耐药结核分枝杆菌基因突变分析

目的 探讨结核分枝杆菌耐药表型与基因突变位点之间的相互关系.方法 采用序列特异性引物分别扩增92株结核分枝杆菌利福平耐药基因rpoB,异烟肼耐药基因katG、inhA、ahpC,链霉素耐药基因rrs、rpsL,乙胺丁醇耐药基因embB及喹诺酮耐药基因gyrA,SSCP筛选出突变序列,DNA测序分析突变性质.结果 59株利福平耐药株rpoB基因突变检出率94.9%(56/59),以Ser450Trp突变最多;90株异烟肼耐药株中,katG基因突变检出率38.9%(35/90),以Ser315Thr最多,3株检出inhA基因突变,ahpC基因无突变检出;34株喹诺酮耐药株中gyrA基因突变检出率82.4%(28/34),主要为Asp94Gly,其次为Ala90Val;31株链霉素耐药株中,15株检出rrs突变,最常见为A514C和A1041G,10株发生rpsL Lys88Arg突变,总的链霉素基因突变检出率为77.4%(24/31);31株乙胺丁醇耐药株中embB 基因突变检出率19.4%(6/31),主要为Met306Val.结论 耐药结核分枝杆菌耐药情况较为严重,以DNA测序为基础的基因突变分析能快速有效地检测结核分枝杆菌的rpoB、katG、gyrA、rrs、rpsL、embB 等耐药分子标识,显示了西安地区耐药性结核分枝杆菌的突变特点,为结核病的临床诊断和合理用药提供了实验依据.     

结核分枝杆菌耐药基因突变的研究

结核病在许多国家出现回升的一个主要原因是细菌耐药性问题 ,随着联合药物治疗的使用 ,又出现了耐多药结核分枝杆菌 (结核菌 ) ,使许多结核病 ,难以治疗 ,增加了死亡率[1] 。目前对于结核菌的耐药机制的研究已有了较大的进展 ,细菌内一些酶的基因突变或缺失是导致耐药的重要原因。随着分子生物学技术的发展 ,通过聚合酶链反应 (PCR)等方法对耐药基因进行快速检测 ,大大缩短了检测时间 (2～3d) ,为耐药结核菌的治疗提供参考。本研究通过PCR -SSCP ,PCR -测序技术检测结核菌临床分离株的katG、rpoB和rpsL基因序列 ,分析济南军区结核菌…     

徐州市结核分枝杆菌耐药原因分析

目的探讨徐州市结核分枝杆菌产生耐药的原因。方法采用发放调查表的方式对161例肺结核患者分别从年龄、收入、职业、文化程度、治疗史、密切接触史等方面进行调查。结果高中及以上文化程度的肺结核患者初治耐药率显著低于初中以下文化程度的肺结核患者(χ2=6.61,P=0.01),复治敏感患者与复治耐药患者在年龄、治疗史方面差异有统计学意义(t=2.99,P=0.01)、(χ2=5.25,P=0.02),中青年肺结核患者耐药率明显高于其他年龄组(χ2=6.30,4.10;P=0.01,0.04)。结论应加强对肺结核患者尤其是文化程度低的肺结核患者的宣教工作,采取切实有效的措施加强对肺结核患者的管理,把直接面视下短程化疗(DOTS)策略[1]落到实处,提高首次治愈率,减少耐药结核病的发生。     

四川德阳地区结核分枝杆菌耐药基因突变位点的分布特点及基因型耐药的分析

目的探讨四川德阳地区结核分枝杆菌耐药基因突变位点的分布特点及基因型耐药的分析。方法收集在2010年2月-2013年3月检出的257例肺结核病患者结核分枝杆菌DNA阳性的痰液标本,采用聚合酶链式反应（PCR）和反向点杂交（RDB）相结合的基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药基因突变位点进行检测和分析。结果 257例肺结核患者中检测出49例存在结核分枝杆菌耐药基因位点突变,其中发生katG 315、rpsL43、embB 306和rpoB 531丝氨酸（S531L）位点突变的分别为30例（11.67%）、18例（7.00%）、11例（4.28%）和10例（3.89%）。234例初治肺结核患者对异烟肼、利福平、乙胺丁醇及链霉素的基因型耐药率分别为9.83%、4.27%、3.42%和5.13%,耐多药率为2.99%;23例复治肺结核患者对上述药物的基因型耐药率分别为52.17%、26.09%、13.04%和43.48%,耐多药率为13.04%。初治患者的基因型耐药率及耐多药率均明显低于复治患者。结论四川德阳地区结核分枝杆菌常见耐药基因突变位点分别为katG 315、rpsL 43、embB 306和rpoB 531丝氨酸（S531L）突变位点;肺结核初治患者的基因型耐药率及耐多药率均明显低于复治患者;该地区肺结核的耐多药率相对较低。     

结核分枝杆菌链霉素耐药分离株rpsL基因突变的检测

目的 探讨结核分枝杆菌（结核菌）对链霉素（Ｓｍ）产生耐药性的分子机制,建立直接快速检测结核菌Ｓｍ药物敏感性的试验方法。方法 应用聚合酶链反应－单链构象多态性（ＰＣＲ－ＳＳＣＰ）银染分析技术检测３２例结核菌临床分离株的ｒｐｓＬ基因。结果 以结核菌标准株（Ｈ３７Ｒｖ）为对照,３２株结核菌临床分离株中,１０株Ｓｍ敏感株的ｒｐｓＬ基因未见ＳＳＣＰ泳动异常,２２株Ｓｍ耐药株中,１６株（７２．７％）的ｒｐｓＬ     

耐药结核分枝杆菌基因变异研究

目的 研究多药结核分枝杆菌ｋａｉＧ、ｉｎｈＡ基因的变异机理。方法 用ｋａｔＧ、ｉｎｈＡ基因片引物,聚合酶链反应扩增产物,克隆后制质粒、直接测定ＤＮＡ序列。结果 １５株耐异烟肼菌株均有ｋａｔＧ基因突变,主要为点突变,其中１４株有４６３位和３１５位ＡＡＰ２密码改变,在１８个耐异烟肼菌株中,全部出现基因ｉｎｈＡ 基因变异,主要为点突和人,以单个点变异主,各菌株变异不同,ｋａｔＧ、ｉｎｈＡ基因同时出现变异     

徐州市结核分枝杆菌耐药情况调查

目的了解徐州市结核分枝杆菌的耐药情况。方法采用整群抽样的方法连续收集徐州市城区结核防治门诊2008年8月至2010年4月痰菌阳性的肺结核患者的痰标本193例,用比例法做一线药物（异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇）的敏感试验,耐多药的患者做二线药物（左氧氟沙星、阿米卡星、卷曲霉素、丙硫异烟胺）的敏感试验。结果符合条件并纳入调查的细菌有178株;178株结核分枝杆菌总的耐药率为38.8%,初治和复治耐药率分别为21.4%、72.1%,耐多药率为18.0%,初治和复治耐多药率分别为4.3%、44.3%,4种一线药物耐药顺序由高到低分别为耐异烟肼30.3%,耐链霉素29.2%,耐利福平22.5%,耐乙胺丁醇19.1%,复治患者对4种一线药物的耐药率明显高于初治患者;同时耐1种、2种、3种、4种药物的初治和复治耐药率分别为6.8%、8.5%、2.6%、4.3%,9.8%、14.8%、9.8%、29.5%,复治患者同时耐3、4种药物的耐药率明显高于初治者;32例耐多药患者对4种二线药物总耐药率为37.5%,耐药顺序由高到低分别为耐左氧氟沙星28.1%,耐丙硫异烟胺15.6%,耐阿米卡星12.5%,耐卷曲霉素6.3%。结论徐州市结核分枝杆菌整体耐药率仍处于高水平,各部门的结核病防治工作者应采取切实有效的措施,降低耐药结核病的发生。     

中国结核分枝杆菌寡核苷酸基因分型及其耐药性分析

目的 选用间隔区寡核苷酸分型方法对有中国代表性的菌株进行基因分型,研究不同基因型在中国的流行情况,并分析基因型与耐药表型的关系.方法 中国疾病预防控制中心于2007-2008年,按照流行病学抽样的原则从中国31个省收集涂片阳性的结核病患者的临床分离株4 017株,采用比例法进行药物敏感性实验,选用寡核苷酸分型方法对菌株进行基因分型.基因型检出率差异比较采用x2检验.结果 在4017株结核分枝杆菌临床分离株中,北京基因型菌株包括2 500株(62.2％).北方地区来源菌株北京基因型检出率达76.5％(1 913株),高于南方地区检出率(53.2％,1 330株),差异有统计学意义(x2=219.69,P＜0.05).南方地区T1型检出率达13.3％(332株),高于北方地区检出率(4.3％,108株),差异有统计学意义(x2=88.07,P＜0.05).北京基因型在耐利福平(21.7％)、耐氧氟沙星(4.9％)和MDR( 11.3％)的比例都高于非北京基因型的相应菌株比例18.4％、2.4％和7.4％,差异有统计学意义(x2值分别为22.10、14.42和14.83,P均＜0.05).结论 北京基因型目前仍然是中国主要流行基因型,并且比例呈现出地域差别,北方地区显著高于南方地区.北京基因型菌株与耐利福平、耐氧氟沙星和MDR有关.     

结核分枝杆菌耐药基因与检测方法的研究进展

结核分枝杆菌(MTB)的高耐药问题已成为新世纪结核病控制的三大难题之一[1].近年来,随着分子生物学技术的迅速发展,人们对MTB耐药的分子机制进行了深入研究,并已取得了很大进展.本文就此内容综述于下.     

结核分枝杆菌km基因的突变情况分析

目的探讨结核分枝杆菌km基因突变的情况。方法通过传统梯度药敏试验和聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析248株分枝杆菌临床分离株耐药情况和km基因的变化。结果药敏试验耐药率为32.7%(81/248),248株分枝杆菌临床分离株的16S rDNA SSCP电泳图谱均与结核分枝杆菌标准株相同。81株耐卡那霉素分离株中,24株(29.6%)km基因SSCP泳动异常。结论其部分耐药原因可能是由于T.M耐KM药物的km基因突变所致。     

河南省结核分枝杆菌基因分型与耐药性分析

摘要:目的：研究河南省结核分枝杆菌基因型别与耐药性和地区分布关系。 方法：用间隔区寡核苷酸序列（Spoligotyping）基因分型技术对344株结核分枝杆菌进行分型。 结果：344株结核分枝杆菌分为4个基因群［Beijing和Beijing近似群(简称北京群)、T群、Manu2群、S和LAM3群］,共24个基因型,北京基因型有299株,占87.7%,但北京型与非北京型之间耐多药（MDR）株所占比例差异无统计学意义（χ²=1.46,P>0.05）;北京基因型在≤60岁感染者中分离率占83.6%;除个别地区外,不同地区间的分布无显著性差异。 结论：河南省结核分枝杆菌以北京基因型为主要流行型,与MDR和任意耐药无相关性,以≤60岁感染者居多,嵩县分离率略低。     

结核分枝杆菌mpt64基因突变研究

目的分析结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)mpt64基因突变情况。方法提取MTB标准株H37Rv和45株MTB临床株的DNA,扩增mpt64基因并进行序列分析。结果 MTB标准株H37Rv和44株MTB临床株的mpt64基因无突变,1株MTB临床分离株的mpt64基因存在63个碱基的缺失突变。结论结核分枝杆菌mpt64基因突变频率低。     

耐药结核分枝杆菌肺结核的影像分析

本文根据我市结防所痰检室2001～2005年的检测资料，对耐药结核分枝杆菌肺结核及同期的菌阳结核分枝杆菌肺结核的影像学表现进行对比分析如下。     

结核分枝杆菌364株耐药结果分析

目的：分析肺结核患者的耐药情况。方法：对沈阳市胸科医院2007-01/2008-05培养阳性的肺结核患者364例进行4种抗结核药物（异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇）的耐药性测定。结果：364株结核分枝杆菌的总耐药率为54.4%,其中初始耐药率为40.2%,获得性耐药率为69.7%;初始耐药率与获得性耐药率比较,差异有统计学意义（2χ=5.43,P〈0.05）。结论：沈阳地区结核病耐药严重,应采取有效的防控措施。     

耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析

目的了解中国耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因的分子特征。方法对138株耐多药结核分枝杆菌和45株敏感菌的耐药相关基因inhA、katG和oxyR-ahpC间隔区(异烟肼)、rpob(利福平)、gyrA(氧氟沙星)和rrs(卡那霉素)进行序列测定,分析其基因突变特点。结果 138株耐多药结核分枝杆菌中,14.4%的菌株inhA基因发生突变,72.5%菌株的katG基因发生突变,15.9%菌株的oxyR-ahpC基因发生突变,同时考虑这3种基因,异烟肼耐药相关基因突变检出率可达90.6%;94.2%菌株的rpoB基因发生突变,74.5%菌株的gyrA基因发生突变,61.1%菌株的rrs基因发生突变,主要的突变位点为katG315(66.7%),inhA-15(9.4%),oxyR-ahpC-10(5.1%),rpoB516(13.8%),526(26.1%)和531(49.3%),gyrA90(21.6%)和94(51%),rrs1401(61.1%)。结论我国耐多药结核菌异烟肼、利福平、氧氟沙星和卡那霉素耐药相关基因最常见突变为katG315、inhA-15,rpoB531、526和516,gyrA94和90,rrs1401。     

结核分枝杆菌耐药基因与检测方法的研究进展

结核分枝杆菌(MTB)的高耐药问题已成为新世纪结核病控制的三大难题之一[1]。近年来,随着分子生物学技术的迅速发展,人们对MTB耐药的分子机制进行了深入研究,并已取得了很大进展。本文就此内容综述于下。一、研究内容近年来,国内外研究者主要从遗传学领域研究入手,企图阐明MTB耐药的分子基础,以找出耐药基因序列。并寻找耐一种药物可能存在的多种耐药基因、寻找耐多药菌株的可能耐药机制、寻找耐药基因突变与可能的诱变因素之关系,建立快速检测MTB耐药基因型的分子生物学诊断技术,以便在控制结核病的流行中发挥作用。二、研究进展(一)阐…     

非结核分枝杆菌临床株rpoB基因多态性分析

目的分析常见非结核分枝杆菌(non-tuberculous mycobacteria,NTM)临床株rpoB基因的多态性。方法提取NTM标准菌株和临床菌株的DNA,扩增其rpoB基因部分序列并进行多态性分析。结果 10种共27株NTM临床株中有8种共14株的rpoB基因存在多态性位点,其中脓肿分枝杆菌和耻垢分枝杆菌中均发现3个多态性位点。结论NTM临床菌株的rpoB基因存在多态性,是否会影响其在NTM分子鉴定中的应用仍需进一步研究。     

rpoB基因在结核分枝杆菌利福平/利福布丁交叉耐药株中突变情况的差异分析

目的 了解结核分枝杆菌利福平/利福布丁交叉耐药株与利福平耐药/利福布丁敏感株rpoB全基因突变特征的差异.方法 测定rpoB全基因序列,比较278株利福平/利福布丁交叉耐药(rifampicin/rifabutin cross-resistant,RIF/Rfb-R)株和40株利福平耐药/利福布丁敏感(rifampicinresistant/rifabutin-susceptible,RIF-R/Rfb-S)株,30株利福平/利福布丁敏感(rifampicin-susceptible/rifabutin-susceptible,RIF-S/Rfb-S)株及标准株H37 Rv之间的rpoB全基因序列突变差异.结果 利福平/利福布丁敏感株和H37Rv rpoB全基因未发现突变;利福平/利福布丁交叉耐药株的常见突变位点是531(70.5％)和526( 20.9％).223( 80.2％)株单点突变株分别含有S531L、S531W、H526D、H526Y、H526R、Q513K、Q513P、Q510H、V176F、P287R、Y395C及H404Y单点突变,55( 19.8％)株多重突变株分别以S531L、H526R、H526Y、H526D、D516G和Q513K位点与其他位点联合突变为主.利福平耐药/利福布丁敏感株的常见突变位点分别是516(65.0％)、526( 17.5％)和533( 10.0％).21(52.5％)株单点突变株分别含有L533P、H526L、H526S、S522L、D516V、D516Y和D516F单点突变,19(47.5％)株多重突变株分别以D516V和L533P位点与其他位点联合突变为主.结论 本批标本中,利福霉素耐药株rpoB基因突变率为100％,利福平/利福布丁交叉耐药株与利福平耐药/利福布丁敏感株rpoB全基因单点突变株的突变位置或氨基酸替换类型、多重突变株的突变位置或组合类型以及常见突变位点或其氨基酸替换类型完全不同,rpoB全基因DNA序列分析对临床科学应用利福平和利福布丁有指导意义.     

江西省3个监测点结核分枝杆菌耐药性及耐药基因检测分析

  目的  了解江西省国家级结核病耐药监测点确诊病例的分枝杆菌分离菌株耐药性及耐药基因突变情况,为耐药结核病防治策略制定提供科学依据。  方法  采用罗氏药敏方法测定结核分枝杆菌的耐药性,并采用PCR-线性杂交酶法进行表型耐药菌株耐药基因检测。  结果  2019年3个监测点共纳入病例280例。 获得264株分离菌株,250株为结核分枝杆菌,14株为非结核分枝杆菌。 大余县、进贤县和广丰区3个监测点的分离株总耐药率、单耐药率、多耐药率、耐多药率分别为25.60%（64/250）、7.20%（18/250）、3.20%（8/250）、5.60%（14/250）;男性分离株耐药检出率高于女性;S315T1是本地区异烟肼耐药基因突变的主要型别,gyrA基因突变是江西省结核分枝杆菌对氟喹诺酮类药物耐药的主要基因。  结论  使用PCR-线性杂交酶法筛查一线药、二线药耐药基因突变,对确定治疗方案及结核病的防控有重要意义。 江西省要加强对耐药结核病患者的管理,控制传染源,从而减少耐药菌株的产生和传播。     

链霉素耐药结核分枝杆菌rpsL、rrs基因突变分析

目的：探讨链霉素耐药相关基因rpsL、的突变与链霉素耐药性的关系。方法：采用PCR和PCR～DS技术对66株临床分离株进行rpsL、rrs基因检测和序列分析。结果：常规药敏实验显示20株为链霉素敏感株，46株为链霉素耐药株。20例敏感株中未发现2个基因突变，46株耐多药临床分离株中rpsL 67％，rrs基因突变率为37％，两种基因同时突变率为2％。结论：PCR—DS对耐链霉素结核分枝杆菌的检出率较高，与传统药敏试验互补，对临床耐药性检测和用药有指导意义。