactive proteinaceous substances and stimulated urine flow. A combination of two or three plant extracts showed subtractive or additive effects, suggesting important bearing on their use therapeutically. © 1997 John Wiley & Sons, Ltd.  相似文献   

14.
目的: 构建三氧化二砷(As_2O_3)诱导的急性早幼粒细胞白血病细胞株NB4细胞凋亡相关基因文库.方法:用含4 μmol·L~(-1)As_2O_3和正常培养基培养NB4细胞24 h,抽提总RNA,经逆转录酶合成双链cDNA,分别以砷诱导凋亡组和对照组作为tester和driver,进行双向抑制性差减杂交(supptess-ion sublxactive hybridization,SSH),筛选As_2O_3诱导的NB4细胞凋亡相关基因,将差异表达基因进行PCR扩增并与pGEM-Teasy克隆载体连接,转化DH5 α大肠杆菌,经蓝白斑筛选获得白色阳性克隆,PCR扩增出未知基因片段.结果:成功构建了分别代表在NB4细胞中表达上调和下调的基因文库.结论: 经双向抑制性差减杂交获得了NB4细胞差异表达基因文库,为克隆NB4细胞凋亡相关基因奠定了基础.  相似文献   

15.
杨双  彭飞  刘年猛  孙慧  杨盛清  袁仕善 《中草药》2014,45(20):2958-2962
目的 鉴定血根碱致钉螺肝脏差异表达的基因。方法 浓度梯度法测定血根碱浸杀钉螺的半数致死浓度(LC50);以80%LC50血根碱浸泡钉螺,分离血根碱组和清水组活钉螺肝脏;提取mRNA,逆转录为cDNA,进行抑制消减杂交;巢式PCR扩增差异cDNA,克隆至pMD-18T载体,PCR和测序鉴定,NCBI中blastx比对分析表达序列标签(expressed sequence tag,EST)。结果 血根碱浸杀钉螺LC50为7.5 mg/L。获得的EST序列大小在150450 bp,经blastx比对,表达上调的基因有α-4(VI)胶原链、α-5(VI)胶原链、40 S核糖体蛋白S19、假定蛋白(WP009787 197.1)、kelch样蛋白、颗粒体样蛋白;表达下调的基因有β-微管蛋白、α-淀粉酶1、大亚基核糖体蛋白L23e、几丁质酶-1、捷蛋白-3、假定蛋白(EKC34 262.1)、线粒体乙醛脱氢酶、肽聚糖识别蛋白、真核转录延长因子1A、铁蛋白、去整合素金属蛋白酶、溶菌酶1、1,3(4)-β-葡聚糖酶1、血蓝蛋白α-4D亚基,这些基因编码蛋白的功能涉及物质转运、蛋白合成、增殖诱导、营养、抗氧化、抗炎、呼吸、信号转导等。结论 血根碱处理导致钉螺肝脏基因表达发生改变。  相似文献   

16.
 目的探讨环孢素A(cyclosporin A,CsA)作用于人滋养层细胞差异表达的功能基因。方法应用抑制性消减杂交筛选1.0μmol·L-1 CsA作用于JAR细胞系前后差异表达的功能基因,经RT-PCR及蛋白质印迹进一步验证CsA作用前后原代分离的人早孕期滋养层细胞及JAR细胞株titin表达的变化。结果CsA作用于人JAR细胞系前后出现6个具有差异表达的基因,其中1个为已知基因titin,2个为功能未知的mRNA,3个为位于16号染色体上的EST。RT-PCR显示,CsA作用于人滋养层细胞24 h后出现titin mRNA的表达,72 h达高峰,并呈现明显的剂量依赖性,1.0μmol·L-1 CsA作用最明显。蛋白质印迹显示,CsA可诱导titin的表达。结论CsA可能通过诱导滋养层细胞titin的高表达,改变其生物学行为,从而有利于胚胎着床及早期发育。  相似文献   

17.
目的 研究益气活血中药复方对CVB3乳鼠心肌细胞感染模型线粒体核糖体蛋白L51(mitochondrial ribosomal protein L51,MRPL51)表达的影响,以期从基因水平揭示CVB3心肌炎的发病机制及益气活血中药复方治疗病毒性心肌炎的作用机制,并进一步证实益气活血中药复方治疗CVB3病毒性心肌炎的有效性.方法 通过乳鼠心肌细胞培养,建立病毒组和益气活血中药复方组心肌细胞模型,以改良的抑制性消减杂交技术(suppression subtractive hybridization,SSH),分离两组差异表达的基因,并通过荧光RT-PCR对上述结果进行验证.结果 SSH结果显示,MRPL51基因在益气活血中药复方组为低表达,而在病毒组则呈高表达状态,荧光RT-PCR结果显示益气活血中药复方组中MRRPL51基因达到阈值的循环数(Ct)明显多于病毒组,提示MRPL51在病毒组中的表达较中药组中高.结论 MRPL5基因表达上调可能是CVB3致病毒性心肌炎机制之一;益气活血中药复方通过下调MRPL5基因的表达而实现治疗病毒性心肌炎的目的 .  相似文献   

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