circRNA的功能及其与胃癌关系的研究进展

目的进一步了解环状RNA(circular RNA,circRNA)的功能并探讨其与胃癌发生、发展的关系以及其对胃癌诊断及预后评估的价值。方法对近年来发表的有关circRNA的功能及其与胃癌相关关系研究的文献进行综述并进行总结分析。结果 circRNA的闭合环状结构特点使其具有酶稳定性。目前研究中较为清楚的功能是它作为微小RNA(miRNA)海绵,它通过与相应位点结合调控基因转录,甚至能够作为翻译模版参与蛋白质的翻译。它通过miRNA海绵作用于被miRNA调控的靶基因从而调控参与胃癌发生及发展相关的生物信号通路以调控胃癌细胞的生长。circRNA在胃癌组织及其癌旁组织以及患者和健康人群的血清中均存在差异性表达,其与胃癌的临床特征(病理分期、淋巴结转移、远处转移、CEA、CA19-9等)和胃癌患者较差的预后及更短的术后生存时间有关。结论由于circRNA的闭环结构特点,使得它具备酶稳定性并可发挥出miRNA海绵为主的多种生物功能。通过circRNA在胃癌中差异性表达的研究分析有望在胃癌的诊断及预后评估中发挥重要的作用。     

microRNA在三阴型乳腺癌中的研究进展

microRNA（miRNA）是一种小分子RNA,对细胞的增殖、分化、凋亡以及应激等生物过程有广泛的调节作用。miRNA通过多种方式参与乳腺癌的发生及进展,笔者就其在三阴型乳腺癌（TNBC）中的研究进展作一综述。     

MicroRNA 与胰腺癌关系的研究进展

胰腺癌是恶性程度最高、预后最差的恶性肿瘤之一,其相关的分子机制的研究具有重要的临床意义。微小RNA（microRNA,miRNA）通过调节基因的表达参与多种生物医学过程,其异常表达与肿瘤的发生发展及预后密切相关。笔者就miRNA与胰腺癌的诊断、治疗和预后关系的研究进展做一综述。     

甲状腺癌非编码RNA与mRNA差异表达谱及竞争性内源RNA调控网络分析

目的:通过生物信息学方法分析甲状腺癌预后相关的非编码RNA与mRNA及信号通路。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载568例甲状腺癌患者的临床信息及其组织样本的非编码RNA(lncRNA、miRNA)与mRNA数据,筛选出差异表达的非编码RNA与mRNA,对差异表达的mRNA进行功能富集分析与通路分析;构建lncRNA-miRNA-mRNA的竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络;结合临床信息进行生存分析获取与甲状腺癌预后相关的非编码RNA与mRNA。结果:共筛选出差异表达的lncRNA 497个(上调93个,下调404个),miRNA 72个(上调5个,下调67个),mRNA 1 097个(上调233个,下调864个)。功能富集分析结果显示差异表达的mRNA主要参与单组织过程、单组织细胞过程、刺激反应等生物学过程,受体结合、分子功能调节、钙离子调节等细胞功能以及细胞、细胞膜、细胞外组件等细胞构成过程。通路分析结果显示差异表达的mRNA主要参与神经反应受体-配体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、肿瘤转录失调等信号通路的调节。构建的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA互作网络中,有2个差异表达lncRNA(MIR181A2HG、OPCML-IT1),1个差异表达miRNA(miRNA-184)和2个差异表达mRNA(E2F1、SALL3)与甲状腺癌的总体生存期明显有关(均P0.05)。结论:所筛选的非编码RNA与mRNA以及相关信号通路在甲状腺癌的预后密切相关,并为甲状腺癌发生、发展机制的研究提供了新的方向。     

环状RNA对肝细胞癌的血管生成、免疫细胞和能量代谢调控的研究进展

肝细胞癌（HCC）是原发性肝癌最主要的病理类型,占肝癌患者总数的75%~85%。HCC的发生发展与编码RNA和非编码RNA的调节功能密切相关,其中环状RNA（circRNA）代表了一类新的内源性非编码RNA。circRNA也是一种共价闭环RNA,它通过对前体mRNA的反向剪接环化形成。与线性RNA相比,circRNA没有5''-末端帽子和3''-末端poly A尾巴结构,可以调节哺乳动物中的基因表达。circRNA的结构保守且稳定,对核酸外切酶具有更高的耐受性。在HCC中,circRNA已被证明可以调节肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和细胞死亡抵抗力。它们在调节血管生成、基因组不稳定、免疫监视和代谢转换方面的作用正在显现。但circRNA在HCC中所涉相关机制的细节仍然难以解析,尤其在调控HCC的血管生成、调节HCC细胞躲避免疫细胞的监测与攻击和调节细胞能量代谢为HCC细胞供能,从而引发HCC的增殖、侵袭和转移等方面。研究在HCC中起关键调控作用的circRNA,针对其靶向治疗能有望提高HCC的治疗效果,并改善患者预后。笔者就HCC中异常表达的circRNA,以及circRNA对HCC的血管生成、免疫细胞和能量代谢的调控做一综述。     

环状RNA在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及生物信息学分析

目的 探讨环状RNA（circRNA）分子在慢性HBV感染者不同时期的差异表达及其作用.方法 收集泰州市人民医院感染病科2014年10月至2015年10月就诊的慢性HBV感染者7例,其中慢性乙型肝炎（CHB）患者4例,慢性HBV携带者3例,3名对照来自健康体检者.采集所有研究对象外周血单个核细胞（PBMC）,应用新一代circRNA表达谱芯片检测PBMC中circRNA分子的表达,并通过荧光定量PCR进行验证.采用微小RNA（miRNA）靶预测软件分析circRNA和miRNA的相互作用位点.应用基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）对其靶向miRNA及调控靶基因进行分析.采用SPSS 17.0软件对数据进行分析.结果 与健康对照者比较,CHB患者表达差异的circRNA分子有137个,其中上调89个,下调48个;慢性HBV携带者表达差异的circRNA分子有444个,其中上调130个,上调5倍以上的有34个,下调314个.CHB患者与慢性HBV携带者相比,差异表达的circRNA分子有1041个,其中上调663个,下调378个,下调超过5倍以上的有54个.差异表达的circRNA上具有miRNA应答元件,可与miRNA种子区域的碱基互补配对.靶基因预测分析显示,hsa_circ_0038646相关miRNA调控的靶基因有533个,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶基因有249个.GO分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA调控靶基因的功能主要富集于激活素结合等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA调控的靶标富集于犰狳重复区域结合等.KEGG分析显示,hsa_circ_0038646分子相关miRNA主要参与T细胞受体结合途径、雌激素受体信号通路等,hsa_circ_0087354分子相关miRNA主要参与粘附连接、MAPK信号途径等.结论 HBV感染不同时期患者circRNA的表达存在差异,差异表达的circRNA可能通过影响相关miRNA分子的多个靶基因及其信号途径参与慢性HBV感染者的免疫调控.     

恶性肿瘤中环状RNA分子机制以及在前列腺癌中的研究进展

环状RNA(circRNA)是一类由mRNA 3′及5′末端首尾相连形成的无蛋白编码功能的RNA分子。circRNA可以通过海绵吸附miRNA的作用,结合RNA结合蛋白(RBP),调节转录翻译,参与恶性肿瘤多个生物过程,包括细胞周期、肿瘤发生、增殖、侵袭、转移、血管生成、细胞凋亡等。本文主要从circRNA的合成、特性、功能来阐述它在前列腺癌发生发展中的作用机制。     

非编码RNA在胃癌中的作用机制研究进展

胃癌是目前世界上恶性程度最高的肿瘤之一.近年来大量的研究证明非编码RNA在胃癌的发生、增殖、转移等生物过程中占据着重要地位,其中小RNA(miRNA)、环状RNA(circRNA)和长链非编码RNA(lncRNA)组成的非编码RNA调控网络涉及多种基因调控过程.目前对胃癌的诊断主要依赖于内镜检查,缺乏简单有效的筛查手段...     

环状RNA与m6A修饰调控恶性肿瘤作用研究进展

N6-甲基腺嘌呤（m6A）是真核生物RNA中最常见的表观遗传修饰,由甲基转移酶、去甲基化酶和阅读蛋白共同调控实现生物体内动态平衡及甲基化的可逆变化,影响RNA的剪接、加工、定位、转运、翻译和降解等过程,从而调控肿瘤的进展。环状RNA (circRNA)作为一种新型多功能非编码RNA,具有结构稳定、进化保守、高度丰富、组织特异性等特征,同时它可通过充当microRNA (miRNA)分子海绵、结合蛋白质、翻译蛋白和调控基因转录和剪接等方式参与调节多种生理病理活动,有望为肿瘤早期诊断和治疗提供新的分子标志物及潜在药物靶点。大量研究表明,m6A与circRNA可分别调控癌基因表达,且两者之间存在相互调节作用,m6A修饰可调节circRNA生物发生、核输出、降解、翻译和先天免疫,circRNA也可通过miRNA分子海绵或结合m6A修饰酶等机制调控m6A修饰,共同参与肿瘤细胞的增殖、迁移侵袭、干性、耐药性和免疫微环境等过程,这将有助于发现更多肿瘤研究的调节机制和治疗靶点。然而,鉴于m6A修饰和circRNA生物学的复杂性,许多研究仍有待阐明,如m6A检测技术尚不精确、m6A修饰的circRNA数...     

创伤性脊髓损伤后环状非编码RNA-微小RNA潜在调控网络信息挖掘

目的通过高通量测序获取创伤性脊髓损伤(traumatic spinal cord injury,TSCI)后环状非编码RNA(circular RNA,circRNA)与微小RNA(microRNA,miRNA)表达谱,预测潜在circRNA-miRNA调控网络。方法取48只雄性C57BL/6小鼠(体质量18~22 g)随机均分为两组(n=24),TSCI组采用Allen’s打击器械制备TSCI模型,假手术组(Sham组)仅切开椎板不损伤脊髓。术后3 d,两组取材行HE染色,观察脊髓组织结构;提取组织总RNA建库,高通量测序鉴定circRNA和miRNA差异表达谱,基因本体分析(gene ontology,GO)注释差异表达的circRNA宿主基因功能,筛选显著差异表达的miRNA,通过TargetScan和miRanda预测circRNAmiRNA靶向结合,筛选关键circRNA,构建潜在调控网络。结果HE染色示Sham组小鼠脊髓结构完整无破裂,TSCI组脊髓结构有明显损伤破裂。测序共鉴定出17440个circRNA、1228个miRNA。差异表达的circRNA宿主基因主要富集在细胞质,生物过程中差异基因主要富集在转录的正调控和蛋白磷酸化过程。差异表达最显著的miRNA为mmu-miR-21-5p,筛选出可与其靶向结合的circRNA6730,以circRNA6730为核心构建潜在circRNAmiRNA调控网络。结论通过表达谱分析和功能注释分析,显著差异表达的circRNA和miRNA有潜在的临床标志物价值,以circRNA6730为核心包含mmu-miR-21-5p的靶向互作网络可能在TSCI的发生发展过程中起重要调控作用,有助于阐明TSCI的病理生理进程机制,为临床诊疗提供新思路。     

环状RNA的功能及其在结直肠癌中的研究进展

环状RNAs(circRNAs)是一种具有共价闭合环状的长链非编码RNA。circRNAs广泛存在于真核细胞并且结构稳定。circRNAs可作为微小RNAs(miRNAs)的分子海绵参与基因转录后调控,也可与多种蛋白相互作用,调控基因转录及蛋白翻译等。越来越多的研究表明,circRNA与结直肠癌的发生、发展密切相关,有望为结直肠癌的诊断和治疗提供新的分子标志物和靶点。本文从circRNAs的形成、生物学功能以及在结直肠癌疾病中的研究进展等方面进行简要综述,以期为结直肠癌早期诊断和治疗提供新靶点。     

环状RNA在肝细胞癌发生发展中的作用研究进展

环状RNA (circRNA)是一类内源性非编码RNA,是由线性RNA经反向剪切形成的闭合环状结构,广泛存在于真核细胞中,且可在多种体液中检测到,具有结构稳定、高度保守以及表达具有特异性等特点,是肿瘤的重要调节因子.circRNA主要通过吸附微小RNA (miRNA)或者RNA结合蛋白(RBP)发挥"海绵作用",进而调...     

自噬相关miRNAs、lncRNAs、circRNAs在骨质疏松症中的作用

骨质疏松症由骨吸收增加和骨形成减少引起,是一种常见代谢性骨疾病,其发生发展的详细分子机制尚不清晰。自噬作为一种应激反应性分解代谢过程,在维持细胞和组织稳态中起着关键作用。非编码RNAs,如微小RNAs、长链非编码RNAs和环状RNAs,通过作为调节因子对基因表达进行转录后调控,在包括自噬在内的许多细胞过程中发挥重要作用。研究表明,部分自噬相关ncRNAs通过调节骨髓间充质干细胞、成骨细胞、骨细胞和破骨细胞生理和发育过程参与维持骨稳态。基于此,本文综述了影响骨微环境的自噬相关微小RNAs、长链非编码RNAs和环状RNAs参与调控骨质疏松发生发展的最新研究进展,为探索骨质疏松症发病机制和确定临床治疗潜在靶点提供理论基础。     

长链非编码RNA 在胰腺癌中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNAs)是一类转录本长度超过200nt、不具备蛋白编码功能的RNA分子。LncRNAs能够在表观遗传、基因转录水平以及转录后水平等不同层面发挥作用。此外,新近发现的微小RNA、环状RNA等可与lnc RNAs交互作用,参与恶性肿瘤的发生与发展过程。近年来,研究发现大量的lncRNAs异常表达于胰腺癌组织和细胞中,在胰腺癌的发生发展中也起着重要作用。因此,笔者就多种异常表达的lncRNAs在胰腺癌中的作用及机制进行综述。     

DDX家族与肿瘤的相关性研究进展

DEAD-box家族是一类以D(Asp)-E(Glu)-A(Ala)-D(Asp)为保守序列的RNA解旋酶家族,参与需要RNA调节的所有细胞过程.研究表明,DDX家族很多成员在肿瘤组织中表达失调,并且参与肿瘤的发生、发展,在肿瘤细胞的增殖、凋亡、细胞周期、侵袭、转移以及代谢等方面发挥关键作用,可以作为肿瘤的诊断、恶性程度的评价、临床预后的预测等新的分子标志物,也为肿瘤的治疗提供了新的潜在分子靶标.本文就DDX家族的结构、功能、以及与肿瘤的关系作一综述.     

Analysis of circRNA‐mRNA expression profiles and functional enrichment in diabetes mellitus based on high throughput sequencing

To study the pathogenesis of diabetes mellitus (DM) and identify new biomarkers, high‐throughput RNA sequencing provides a technical means to explore the regulatory network of MD gene expression. To better elucidate the genetic basis of DM, we analysed the circRNA and mRNA expression profiles in serum samples from diabetic patients. The circRNAs and mRNAs with abnormal expression in the DM group and non‐diabetic group (NDM) were classified by RNA sequencing and differential expression analysis. The circRNA‐miRNA‐mRNA regulatory network reveals the mechanism by which competitive endogenous RNAs (ceRNAs) regulate gene expression. The biological functions and interactions of circRNA and mRNA were analysed by gene ontology (GO) enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis. Differential expression analysis showed that 441 circRNAs (366 up‐regulated, 75 down‐regulated) and 683 mRNAs (354 up‐regulated, 329 down‐regulated) were significantly differentially expressed in the DM group compared with the NDM group. Screening of the differential genes at the nodes of the interaction network showed that a single circRNA could interact with multiple miRNAs and then jointly regulate more mRNAs. In addition, the expressions of circRNA CNOT6 and AXIN1 as well as mRNA STAT3, MYD88, and B2M were associated with the progression of diabetes. Enrichment pathway analysis indicated that differentially expressed circRNA and mRNA may participate in Nod‐like receptor signalling pathway, insulin signalling pathway, sphinolipid metabolism pathway, and ribosome pathway, and play a role in the pathogenesis of diabetes. This study provides a theoretical basis for elucidating the molecular mechanism of DM occurrence and development at circRNA and mRNA levels.     

microRNA 在肝细胞癌发生发展和诊治中的作用

microRNA（miRNA）是一类高度保守的内源性非编码小分子单链RNA,通过与靶mRNA完全或部分互补结合,导致其裂解或转录后翻译抑制,调控基因表达,参与细胞增殖、分化、凋亡等多个重要生物学过程,同时具有癌基因和抑癌基因的作用。近年来研究发现,miRNA在肝细胞癌（HCC）的发生发展和诊治中起重要作用。笔者就该领域的研究现状作一综述。

     

影响甲状腺乳头状癌颈侧淋巴结转移的高危因素

目的探讨影响甲状腺乳头状癌(PTC)颈侧淋巴结转移的高危因素。方法选择2011-01-2018-03间在云浮市人民医院接受手术的120例PTC患者,对其临床资料进行回顾性分析。结果 120例患者中颈侧淋巴结转移82例,其中79例(96.3%)为中央区转移、3例(3.7%)为侧颈部淋巴结转移。PTC颈侧淋巴结转移的发生与性别、原发病灶大小、肿瘤位置、合并结节性甲状腺肿、合并桥本甲状腺炎等因素密切相关(P<0.05)。结论 PTC颈侧淋巴结转移高发人群为男性,肿瘤的大小、位置、合并结节性甲状腺肿、合并桥本甲状腺炎,均为影响PTC颈侧淋巴结转移的高危因素。