基于网络药理学及分子对接探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎的作用机制

[目的]基于网络药理学和分子对接技术探究补肾健脾方治疗慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)的作用机制。[方法]借助中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、UniProt等数据库筛选活性成分及其对应靶点,利用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点网络图。通过DisGeNET和STRING数据库构建药物-疾病交集靶点的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络。采用DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。对药物核心活性成分和靶点进行分子对接,以验证预测结果。[结果]补肾健脾方包含槲皮素、山奈酚等188个活性成分,以及白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、血清白蛋白(albumin,ALB)...     

基于数据挖掘和网络药理学的甬派中医治疗糖尿病的用药规律及机制分析

[目的] 基于数据挖掘分析甬派中医治疗糖尿病的用药规律,同时采用网络药理学分析核心药物治疗糖尿病的潜在活性成分及机制。 [方法] 收集宁波市第一医院2016至2020年中药治疗糖尿病的处方,采用中医传承辅助系统构建处方数据库,分析用药规律并筛选核心药物。采用中医药数据和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)以及基因组注释数据平台(Genome Annotation Database Platform,GeneCard)等数据库构建“疾病-核心药物-成分-靶点”网络,采用STRING数据库构建蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络,采用R语言对相关靶点进行核心靶点的基因本体(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。 [结果] 共纳入处方430首,其中药性以寒、温、平为主,药味以甘类为主。使用频次最高(＞100次)的中药有甘草、茯苓、陈皮、石斛、白术、黄芪、地黄、党参和枸杞子。关联规则表明,使用频率较高的两药组合有:陈皮-甘草、陈皮-茯苓、白术-茯苓、甘草-茯苓;三药组合为陈皮-白术-茯苓。药物组合网络筛选出核心药物组成为白术-茯苓-陈皮-甘草,发挥益气健脾的功效。网络药理学分析结果表明,核心药物中的32个活性成分与糖尿病靶点相关,在活性成分贡献度排名中,白术和茯苓的成分排名普遍靠前,白术主要成分为白术三醇和苍术酮衍生物,茯苓主要成分为甾醇类,陈皮为柚皮素和甾醇类,甘草以黄酮类成分为主。KEGG结果表明核心药物主要影响脂质和动脉粥样硬化、内分泌抵抗、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路和晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)系统,其中AGE-RAGE系统包含的核心靶点最多,且与糖尿病密切相关。[结论] 甬派中医对糖尿病的治疗以益气健脾为主,同时配合养阴清热,具有多成分、多靶点治疗的特点,其机制可能主要与AGE-RAGE轴密切相关,上述研究为甬派中医治疗糖尿病的方法提供了理论支撑。     

基于网络药理学探讨桂枝茯苓丸治疗急性脑梗死的作用机制及体内验证

目的 基于网络药理学的研究方法探讨桂枝茯苓丸治疗急性脑梗死的作用机制。方法 在中药系统药理数据库及分析平台（TCMSP）数据库中收集桂枝茯苓丸的主要活性成分,设置口服利用度（OB）≥30%,类药性（DL）≥0.18为筛选条件;使用GeneCards、OMIM、DrugBank数据库收集急性脑梗死的作用靶点,获得桂枝茯苓丸与疾病的交集靶点,绘制交集韦恩图;利用BisoGenet构建PPI网络,通过Cytoscape提取核心靶点;获取关键靶点蛋白后利用Metascape进行GO功能及KEGG通路富集分析。结果 利用TCMSP检索共获得桂枝茯苓丸有效成分65个,主要为槲皮素、β-谷甾醇、齿孔酸、猪苓酸C、白花素等;筛选出桂枝茯苓丸治疗急性脑梗死的关键靶点135个,包括TP53、MCM2、UBC等;涉及细胞周期信号通路、泛素介导的蛋白降解信号通路、PI3K-Akt信号通路等119条相关信号通路;分子对接结果显示多个化合物与蛋白的结合能≤8 kJ/moL;实验组的tp53、UBC基因表达量较模型组的低,PI3K、P-Akt蛋白表达量较模型组的高（P＜0.05）。结论 桂枝茯苓丸治疗急性脑梗死具有多通路、多靶点的特点,为今后研究桂枝茯苓丸治疗急性脑梗死的机制提供了科学的理论依据及研究思路     

基于分子对接技术探究天花粉活性成分与2型糖尿病靶点的相互作用

目的 基于分子对接技术探究天花粉活性成分与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus, T2DM)靶点的相互作用。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库获得天花粉活性成分及作用靶点，在GeneCards和DisGeNET数据库中获得T2DM靶点。将天花粉活性成分靶点与T2DM靶点取交集，获取药物-疾病共有靶点，导入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。构建共有靶点的蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI),分析得出关键靶点。最后，利用Sybyl软件进行分子对接，验证活性成分与关键靶点相互作用。结果 天花粉活性成分为仙人掌甾醇...     

基于网络药理学和分子对接探索桂枝茯苓丸治疗卵巢癌的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探索桂枝茯苓丸治疗卵巢癌的主要活性成分和作用机制.方法:使用TCMSP数据库检索并筛选桂枝茯苓丸中每味中药的活性成分,在Uniprot数据库找出药物活性成分的作用靶点,通过Cytoscape软件的Network Analyzer功能筛选出药物的主要活性成分及靶点.使用Genecards...     

基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏治疗痴呆的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨“寒凉”中药黄连、黄芩、黄柏(三黄)治疗痴呆的作用机制。方法 通过数据挖掘《宣明论方》,筛选出符合“寒凉”属性并且是治疗“痴呆症”的常见中药黄芩、黄连、黄柏。通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)数据库检索“三黄”的有效成分和作用靶点，在GeneCards、DrugBank等数据库检索痴呆症(dementia)靶点。利用Cytoscape3.7.2构建“药物-成分-靶点”网络，用VENNY2.1获得“三黄”和痴呆症的交集靶点后，构建蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI),利用Metascape库对核心靶点进行GO、KEGG富集分析，并构建“三黄”药物-成分-靶点-通路-疾病网络，最后利用分子对接，以反向验证“三黄”活性成分与核心靶点之间的关系。结果 筛选出“三黄”治疗痴呆症的重要活性成分有槲皮素、β-谷甾醇、小檗碱、黄连...     

基于网络药理学的黄连-升麻药对治疗复发性口腔溃疡中西医学机制探讨

[目的] 探讨黄连-升麻药对治疗复发性口腔溃疡(recurrent aphthous ulcer,RAU)的现代药理机制,分析可能存在的中医治法相关疗效因素,进一步指导中医临床辨治。[方法] 使用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)检索药物成分及靶点,通过在线人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、人类基因组注释数据库(Human Genome Annotation Database,GeneCards)等检索疾病相关靶点,取交集后采用STRING平台进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)分析,以CytoScape 3.7.2软件绘制PPI网络图并筛选出核心靶点,上传至MetaScape数据库,进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析与京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析并构建网络图,利用AutoDock 4.2.6软件进行分子对接,并采用PyMOL软件将对接结果可视化。采用脊柱两侧注射完全弗氏佐剂的方法构建RAU大鼠模型;采用实时定量聚合酶链式反应(Real-time quantitative polymerase chain reaction,Real-time qPCR)检测各组大鼠口腔组织中核心靶基因的表达情况。[结果] 筛选得到黄连、升麻活性成分共19个,靶点191个,药物与疾病交集靶点127个,药对干预RAU核心靶点23个,并依据连接度筛选出7个最关键的靶点,核心通路为白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)与肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)相关的信号通路。分子对接结果显示核心有效成分豆甾醇与各关键靶点均有较高的结合活性。动物实验发现,该药对可有效减少大鼠口腔溃疡数目。与空白对照组比较,模型组、低剂量组、中剂量组和高剂量组关键靶点表达明显更高(P<0.05);高剂量组靶点的mRNA相对表达和口腔溃疡数明显低于模型组、低剂量组、中剂量组(P<0.05)。[结论] 黄连-升麻药对治疗RAU的分子机制,与其抗炎、保护口腔黏膜、调节免疫等作用有关,而相关的中医疗效机制涉及清热解毒、化瘀通络、托毒敛疮生肌等。     

基于网络药理学和分子对接探讨裘氏二藤汤治疗慢性盆腔炎的机制

[目的] 基于网络药理学和分子对接方法,探讨二藤汤的有效成分治疗慢性盆腔炎的机制。[方法] 利用TCMSP和TCMID数据库筛选出二藤汤有效成分及其靶点,运用Uniprot数据库获取标准化的靶点名称,同时,利用Cytoscape3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。通过GeneCards、OMIM数据库收集慢性盆腔炎靶点,同时,利用Venny 2.1.0获取“药物-疾病”的交集靶点并绘制韦恩图,通过STRING平台构建PPI网络图,并运用Cytoscape 3.7.2软件中CytoNCA插件筛选关键靶点。利用Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路的富集分析。最后,利用AutoDock Vina 1.1.2对关键靶点和活性成分进行分子对接。[结果] 通过筛选共获得231个活性成分,211个“药物-疾病”交集靶点;GO分析获得2538个条目,分别为2174个BP,233个MF及131个CC条目。KEGG分析得到209条信号通路;分子对接结果显示关键靶点与核心活性成分具有较好的结合活性。[结论]二藤汤通过多成分、多靶点、多通路治疗慢性盆腔炎。     

基于网络药理学和分子对接探究苓桂术甘汤治疗多囊卵巢综合征的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探究苓桂术甘汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome, PCOS)的作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库TCMSP和已发表文献筛选苓桂术甘汤方有效活性成分,通过在线人类孟德尔遗传数据库(GeneMap)、DisGeNET数据库、人类基因数据库(Gencards)以及DrugBank数据库检索PCOS的靶点。利用Venny 2.1.0在线平台获取药物疾病交集靶点。运用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-活性成分-潜在靶点”网络图。通过STRING数据库构建PPI网络图。依托DAVID数据库对药物疾病交集靶点进行KEGG富集分析和GO的生物功能分析。借助Chem 3D、AutoDock Tools、Vina 1.1.2以及Pymol软件对药物关键活性成分和疾病的重要靶点进行分子对接。结果 共筛选出交集靶点348个,核心靶点11个,对应着4种中药的144个有效活性成分。通过GO分析得到1660条生物过程。KEGG富集分析得到187条信号通路。将药物关键活性成分及疾病关键靶点进行分子对接。结论 苓桂术甘汤中的关键成分通...     

芪蛭通窍胶囊“异病同治”前列腺增生症和慢性前列腺炎的网络药理作用机制及分子对接

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨芪蛭通窍胶囊（QTC）异病同治前列腺增生症（BPH）和慢性前列腺炎（CP）的作用机制。方法 基于TCMSP、BATMAN、PubChem及Swiss Target Prediction数据库搜集、获取QTC活性成分及相应靶点、GeneCards数据库预测BPH和CP靶点基因,利用Venny 2.1.0获取交集靶点、Cytoscape 3.10.1构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,基于STRING数据库构建蛋白质互作（PPI）网络后导入Cytoscape输出核心靶点、Metascape数据库进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后进行分子对接测试。结果 共获得QTC活性成分70个,包括槲皮素等;“药物-疾病”交集靶点214个。QTC可能作用于前列腺组织缺氧和炎症微环境,干预缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、白细胞介素-6(IL-6)等多个靶点,调控核因子-κB(NF-κB)、磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）、HIF-1α等多条相关途径。分子对接结果显示槲皮素与8...     

采用网络药理学与分子对接技术研究筋骨痛消丸治疗髌骨软化症的作用机制

目的:通过网络药理学和分子对接技术研究筋骨痛消丸治疗髌骨软化症(chondromalacia patellae)的作用机制。方法:首先通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)挖掘筋骨痛消丸中各种中药的活性成分并预测其作用靶点,TCMSP数据库中缺失的中药利用文献检索与Swiss Target Prediction数据库获得有效成分及对应靶点。利用Uni Prot数据库,将获得的靶点蛋白的名称标准化。登录Gene Cards、Pharm Gkb等数据库,获取髌骨软化症的疾病靶点。之后将药物靶点和疾病靶点取交集,制作出韦恩图。运用Cytoscape软件,筛选并构建“药物-活性成分-交集靶点-疾病”网络;利用String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,并使用R语言对预测靶点进行GO富集分析和KEGG通路分析。最后通过Autodock软件对药物的主要活性成分和核心作用靶点进行分子对接验证。结果:研究结果显示筛选得到筋骨痛消丸治疗髌骨软化症的活性成分188个及靶点249个,主要活性成分为槲皮素、柚皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇等,PPI网络主要计算出AKT1、CASP8、CASP3...     

网络药理学常见不同富集方法比较研究——以当归补血汤治疗贫血为例

目的:以当归补血汤治疗贫血为例比较常见网络药理学不同富集方法的差异,并对当归补血汤的活性成分和核心靶点进行分子对接,为后续网络药理学研究提供参考。方法:从TCMSP数据库、Uni Prot数据库、Gene Cards数据库获取当归补血汤活性成分、作用靶点及贫血相关靶点,用在线Venny 2.1.0平台对活性成分作用靶点和贫血靶点取交集,用Cytoscape 3.7.1绘制药物-活性成分-靶点-疾病网络。交集靶点导入STRING蛋白互作数据库构建PPI网络,取DC值的2倍中位数得到核心靶点。使用Auto Dock软件对活性成分和核心靶点进行分子对接、验证成分和靶点的结合性。用Metascape数据库、DAVID数据库、Cytoscape软件的Glue GO插件及R语言的“cluster Profiler”程序包对核心靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,取KEGG通路分析结果前20条信号通路进行比较。结果:当归补血汤活性成分共22个,对应...     

基于网络药理学对丹参治疗非酒精性脂肪肝病主要活性成分及潜在靶点分析

目的运用网络药理学研究方法对丹参治疗非酒精性脂肪性肝病(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)主要活性成分及核心靶点进行分析。方法采用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、DRAR-CPI分子对接平台和Uniprot数据库筛选出丹参的有效活性成分及作用靶点基因,通过Gene Cards数据库收集NAFLD疾病基因,然后对药物作用基因及疾病相关基因进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点,进而构建活性成分-靶点相互作用网络,并进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果研究得到26个作用于NAFLD疾病靶点的活性成分和98个作用靶点,GO功能富集分析确定了289个条目,KEGG通路分析共发现83条作用通路。结论本研究结果初步探讨了丹参治疗NAFLD的基本药理作用及其相关机制,并为进一步的实验室研究奠定了良好的基础。     

基于数据挖掘和网络药理学研究中药免疫增强剂的作用机制及用药规律

目的 采用数据挖掘的方法探究复方专利处方中用于增强免疫力的中药配伍规律,并运用网络药理学、分子对接技术分析其中核心药物的潜在作用机制。方法 挖掘国家知识产权局中药增强免疫力的复方专利数据,进行中药频次、关联规则以及复杂网络分析,并筛选出核心药物。利用TCMSP平台筛选核心药物活性成分并进行靶点预测,于疾病数据库OMIM、DrugBank、GeneCards、Uniprot筛选免疫力相关靶点,获取核心中药与免疫力的交集靶点;对交集靶点进行蛋白互作(PPI)分析和基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用分子对接技术对药物活性成分、关键靶点进行验证。结果 分析中药复方专利得出5味核心药物：黄芪、人参、枸杞子、茯苓、当归,有效活性成分对应靶点214个,1 784个免疫力相关靶点,交集靶点55个,关键作用靶点有RELA、TNF、TP53、IL-6。GO分析结果显示主要调控对细菌起源分子的反应、对脂多糖的反应、对生物刺激的反应等。KEGG通路160条,主要涉及脂质与动脉粥样硬化、南美洲锥虫病、TNF信号通路、癌症通路等多条信号通路。分子对接结果显示,槲皮素、山柰...     

基于网络药理学和分子对接探讨土茯苓-车前子干预尿酸性肾病作用机制

目的 通过网络药理学方法和分子对接研究土茯苓-车前子干预尿酸性肾病的可能机制。方法 使用TCMSP数据库筛选土茯苓-车前子化学成分及作用靶点,利用GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选尿酸性肾病相关靶点,获取药物-疾病交集靶点,利用STRING11.0数据库构建蛋白相互作用网络,利用Cytoscape3.7.2软件构建活性成分-靶点网络,利用DAVID6.8数据库对药物-疾病交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。利用AMDock1.0软件对主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 获得土茯苓活性成分15个,车前子9个,活性成分与尿酸性肾病交集靶点59个,核心靶点有IL6、TNF、PPARG、TP53等。GO功能分析得到生物过程238个,细胞组分39个,分子功能46个;KEGG通路富集分析得到84条通路,包括AGE-RAGE、IL-17、TNF信号通路等。分子对接结果显示,主要活性成分与核心靶点之间有较强亲和力。结论 土茯苓-车前子干预尿酸性肾病与调节肝、肾细胞相关细胞因子,激活AGE-RAGE、IL-17、TNF信号通路,影响肝、肾细胞生物活性有关。     

基于网络药理学和分子对接探究参芪复方治疗糖尿病肾病分子机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术探讨参芪复方治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的分子机制。方法 首先运用TCMSP数据库获得参芪复方的活性成分及对应靶点;从OMIM、DrugBank、TTD、GeneCards数据库中筛选获得DKD的相关靶点。接着将参芪复方活性成分靶点和疾病靶点取交集,得到交集靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点”(D-A-T)网络图。然后将交集靶点上传至String平台进行PPI网络分析,并挖掘网络中核心靶点;采用Metascape平台分析对交集靶点进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。最后,运用AutoDock Vina 1.1.2对参芪复方的核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 研究发现参芪复方通过槲皮素、山柰酚、木樨草素等核心成分作用于AKT1、IL6、MAPK1、VEGFA等核心靶点,调节糖尿病并发症中AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、胰岛素抵抗、松弛素信号通路,并且参与了对有毒物质的反应、对受伤的反应、细胞迁移的正向调节等生物学过程以调控DKD。分子对接结果表明参芪...     

黄芪桂枝五物汤治疗强直性脊柱炎的网络药理学探讨

目的 运用网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪桂枝五物汤治疗强直性脊柱炎(AS)的分子机制。方法 按照黄芪桂枝五物汤的组成,在TCMSP数据库上搜索其化学成分和作用靶点,并对药物靶点进行基因注释;分别从Gene Cards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank五个数据库中搜索AS疾病相关靶点。然后利用Cytoscape 3.8.0软件将药物、活性化学成分、药物与疾病交集靶点三者构建“中药-活性有效成分-交集靶点”可视化网络;将可视化网络数据导入String数据库,构建蛋白互作网络;利用R语言软件和R包对结果进行GO和KEGG富集分析;最后对核心有效成分和核心靶点进行分子对接。结果 共获取黄芪桂枝五物汤活性化合物74个,根据疾病-中药汤剂共有的靶标逆向筛选中药汤剂活性成分后,剩余32个,预测出对应靶点997个;AS疾病相关靶点2 234个,交集靶点78个;利用CytoNCA插件二次打分后,共筛选得到8个核心靶点。GO富集分析共获得1 990条结果,KEGG富集分析共获得135个结果;分子对接结果表明,核心有效成分与核心基因的靶点能够稳定对接。结论 黄芪桂枝五物汤治疗AS是通...     

基于网络药理学探讨益气补肺颗粒对肺癌的免疫调节机制

目的 利用网络药理学方法探讨益气补肺颗粒对肺癌的免疫调节机制。方法应用中药系统药理学数据库分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、公共化合物数据库(PubChem)、药物靶点预测数据库(Swiss Target Prediction)及人类基因数据库(the Human Gene Database,GenCards)分别获得药物成分、药物潜在靶点和肺癌相关靶点,将二者交集靶点通过String数据平台进行药物-疾病蛋白质互作网络构建,进而利用Cytoscape软件筛选出关键药物成分和核心靶点。通过Webgestalt数据平台进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析;运用AutoDock进行分子对接。结果益气补肺颗粒含有潜在活性成分129个,主要成分包括3-甲氧基光甘草定、甘草酚、菜豆醇、7-甲氧基...     

基于网络药理学和细胞实验探讨陈皮-紫苏子药对治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的：基于网络药理学和细胞实验探讨陈皮-紫苏子药对治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)检索陈皮、紫苏子的化学成分与作用靶点。利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-作用靶点”网络,将度值排名前5位的化合物作为陈皮-紫苏子药对的核心成分。通过GeneCards数据库检索COPD相关靶点,借助微生信平台获取药物与COPD的交集靶点。将交集靶点上传至STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,进而筛选核心靶点。通过Metascape数据库进行基因本体(Gene Ontology, GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KE...     

基于网络药理学探讨健脾祛湿化瘀膏对支气管扩张缓解期的作用机制

[目的]分析健脾祛湿化瘀膏的有效化学成分及作用于人体的靶点蛋白,以探索其治疗支气管扩张缓解期的作用机制。[方法]通过中药系统药理学数据库分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)对健脾祛湿化瘀膏的化学活性物质及作用于人体的靶点蛋白进行检索和筛选,同时应用基因组注释数据库平台(genome annotation database platform,GeneCards)预测疾病靶点,绘制关键化学成分-靶点网络图;通过String数据库平台构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络,寻找PPI核心基因,再进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,找出所涉及的信号通路,构建靶点-信号通路网络图。[结果]通过筛选,共获得健脾祛湿化瘀膏治疗支气管扩张缓解期的关键化学成分107个,共同靶点60个;GO富集分析结果包括营养水平应答、囊泡腔、血红素结合等,KEGG富集分析结果包括晚期糖基化终产物及其受体(advanced glycation end products-receptor for advanced glycation end products,AGE-RAGE)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、白介素-17(interleukin-17,IL-17)信号通路等。[结论]健脾祛湿化瘀膏可能通过调节AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等发挥抗感染、抗炎、调节免疫的功能,进而起到治疗支气管扩张缓解期的作用。