基于生物信息学分析的口腔鳞状细胞癌微小RNA预后模型

目的通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的微小RNA(miRNA)预后模型,以期对OSCC患者进行精准的分组,提高治疗的针对性。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载OSCC患者的miRNA、mRNA表达谱和临床数据。采用单因素和多因素Cox风险回归分析筛选和建立miRNA预后模型。受试者工作特征曲线(ROC)和曲线下面积(AUC)检验预后模型的性能。预测6-miRNAs靶基因,与差异mRNA取交集后行基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。构建蛋白互作网络(PPI)筛选中枢基因。结果通过单因素和多因素Cox回归分析得到基于6个miRNA的预后风险模型。train组、test组和所有样品组中预测5年生存率的ROC曲线下AUC值分别为0.757、0.673、0.724。单因素和多因素Cox回归分析显示,6-miRNAs预后模型可以作为一个独立的预后因素(P<0.001)。靶基因构建PPI网络中前10个中枢基因为CCNB1、EGF、KIF23、MCM10、ITGAV、MELK、PLK4、ADCY2、CENPF、TRI...     

口腔鳞癌中缺氧基因相关预后模型的构建与验证

目的:通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的缺氧基因预后模型。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库下载OSCC患者的mRNA表达谱、临床数据和预后信息；通过蛋白互作网络(PPI)、Cox回归分析筛选和建立缺氧基因预后模型；生存分析(Kaplan-Meier, K-M)和受试者工作特征曲线(ROC)检验预后模型的准确性，单因素和多因素Cox回归评估模型作为独立预后因素的可行性；免疫相关性分析筛选差异表达的免疫检查点基因。结果:通过Cox回归分析构建了基于SLC2A3、GPI、PGK1三个缺氧基因的预后模型，将OSCC患者分为高风险组(n=173)、低风险组(n=172)。TCGA数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P<0.001),患者1、 3、 5年ROC曲线下面积分别为0.626, 0.677和0.713; GEO数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P=0.023),患者1、 3、 5年ROC曲线下面积分别为0.683、 0.705和0.690;单因素和多因...     

MicroRNA model that can predict the prognosis of oral squamous cell carcinoma based on bioinformatics analysis

目的 通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者预后相关的微小RNA（miRNA）预后模型,以期对OSCC患者进行精准的分组,提高治疗的针对性。方法 通过癌症基因组图谱（TCGA）数据库下载OSCC患者的miRNA、mRNA表达谱和临床数据。采用单因素和多因素Cox风险回归分析筛选和建立miRNA预后模型。受试者工作特征曲线（ROC）和曲线下面积（AUC）检验预后模型的性能。预测6-miRNAs靶基因,与差异mRNA取交集后行基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。构建蛋白互作网络（PPI）筛选中枢基因。结果 通过单因素和多因素Cox回归分析得到基于6个miRNA的预后风险模型。train组、test组和所有样品组中预测5年生存率的ROC曲线下AUC值分别为0.757、0.673、0.724。单因素和多因素Cox回归分析显示,6-miRNAs预后模型可以作为一个独立的预后因素（P<0.001）。靶基因构建PPI网络中前10个中枢基因为CCNB1、EGF、KIF23、MCM10、ITGAV、MELK、PLK4、ADCY2、CENPF、TRIP13。其中EGF和ADCY2与生存预后相关（P<0.05）。结论 6-miRNAs可有效地作为OSCC患者一种新的独立的预后模型,或可成为指导OSCC精准治疗的新方法。     

Nomogram预测根治性切除局部晚期口腔鳞状细胞癌患者的预后

目的:口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)是口腔癌的主要组织学类型,局部晚期OSCC的治疗仍是挑战。本研究构建并验证预测根治性切除局部晚期OSCC患者预后的列线图。方法:将269例OSCC根治性切除的患者分为训练队列与验证队列。用Cox回归分析患者预后的影响因素,构建可预测患者总生存期(OS)和癌症特异性生存期(CSS)的列线图模型。用一致性指数(C-index)、校准曲线和决策曲线分析(DCA)评价该模型,并在验证队列中验证。结果:年龄、Kaplan-Feinstein(KFI)指数、pT、阳性淋巴结数和全身免疫炎症指数(SII)与OS和CSS显著相关。基于这些因素,构建预测OS和CSS的列线图在训练队列中的C-index分别为0.712和0.709。校准曲线在实际值和预测值间吻合。DCA表明列线图有临床实用性。结果在验证队列中得到证实。结论:该模型可预测根治性切除局部晚期OSCC患者3年和5年的OS和CSS。     

基于自噬相关基因建立和验证口腔鳞状细胞癌的预后风险评分模型

目的 ：构建自噬相关基因（autophagy-related genes,ARGs）的预后风险评分模型,预测口腔鳞状细胞癌（oral squamous cell carcinoma,OSCC）的生存率。方法：从癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库中检索差异表达的ARGs,通过Cox回归分析及套索（the least absolute shrinkage and selection operator, LASSO）回归分析确定预后的ARGs,构建总生存期（overall survival, OS）风险评分模型。根据中位风险评分将TCGA数据库和基因表达汇编（gene expression omnibu,GEO）数据库中所有病例归类为低风险组和高风险组,使用Kaplan-Meier(K-M)法分析高、低风险组的OS,通过描述高、低风险组患者风险评分分布、生存状态分布和基因表达模式论证风险评分模型的准确性。构建列线图定量估计OSCC患者的生存率。通过免疫细胞浸润差异分析探讨该模型预测OSCC预后的潜在机制。结果：筛选出37个差异表达的ARGs,构建...     

血浆miR-1290表达水平对口腔鳞状细胞癌患者预后预测的价值

目的探讨血浆miR-1290表达水平对口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后预测的价值。方法选取2014年1月—2018年12月儋州市人民医院收治的OSCC患者70例,采用实时荧光定量聚合酶链反应检测OSCC患者血浆miR-1290表达水平。通过ROC曲线确定血浆miR-1290表达水平的最佳界值,并以此为标准将OSCC患者分为高miR-1290组(n=31)和低miR-1290组(n=39),对2组临床病理特征进行比较。应用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用单因素及多因素COX回归模型分析影响OSCC患者预后不良的危险因素。结果 OSCC组血浆miR-1290表达水平(0.65±0.14)明显低于对照组(2.06±0.90),二者间差异有统计学意义(t=13.912,P<0.001)。血浆miR-1290低表达与OSCC患者的临床分期、分化程度、肿瘤直径及淋巴结转移有关(P<0.05)。生存分析显示,低miR-1290组患者总生存率和无进展生存率明显低于高miR-1290组(P<0.01)。多因素COX回归模型分析显示,临床分期、淋巴结转移及血浆miR-129...     

血浆miR-1290在口腔鳞状细胞癌中的表达及临床意义

目的:探讨血浆miR-1290表达水平对口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)患者预后预测的价值。方法:选取2015年1月～2018年10月儋州市人民医院收治的OSCC患者82例,采用实时荧光定量PCR技术检测OSCC患者血浆miR-1290表达水平。通过受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线确定血浆miR-1290表达水平的最佳截断值,并以此为标准将OSCC患者分为高miR-1290组(n=48)和低miR-1290组(n=34),对两组临床病理特征进行比较。应用Kaplan-Meier法绘制生存曲线,采用单因素及多因素COX回归模型分析影响OSCC患者预后不良的危险因素。结果:OSCC组血浆miR-1290表达水平明显低于对照组(P<0. 01)。血浆miR-1290低表达与OSCC患者的临床分期、分化程度、肿瘤直径及淋巴结转移有关(P<0. 05)。生存分析显示,低miR-1290组患者总生存率明显低于高miR-1290组(P<0. 01),低miR-1290...     

经首次根治性手术治疗口腔鳞状细胞癌患者的生存相关影响因素分析

目的分析口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者的总体生存率,以及影响生存率的临床病理因素。方法采集对首次接受根治性外科手术治疗的78例OSCC患者的临床病理及随访资料进行回顾性分析。对计数、计量资料进行描述性分析;采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线;采用COX比例风险回归模型进行单因素和多因素分析,分析患者的生存率及预后相关影响因素。结果最终纳入生存分析的患者共计68例,中位随访时间为63(6~87)个月,5年总体存活率为55.9%,随访期间因OSCC死亡患者的中位生存时间为20.5(6~52)个月。单因素分析表明,临床分期、原发灶大小、淋巴结转移、病理分化及复发转移是影响生存时间的暴露因素(P<0.05);多因素分析表明,病理分化、复发转移是影响生存时间的独立危险因素(P<0.05)。78例OSCC患者中合并发生食道鳞状细胞癌(ESCC)者有4例(5.1%)。结论根据肿瘤的临床分期(TNM分期)、原发灶大小、淋巴结转移、病理分化及复发转移可对患者的生存预后作出一定的预测,其中病理分化及复发转移是影响生存预后的独立危险因素。有吸烟饮酒史的OSCC患者应常规进行ESCC临床筛查。     

cT1-2N0M0口腔鳞状细胞癌隐匿性淋巴转移规律及相关因素分析

目的研究c T1-2N0M0口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者隐匿性淋巴转移(OLM)规律及相关因素,为此类患者颈部处理提供参考。方法回顾性分析中山大学附属口腔医院口腔颌面外科232例c T1-2N0M0OSCC病例资料。根据隐匿性淋巴结分布探讨其转移规律,Log-rank及Cox回归比例模型分析其对预后的影响,Kaplan-Meier法绘制OLM患者的生存曲线。单因素分析(卡方检验)OLM的相关因素,对有统计学意义者进行多因素Logistic回归分析。结果 232例患者中46例发生OLM,以Ⅱ区最多(42.9%),Ⅰ区次之(31.7%),其次是Ⅲ区(19.0%)。Cox多因素分析显示OLM是影响患者预后的重要因素,OLM患者5年总生存率(OS)、疾病特异性生存率(DSS)和无复发生存率(RFS)分别为63.0%、73.9%、56.5%,显著低于无OLM患者(χ2OS=45.0、χ2DSS=31.2、χ2RFS=58.6,P均<0.05)。单因素分析显示,肿瘤生长方式、浸润程度及肿瘤生长时间与OLM相关,多因素Logistic回归分析显示肿瘤浸润程度(Wald=13.0,P=0.001)及肿瘤生长时间(Wald=7.9,P=0.049)与OLM密切相关,其中侵犯肌层及生长时间1年以上为OLM的预测因素,其OR值分别为6.0和4.6。结论Ⅰ~Ⅲ区是隐匿性淋巴结的主要分布区域。对于c T1-2N0M0OSCC,肿瘤生长1年以上或侵犯肌层的患者更容易发生OLM,是选择性颈淋巴结清扫术的参考因素。     

基于铁死亡基因的口腔鳞癌预后模型开发和验证

目的:探究铁死亡相关基因(FRGs)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的预后价值并构建预后模型。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载OSCC患者的RNA-seq和临床数据,利用生物信息学方法筛选差异表达FRGs,从而构建预后模型并对其准确性进行验证,使用基因综合表达(GEO)数据库的独立队列做外部验证。结果:预后模型包括3个FRGs,与其他临床指标相比基于该模型的风险评分是一个更好的预后指标,可以作为OSCC的独立预后因素,并且模型的准确性在GEO的数据集中得到了验证。结论:本研究成功构建了一个FRGs模型,该模型可用于预测OSCC患者预后,为铁死亡在OSCC临床预后中的研究提供参考。     

吸烟饮酒对不同年龄OSCC患者预后的影响

目的 通过分析口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)患者的临床资料,讨论吸烟饮酒对不同年龄OSCC患者预后的影响。方法 收集2010年6月—2021年6月西安交通大学口腔医院颌面肿瘤外科收治的215例OSCC患者病例资料进行回顾性分析,将年龄≤45岁的患者定义为青年组患者,将年龄＞45岁的患者定义为中老年组,根据是否有吸烟饮酒史进一步分组,通过分析无瘤生存率、无远处转移生存率和总生存率对患者预后进行评估。结果 OSCC所有纳入病例中,青年组舌或其他位置恶性肿瘤发病率显著高于中老年组患者(P<0.05),且OSCC临床分期和分化程度与预后指标均显著相关(P<0.05);预后分析发现青年组患者吸烟饮酒史和临床分期与预后显著相关(P<0.05),中老年组患者单因素分析发现OSCC临床分期(P<0.05)与预后相关而多因素分析无相关性(P>0.05);生存分析发现青年组患者中吸烟饮酒是造成不良预后的危险因素,中老年组中无相关性。结论 吸烟饮酒史对青年患者预后有较大影响,临床上应对具有吸烟饮酒史的青年OSCC患者高度关注。     

UHRF1在口腔黏膜鳞癌中的表达及其对临床预后的价值研究

目的 分析泛素样含PHD和环指域1(ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1,UHRF1)在口腔黏膜鳞状细胞癌中的表达及其临床意义。方法 收集2008—2016年间,于中国科学技术大学附属第一医院口腔颌面外科接受手术治疗的原发性口腔鳞癌患者,利用免疫荧光染色评估患者的肿瘤组织、癌旁正常组织及侵袭前沿中的UHRF1表达,了解其表达差异性。以免疫反应强度分布指数(immunoreactivity intensity distribution index, IRIDI)值4分为界限,将患者分为UHRF1高表达组和低表达组,分析UHRF1表达水平与患者临床病理特征之间的关系,利用Kaplan-Meier法对肿瘤组织中UHRF1表达水平与患者生存率的相关性进行分析,运用Cox风险模型对影响口腔癌患者生存率的相关危险因素进行分析。结果 与肿瘤侵袭前沿、癌旁正常组织相比,UHRF1在口腔鳞癌肿瘤组织中高表达(P<0.01)。口腔鳞癌组织中UHRF1的表达水平与患者性别、肿瘤大小、浸润深度相关(P<0.05)。UHRF1低表达组和高...     

Detection of serum Cyfra 21-1 in patients with primary oral squamous cell carcinoma

Oral squamous cell carcinoma (OSCC) is the most common malignant tumour in the oral and maxillofacial region, and has a poor prognosis. Cyfra 21-1 is a useful tumour marker for squamous cell carcinoma, but the clinical value of Cyfra 21-1 in OSCC has not been confirmed. In order to investigate the diagnostic and prognostic value of serum Cyfra 21-1 in primary OSCC patients, the preoperative serum Cyfra 21-1 concentration of 100 OSCC patients and 56 healthy subjects was detected by enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). The cut-off value was calculated with a receiver operating characteristic (ROC) curve, and prognostic analysis was performed using the Kaplan-Meier method and Cox regression models. The preoperative serum Cyfra 21-1 concentration in OSCC patients (1.18+/-1.20 microg/L) was significantly higher (t=6.585, P<0.001) than that in healthy subjects (0.40+/-0.16 microg/L). With a cut-off value of 0.65 microg/L, the diagnostic sensitivity and specificity was 0.570 and 0.964, respectively. There was significant correlation with tumour recurrence and survival rate: the higher the serum Cyfra 21-1; the higher the tumour recurrence rate and lower the survival rate. Serum Cyfra 21-1 was an independent prognostic factor for OSCC using univariate and multivariate Cox models.     

Squamous cell carcinoma of the tongue and floor of the mouth: analysis of survival rate and independent prognostic factors in the Amazon region

Oral squamous cell carcinoma (OSCC) accounts for more than 95% of all malignant neoplasms in the oral cavity. Although several studies have shown the epidemiology of this cancer in Brazil, there do not seem to be any studies that describe the prognostic factors related to OSCC in the Amazon region. Therefore, the aim of this study was to determine the survival rate and prognostic significance of different factors in patients from this region affected by OSCC. Data from 85 patients with histologically confirmed squamous cell carcinoma of the tongue and floor of the mouth identified from the Ofir Loyola Hospital archives were collected and analyzed using univariate (log-rank test) and multivariate (Cox proportional hazard model) tests. The overall 5-year survival rate was found to be 27%. Univariate analysis showed that the 5-year survival rate was significantly higher for younger (≤ 45 y) female patients, patients with T1-2 tumors and clinically clear neck nodes (N0), patients with early stage cancers (AJCC stage I-II), and patients treated with surgical procedures. However, multivariate analysis showed that the 5-year survival rate was significantly higher only in the younger patients and those who underwent surgical treatment. The age of the patient at the moment of diagnosis and treatment with surgical procedures were the only independent prognostic factors that affected the 5-year survival rate of the patients in this region.     

E-cadherin和Vimentin在OSCC上皮-间质转化中的作用及表达

目的:探讨E-钙黏蛋白(E-cadherin)和波形蛋白(Vimentin)在口腔鳞状细胞癌(OSCC)上皮-间质转化中的作用及表达。方法:选取76例口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者和40例健康者作为对照组,利用RT-PCR检测OSCC和正常口腔黏膜组织中TGF-β1、E-cadherin和Vimentin表达。结果:OSCC患者组织中TGF-β1 mRNA和Vimentin mRNA相对表达量均高于对照组,而E-cadherin mRNA相对表达量低于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);TGF-β1、E-cadherin和Vimentin在OSCC组织中表达均与分化程度有关,分化程度越高,TGF-β1 mRNA和Vimentin mRNA相对表达量越高,而E-cadherin mRNA相对表达量则越低;Pearson相关分析显示,OSCC中TGF-β1 mRNA相对表达量与E-cadherin mRNA相对表达量呈负相关(r=-0.322,P=0.004),而与Vimentin mRNA相对表达量呈正相关(r=0.661,P=0.000)。结论:TGF-β1和Vimentin 在OSCC组织中表达增强,而E-cadherin则表达降低,提示EMT过程在OSCC发生及进展过程中发挥重要作用。     

Clinicopathological prognostic factors of oral tongue squamous cell carcinoma: a retrospective study of 202 cases

Although several histopathological parameters and grading systems have been described as predictive of the treatment response and outcome of oral squamous cell carcinoma (OSCC), none is universally accepted. A new scoring system, the histological risk model, was recently described to be a powerful predictive tool for recurrence and overall survival in OSCC. The aim of this study was to verify the predictive role of the histological risk model in a cohort of 202 patients at all stages of oral/mobile tongue squamous cell carcinoma (OTSCC). Demographic and clinical data were collected from the medical records and the tumours were evaluated using the histological risk model. Statistical analyses were performed using the χ² test, the Kaplan–Meier method, and the Cox regression model. The histological risk model showed no statistical correlation with demographic or clinical parameters and did not Predict the outcome of the OTSCC patients. However, multivariate regression analysis revealed a significant correlation of the clinical disease stage with the disease outcome. Despite major efforts to identify new predictive parameters and histological systems, clinical features are still the most reliable prognostic factors for patients with OTSCC.     

Tumor–stroma ratio is a crucial histological predictor of occult cervical lymph node metastasis and survival in early-stage (cT1/2N0) oral squamous cell carcinoma

Occult cervical lymph node metastasis is a significant prognostic factor in patients with early-stage (cT1/2N0) oral squamous cell carcinoma (OSCC). The aim of this study was to investigate the potential value of the tumor–stroma ratio (TSR) as a histological predictor of occult cervical metastasis and survival in early-stage OSCC. This retrospective study included 151 patients who underwent excision of the primary lesion and elective neck dissection from 2013 to 2017. The clinicopathological features of the tumor, risk factors associated with occult neck metastasis, and prognostic factors for overall survival (OS) and disease-free survival (DFS) were studied. A significant correlation of TSR (P = 0.009) was found with occult neck metastasis in the multivariate logistic regression model. Multivariate Cox proportional hazards regression analysis showed that the TSR (P = 0.002) and perineural invasion (P = 0.011) were associated with OS. Occult neck metastasis (P = 0.032) was associated with DFS. These findings indicate that assessment of the TSR might be useful in prognostication for early-stage OSCC patients. Moreover, the TSR is effective in allowing an accurate evaluation of the risk of occult neck metastasis, and this may be easily applicable in the routine pathological diagnosis and clinical decision-making for elective neck dissection.     

Claudin-7在口腔鳞状细胞癌中的表达和作用研究

目的 探究Claudin-7在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中的表达及作用。方法 通过免疫组化实验和蛋白质免疫印记实验检测OSCC中Claudin-7的表达情况,并分析Claudin-7和不同病理参数的关系。通过慢病毒转染Cal27和HN6细胞系上调Claudin-7表达,通过CCK-8和Transwell实验检测细胞增殖及迁移能力的变化;通过蛋白质免疫印迹实验和实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测Claudin-7对上皮间充质转化(EMT)指标的影响。结果 Claudin-7在OSCC中低表达(P<0.05),其表达水平和OSCC患者肿瘤大小、分化程度和淋巴结转移相关(P<0.05)。过表达Claudin-7可抑制Cal27和HN6细胞增殖和迁移,并且上调E-钙黏蛋白(E-cadherin)及下调N-钙黏蛋白(N-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)的蛋白和mRNA(P<0.05)。结论 Claudin-7在OSCC中低表达,上调其表达可通过影响上皮间充质转化抑制OSCC细胞的增殖和迁移。Claudin-7可作为OSCC治疗的一个新靶点。