福建省志贺菌PFGE分型研究

目的了解福建省志贺菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型情况,描述基因群的流行及分布特征,探讨优势血清群的变迁规律。方法收集2005-2010年志贺菌96株,分离自临床患者。选择NotⅠ进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准。采用脉冲场凝胶电泳技术分析电泳酶切指纹图谱,运用BioNumer-ics软件进行聚类分析。结果按照100%的相似度可将34株福氏志贺菌酶切图谱分为27种PFGE型别;将62株宋内志贺菌酶切图谱分为43种PFGE型别。根据TENOVER原则,福氏志贺菌有2个优势基因群G1-G2,宋内志贺菌有4个优势基因群GI-GIV。优势基因群集中分布于7～10月,其他PFGE型别分布比较分散,无明显时间和地区的聚集性。结论福建省志贺菌分子分型呈现多样性,宋内和F4c的某些基因群可能逐渐演变为福建省优势且稳定的志贺菌流行菌株。     

北京市2004年-2010年志贺菌菌型分布及毒力基因分析

目的:了解近年来北京市志贺菌菌型变化及毒力基因分布特征。方法:对2004年-2010年监测到的1413株志贺菌进行血清分型;应用荧光PCR方法进行ipaHs、et1和sen基因的检测。结果:宋内志贺菌741株(52.4%),福氏志贺菌664株(47.0%),痢疾和鲍氏志贺菌各4株(1.2%)。福氏志贺菌共分为19种血清型,以F4c、F2a、F1a为主。宋内志贺菌自2007年首次超过福氏成为优势菌型后,所占比例逐渐加大,2010年已达到79.3%。福氏志贺菌也逐步由F4c转向以F2a为主,并伴有其它血清型交替出现。ipaH s,et1和sen三种基因的携带率分别为95.4%,82.3%和57.5%。set1和sen在福氏志贺菌的携带率明显高于宋内志贺菌。结论:近8年北京市志贺菌菌型发生了显著变化,宋内志贺菌正逐步成为主导菌型。毒力相关基因在不同菌型的分布存在差异。     

志贺菌临床分离株菌群分布与福氏志贺菌分子分型

目的了解新疆食源性疾病监测中志贺菌临床分离菌株的菌群分布及福氏志贺菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型的特征。方法通过对80株志贺菌临床分离株的生化和血清学鉴定,掌握其菌群和菌型的分布,同时用PFGE和Bio Numerics 6.6软件对福氏志贺菌的DNA指纹图谱进行分子分型和聚类分析。结果 2013年-2015年食源性疾病监测分离到的80株志贺菌中以福氏志贺菌占比最高(83.75%),其次为宋内志贺菌(12.5%)、痢疾志贺菌(2.5%)。福氏志贺菌为优势菌群,其菌型则以福氏2a型占比最高(38.81%),其次为福氏2b型(20.90%)、福氏1b(14.93%),不同年间菌型的分布有所不同。结论福氏志贺菌2a型、2b型为新疆食源性监测中志贺菌的优势菌型,福氏志贺菌PFGE带型呈多样性,同一种血清型的PFGE带型分布呈集中和分散2种形式,同一血清型呈现不同带型,其遗传相关性与表型并不一致。     

上海市静安区儿童腹泻中分离的宋内志贺菌脉冲场凝胶电泳分析

[目的]研究上海市静安区2006～2008年儿童腹泻标本中分离的20株宋内志贺菌的耐药性和脉冲场凝胶电泳图谱特征。[方法]采用K-B法检测对16种抗生素的敏感性,并用WHONET5.3软件对菌株的耐药性进行分析。通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行分子分型,通过同源性分析以确定菌株间的亲缘关系。[结果]20株宋内志贺菌对利福平和奈啶酸100%耐药,对四环素、氨苄青霉素、复方新诺明的耐药率≥85%。主要分为6种复合耐药型。19株宋内志贺菌被分成16个带型,聚类分析显示属于来源高度相似的克隆系。[结论]建立了本区的宋内志贺菌脉冲常凝胶电泳分析方法和初步带型数据库。宋内志贺菌存在多重耐药现象,抗生素型与基因型间无明确关系。     

安徽省2007～2008年志贺氏菌流行株菌型分布及脉冲场分子分型

目的了解安徽省志贺氏菌的流行菌型,并建立脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型方法,为菌痢防控提供理论基础。方法对22株志贺氏菌进行血清分型、药物敏感试验和PFGE试验。结果22株志贺氏菌血清分型：B群19株,占总数86.5%;C群1株,占总数的4.5%;D群2株,占总数的9.0%。成功建立了菌痢的PFGE分子分型方法,并将我省22株流行株分为若干带型。试验结果进一步作聚类分析。结论安徽省菌痢流行株以福氏为主;安徽省PFGE分子分型方法和初步带型数据库对提高细菌检测水平有一定意义。     

湖北省部分志贺氏菌基因检测结果分析

目的 检测分析志贺氏细菌基因型,追踪传染源,为科学控制志贺氏细菌类重点肠道传染病提供科学依据.方法 用脉冲场凝胶电泳方法检测志贺氏菌基因,用软件分析电泳图谱.结果 检测8株为宋内志贺氏菌,检测8株宋内志贺氏菌DNA基因有3个基因型,2地区宋内志贺氏DNA基因型相近;检测29株福氏志贺氏菌来源鄂西南、鄂西北、江汉平原部分志贺氏菌DNA基因型相近,基因型分布相对复杂.武汉市的福氏志贺氏菌DNA基因分属于2个基因型和F1a和F4c血清型;宜昌市的福氏志贺氏菌DNA基因分属于1个基因型;十堰市福氏志贺氏菌DNA基因分属于3个基因型和F1a、F2a和F4c血清型;襄阳市福氏志贺氏菌DNA基因分属于2个基因型和F1a和F4c血清型;黄冈市福氏志贺氏菌DNA基因分属于2个基因型和2个血清型.结论 志贺氏菌基因型分布复杂,基因型结果与血清型存在差异,应该把志贺氏菌DNA基因型的检测工作纳入重点监测工作范围.     

浙江省引起暴发的宋内志贺菌的耐药性及分子分型研究(2006)

目的：了解引起浙江省菌痢暴发的宋内志贺菌耐药性及分子分型情况，为流行病学溯源及合理有效使用抗生素提供依据。方法：77株志贺菌均按GB16002-1995标准进行鉴定分型，并采用Kirby-Bauer法检测其对14种抗生素的敏感性，并采用WHONET5．3软件，对菌株的耐药性进行分析。同时，通过脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术对菌株进行分子分型，通过同源性分析以确定菌株间的亲缘关系。结果：77株宋内志贺菌对氨苄西林、利福平的耐药率最高，达100．0％，其次是红霉素98．7％；对诺氟沙星、环丙沙星最敏感，其敏感性高达98．7％。脉冲场凝胶电泳分型77株试验菌株共分为3个PFGE基因型，1型16株占20．8％，庆元、苍南菌痢暴发可能源于同一宋内志贺菌克隆系；2型34株占44．2％，常山、龙湾菌痢暴发可能源于同一宋内志贺菌克隆系；3型27株，均分离自江山，占35．0％。结论：宋内志贺菌是2006年引起浙江省菌痢暴发的主要菌型，多重耐药现象严重，基因型间差异较小，抗生素型与基因型间无明确关系。     

天津地区志贺菌志贺肠毒素基因分布与脉冲场凝胶电泳分型研究

目的 了解天津地区志贺菌流行株的志贺肠毒素基因分布和PFGE分子分型情况.方法 采用PCR方法检测天津地区2005-2007年分离的62株志贺菌编码志贺肠毒素的基因(set1A、set1B、sen),并用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对菌株进行分子分型和聚类分析.结果 62株志贺菌中福氏志贺菌占58.06%,其中福氏2b...     

杭州地区1998—2005年志贺菌分子分型及变异研究

脉冲场凝胶电泳(PFGE)是一种重复性好、分辨率高的细菌分子分型方法,已被广泛应用于病原性细菌的分子流行病学研究。作者利用PFGE分子分型方法对1998-2005年杭州地区分离到的116株志贺菌进行分子分型,以探索志贺菌的PFGE型别变异情况。1.材料与方法:①菌株来源:试验菌株由杭州市和所辖县(市、区)疾病预防控制中心(CDC)提供,所有菌株均分离于腹泻患者的粪便。②PFGE分型:按照2005年美国CDC公布的宋内志贺菌PFGE标准化方法操作,Marker为沙门菌Braenderup血清型H9812株。电泳条件:电压6V,脉冲参     

上海市闵行区952株志贺菌的血清分型及耐药性分析

目的了解上海市闵行区痢疾病原菌的优胜菌型以及药物敏感特征,为痢疾预防控制提供科学依据。方法采用血清凝集试验、菌种鉴定仪系统生化鉴定和K-B法药敏试验对从腹泻病人分离的志贺菌进行流行病学分型和药物敏感试验。结果 952株志贺菌中福氏志贺菌694株,宋内志贺菌258株。福氏志贺菌共分为13个血清型,其中福氏Ⅳc 288株,福氏Ⅰa 119株,福氏Ⅱb118株,福氏Ⅱa84株,福氏X变种43株,其余8个菌型共42株。复方新诺敏耐药率91.16%,氨苄青霉素耐药率84.07%,氯霉素耐药率25.87%,庆大霉素耐药率17.03%,其余耐药率均在10%以下,头孢噻肟、丁胺卡那、头孢噻吩、头孢唑啉、氟哌酸均敏感。结论该区志贺菌感染的优势菌型为福氏Ⅳc型、宋内氏志贺菌、福氏Ⅰa型、福氏Ⅱb型和福氏Ⅱa。药物头孢噻肟、丁胺卡那霉素、头孢噻吩、头孢唑啉可作为目前临床治疗痢疾的常用药物。     

2010年北京市感染性腹泻病原学监测分析

目的 了解2010年北京市感染性腹泻致病菌的病原构成、流行特征及主要致病菌的血清型分布。方法 收集2010年4—12月期间北京监测哨点的肠道门诊腹泻病例的粪便或肛拭子标本2118份,采用分离培养、生化鉴定和血清分型的方法对其进行霍乱弧菌、副溶血性弧菌、沙门菌、志贺菌和肠致泻性大肠杆菌等多种肠道致病菌的检测,并对其时间分布、感染者年龄分布及血清型别构成进行分析。结果在2118份标本中,共分离到478株菌,检出率为22.6％。其中志贺菌位居阳性检出菌的首位,占40.8％( 195/478),副溶血性弧菌、沙门菌和肠致泻性大肠杆菌分别占23.8％(114/478)、19.0％(91/478)和4.8％(23/478)。肠道致病菌的人群分布主要集中在20 ～ 39岁的成年组,其中30 ～39岁检出率最高,检出率为27.2％(92/338)。不同病原菌的人群年龄分布不同。病原菌的检出具有明显季节性,7-10月检出率较高,检出率分别为23.5％( 114/486)、32.8％(176/536)、36.1％ (90/249)、25.9％(29/112),其余月份检出率＜16.O％。检出的志贺菌以宋内志贺菌为优势血清型,占83.1％(162/195);副溶血性弧菌以O3∶K6为优势血清型,占63.2％ (72/114)。沙门菌以肠炎和鼠伤寒沙门菌为优势血清型,分别占13.2％( 12/91)、12.1％(11/91)。肠致泻性大肠杆菌以肠致病性大肠杆菌、肠产毒性大肠杆菌2种菌群为主,分别占69.6％( 16/23)、30.4％(7/23)。结论北京市感染性腹泻主要致病菌依次为志贺菌、副溶血性弧菌和沙门菌等。其中志贺菌和沙门菌血清型构成发生了变迁。     

山东省2011-2014年志贺氏菌分子分型及耐药性分析

  目的  通过对山东省2011-2014年分离的志贺氏菌（Shigella）进行血清、毒力基因、分子分型和药敏等分析,了解山东省志贺氏菌的特性及流行趋势。  方法  用玻片凝集法进行血清分型,PCR方法扩增相关毒力基因,用脉冲场凝胶电泳技术进行分子分型,采用微量肉汤稀释法测定菌株抗生素敏感性。  结果  44株志贺氏菌主要为福氏志贺氏菌（Shigella flexneri）（54.55%）和宋内志贺氏菌（Shigella sonnei）（43.18%）。ipaH、set1、sen、ial毒力基因携带率分别为100%、43.18%、56.82%、50.00%。经脉冲场凝胶电泳分型（pulsed field gel electrophoresis,PFGE）,福氏志贺氏菌被分为18种带型,且总体相似度偏低;宋内志贺氏菌被分为14种带型,且89.47%的菌株相似度在90%以上。44株志贺氏菌对15种抗生素中的14种均存在不同程度的耐药。93.18%的菌株为多重耐药菌株。  结论  山东省志贺氏菌以福氏和宋内血清群为主,毒力基因携带率高,有聚类分布出现,耐药严重,应加强对志贺氏菌菌型、溯源和耐药性的监测。     

上海市闵行区2003—2009年志贺菌菌型分布及变迁

目的了解上海市闵行区志贺菌的菌型分布及优势菌型,为痢疾的防治工作提供科学依据。方法收集该地区2003—2009年送检样品中分离到的志贺菌进行流行病学分型。结果 7年中共检出1 324株志贺菌,分为14个血清型,福氏志贺菌933株,宋内志贺菌391株。其中福氏4c 255株,福氏2b 206株,福氏2a 197株,福氏1a 136株,福氏X变种77株,还包括福氏1b、福氏3a、福氏4a、福氏4b、福氏5a、福氏5b、福氏6a、福氏Y变种共62株。2003年,优势菌型为福氏2 b,到2009年福氏2 a成为优势菌型。结论该地区流行的志贺菌为福氏志贺菌和宋内志贺菌,其中优势菌型为福氏2b型、福氏2a型、福氏4c型和宋内志贺菌,优势菌型出现了变迁。     

甘肃省2006-2009年细菌性痢疾耐药谱及脉冲场凝胶电泳分析

目的 对中国甘肃省2006-2009年细菌性痢疾监测点分离到的志贺菌进行耐药谱和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型研究,探讨甘肃省细菌性痢疾的分子流行病学特征.方法 对2006-2009年甘肃省细菌性痢疾监测点分离到的473株志贺菌进行血清型及耐药性分析;采用限制性内切酶对2009年分离的166株志贺菌进行PFGE分型...     

上海嘉定区志贺菌新菌型的出现及菌型的变迁

目的：了解本地区志贺菌的菌型分布及菌型变迁的情况。方法：收集本地区1995年-2005年送检样品中分离到的志贺菌，进行血清学分型。结果：在11年中共检出志贺菌825株，其中B群占91．03％，为优势菌群。本地区出现了3种新的志贺菌血清型福氏4c、福氏1c和福氏2未定型。在11年中福氏2a型检出最多，占38．79％，其次是福氏4c型、福氏1a型、福氏2b型，分别占15．15％、11．03％、9．70％。在2003年之前福氏2a型一直是引起本地区菌痢的优势菌型，2003年优势菌型变迁为福氏2b型，2004年和2005年新菌型福氏4c型成为优势菌型。结论：本地区有新的志贺菌血清型出现，优势菌型也出现了变迁，应加强对志贺菌病的监测工作。     

Electropherotyping of plasmid DNA of different serotypes of Shigella flexneri isolated in Bangladesh

One hundred and twenty-five Shigella flexneri strains, isolated during January-December 1984, at the Dhaka treatment centre of the International Centre for Diarrhoeal Disease Research, Bangladesh, were serotyped using absorbed rabbit antisera specific for all type- and group-factor antigens, as well as a group of ten mouse and rat monoclonal antibodies. Electropherotypes of the plasmid deoxyribonucleic acid (DNA) were also determined. S. flexneri 2a was the predominant serotype followed by 3b, 1a, and 2b. The recently described E1037 antigen was also found in three strains of S. flexneri serotype 6. Electropherotyping of the plasmid DNA showed that three plasmids of approximately 140, 2.7, and 2 megadalton (MDa) were present, respectively, in 97, 97 and 94% of the 125 strains. Additional plasmids of various other sizes were also present in different serotypes except in serotype 2a. The additional plasmids again appeared to be specific for that particular serotype. For example, all 12 strains of S. flexneri 2b harboured an additional plasmid of approximately 1 MDa. Thus, electropherotyping of plasmid DNA of different serotypes of S. flexneri might be useful to differentiate S. flexneri from other species of Shigella and in identifying different serotypes of S. flexneri. Therefore, the common plasmids, plus the additional plasmids, could be used to identify epidemic, as well as sporadic, subclones of S. flexneri strains.     

Identification of newly recognized serotype 1c as the most prevalent Shigella flexneri serotype in northern rural Vietnam

We investigated the identity of 37 Shigella flexneri strains that had previously been isolated from northern rural Vietnam (Son Tay Province) and described as untypable. Twenty-four isolates reacted with MASF 1c, a monoclonal antibody specific for S. flexneri serotype 1c. A further ten untypable isolates were found to be rough mutants (no longer expressing O-antigen) that were derived from serotype 1c strains. Pulsed-field gel electrophoresis demonstrated that these strains consisted of many different clones, indicating serotype 1c was well established in this region in the late 1990s. Serotype 1c was the most prevalent S. flexneri serotype isolated in the Son Tay Province, accounting for about 40% of S. flexneri isolates. Subsequent isolation of S. flexneri serotype 1c in this region and elsewhere in Vietnam confirmed that serotype 1c is of genuine importance in Vietnam.     

2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型变迁及耐药性分析

目的 2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型变迁及耐药性分析。方法按《全国细菌性痢疾监测方案》的要求进行。结果 2008年西城区福氏志贺菌7株,占63.6%;宋内志贺菌4株,占36.4%。2009年西城区福氏志贺菌12株,占37.5%;宋内志贺菌19株,占59.4%;鲍氏志贺菌1株,占3.1%。2010年福氏志贺菌6株,占14.3%;宋内志贺菌36株,占85.7%。药敏试验结果:志贺菌对头孢吡肟、头孢西丁、头孢他啶、氧氟沙星、左氧氟沙星、诺氟沙星、氨曲南药物敏感。对氨苄西林、磺胺、奈啶酸耐药。结论 2008—2010年北京市西城区志贺菌血清型主要为福氏志贺菌和宋内志贺菌,但是福氏志贺菌已呈逐年减少趋势,而宋内志贺菌呈逐年增多趋势。志贺菌对头孢类药物和氟喹诺酮类药物敏感,临床宜选用此类药品进行治疗。     

上海市静安区2005～2008年分离到的志贺菌血清型分布及耐药性分析

[目的]分析2005～2008年静安区分离到的志贺菌菌型分布和耐药谱的变化,指导临床用药。[方法]参照《全国细菌性痢疾监测方案》(试行)对志贺菌进行鉴定及药敏试验,用WHONET5.4软件对药敏试验结果进行统计分析。[结果]共鉴定志贺菌139株,其中福氏志贺菌为67株,占48.20%;宋内志贺菌为72株,占51.80%。福氏志贺菌在2005年和2006年以F4c为主,而在2007年和2008年则逐渐转为以F2a为主。福氏志贺菌对利福平、奈啶酸、氨苄青霉素100%耐药,对四环素耐药率﹥90%。宋内志贺菌则对利福100%耐药,对奈啶酸、四环素、复方新诺明耐药率﹥90%。[结论]福氏和宋内志贺菌对第三代头孢菌素头孢噻肟耐药率已分别达到39.62%和27.45%,提示临床上应加强耐药性的监测,避免选择性压力和耐药基因的传播。