GOPubMed:基于GO和MeSH的信息检索与分析研究

GOPubMed是一种基于PubMed的结果可视化和后处理类型的智能搜索引擎.从工作原理、关键技术以及扩展功能3个方面对其性能进行解析.研究显示,GOPubMed利用基于语义网的语义分类工具--GO(Gene Ontology,基因本体)和MeSH,对PubMed检索结果进行分类,帮助用户快速地找出最相关的命中文献,实现语义网与生物医学信息检索的完美结合,并能对检索结果从多角度进行可视化统计分析.     

如何利用Internet对医学信息进行检索

生物医学信息和文献量增长迅速 ,数量庞大 ,通过图书馆查找所需文献已显得费时费力 ,而计算机联网检索大大改善了数据库文件的利用 ,促进了资源共享。因此 ,通过Internet国际计算机网络进行医学信息及文献的检索具有内容新、范围广、数量大、速度快、功能多的优点。1　Internet上常用生物医学搜索引擎搜索引擎是目前互联网上最有效的信息查寻工具 ,主要任务是在Internet中主动搜索其它网站的信息并对其自动检索。搜索引擎向用户提供包含某一个关健词信息的网址并提供网站的链接。目前 ,因特网上常用生物医学搜索引擎有下列几种。1 .1　Med…     

Internet上英文生物医学搜索引擎性能评价--(二)基于层次分析法和系统聚类法的英文生物医学搜索引擎性能评价

在充分剖析八大英文生物医学搜索引擎的基础上，通过咨询表由专家为各引擎打分，利用(一)(本刊2期)研究中得出的搜索引擎评价指标权重值，将专家打分的平均分乘以权重值得综合得分，然后对各引擎各指标的综合得分进行系统聚类，从而比较各引擎各方面性能。     

医学搜索引擎Health Gate评析

随着计算机、现代通讯技术和生物医学信息学的飞速发展,Internet上的生物医学资源与日俱增.许多生物医学研究机构、医学院校和信息公司相继推出生物医学检索搜索引擎和指南,一些著名的生物医学数据库也纷纷入网,使教学、科研和医务人员从中可获得基因序列、医学文献等重要信息,在生物医学领域的研究工作中起到了重要的作用.网上生物医学数据库以MEDLINE最为著名,可以通过医学搜索引擎,如BiomedNet,Medical Matrix,Cliniweb,HealthGate等来杳阅.     

网上生物医学搜索引擎-BioMedNet

概括了网上大型生物医学搜索引擎-BioMedNet的结构、功能和使用方法,并介绍了BioMedNet的检索规则和技巧.     

搜索引擎的未来发展

分析研究搜索引擎发展的现状以及搜索引擎的类型,并对搜索引擎的未来发展进行深入的探讨。     

几种中文搜索引擎在中医药信息检索中的对比

中国目前还没有传统医学方面的搜索引擎，但是成熟的普通中文搜索引擎并不少，广大传统医药从业人员如果能应用好它们，也可减少查找中医药资源的奔波之苦。笔者对常用的8种中文搜索引擎检索中医药信息的效果进行评测分析，从中挑选效果较好的品种。     

通用搜索引擎与医学搜索引擎的比较研究

设计有代表性的检索提问,将搜索引擎分为A组（医学搜索引擎,n=9),B组（通用搜索引擎,n＝9）,用SPSS8．0统计软件对检索结果进行分析;文献计量学方法用于分析“发热处理”检索结果。通过比较,明确通用搜索引擎和医学搜索引擎在检索不同提问时获得网页内容相关性,网页重复,新颖性及无效链接等方面有无显著性差异;从用户角度对两组搜索引擎查寻专题信息“发热处理”的检索结果进行分析评价。结果表明,医学搜索引擎检出结果的内容相关性不如通用搜索引擎,无效链接百比高于通用搜索引擎;索及网页的更新时效性比通用搜索引擎强,网页重复率较通用搜索引擎低;医学搜索引擎提供“发热处理”信息的质量和完整性不如通用搜索引擎;二者提供的有效信息均较少。以上结果提示,多种搜索引擎联合检索有助于获得较多的有用信息;医学搜索引擎及网页的质量,数据库规模有待改进和提高。     

网络医学搜索引擎概述

搜索引擎(又称检索引擎),是自动搜索信息的专用软件.目前搜索引擎已成为人们获取网络信息资源的主要途径.搜索引擎根据收录范围,可分为综合性搜索引擎和专业性搜索引擎两大类.本文重点对医学专业搜索引擎进行了介绍.     

试论搜索引擎的发展和专题搜索引擎的建立

从学科发展角度全面论述了搜索引擎的发展历程,并就当前搜索引擎研究的热点问题和对中文搜索引擎走势的影响提出见解,引发人们对该问题的思考,同时对我系建立的器官移植专题导航系统做一简要介绍.     

甲状旁腺切除术对甲状旁腺机能亢进性骨病的远期疗效

为了评价甲状旁腺切除术对原发性甲状旁腺机能亢进（ＰＨＰＴ）所致骨病的远期疗效，回顾分析了１６例术后平均５．１（１．０～１０．５）年患者的临床表现、骨结构和骨密度恢复情况，结果表明手术虽能明显改善患者骨病，但在随访终点有１０／１６例（６２．５％）骨病恢复不全，其中骨病重的Ｙ１组比骨病轻的Ｙ２组恢复不全比例更高（Ｐ＜０．０５），１４／１６例血骨钙素（ＢＧＰ）和尿吡啶并啉（Ｐｙｒ）浓度处于中青年对照组范围内，这意味着其成骨与破骨处于平衡状态。这些结果提示：ＰＨ－ＰＴ患者应尽早诊断治疗，术后应对患者密切随访，重视对骨病恢复不全者的后续治疗     

胰十二指肠切除术后住院时间影响因素分析-回顾性研究

Background. Postoperative hospital stay after pancreaticoduodenectomy (PD) was relatively longer than other gastrointestinal operations, The aim of current study was to investigate the risk factors of postoperative hospital stay after PD. Methods. Patients who were performed PD in Cancer Hospital Chinese Academy of Medical Sciences (CHCAMS) between December 2008 and November 2012 were selected for the retrospective study. The clinical and pathological data was collected and analyzed. The primary outcome was postoperative hospital stay. Normal discharge or recovery was defined as postoperative hospital stay no more than 10 days, otherwise it was defined as delayed discharge or recovery (including hospital death). Results. Finally, 152 patients were enrolled in present study. Postoperative hospital stay was 19.7±7.7 (7-57 d). 67 of 152 patients were normal discharge, and 85 of 152 patients were delayed discharge. The overall morbidity of complications was 62.5% (95/152), and the mortality rate was 3.29% (5/152). Multiple factors analysis showed that complication morbidity (adjusted OR=10.40, 95%CI=3.58-30.22), age (adjusted OR=4.09, 95%CI=1.16-14.39), BMI (body mass index) (adjusted OR=4.40, 95%CI=1.19-16.23), surgical procedure (adjusted OR=26.14, 95%CI=4.94-153.19), blood transfusion (adjusted OR=7.68, 95%CI=2.09-28.27) and fluid input (adjusted OR=3.47, 95%CI=1.24-11.57) were significantly associated with delayed discharge. Conclusions. Postoperative complications affects the postoperative hospital discharge. Furthermore, age, BMI, transfused red blood, surgical procedure and input might prolong LOS (length of hospital stay). Studies with more patients were needed in future.     

甲磺酰胺苯乙胺类化合物抗心律失常活性的定量构效关系研究(Ⅰ)

以ＰＯＬＹＧＥＮ软件中的ＣＨＡＲＭｍ程序和集团坐标轮换法，对合成的１２个甲磺酰胺苯乙胺类化合物的结构进行计算机分子模拟。根据所得化合物的能量最低构象，计算了其ＶＤＷ体积、偶极矩、总键能、总键角能、总非正则能以及氮原子电荷等值，并对这些化合物进行ＣＮＤＯ／２法量化计算，这些计算结果作为结构参数分别与１２个化合物抗心律失常活性进行相关分析，以逐步回归法建立了两个相关性较好的方程：ｌｇｌ／ＭＥＣ＝６．９９９１－０．３８４２Ｘ２＋３．６７９６Ｘ５［ｎ＝１２，ｒ＝０．８５５９７５，ｓ＝０．１８９６７２，Ｆ＝１２．３３４６４＞Ｆ１－０．０５（３，９）＝３．８６］；ｌｇｌ／ＭＥＣ＝１４．７０３８－２１３．２６９２Ｘ４－１０．４８２９Ｘ５［ｎ＝１２，ｒ＝０．９３１９１９，ｓ＝０．１３３０４７，Ｆ＝２９．７１３５４＞Ｆ１－０．０１（３，９）＝６．９９］。结果提示，这类化合物的抗心律失常活性与分子中的原子轨道杂化程度和氮原子对分子ＨＯＭＯ和ＬＵ－ＭＯ的贡献有关，可以看出，氮上的取代不同会引起抗心律失常活性的不同     

欧洲刺柏（Juniper）

活性成分与药理作用欧洲刺柏药用部位是其浆果，具有促水排泄、防腐、抗胃肠胀气和抗风湿作用，还可改善胃功能。用作促水排泄药可增加尿量（水丢失），但不增加钠排泄。成分萜品烯-4-醇可增加肾小球滤过率，但刺激肾。欧洲刺柏浆果对单纯疱疹病毒体外显示抗病毒活性，并具抗真菌活性。动物实验显示，欧洲刺柏浆果提取物具有堕胎、抗生育、抗炎、抗胚胎植入、降血压、升血压和降血糖作用。欧洲刺柏浆果油具有兴奋子宫的活性，以及利尿、胃肠道抗菌和刺激作用，该油对平滑肌有阻止解痉作用。     

基于网络药理学探讨独活-羌活-细辛治疗膝骨关节炎的作用机制*

目的 基于网络药理学的方法分析和预测独活-羌活-细辛治疗膝骨关节炎可能的作用机制。方法 利用TCMSP数据库获取独活、羌活、细辛的活性成分及靶点,与CTD、NCBI等数据库获取的膝骨关节炎疾病基因靶点映射,构建药物-活性成分-疾病靶点网络。进行MCODE聚类分析,通过Omicshare云平台和DAVID数据库GO、KEGG通路富集分析。结果 从3味药中共筛选出了36个活性成分及205个靶点,主要有山柰酚、 β-谷甾醇、芝麻脂素、异紫花前胡苷等关键成分,AKT1、ESR1、JUN、CASP3等为关键靶点,核心基因有NOS3、ESR1、COX1、NR1I2,关键的生物进程和通路有类固醇激素反应性、活性氧代谢过程、AGE-RAGE通路和TNF通路。结论 独活-羌活-细辛可能通过多成分、多靶点网络来治疗膝骨关节炎。