酵母双杂交技术筛选NECL1胞内区的结合蛋白

目的 筛选人源膜表面黏附分子NECL1蛋白胞内区相互作用蛋白。 方法 构建含人NECL1蛋白胞内区氨基酸编码序列的诱饵质粒pGBKT7-NECL1C,对人胎脑cDNA文库进行酵母双杂交筛选。用GST pull down实验进行体外蛋白相互作用的验证。结果 酵母双杂交阳性克隆测序后显示共存在9段不同序列（存在重复克隆）。比对氨基酸序列得到5个可能相互作用蛋白。通过GST pull down 实验验证了其中两个蛋白与NECL1胞内区的相互作用。结论 应用酵母双杂交系统,获得了一些候选的NECL1胞内区相互作用蛋白。     

应用酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织SHIP2的相互作用蛋白

目的通过酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织标准均一化cDNA文库,寻找与含Src同源蛋白2肌醇-5-磷酸酶2(SHIP2)相互作用的蛋白。方法利用酵母双杂交系统,以SHIP2的P1(SH2+5-Ptase)和P2(PRD+SAM)段作为诱饵蛋白,筛选出人胃黏膜上皮组织均一化cDNA文库中与SHIP2相互作用的蛋白,并通过免疫共沉淀法进行验证。结果挑选出39个阳性克隆,经测序比对分析,回复性杂交,免疫共沉淀试验验证,最终确定一个与SHIP2相互作用的蛋白抗增殖蛋白1(prohibitin1/PHB)。结论酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织SHIP2的相互作用蛋白PHB。     

酵母双杂交系统筛选CLN8P相互作用蛋白

目的：应用酵母双杂交系统筛选CLN8P相互作用蛋白质,通过对相互作用蛋白质的筛选及研究,探讨CLN8的功能,为NCL8和NCLs疾病群的发病机制研究提供线索,并为疾病的蛋白质相互作用网络提供资料。方法 应用酵母双杂交技术,以pLexA-CLN8为诱饵质粒筛选人胎脑cDNA文库,得到Leu+LacZ+阳性克隆,进一步进行验证,并对验证后的阳性克隆的外源性片断进行测序及同源性分析。结果 从人胎脑cDNA文库中筛选得到60个Leu+LacZ+阳性克隆;将获得的具有外源性片段的文库质粒与诱饵质粒一对一重新转入酵母体内对相互作用进行验证,共获得阳性克隆22个;对验证后阳性克隆测序并进行同源性分析,共获得不同的候选基因序列10个。结论 应用酵母双杂交系统,共筛选得到10个不同的基因,其编码蛋白与CLN8P有相互作用,可能与NCLs 发病机制相关。     

NF-κB p50亚基同源结构域相互作用多肽的筛选

目的：应用酵母双杂交技术筛选获得与核因子κB（NF-κB）p50亚基同源结构域（RHD）相互作用的多肽。方法：应用酵母双杂交技术，以NF—κBp 50 RHD为诱饵，筛选16肽cDNA文库，寻找与其相互作用的多肽，应用β-gal试验、酵母交配试验及一对-酵母回复性杂交等方法筛除假阳性克隆，确定阳性克隆。结果：经酵母双杂交及反复的排查，共获得8个阳性克隆。通过GenBank进行检索，未发现与之相匹配的蛋白序列。结论：获得8个与NF-κB p50 RHD相互作用的新型多肽，多肽的功能需进一步验证。     

酵母双杂交技术筛选并回转验证在胞内与PML-C结构域相互作用的蛋白

目的 利用酵母双杂交技术在活细胞内筛选并回转验证与PML-C结构域相互作用的蛋白质.方法 通过诱饵质粒pGBKT7-PML-C,利用酵母双杂交系统从白血病细胞cDNA文库中筛选与PML-C结构域相互作用的蛋白质.结果 利用酵母双杂交技术筛选到43个能与PML-C结构域相互作用的克隆;经进一步的归类与酵母回转试验得到9个阳性克隆.结论 在细胞内PML-C结构域能与多种蛋白质有相互作用.中性粒细胞弹性蛋白酶(neutrophil elastase,NE)介导的急性早幼粒细胞白血病的发生可能与这些相互作用所致的生物学功能改变有关.     

应用酵母双杂交技术筛选与RANK蛋白新基序IVVY相互作用的蛋白

目的: 应用酵母双杂交技术筛选小鼠巨噬细胞中与核因子κB受体激活因子(RANK)蛋白上新基序IVVY相互作用的蛋白,以探寻RANKL/RANK系统中介导破骨细胞形成的RANK下游新信号转导蛋白。方法: 应用GAL4酵母双杂交系统3,构建仅包含编码新基序⁵³⁵IVVY⁵³⁸ 的一小段RANK的cDNA片段为诱饵质粒pGBKT7-IVVY,并与巨噬细胞cDNA文库质粒pGADT7-library共转化AH109酵母,筛选与RANK蛋白新基序IVVY相互作用的蛋白,通过回复性杂交实验验证其可靠性,并对阳性克隆进行测序和基因同源性分析。结果: 筛选出4个可能与IVVY基序有相互作用的蛋白,包括Ring1和YY1结合蛋白(RYBP)、ATP结合盒、E2F转录因子和热休克蛋白8,其中表达RYBP的阳性克隆出现频率高、速度快。结论: 应用酵母双杂交技术成功地筛选出4个可能与IVVY基序相互作用的候选蛋白,其中RYBP可能性最大。     

应用酵母双杂交技术筛选干扰素β结合蛋白的研究

目的 应用酵母双杂交技术筛选干扰素β（IFNp）结合蛋白。方法 用多聚酶链反应（PCR）技术扩增IFNB基因，连接酵母表达载体pGBKT7构建诱饵质粒，转化酵母细胞AH109，与含人肝细胞cDNA文库质粒的酵母细胞Y187进行配合，在营养缺陷型培养基（SD／-Trp-Leu-His-Ade）和X-α-半乳糖（X-α-gal列）上进行双重筛选阳性克隆，提取酵母质粒后转化大肠埃希菌（DH5α）并经氨苄西林抗性筛选，提取单克隆菌落质粒，进行酶切鉴定及序列测定，并进行生物信息学分析。结果 应用酵母双杂交技术筛选出阳性克隆29个，经生物信息学分析，排除读码框架不正确者，最后得到19个克隆基因，编码14种已知蛋白和一种未知功能蛋白。初步发现铁蛋白与IFNB具有结合作用。结论 应用酵母双杂交技术筛选出多种与IFNB具有结合作用的蛋白。     

人gp130结合分子与TLE1分子通过同源的Q结构域相互作用

目的：确定人gp130结合分子（GAM）与transducin lide enhancer of split 1(TLE1)分子间是否存在相互作用及相互作用的结构基础，以深入研究这两种分子的功能。方法：扩增编码GAM与TLE1分子不同结构域的cDNA，构建含有这些不同结构域的酵母双杂交载体，通过酵母双杂交系统分析和免疫共沉淀试验，研究这两种分子间的相互作用。结果：DNA序列测定证实成功构建了含GAM与TLE1分子不同结构域的酵母双杂交载体，酵母双杂交分析表明GAM与TLE1分子通过氨基端的Q结构域相互结合，免疫共沉淀试验证实了这一发现。结论：证实GAM与TLE1分子通过氨基端的Q结构域相互结合。     

酵母双杂交体系(Yeast Two-Hybrid System):一种研究蛋白一蛋白相互作用的强有力方法

双杂交体系是研究蛋白一蛋白相互作用的一种有效方法。将相互作用的两个蛋白分别与转录因子的DNA结合结构域和转录激活结构域融合成两个杂交体，在酵母细胞内，通过报告基因的表达情况反映两蛋白之间的相互作用。其主要特点是操作简单，可以研究蛋白间弱相互作用，通过筛库可直接得到与目的蛋白相互作用蛋白的DNA序列。用双杂交体系筛库时最值得注意的是假阳性问题。     

甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究

目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A／Guangdong／7028／2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2重组载体,利用Y2HGold酵母双杂交系统,从人类通用cDNA文库中筛选与其相互作用的蛋白。结果成功构建含诱饵蛋白基因的pGBKT7-PB1-F2重组载体,转化酵母自激活和毒性实验显示为阴性：酵母双杂交实验显示Y2HGold和Y187酵母的结合率为5．22％,符合实验要求;经筛选和验证后,得到3个与截短型PB1-F2蛋白有相互作用的阳性克隆,分别为钾／钠ATP酶B1亚基、热休克蛋白40和白介素-2受体1亚基。结论初步推断截短型H3N2流感病毒PB1-F2蛋白可能影响流感病毒在宿主细胞中的复制功能和凋亡调控。     

应用酵母双杂交系统发现hALR与Na,K-ATPase间的相互作用

目的:采用酵母双杂交系统寻找与人肝再生增强因子(hALR)相互作用的蛋白质, 探讨ALR的作用机理。方法: 构建hALR诱饵质粒pGBKT7-hALR, 醋酸锂法转化AH109酵母菌, 转化菌在SD/-Trp-His培养基上培养及滤纸法β一半乳糖苷酶活性检测排除自身激活作用后, 与人肝cDNA文库质粒预转化的酵母菌Y187进行接合试验, 接合产物在QDO培养基上筛选, 阳性克隆进一步在含X-α-Gal的QDO平板上鉴定, X-α-Gal活性呈阳性的克隆, 进行PCR及酶切鉴定排除完全相同克隆, 进一步进行回交试验排除假阳性, 对阳性克隆进行序列测定和生物信息学分析。结果:得到数个阳性克隆, 序列分析结果表明其中1个阳性克隆是Na⁺, K⁺-ATPaseβ亚基部分基因, 长669bp, 3'端非编码区224bp, 编码区长445bp, 编码Na⁺, K⁺-ATPaseβ亚基C端的147个氨基酸残基。结论:应用酵母双杂交系统筛选出Na⁺, K⁺-ATPase与hALR具有相互作用。     

酵母双杂交技术筛选乙型肝炎病毒DNA聚合酶TP结合蛋白的研究

目的　筛选与乙型肝炎病毒 (HBV)DNA聚合酶-N末端蛋白 (TP)相互结合的肝细胞蛋白 ,进一步探讨TP的生物学功能。方法　用聚合酶链反应 (PCR)技术扩增TP片段 ,连接入酵母表达载体pGBKT7中构建诱饵质粒 ,转化酵母细胞AH 10 9并在其内表达 ,然后与转化了人肝cDNA文库质粒pACT2的酵母细胞Y187进行配合 ,在营养缺陷型培养基和X-α-半乳糖苷酶 (X-α-gel)上进行双重筛选阳性菌落 ,DNA序列测定并进行生物信息学分析。结果　成功获得了 4 7个与TP特异性结合的阳性克隆 ,包括人类固醇调节元件结合蛋白 1(SREBP1)、RNA聚合酶Ⅱ亚单位 (hsRPB7)、血浆铜蓝蛋白(CP)等 2 1种已知功能蛋白质基因和 19个假设蛋白基因。结论　HBVDNA聚合酶-TP可以与某些已知和未知功能蛋白相互结合 ,提示其具有较广泛的生物学功能     

人CASK/LIN-2下游信号分子的初步研究

目的：揭示人类新基因ＣＡＳＫ／ＬＩＮ－２的生物学功能,运用酵母要效ＬｅｘＡ系统寻找与ｈＣＡＳＫ的鸟苷酸激酶结构域（ｇｕａｎｙｌａｔｅ ｋｉｎａｓｅ ｄｏｍａｉｎ－ｌｉｋｅ,ＧＫ）相互作用的蛋白信号分子。方法：将ｈＣＡＳＫ的ＧＫＤＮＡ片段亚克隆ｐＬｅｘＡ融合表达质粒,得到的重组质粒ｐＬｅｘＡ－ＧＫ转化酵母ＥＧＹ４８。经证实该重组质粒无转录活性并能进入胞核,结合ＬｅｘＡ操纵基因。将人胎脑文库质粒转化ＥＧＹ４８（ｐＬｅｘＡ－ＧＫ,ｐ８０ｐ－ｌａｃＺ）,在Ｇａｌ／Ｒａｆ ｈｉｓ－ｔｒｐ－ｕｒａ－ｌｅｕ－和Ｇａｌ／Ｒａｆ ｈｉｓ－ｔｒｐ－ｕｒａ－Ｘ－ｇａｌ条件下筛选ｌｅｕ＋和ｌａｃＺ＋酵母克隆,提取上述阳性酵母质粒转化大肠杆菌ＫＣ８,分离出文库质粒;再将这些文库质粒转化ＥＧＹ４８（ｐＬｅｘＡ－ＧＫ,ｐ８０ｐ－ｌａｃＺ）,     

应用酵母双杂交系统筛选E2F1相互作用蛋白

目的:应用酵母双杂交系统从人正常胃黏膜细胞的cDNA文库中筛选E2F1转录因子的相互作用蛋白。方法:以pGBKT7-E2F1为诱饵质粒筛选人正常胃黏膜细胞的cDNA文库,得到阳性克隆,反复验证,并对验证后的阳性克隆进行测序及同源性分析。结果:从人正常胃黏膜细胞的cDNA文库中筛选得到20个阳性克隆,经测序和同源性分析,筛除假阳性克隆,最终得到18个不同的候选基因序列。其中,17个为可知基因序列,它们分别是:组织蛋白酶B、SIVA1、干扰素调节因子7、鸟苷酸激酶1、ATP酶抑制因子1、核糖体蛋白SA、纤溶酶原激活物抑制剂1 mRNA结合蛋白、精氨琥珀酸合酶1、卵泡抑素类似物3、金属硫蛋白2A、内质网钙结合蛋白1、WNT1可诱导信号通路蛋白2、CDC42 效应蛋白1、可溶性半乳糖凝集素结合蛋白1、中胚层发育候选2、外切酶体成分7和含EGF腓骨蛋白样胞外基质蛋白 1,尚有一未知基因片段。结论:应用酵母双杂交系统成功筛选出18种E2F1相互作用蛋白,为进一步探讨E2F1影响胃癌细胞生物学行为的分子机制奠定了基础。     

Protein-protein interactions between native Ro52 and immunoglobulin G heavy chain.

Using a yeast two-hybrid system to search for proteins interacting with Ro52 autoantigen, we identified a novel protein-protein interaction. Two different cDNA clones, which interacted with Ro52 in the yeast two-hybrid system, were identified and isolated from a human B-cell library. Surprisingly, both clones encoded the heavy chain of human IgG1. The expression of both HIS3 and beta-galactosidase reporter genes in yeast suggested that the interaction between Ro52 and IgG occurred in vivo. In vitro studies utilizing recombinant Ro52 and purified immunoglobulins indicated that the interaction was immunoglobulin class and subclass specific. Ro52 interacted with IgG1 and IgG4, but not with IgG2, IgG3, IgA or IgM. Ro52 could also precipitate IgG directly from serum. The identified cDNA clones did not include the variable region of IgG, which suggested a non-classical interaction independent of antibody specificity. We further mapped the domain of Ro52 responsible for this interaction to the C-terminus rfp-like region. In conclusion, our data support an unusual interaction between native Ro52 and IgG. The potential biological significance of this unusual protein-protein interaction is discussed.     

人肝再生增强因子相互作用蛋白基因的克隆

目的：寻找与人肝再生增强因子(hALR)相互作用的蛋白质．探讨其在肝再生过程中的分子生物学机制。方法：采用酵母双杂交系统，以hALR作诱饵蛋白筛选预转化的人肝cDNA文库，对阳性克隆进行生物信息学分析。结果：筛选出6组与hALR具有特异性相互作用的蛋白基因，分别是：血清白蛋白、金属硫蛋白、Na／K-ATPase、硒蛋白P和两个未知功能基因的cDNA序列。结论：初步克隆了与hALR相互作用蛋白基因，为以后深入研究这些蛋白质与hALR之间的相互作用，进一步揭示hALR的作用机制奠定了基础。     

A human cDNA expression library in yeast enriched for open reading frames

We developed a high-throughput technique for the generation of cDNA libraries in the yeast Saccharomyces cerevisiae which enables the selection of cloned cDNA inserts containing open reading frames (ORFs). For direct screening of random-primed cDNA libraries, we have constructed a yeast shuttle/expression vector, the so-called ORF vector pYEXTSH3, which allows the enriched growth of protein expression clones. The selection system is based on the HIS3 marker gene fused to the C terminus of the cDNA insert. The cDNAs cloned in-frame result in histidine prototrophic yeast cells growing on minimal medium, whereas clones bearing the vector without insert or out-of-frame inserts should not grow on this medium. A randomly primed cDNA library from human fetal brain tissue was cloned in this novel vector, and using robot technology the selected clones were arrayed in microtiter plates and were analyzed by sequencing and for protein expression. In the constructed cDNA expression library, about 60% of clones bear an insert in the correct reading frame. In comparison to unselected libraries it was possible to increase the clones with inserts in the correct reading frame more than fourfold, from 14% to 60%. With the expression system described here, we could avoid time-consuming and costly techniques for identification of clones expressing protein by using antibody screening on high-density filters and subsequently rearraying the selected clones in a new "daughter" library. The advantage of this ORF vector is that, in a one-step screening procedure, it allows the generation of expression libraries enriched for clones with correct reading frames as sources of recombinant proteins.