耐碳青霉烯类大肠埃希菌耐药基因及同源性分析

目的 分析某院分离的耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CRECO)的耐药基因及同源性,为临床治疗及感控提供参考。方法 收集福建医科大学附属泉州第一医院2017-2021年分离的CRECO 36株,对成功复苏的15株CRECO进行耐药基因及同源性分析;用PCR扩增碳青霉烯酶(CPAs)基因(bla_KPC、bla_IMP、bla_NDM、bla_VIM、bla_OXA-48);多位点序列分型(MLST)用于检测其基因序列(ST型)。结果 (1)36株CRECO标本类型主要为尿液(55.56%)。(2)CRECO对哌拉西林、左氧氟沙星等8种抗菌药物耐药率达100.0%,对庆大霉素、氯霉素等7种抗菌药物耐药率>50.0%,对阿米卡星、多黏菌素耐药率分别为19.4%、2.8%,尚未发现对替加环素耐药。(3)通过PCR扩增15株复苏菌株的耐药基因,共获得14株阳性：2株bla_KPC-1,11株bla_NDM-5,1株bla_NDM-1;1株...     

耐碳青霉烯类大肠埃希菌对替加环素异质性耐药的机制

目的 研究耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CREC)对替加环素异质性耐药的分子机制,为临床治疗和合理应用抗生素提供依据.方法 收集2017年1月至2019年3月间多中心分离的CREC,用改良E-test法和菌群谱型分析微量滴定法(MPAP)初筛,群体谱分析法(PAP)确认CREC对替加环素的异质性耐药情况,并用荧光定量RT-q...     

骨科患者尿路感染耐碳青霉烯类大肠埃希菌的耐药性及危险因素研究

目的研究骨科患者尿路感染耐碳青霉烯类大肠埃希菌(CREco)的耐药性及其导致尿路感染的危险因素。方法通过回顾性调查方式,对某医院收治的尿液培养大肠埃希菌阳性骨科患者的临床资料进行分析,以了解患者尿路感染CREco的耐药性及其危险因素。结果从该医院住院尿路感染送检标本中检出CREco菌株48例。CREco菌株对大部分常用抗菌药物的耐药率高于大肠埃希菌碳青霉烯类敏感株(P <0. 05)。多因素分析结果显示,入住ICU、入住ICU> 1周、留置导尿时间> 14 d、近1个月使用碳青霉烯类抗菌药物、住院时间> 30 d等因素构成骨科患者CREco尿路感染的独立危险因素。结论骨科患者尿路感染CREco耐药情况严重,应采取有效的防控措施,降低CREco所致尿路感染的风险。     

临床来源碳青霉烯耐药大肠埃希菌药物敏感性及分子流行病学特征分析

目的 探讨临床分离的碳青霉烯耐药大肠埃希菌药物敏感性特征及分子流行病学特征,为院内感染控制及临床治疗提供基础数据。方法 收集某医院临床分离的21株对碳青霉烯类药物耐药的大肠埃希菌,采用琼脂稀释法测定菌株对11种临床常用药物的最低抑菌浓度（MIC）;Carba NP试验检测菌株产碳青霉烯酶情况;采用PCR扩增及序列比对检测耐药基因（包括blaNDM、blaKPC、blaIMP、blaVIM、blaOXA）携带状况;采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）和多位点序列分型（MLST）对菌株进行分子分型。结果 21株碳青霉烯耐药大肠埃希菌中,对哌拉西林、头孢吡肟、头孢曲松、头孢他啶等-内酰胺类药物和左氧氟沙星耐药率为100.00%;对甲氧苄啶-磺胺甲恶唑的耐药率也高达76.19%;对米诺环素、阿米卡星和磷霉素的耐药率相对较低,分别为23.81%、23.81%和19.05%。Carba NP试验阳性菌株17株,均携带blaNDM-1基因,其余4种基因检测均为阴性。MLST显示21株菌株共有9种ST型别,其中携带blaNDM-1基因的大肠埃希菌主要为ST167型和ST540型。PFGE显示来自泌尿外科的3株菌株电泳图谱完全相同,另外来自不同病房的2株菌株电泳图谱也完全相同,提示医院内存在同一克隆菌株传播的可能。结论 该医院碳青霉烯耐药大肠埃希菌基因型分布呈现多态性;对碳青霉烯类药物耐药的机制主要是携带blaNDM-1基因;携带该基因的大肠埃希菌对临床常用抗菌药物往往呈现多重耐药,给临床治疗带来了困难。加强对碳青霉烯耐药菌株基因型和耐药基因的检测,将对减缓或阻断耐药菌的传播具有重要意义。     

多重耐药大肠埃希菌的基因分型及耐药分析

目的探讨分离自该院患者临床标本的24株多重耐药大肠埃希菌的基因分型、耐药情况及在院内科室的分布情况,为临床合理使用抗菌药物提供依据。方法通过MIC法分析大肠埃希菌对抗菌药物的敏感性,采用肠杆菌科基因间重复性一致序列(ERIC)-聚合酶链反应(PCR)对筛选出多重耐药的大肠埃希菌进行基因分型。结果 24株多重耐药大肠埃希菌分为A型和B2型两个基因型,来源于呼吸科的为10株,泌尿外科6株,ICU 5株(B2型3株),血液肿瘤科3株(B2型1株)。药敏试验显示4株B2型大肠埃希菌对头孢西丁、头孢他啶、阿米卡星、替卡西林+克拉维酸等全部耐药。24株大肠埃希菌对阿莫西林、头孢噻吩、庆大霉素、替卡西林、哌拉西林的耐药率均达70%以上。结论 B2型大肠埃希菌表现为多重耐药性,致病性强,并且主要分布在ICU及血液肿瘤科中,应该根据患者感染不同基因型的大肠埃希菌来合理调整抗菌药物的使用。     

碳青霉烯耐药大肠埃希菌的基因组学特点分析

目的 分析碳青霉烯耐药大肠埃希菌（ＣＲＥＣ）的基因组流行病学特征，调查共携带 ｂｌａＮＤＭ和 ｂｌａＫＰＣ的大肠埃希菌在南京 鼓楼医院的流行情况，并分析该类细菌的播散特点。 方法 对 ２０１５ 年从南京 ６ 家医院收集的 １１ 株 ＣＲＥＣ 菌株，进行全基因 组测序组装后，分析耐药基因、毒力因子、多位点序列分型（ＭＬＳＴ）、血清型和 ＦｉｍＨ 型的分布并构建系统发育树。 对于从南京 鼓楼医院 ２０１３—２０１７ 年收集的 ＣＲＥＣ 菌，使用 ＰＣＲ 和 ＤＮＡ 测序法筛选共携带 ｂｌａＮＤＭ和 ｂｌａＫＰＣ的菌株，脉冲场凝胶电泳技术 （ＰＦＧＥ）进行遗传相关性分析；接合试验分析基因的可转移性。 结果 所有的 ＣＲＥＣ 都携带了至少 １ 种碳青霉烯酶编码基因， 其中，９ 株 ＣＲＥＣ 细菌携带 ｂｌａＮＤＭ?５，３ 株携带 ｂｌａＫＰＣ?２，２ 株携带 ｂｌａＮＤＭ?１，３ 株同时携带 ｂｌａＮＤＭ?５和 ｂｌａＫＰＣ?２。 ＭＬＳＴ 分析发现 ７ 种不 同的序列分型（ＳＴ），２ 株细菌为 ＳＴ４１０，其余的 ６ 种 ＳＴ 型依次为 ＳＴ３４８９、ＳＴ１５６、ＳＴ６８３、ＳＴ２９７、ＳＴ１６７ 和 ＳＴ３６１；其次，１１ 株细菌 中鉴定出 ６ 种不同的血清型和 ８ 种 Ｆｉｍ 型；１１ 株细菌的质粒图谱虽然呈多样性，但每株细菌都含有质粒复制子 ＩｎｃＸ３。 系统 发育分析表明，１１ 个 ＣＲＥＣ 分离株之间有很大的遗传多样性；ＰＦＧＥ 显示 ６ 株共携带 ｂｌａＮＤＭ和 ｂｌａＫＰＣ的分离株之间也存在较大 的遗传多样性。 接合试验表明 ｂｌａＮＤＭ可转移，但与 ｂｌａＫＰＣ基因不在同一质粒。 结论 ｂｌａＮＤＭ是 ＣＲＥＣ 中主要的碳青霉烯酶基 因，ｂｌａＮＤＭ?５是主要的 ｂｌａＮＤＭ基因，可能通过 ＩｎｃＸ３ 质粒水平传播。 ＭＬＳＴ、Ｆｉｍ 分型、血清分型和进化树发育表明 ＣＲＥＣ 呈遗传 多样性。     

大肠埃希菌耐消毒剂基因的检测分析

目的检测临床分离的65株大肠埃希菌耐消毒剂基因qacE-su l1的存在情况。方法采用聚合酶链反应(PCR)技术检测65株大肠埃希菌及1株ATCC 25922的qacE-su l1基因。结果65株大肠埃希菌的qacE-su l1基因的阳性率为58.46%。结论大肠埃希菌耐消毒剂的qacE-su l1基因携带率较高,可能是该菌引起院内感染的重要原因,应引起我国医院消毒界的重视。     

携带不同酶型基因耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌对常见抗耐药菌药物的敏感性观察

目的 了解宁波地区耐碳青霉烯肺炎克雷伯菌（CRKP）菌株携带碳青霉烯酶型基因分布,以及携带不同碳青霉烯酶型基因的CRKP对常见抗耐药菌药物的敏感性。方法 选择2019年1月—2021年12月宁波地区多家中心市医院临床非重复分离的CRKP共150株,采用PCR法检测碳青霉烯酶基因携带情况;采用肉汤稀释法检测常用抗CRKP药物替加环素、多黏菌素B、头孢他啶/阿维巴坦对分离CRKP的敏感性;采用K-B法检测CRKP对8种报道中使用的联合药物的敏感性。结果 宁波地区CRKP菌株主要携带KPC-2型耐药基因,其次是NDM-1型耐药基因,对替加环素、多黏菌素B敏感率均较高;头孢他啶/阿维巴坦对携带A类酶基因的CRKP的作用力较强,对携带B类、D类酶基因的CRKP作用弱;磷霉素、阿米卡星和氯霉素的抑菌圈直径较大,可以作为治疗CRKP感染的联合药物,氨曲南和阿米卡星可用于治疗携带B类酶基因的CRKP感染。结论 部分抗菌药物对携带不同酶型基因菌株敏感性不同。     

临床分离耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌同源性及耐药基因携带研究

目的研究临床分离的耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)同源性及其耐药基因携带率,为有效防控CRKP感染提供理论依据。方法采用基因分析(PCR)技术,对某医院临床分离的CRKP菌株进行耐药基因检测与分析。结果共分析临床分离的CRKP 47株,对该医院临床常用20种抗菌药中的16种耐药率达到90%以上。该医院分离的CRKP主要来源于患者痰液,占分离总菌株数的68%,患者主要来自重症监护病房。47株CRKP中,有41株检出blaKPC-2,33株检出blaCTX-M-1-like,6株检出blaCTX-M-9-like,3株菌检出blaNDM-1。47株CRKP同源性分析显示,A型6株、B型11株及C型19株。结论该医院临床分离的47株CRKP携带多种耐药基因,以blaKPC-2和blaCTX-M-1-like为主,共分布在3种同源菌型,必须加强CRKP监测和抗菌药物管理。     

产β-内酰胺酶大肠埃希菌的临床分布及耐药性分析

目的 分析医院2012年1月～2014年12月分离的产β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌临床分布与耐药性,为临床合理使用抗菌药物提供依据。方法 住院患者中分离1 587株大肠埃希菌进行回顾性分析,采用珠海迪尔公司微生物鉴定仪进行鉴定和药敏试验,用表型确证实验检测ESBLs。结果 1 587株大肠埃希菌中检出产ESBLs菌株为901株(56.8%),主要分布科室为泌尿外科、内分泌科、呼吸科; 标本来源主要分布为尿液609株(47.3%),痰液411株(31.9%),血液83株(6.5%); 产ESBLs菌株大肠埃希菌对亚胺培南耐药率为0; 对青霉素类、头孢菌素类的耐药性>90.0%,对左旋氧氟沙星、环丙沙星耐药性>70.0%; 对阿莫西林/克拉维酸、替卡西林/克拉维酸、哌拉西林/他唑巴坦、阿米卡星耐药率较低<7.7%。结论 近3年医院临床分离的大肠埃希菌耐药性呈逐年增高趋势,产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)大肠埃希菌检出率逐年升高,表现为多耐药,因此,加强耐药性检测和监测,对指导合理使用抗菌药物非常重要。     

我院大肠埃希菌耐药性分析

目的了解我院2011年大肠埃希菌对常用抗菌药物的耐药现状及标本分布,为临床治疗提供依据。方法对2011年1月～12月临床科室送培标本分离出的266株大肠埃希菌的耐药情况进行回顾性分析。结果我院分离的266株大肠埃希菌对各类常用抗菌药物均表现为严重耐药,其中环丙沙星的耐药率最高,达83.2%,庆大霉素、头孢唑林钠、头孢呋辛钠和头孢曲松钠耐药率达70%～80%,左氧氟沙星、头孢噻肟钠、氨苄西林/舒巴坦钠的耐药率在60%～70%,仅头孢西丁钠的耐药率低于50%。结论我院分离的大肠埃希菌耐药严重,且呈多重耐药,故临床必须重视合理使用抗菌药物,以减少或延缓多重耐药菌株的产生。     

耐碳青霉烯铜绿假单胞菌耐药基因筛查及对多粘菌素异质性耐药的研究

[目的]分析耐碳青霉烯铜绿假单胞菌(CRPA)耐药基因特征及对多粘菌素异质性的耐药情况.[方法]收集76株CRPA,PCR检测耐药相关基因,检测菌株对多粘菌素的敏感性.选15株行群体谱分析多粘菌素异质性,应用联合用药实验筛选用药方案.[结果]76株CRPA,碳青霉烯酶相关基因IMP阳性15株(19.74％),VIM阳性...     

尿路感染细菌分布及大肠埃希菌耐药性分析

目的分析尿路感染的病原菌分布及主要致病菌大肠埃希菌的耐药性,为临床合理使用抗菌药物提供科学依据。方法统计2007年本院尿液标本中分离的各种病原菌,并对大肠埃希菌药敏试验结果进行分析。结果尿路感染病原菌以大肠埃希菌为主,占40．31％,其次为真菌和肠球菌。大肠埃希菌对氨苄西林、头孢噻吩、萘啶酸、替卡西林的耐药率均在90％以上,对头孢西丁、呋喃妥因的耐药率小于10％,对亚胺培南则全部敏感。结论尿路感染主要致病菌为大肠埃希菌,府及时检测病原菌及其耐药情况,合理使用抗菌药物。     

葡萄球菌感染的临床分布和耐药性监测及治疗对策

目的 研究葡萄球菌的临床分布和耐药性,指导临床合理应用抗生素。方法 应用ATB自动细菌鉴定仪及药敏分析仪对临床标本中分离的327株葡萄球菌进行鉴定和药敏试验,同时进行MRS检测,并结合临床资料进行分析。结果共分离出葡萄球菌327株,其中金葡菌138株(42.2％),居第一位;表皮葡萄球菌101株(30.9％)位居第二;其它如溶血葡萄球菌、人葡萄球菌、沃氏葡萄球菌等均占有一定比例。327株葡萄球菌中共检出耐苯唑西林葡萄球菌(MRS)230株,占70.3％,苯唑西林敏感葡萄球菌(MSS)97株。MSS对青霉素和红霉素的耐药率高,分别为80_8％-82.2％和44.4％-51.9％,对其它抗菌素均敏感。MRS对万古霉素、替考拉宁、呋喃妥因和利福平等敏感性高,对其余多种抗菌素耐药。葡萄球菌主要分离自呼吸道、泌尿道、感染伤口和血液等标本。科室分布依次是ICU、肿瘤科和外科等。结论 临床分离菌中的葡萄球菌日益增多,对抗菌素的耐药率增高,本院MRS检出率较高,应重视MRS的检测和药敏试验。同时,临床医师应根据药敏结果,合理有效地选用抗菌素。     

多重耐药大肠埃希菌菌株氯霉素耐药相关基因研究

目的 了解多重耐药大肠埃希菌(ECO)对氯霉素的耐药机制.方法 采用PCR法检测20株多重耐药ECO菌氯霉素耐药基因(catB,cmlA).结果 catB基因阳性3株(阳性率15%),cmlA基因阳性7株(阳性率35%).一株catB基因PCR产物经DNA测序并翻译为氨基酸序列与已在美国国立生物信息中心[NCBI]登录的catB基因序列比对,结果为与大肠埃希菌CATB3[登录号:ABP35557]序列98%(88/89)相同,能判断为新亚型.结论 该组多重耐药ECO菌对氯霉素耐药与携带catB,cmlA基因相关.     

PmrD Is Required for Modifications to Escherichia coli Endotoxin That Promote Antimicrobial Resistance

In Salmonella enterica, PmrD is a connector protein that links the two-component systems PhoP-PhoQ and PmrA-PmrB. While Escherichia coli encodes a PmrD homolog, it is thought to be incapable of connecting PhoPQ and PmrAB in this organism due to functional divergence from the S. enterica protein. However, our laboratory previously observed that low concentrations of Mg²⁺, a PhoPQ-activating signal, leads to the induction of PmrAB-dependent lipid A modifications in wild-type E. coli (C. M. Herrera, J. V. Hankins, and M. S. Trent, Mol Microbiol 76:1444–1460, 2010, http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2958.2010.07150.x). These modifications include phosphoethanolamine (pEtN) and 4-amino-4-deoxy-l-arabinose (l-Ara4N), which promote bacterial resistance to cationic antimicrobial peptides (CAMPs) when affixed to lipid A. Here, we demonstrate that pmrD is required for modification of the lipid A domain of E. coli lipopolysaccharide (LPS) under low-Mg²⁺ growth conditions. Further, RNA sequencing shows that E. coli pmrD influences the expression of pmrA and its downstream targets, including genes coding for the modification enzymes that transfer pEtN and l-Ara4N to the lipid A molecule. In line with these findings, a pmrD mutant is dramatically impaired in survival compared with the wild-type strain when exposed to the CAMP polymyxin B. Notably, we also reveal the presence of an unknown factor or system capable of activating pmrD to promote lipid A modification in the absence of the PhoPQ system. These results illuminate a more complex network of protein interactions surrounding activation of PhoPQ and PmrAB in E. coli than previously understood.     

Distribution and Relationships of Antimicrobial Resistance Determinants among Extended-Spectrum-Cephalosporin-Resistant or Carbapenem-Resistant Escherichia coli Isolates from Rivers and Sewage Treatment Plants in India

To determine the distribution and relationship of antimicrobial resistance determinants among extended-spectrum-cephalosporin (ESC)-resistant or carbapenem-resistant Escherichia coli isolates from the aquatic environment in India, water samples were collected from rivers or sewage treatment plants in five Indian states. A total of 446 E. coli isolates were randomly obtained. Resistance to ESC and/or carbapenem was observed in 169 (37.9%) E. coli isolates, which were further analyzed. These isolates showed resistance to numerous antimicrobials; more than half of the isolates exhibited resistance to eight or more antimicrobials. The bla_NDM gene was detected in 14/21 carbapenem-resistant E. coli isolates: bla_NDM-1 in 2 isolates, bla_NDM-5 in 7 isolates, and bla_NDM-7 in 5 isolates. The bla_CTX-M gene was detected in 112 isolates (66.3%): bla_CTX-M-15 in 108 isolates and bla_CTX-M-55 in 4 isolates. We extracted 49 plasmids from selected isolates, and their whole-genome sequences were determined. Fifty resistance genes were detected, and 11 different combinations of replicon types were observed among the 49 plasmids. The network analysis results suggested that the plasmids sharing replicon types tended to form a community, which is based on the predicted gene similarity among the plasmids. Four communities each containing from 4 to 17 plasmids were observed. Three of the four communities contained plasmids detected in different Indian states, suggesting that the interstate dissemination of ancestor plasmids has already occurred. Comparison of the DNA sequences of the bla_NDM-positive plasmids detected in this study with known sequences of related plasmids suggested that various mutation events facilitated the evolution of the plasmids and that plasmids with similar genetic backgrounds have widely disseminated in India.