基于网络药理学探讨鸡血藤对糖尿病周围神经病变的作用机制

目的:应用网络药理学研究鸡血藤治疗糖尿病周围神经病变(Diabetic Peripheral Neuropathy,DPN)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索鸡血藤的主要有效成分及作用靶点,应用GeneCards数据库检索DPN的关键靶点,接着使用R语言绘制韦恩图得到鸡血藤治疗DPN...     

基于网络药理学探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制。方法:根据中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选桃红四物汤药物活性成分和靶点。根据Gene Cards、OMIM数据库筛选糖尿病周围神经病变(DPN)靶点基因,构建韦恩图,得到桃红四物汤治疗DPN的作用靶点,应用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点-疾病网络。应用R软件进行基因本体(GO)功能注释和东京基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共筛选出桃红四物汤43种有效成分,212个作用靶点,4662个DPN相关靶点,桃红四物汤干预DPN主要涉及150个靶点基因。富集出生物过程155条、信号通路166条。结论:桃红四物汤可能通过调节AKT1、JUN、MAPK1等靶点,调控AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、IL-17信号通路等多种途径治疗DPN。     

糖痹康治疗糖尿病周围神经病变机制的网络药理学研究

目的：基于网络药理学探究糖痹康治疗糖尿病周围神经病变（Diabetic Peripheral Neuropathy,DPN）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及Swiss Target Prediction数据库检索,以“Diabetic peripheral neuropathy”为关键词,在GeneCards数据库检索DPN的靶点基因。通过STRING数据库分析关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用关系,并利用DAVID数据库进行基因本体论（GO）富集分析以及京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析,运用Cytoscape 3.6.0软件进行药物活性成分-药物-靶点-疾病的网络分析。结果：糖痹康治疗DPN的药物作用成分111个,与疾病的共同靶点共168个;主要有效成分为槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素、豆甾醇、山柰酚等;相关靶点为前列腺素氧化环化酶（Prostaglandin-Endoperoxide Synthase,PTGS）2、PTGS1、β2肾上腺素受体（Adrenoceptor Beta 2,ADRB2）、心脏钠离子通道α亚单位（Sodiu...     

基于网络药理学研究国医大师熊继柏运用藤类药治疗糖尿病周围神经病变的分子机制

目的：基于网络药理学研究国医大师熊继柏运用藤类药(特指黄芪虫藤饮中的“五藤”,即青风藤、海风藤、络石藤、鸡血藤、钩藤)治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的分子机制。方法：在TCMSP数据库中获取五藤有效成分及相关靶点,利用UniProt平台对其进行规范。通过OMIM、GeneCard和DrugBank数据库筛选DPN疾病靶点,将二者取交集后导入STRING 11.5并通过Cytoscape 3.7.1对其进行分析,得到核心靶点及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络与五藤成分-DPN靶点-通路网络。在Metascape平台进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析后用R语言作图。运用Autodock与Pymol软件进行分子对接。结果：五藤关键活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、beta-谷甾醇等;核心靶点为禽肉瘤蛋白癌基因同源物(JUN)、蛋白激酶B1(AKT1)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、肿瘤蛋白53(TP53)、丝裂原激活蛋白酶1(MAPK1)等;关键通路为晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、白细胞介素-17(IL-...     

基于网络药理学探讨黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制

目的:探讨黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制.方法:本研究通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取黄芪中含有的活性成分及成分所对应的靶点,通过GeneCards数据库挖掘糖尿病肾病疾病靶点,结合化合物及疾病靶点,构建成分-靶点网络图,并针对靶点进行基因本体(GO)富集分析及KEGG通路富集分析.结果:黄芪中含有24...     

穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的网络药理学作用机制

目的研究穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的网络药理学作用机制。方法利用PharmMapper、Genecards数据库预测和筛选出穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的潜在靶点,通过DAVID 6.8数据库对获得的靶点蛋白进行GO富集分析和KEGG通路注释,采用String 10.5数据库和Cytoscape 3.5.1软件绘制蛋白相互作用网络和"活性成分-靶点-信号通路"网络图。结果穿山龙27个活性成分可通过调控SRC、PIK3R1、STAT1、MAPK1、JAK2、IGF1、IL2等靶点,干预PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、VEGF信号通路、TLRS信号通路、JAK/STAT信号通路、PPAR信号通路等相关信号通路,从而参与炎症、免疫、氧化应激等过程来发挥治疗痛性糖尿病周围神经病变的作用。结论本研究结果初步预测了穿山龙治疗痛性糖尿病周围神经病变的主要活性成分、靶点和相关通路,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。     

黄芪桂枝五物汤治疗糖尿病周围神经病变靶点预测与机制探讨

目的:通过网络药理学的方法对黄芪桂枝五物汤治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的相关靶点进行预测与机制探讨。方法:利用中药网络药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选出黄芪桂枝五物汤中有效成分和相关靶标蛋白;运用网络可视化软件Cytoscape 3.5.1构建黄芪桂枝五物汤有效成分-靶标相互作用网络进行拓扑学分析;借助STRING在线数据库进行蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析;从Uniprot数据库中获取靶标蛋白的基因名称后,借助David数据库进行KEGG通路功能富集分析,研究黄芪桂枝五物汤在治疗DPN上的作用机制及原理。结果:黄芪桂枝五物汤的核心化合物有槲皮素(quercetin),山柰酚(kaempferol),β-谷甾醇(beta-sitosterol),7-O-甲基异丙醇胺(7-O-methylisomucronulatol),异鼠李素(isorhamnetin)等,核心靶标有前列腺素G/H合酶2(prostaglandin G/H synthase2),热休克蛋白HSP90(heat shock protein HSP90),核受体共激活因子2(uclear receptor coactivator2)等;PPI网络图显示黄芪桂枝五物汤有效成分中关键蛋白主要有CJun氨基端激酶(JUN),肿瘤蛋白p53(TP53),FOS,丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),转录因子P65(RELA),白细胞介素-8(IL-8)等;KEGG结果表明黄芪桂枝五物汤主要作用与肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway),Toll样受体信号通路(Toll-like receptor signaling pathway)等信号通路有关。结论:黄芪桂枝五物汤主要通过多种途径,多种信号通路作用于多种靶点发挥其药物功效,利用网络药理学通过多种数据库与统计分析软件可以有效预测与分析药物的潜在作用与起效机制。     

木贼-青葙子药对治疗糖尿病视网膜病变作用机制网络药理学研究

目的 运用网络药理学方法 探讨木贼-青葙子药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制.方法 应用TCMSP、ETCM、Uniprot数据库检索木贼和青葙子药物成分及靶点,应用GeneCards、OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变基因,通过Venny软件获得交集靶点,利用Cytoscape3.6.1软件构建靶点关系网络,录入St...     

基于网络药理学和分子对接探讨黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变的作用机制

目的 利用网络药理学和分子对接探讨黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变的作用机制,为创新药物开发和作用机制研究提供依据。方法 利用成分靶点数据库（SwissTargetPrediction）和靶点数据库平台（Targetnet）筛选出黄芪甲苷的潜在靶点,在人类基因数据库（GeneCards）、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）和药物靶标数据库（TTD）中检索糖尿病视网膜病变的相关靶点。将黄芪甲苷潜在靶点和糖尿病视网膜病变相关靶点进行重合,交集靶点即为黄芪甲苷治疗糖尿病视网膜病变可能的作用靶点。随后进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络建立、基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。在此基础上,运用实验研究对发现的结合力最强的关键靶点信号传导通路进行了验证。结果 黄芪甲苷的作用靶点和糖尿病视网膜病变的交集靶点共56个,经过PPI网络分析获得排名前5位的关键靶点为蛋白激酶B1（Akt1）、血管内皮生长因子A（VEGFA）、表皮生长因子受体（EGFR）、非受体酪氨酸蛋白激酶（Src）、信号转导和转录激活因子3（STAT3）。分子对接分析验证显示,黄芪甲苷与上述5个关键靶标受体的亲和力较强。实验研究表明,黄芪甲苷通过Akt/Nrf2/HO-1和Akt/糖原合成酶激酶-3β（GSK-3β）信号通路的调控,抑制了高糖引起的视网膜色素上皮细胞的损伤。结论 黄芪甲苷的潜在靶点与糖尿病视网膜病变的相关靶点高度相关,表明黄芪甲苷具有多靶点、多途径治疗糖尿病视网膜病变的潜在作用。     

基于网络药理学探讨黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的作用机制

目的基于网络药理学探讨黄芪-山药药对治疗2型糖尿病的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索黄芪山药药对中药物成分,并以口服生物利用度(OB)值≥30%、类药性(DL)值≥0.18为条件筛选出黄芪山药的有效活性成分,确定药物有效活性成分后通过TCMSP数据库预测相应靶点,再将预测的靶点输入到Uniprot中转换为相应的基因。将有效活性成分及靶点对应的基因导入Cytoscape3.2.1中构建黄芪-山药有效成分—靶点网络。通过Pharm Gkb数据库检索2型糖尿病相关基因,并将检索出的基因导入Cytoscape3.2.1,利用Bisogenet插件构建2型糖尿病疾病靶点网络。利用Cytoscape3.2.1软件中Merge插件将黄芪-山药有效活性成分—靶点网络和疾病靶点网络进行合并。根据degree值筛选核心基因团,最后利用DAVID对筛选出的核心基因团进行GO注释和KEGG通路分析。结果黄芪有效活性成分20个,山药有效活性成分16个,2型糖尿病相关疾病基因43个。KEGG通路为PI3K/Akt信号通路、Fox O信号通路相关、甲状腺激素信号通路。结论黄芪-山药的有效活性成分治疗2型糖尿病可能与PI3K/Akt信号通路、Fox O信号通路相关、甲状腺激素信号通路相关。     

基于网络药理学的黄芪-当归-川芎治疗糖尿病肾脏疾病机制研究

目的:利用网络药理学技术研究黄芪-当归-川芎治疗糖尿病肾脏疾病(Diabetic Kidney Disease,DKD)的潜在作用机制.方法:运用网络数据库对三味药物黄芪、当归、川芎组成的药组的化学成分及其作用靶点与DKD的靶点进行筛选.利用Cytoscape 3.7.2软件,构建“中药组活性成分-作用靶点”网络.利用...     

基于网络药理学探讨黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制

目的 基于网络药理学探讨黄芪治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的作用机制.方法 应用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选出黄芪的活性成分及其作用靶点,采用OMIM数据库,Drugbank数据库,TTD数据库,GeneCards数据,检索与DKD相关的靶点基因.利用Ven...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪桂枝五物汤治疗糖尿病周围神经病变和类风湿性关节炎“异病同治”的作用机制

目的 运用网络药理学方法和分子对接技术,从益气活血的角度探讨黄芪桂枝五物汤治疗糖尿病周围神经病变(diabetic peripheral neuropathy, DPN)和类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis, RA)“异病同治”的作用机制。方法 本研究运用网络药理学,从中医“同治异病”的角度探讨黄芪桂枝五物汤治疗DPN、RA的作用机制。结果 黄芪桂枝五物汤治疗DPN、RA都采用了益气温经、和血通痹的治疗方法,证实了DPN、RA在其证候特点的相同点,也推出了两者“异病同治”的客观存在性。黄芪桂枝五物汤对DPN和RA的治疗作用主要是通过整体调控晚期糖基化终末产物(advanced glycosylation end products, AGEs)—糖基化终末产物受体(receptor of AGEs, RAGE)信号通路实现的,但对不同病变有不同的侧重点。DPN的治疗主要通过抑制神经元凋亡和刺激突触再生来保护神经。RA的治疗往往依赖于对肿瘤坏死因子(transforming necrosis factor, TNF)信号通路、Toll样受体(Toll-like rec...     

基于网络药理学方法和分子对接技术探讨芍药甘草汤合桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变的作用机制

目的：运用网络药理学方法及分子对接技术探讨芍药甘草汤合桃红四物汤治疗糖尿病周围神经病变（DPN）的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选芍药甘草汤合桃红四物汤的活性成分及相关靶点信息;从DrugBank、PharmGKB、GeneCards、OMIM和TTD数据库中获取DPN的靶点基因。运用Cytoscape软件、STRING数据库构建芍药甘草汤合桃红四物汤活性成分-DPN共同靶点基因关系网络及共同靶点基因的蛋白质相互作用（PPI）网络。利用R语言软件进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。采用AutoDock Vina软件进行分子对接。结果：共获得161个芍药甘草汤合桃红四物汤活性成分,184个芍药甘草汤合桃红四物汤活性成分-DPN共同靶点基因。核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮,核心靶点基因为信号传导及转录激活蛋白3 (STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、热休克蛋白90AA1 (HSP90AA1)、丝裂原活化蛋白激酶1 (MAPK1)、转录因子p65 (RELA)。GO功能富集分析得到2 940条GO条目,KEGG通路富集分析得到182条信号通路。分子对接结果显示,木犀草素与HSP90AA1的结合活性最好。结论：芍药甘草汤合桃红四物汤具有多成分、多靶点、多通路的效应特点,其作用机制可能是槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等活性成分作用于STAT3、MAPK3、HSP90AA1、MAPK1、RELA等靶点基因,调控磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B (PI3K-Akt)、晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）、白细胞介素-17 (IL-17)、肿瘤坏死因子（TNF）、缺氧诱导因子1 (HIF-1)等多条信号通路,通过抗氧化应激、抑制炎症反应、保护神经细胞、改善胰岛素抵抗发挥治疗DPN的作用。     

基于网络药理学与分子对接探讨防己—黄芪药对治疗糖尿病肾病的作用机制

目的 采用网络药理学与分子对接的方法挖掘防己—黄芪药对治疗糖尿病肾病的有效活性成分和作用靶点,分析其可能的作用机制.方法 利用TCMSP数据库检索防己—黄芪的化学成分以及对应的靶点,以口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30％、类药性(drug likeness,DL)≥0.18作为筛选条件筛...     

基于网络药理学和细胞生物学研究黄芪治疗糖尿病肾病的作用机制

目的 运用网络药理学和细胞生物学验证探讨黄芪治疗糖尿病肾病的分子作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选出黄芪有效成分;利用Drugbank数据库、GeneCards和OMIM数据库筛选黄芪有效成分和糖尿病肾病的相关靶点;应用String数据库绘制PPI网络;通过Cytoscape软件绘制黄芪-成分-...