基于GEO数据库的银屑病lncRNA筛选与ceRNA网络构建

目的：构建银屑病竞争性内源性RNA(ceRNA)调控网络，为银屑病发病机制提供生物信息学参考。方法：基于基因表达综合数据库(GEO)筛选差异表达的lncRNA并通过相关性分析找到与其相关的编码基因，进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用lncBase数据库预测lncRNA的靶向微小RNA(microRNA, miRNA);使用TargetScan数据库预测编码基因靶向miRNA;利用Cytoscape构建ceRNA网络。结果：本研究基于差异表达的lncRNA构建出6个lncRNA(LIN01094、LINC01215、KLF-AS1、TINCR、EMX2OS、C14orf132)介导的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络，显示这些lncRNA可能通过影响细胞周期、蛋白酶体、DNA复制、细胞因子-细胞因子受体的相互作用、FoxO信号通路等发挥作用。结论：差异表达的(lncRNA LIN01094、LINC01215、KLF-AS1、TINCR、EMX2OS、C14orf132)可能作为ceRNA发挥调控功能，参与银屑病发病。     

甲状腺乳头状癌相关ceRNA网络的生物信息学分析

目的 近些年由于高通量测序的发展,针对环状RNA(circRNA)的研究越来越多,但仍有大量的环状RNA有待探索,本文通过对甲状腺乳头状癌(PTC)中竞争性内源性RNA(ceRNA)的研究,构建circRNA-miRNA-mRNA的ceRNA网络,探索PTC中环状RNA潜在的调控机制,为临床寻找新的标志物或治疗靶点提供新的思路和见解。方法 整合GEO和TCGA两大数据库,下载与PTC相关的芯片及临床数据,运用生物信息学方法构建与生存相关的ceRNA网络机制。结果 两大数据库中共鉴定出16个环状RNA、199个miRNA和4 308个mRNA的差异表达基因,通过Cancer-Specific CircRNA Database预测环状RNA可能结合的miRNA并绘制韦恩图,将得到11个差异表达的miRNA通过TargetScan、miRDB两大数据库预测mRNA靶基因并整合,共得到751个差异表达的mRNA,通过三者之间作用关系整合成ceRNA网络并进行可视化,利用STRING网站工具构建蛋白质相互作用网络,计算并筛选出其中密度最高、接近中心性的前10个枢纽基因,GO和KEGG通路富集分析...     

遗忘型轻度认知功能损害血浆中竞争内源性RNA网络构建及分析

目的 探讨阿尔茨海默病（Alzheimer′s disease,AD）轻度认知功能损害阶段（amentia mild cognitive impairment,aMCI）血浆中的非编码RNA（noncoding RNA,ncRNA）功能失调与AD的病理生理相关性,并探讨潜在的AD生物标志物和发病机制。 方法 纳入金标准诊断的aMCI受试者5例和正常对照组（normal control,NC）5例,应用微阵列技术分析aMCI和NC血浆中长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）、微小RNA（microRNA,miRNA）和信使RNA（messenger RNA,mRNA）的表达谱,应用R软件筛选出差异表达的lncRNA、miRNA、mRNA,通过PicTar 2005、TargetScan 5.1和miRanda v5数据库对差异表达的RNA的关系进行分析,建立以上调lncRNA为中心的竞争内源性RNA（competing endogenous RNA,ceRNA）网络,并对其中相关差异表达的mRNA进行基因本体论功能富集和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。 结果 在外周血浆中总共筛选出lncRNA 287个、miRNA 46个和mRNA 208个在aMCI和NC的表达差异有统计学意义（P＜0.05）,分别有lncRNA3个、 miRNA5个和mRNA7个参与构建了遗忘型轻度认知功能损害ceRNA调控网络。GO和KEGG结果显示差异表达mRNAs主要在RNA代谢过程、细胞质应激颗粒、转录调控因子活性等生物学过程,单纯疱疹感染通路、催产素信号通路和叶酸合成通路上显著聚集。 结论 不同的ncRNA参与AD的发病机制,构建的ceRNA网络有助于增进对AD发病分子生物学机制的认识,ncRNAs可能成为AD诊断的生物标志物和治疗干预的新靶点。     

基于房颤中circRNA-miRNA-mRNA网络构建和免疫细胞浸润的生物信息学分析

目的：采用生物信息学方法挖掘公共数据库,构建房颤（AF）的内源性RNA (ceRNA免疫调节网络,了解AF的发生发展机制。方法：从基因表达数据库（GEO）中下载AF患者和健康对照者环状RNA (circRNA)(GSE129409)、微小RNA (miRNA)(GSE28594)和mRNA(GSE41177)基因表达数据。采用R软件中的“limma”数据包鉴定出差异表达的circRNA、miRNA和mRNA,并通过相关数据库进行可视化展示。通过ENCORI、circBank、TargetScan和miRDB数据库预测差异表达的circRNA、 miRNA和mRNA之间的调控关系,并基于circRNA-miRNA对和miRNA-mRNA对构建ceRNA调控网络。采用DAVID数据库对差异表达mRNA (DEmRNA)进行基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析以注释其功能。采用受试者工作特征（ROC）曲线筛选最佳基因特征并计算ROC曲线下面积（AUC）。采用CIBERSORT软件分析AF中免疫细胞浸润情况。结果：共鉴定出103个差异circRNAs、 37个差异m...     

基于生物信息学构建阿尔茨海默病内源竞争RNA调控网络

目的 探讨阿尔茨海默病(AD)中差异长链非编码RNA(lncRNA)与靶向微RNA(miRNA)、mRNA的相互作用关系及其导致AD的发病机制.方法 在基因表达综合数据库(GEO)中下载数据,筛选出在AD早中晚期存在差异表达的lncRNA和mRNA,运用RegRNA预测lncRNA的靶向miRNA,TargetScan...     

再生障碍性贫血患者RNA互作网络分析及潜在治疗药物预测

目的 探究再生障碍性贫血(aplastic anemia, AA)患者骨髓T细胞差异表达的微小核糖核酸(microRNA,miRNA)和信使RNA(messenger RNA,mRNA)基因,构建互作调控网络并筛选药物,随后评估其治疗方案疗效。方法在基因表达数据库检索并进行综合分析,使用R语言对AA相关miRNA与mRNA进行差异表达分析,并通过miRNet预测差异表达miRNAs(DE-miRNAs)的靶向mRNAs,并与差异表达mRNAs(DE-mRNAs)进行比较与负相关配对,得到失调mRNAs,再对失调mRNAs进行功能基因注释(GO)分析与通路富集(KEGG)分析,构建AA的miRNA-mRNA互作调控网络。采用自主研发的表观精准治疗平台(EpiMed)进行潜在治疗药物预测,并将盐酸二甲双胍纳入新型联合治疗方案中,对入组的40例难治性AA进行临床疗效评估,评估主要指标包括血红蛋白、中性粒细胞绝对值、血小板计数及输血依赖等。结果 差异分析最终获得26个DE-miRNA与168个靶向DE-mRNA,对其进行构建调控网络。GO和KEGG分析结果显示,AA相关失调mRNA可能参与T细...     

基于微RNA-mRNA调控网络对草酸钙肾结石形成关键分子的筛选和分析

目的 应用生物信息学技术构建草酸钙肾结石大鼠miRNA-mRNA调控网络并筛选出调控草酸钙肾结石形成的关键分子。方法 从基因表达汇编（GEO）数据库中筛选出乙二醇喂养14 d诱导的草酸钙肾结石大鼠肾组织的miRNA和mRNA数据集,利用GEO2R在线工具分析得到差异表达miRNA(DEM)和差异表达基因（DEG）,并用热图进行展示。利用在线靶基因预测工具miRWalker预测DEM的靶基因,根据miRNA负向调控mRNA原理应用R语言“venn.diagram”包与DEG取交集,得到参与调控草酸钙肾结石形成的基因,然后应用“clusterprofile”包对调控基因进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,利用String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析,利用Cytoscape软件实现对PPI和miRNA-mRNA调控网络可视化和关键基因的筛选。结果 共分析得到38个DEM和364个DEG。将预测得到的DEM靶基因与DEG取交集后得到116个调控基因,这些基因富集在24个GO条目和22个KEGG信号通路中。成功构建了miRNA-mRNA调控网...     

基于生物信息学方法预测与多囊卵巢综合征相关的miRNA

目的：基于生物信息学方法构建多囊卵巢综合征(PCOS)表达的miRNA及miRNA靶基因的调控网络。方法：从GEO数据库的GPL16543平台下载miRNA基因芯片数据集GSE72274,用GEO2R筛选差异表达的miRNA,应用在线数据库miRWalk分析预测miRNA差异表达的靶基因。对靶基因进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析。应用Cytoscape软件绘制miRNA及其相关靶基因调控图。通过STRING网站对靶基因进行PPI网络构建,并使用CytoHubba插件进行Hub基因分析。结果：共筛选出差异miRNA一共38个,其中32个上调,6个下调。预测差异miRNA的靶基因得到393个,GO分析发现差异的靶基因主要参与RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的调节、RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的正调节、蛋白结合、金属离子结合、D等生物学过程。KEEG分析表明其主要参与TGF-β信号通路和Hedgehog信号通路。成功构建miRNA相关靶基因调控网络,调控网络中的miRNA包括：hsa-miR-135b-5p、hsa-miR-199a-3p、hsa-miR-32-5p。通过CytoHubba...     

基于微阵列数据分析的甲状腺癌circRNA⁃miRNA调控预测模型研究

目的：通过微阵列分析寻找更多甲状腺癌中差异表达的环状RNA（circRNA）并探讨其作用机制。方法：使用R软件分析来自基因表达图谱（gene expression omnibus,GEO）数据库中下载的基因芯片数据集GSE93522得到差异表达的circRNA。使用miRDB、miRTarBase和TargetScan数据库预测相关微小RNA（miRNA）和信使RNA（mRNA）,结合来自肿瘤基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库的513个甲状腺癌组织样本和59个癌旁组织样本中差异表达的miRNA和mRNA,利用Cytoscpe软件构建circRNA?miRNA?mRNA调控网络。通过基因本体论（gene ontology,GO）分析、京都基因与基因组百科全书数据库（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）分析以及生存曲线分析等,筛选其中重要的circRNA?miRNA?mRNA调控网络。进一步结合基因芯片数据集GSE40807、GSE3467和GSE33630以及TCGA库中数据及临床资料验证得到的调控网络。结果：构建的circRNA?miRNA?mRNA调控网络包括18个circRNA、8个miRNA和26个mRNA。GO分析显示,其中一些mRNA参与细胞代谢、迁移等,并参与细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶复合物的组成。KEGG分析显示,一些mRNA与PI3K?AKT通路、MAPK通路和P53信号通路等相关。结合circRNA评分构建由21对circRNA?miRNA关系对和16对miRNA?mRNA关系对组成的重要circRNA?miRNA?mRNA调控网络,其中包括6个circRNA、8个miRNA和16个mRNA。根据TCGA数据库中表达验证及临床资料分析,得到hsa_circ_0001658?hsa?mir?183?AKAP12调控网络与甲状腺癌发生发展关系最为密切。结论：多条circRNA?miRNA?mRNA网络与甲状腺癌的发生发展有关,其中hsa_circ_0001658?hsa?mir?183?AKAP12调控网络最为重要,这可能有助于寻找更多的甲状腺癌诊断与预后标志物和治疗靶点。     

妊娠期糖尿病患者外周血长链非编码RNA表达谱的差异性分析

目的 探讨妊娠期糖尿病(GDM)患者外周血中长链非编码RNA(lncRNAs)的差异表达谱及其功能。方法 分别收集2020年7月至2021年12月在宣汉县人民医院妇产科入院治疗的妊娠期糖尿病患者(GDM组)、门诊健康体检孕妇(对照组)外周血标本各3例。使用高通量测序技术筛选获得差异表达的lncRNA，并通过GO富集分析和KEGG Pathway富集分析查明差异表达的lncRNAs靶向调控的m RNA转录本的生物信息学功能。结果 与对照组比较，GDM组共筛选出差异表达的lncRNAs 333个，mRNA 2 036个，其中上调的lncRNAs 169个，m RNA645个；下调的lncRNAs 164个，m RNA 1 391个；GO生物学功能富集分析结果显示：差异表达的lncRNAs靶向调控的mRNA转录本主要富集在转录因子AP-1复合物、蛋白质复合物分解的调控、免疫系统调节、防御反应、细胞解剖实体、大分子代谢过程的调控、氮化合物代谢过程的调控、胞浆、代谢过程调节等；KEGG信号通路富集分析结果显示：差异表达的lncRNAs靶向调控的m RNA转录本参与的信号通路主要包括B细胞受体信号...     

结直肠癌中LncRNA介导的内源性竞争性RNA调控网络

【摘要】 目的 构建结直肠癌RNA调控网络,探讨结直肠癌中分子调控机制。方法 从TCGA数据库中提取结直肠癌转录水平表达数据,筛选差异表达RNAs,结合miRDB, miRcode, miRTarBase和TargetScan数据库靶基因预测 结果,整合LncRNA- miRNA.miRNA-mRNA关系对,基于ceRNA假说及LncRNA细胞内定位,筛选出胞质表达并介导该网络调控的LncRNA,重建结直肠癌中IncRNA-miRNA-mRNA作用网络。结果 在结直肠癌差异表达基因分析中初步筛选出119个LncRNA、32个m沢NA以及59个mRNA;识别777对LncRNA-miRNA与77对miRNA-mRNA, 基于ceRNA假说以及LncRNA在细胞内定位,最后筛选出15个上调LncRNA、3个下调miRNA(hsa-mir-145, hsa-mir- 193b, hsa-mir-150)以及5个上调mRNA重建ceRNA网络。结论 成功构建结直肠癌中LncRNA介导调控的ceRNA 网络,识别出预后相关的潜在靶点,为结直肠癌治疗研究提供了新的参考依据。     

基于生物信息学方法构建肝癌患者预后相关内源竞争RNA调控网络

目的：基于生物信息学方法探索肝细胞癌相关的差异表达基因（DEGs），并构建预后相关内源竞争RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络。方法：利用数据集GSE89377，筛选肝细胞癌不同发展时期的肿瘤组织与正常组织间的差异表达基因；通过GEPIA,HPA数据库探究DEGs的mRNA和蛋白在肝细胞癌中的表达，及对患者预后的影响；随后通过Cox回归分析，筛选可独立预测患者预后的关键基因；进一步通过GO和KEGG富集分析探索关键基因相关信号通路。最后，通过miRmap、miRWalk和Targetscan数据库预测关键基因的上游微小RNA (microRNA,miRNA)，并筛选预后相关miRNAs；通过Starbase和Lncbase预测重要miRNAs的LncRNAs，并筛选预后相关LncRNAs。以此构建影响肝癌患者预后的差异基因-miRNA-LncRNAs的ceRAN调控网络。结果：韦恩分析及表达分析发现，4个DEGs在肝癌组织及正常组织间差异表达，即AKR1B10、LAGLS4、MUC13、IGFALS；其中，AKR1B10高表达可独立预测肝癌患者...     

基于高通量芯片对急性髓系白血病竞争内源性RNA网络的构建和分析

目的:构建急性髓系白血病(AML)相关的竞争内源性RNA(ceRNA)网络,探讨AML发生发展的分子机制.方法:采用NCBI的基因表达数据库(GEO)下载AML的表达矩阵(GSE96535),通过R语言的edgeR函数对差异表达的mRNA和长链非编码RNA(lncRNA)进行筛选.采用miRcode、miRDB、miR...     

缺血性脑卒中患者的循环免疫circRNA-miRNA-mRNA轴预测

目的:探讨缺血性卒中(Ischemic Stroke, IS)患者的循环免疫环状RNA(circular RNA,circRNA)-微小RNA(microRNA,miRNA)-信使RNA(messenger RNA,mRNA)轴,寻找治疗IS的分子靶点。方法:从GEO数据库中检索到了GSE16561、GSE195442数据集,使用R软件或者GEO2R工具查找缺血性卒中患者与正常对照血液之间差异表达的基因、circRNAs。通过STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,用Cytoscape3.9.1进行可视化,使用CytoNCA中的介数中心度筛选出评分较高的基因。对筛选出前15个评分较高的差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)途径富集分析。之后,根据mirTargets 2.0数据库预测靶标miRNAs,构建miRNA-mRNA调控网络。使用GEO2R工具筛选出IS患者差异表达的circRNAs,结合文献挑选出显著差异并且已经经过PCR验证过的circRNAs,使用Circular RNA Interactome构建circRNA-miR...     

基于生物信息学构建肝细胞癌预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络

目的 应用生物信息学方法筛选肝细胞癌中差异表达的环状RNA (circRNA),构建肝癌预后相关circRNA-微RNA (miRNA)-mRNA调控网络。方法 从基因表达综合（GEO）数据库中下载肝癌相关circRNA数据集,应用GEO2R工具筛选差异表达circRNA,在Circular RNA Interactome及circBank数据库中预测与circRNA相结合的miRNA,在miRDB、RNAInter及TargetScan数据中预测miRNA的靶基因,构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。应用DAVID软件、STRING数据库、Cytoscape软件及GEPIA数据库对靶基因进行功能注释、通路分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）构建及预后分析,最后确定肝癌预后相关circRNA-miRNA-核心靶基因调控网络。结果 筛选出1个circRNA,为hsa＿circRNA＿0000301,与之结合的miRNA有4个,分别为hsamiR-377-3p、hsa-miR-767-3p、hsa-miR-1178-3p及hsa-miR-1228-3p。功能注释和通路富...     

肝细胞癌患者外周血单个核细胞诊断候选基因的筛选及其调控网络分析

目的: 通过筛选肝细胞癌（HCC）患者外周血单个核细胞（PBMC）诊断候选基因并分析其上游互作微小RNA（miRNA）、长链非编码RNA（lncRNA）、环状（circRNA）和参与的通路,探讨HCC发生、发展过程中的调控机制并寻找可用于临床诊疗的分子靶点。方法: 利用GEO数据库筛选HCC患者PBMC中的差异表达基因集,分别进行功能富集及互作分析,继而利用网络模块划分方法寻找差异表达基因中的诊断候选基因,再利用mirDIP、starBase在线工具对诊断候选基因的上游miRNA、lncRNA、circRNA进行预测。结果: 获得高可信度的差异表达基因265个,差异表达基因主要富集于增殖调控、代谢调节、细胞通信、炎症疾病等功能,基因本体及KEGG通路富集结果相互关联。筛选获得4个诊断候选基因,包括RNA结合蛋白FUS、C-X-C基序趋化因子配体8、卡林蛋白和RNA聚合酶Ⅱ亚单位H。预测到10个miRNA、1个lncRNA和38个circRNA符合筛选标准,最后构建出一个lncRNA/circRNA-miRNA-mRNA-通路调控网络。结论: 本研究基于数据挖掘方法筛选获得HCC患者PBMC中的诊断候选基因及其调控网络,为HCC的早期诊断和合理治疗提供了理论依据,有助于寻找新的肿瘤标志物。     

M1型巨噬细胞参与炎症反应的生信分析

目的:利用生物信息学预测与M1型巨噬细胞参与炎症反应有关的关键基因，以及调控该基因的miRNA。方法:NCBI-GEO数据库筛选人源单核巨噬细胞表达谱，使用GEO2R筛选差异表达基因，通过WebGestalt数据库对上述基因进行GO和KEGG功能富集分析，STRING 11.0数据库构建蛋白质相互作用网络，并应用Cytoscape 3.7.2软件进行可视化分析，采用Cyto Hubba插件最终圈定HUB基因，利用mirWalk数据库和miRcode数据库预测靶向调控HUB基因的miRNA。结果:(1)GEO数据库共筛选出123个高表达差异基因，7个低表达基因；(2)经Cytoscape分析得到前20个最关键的枢纽基因，并圈定与炎症相关的基因STAT1;(3)mirWalk和mirCode数据库预测miRNAs并进行交集分析，得出STAT1受miR-23a靶向调控。结论:miR-23a靶向调控STAT1抑制M1型巨噬细胞参与的炎性反应。     

高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建

目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建。方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子。利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系。通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析。利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调。差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路。基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点。结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切...     

基于二代测序技术ghrelin作用后人卵巢癌细胞差异表达lncRNA的生物信息学分析

目的 分析二代测序技术ghrelin作用后的人卵巢癌细胞株SK-OV-3中长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达。方法 从对照组（不添加ghrelin）和实验组（添加600 ng/mL ghrelin 24 h）的人卵巢癌细胞株SKOV-3中分别提取RNA进行测序,筛选出实验组发生差异表达的lncRNA,对其进行靶基因预测并将预测结果与差异mRNA取交集,对取交集后的基因进行GO分析和KEGG通路分析。结果 筛选获得差异表达的lncRNA有236个（上调130个,下调106个）;差异表达mRNA有71个（上调66个,下调5个）。差异表达lncRNA靶基因与差异表达mRNA取交集筛选获得57个基因。GO和KEGG通路富集分析结果显示：这些差异表达lncRNA主要与精、赖氨酸跨膜转运,氧化应激反应及发育过程相关,并且主要富集在细胞因子受体信号通路、胰高血糖素和胰岛素信号通路及癌症相关信号通路上。结论 ghrelin作用后的人卵巢癌细胞中lncRNA的表达有差异,其可能参与卵巢癌的发生、发展,提示ghrelin可能在卵巢癌治疗中具有重要作用。     

基于circRNA-miRNA-mRNA网络揭示circRNA在甲状腺乳头状癌中的作用

背景 甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是一种常见的内分泌肿瘤,越来越多证据表明circRNA与肿瘤的发展密切相关,但circRNA在PTC中的功能尚不清楚.目的 基于生物信息学方法,构建PTC患者circRNA-miRNA-mRNA网络,探索circRNA在PTC预后中的调控机制.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)获取PTC患者的circRNA数据,其中肿瘤组6例,对照组6例;miRNA数据中包含肿瘤组5例,对照组5例;mRNA数据中包含肿瘤组32例,对照组51例.分别筛选出差异表达的circRNA、miRNA和mRNA,从而构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络;下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中PTC患者的RNA-seq数据及临床病例资料,通过Kaplan-Meier分析筛选出与PTC患者预后相关的mRNA,进一步构建与PTC患者预后相关的circRNA-miRNA-mRNA调控网络.结果 根据GEO数据库中的测序数据集,对比肿瘤组与对照组,最终筛选出30个差异表达circRNA、10个差异表达miRNA以及12个差异表达mRNA,成功构建了PTC相关circRNA-miRNA-mRNA调控网络;通过TCGA数据库发现KIT、SFN、SPRY4这3个mRNA与PTC患者预后密切相关,从而建立PTC预后相关circRNA-miRNA-mRNA调控子网络,明确circRNA在PTC中的调控机制.结论 本研究为circRNA通过ceRNA机制影响PTC预后提供依据,并为PTC的治疗和预后判断提供理论基础和新见解.