藏族人群原发性高血压易感基因全基因组关联分析

目的通过全基因组关联分析(GWAS)发现并鉴定与藏族高血压关联的遗传变异。方法结合高通量芯片分析和高效DNA混合池策略的SNP-Ma P方法,对藏族原发性高血压(EH)患者与藏族正常对照进行了全基因扫描。筛选出有显著差异的位点后,用直接测序和PCR-RFLP的方法,进行群体验证,鉴定出各个基因型和相应等位基因的频率。结果在全基因组的遗传标记中,5个标签位点的等位基因频率在患者组与对照组之间存在显著差异(P9.2×10-8)。用直接测序和PCR-RFLP的方法进行群体验证,发现rs17136827和rs1866525两个位点的基因型和等位基因频率分布在两组间均无差异;rs9865108、rs12541835和rs4547758的基因型频率和等位基因频率在两组间的差异显著,携带C等位基因个体具有较高的EH发病风险。结论证实affymetrix Human SNP芯片和高效混合池策略结合的SNP-Ma P能够有效地大范围分析人类EH易感基因。rs9865108、rs12541835和rs4547758与藏族EH易感相关。     

原发性高血压易感基因的定位分析研究进展

连锁分析是寻找原发性高血压（ESH）易感基因的一种较为有效的方法。近年来研究显示：血管紧张素原、脂蛋白脂酶基因等可能是ESH的易感位点，但对胰岛素及其受体、SA等基因本文未获得相似的信息。目前，大多数研究均以候选基因为线索，选取少量遗传标记作同胞对分析，应用高密度连锁分析和基因组扫描技术进行研究尚未见报道。     

原发性高血压易感基因的定位分析研究进展

连锁分析是寻找原发性高血压（ＥＳＨ）易感基因的一种较为有效的方法。近年来研究显示：血管紧张素原、脂蛋白脂酶基因等可能是ＥＳＨ的易感位点，但对胰岛素及其受体、ＳＡ等基因本文未获得相似的信息。目前，大多数研究均以候选基因为线索，选取少量遗传标记作同胞对分析，应用高密度连锁分析和基因组扫描技术进行研究尚未见报道。     

慢性乙型肝炎易感基因的全基因组关联研究进展

慢性乙型肝炎(chronic hepatitis B,CHB)是一种由遗传、病毒与环境因素共同导致的复杂疾病,具有高度的遗传异质性。自2009年首个CHB全基因组关联研究(genome-wide association studies,GWAS)报道以来,许多GWAS相继开展。文章首先对目前发表的CHB易感基因的GWAS结果进行汇总,发现染色体6p21.32区域中CHB易感位点最多。然而目前GWAS主要基于常见变异-常见疾病原则设计,只涉及了频率≥5%的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),没有涵盖人类基因组中重要的低频变异。同时GWAS鉴定到的最显著关联的SNP大多位于内含子、基因间区等非编码区域内,导致功能学研究无法开展。乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)功能性受体钠离子-牛磺胆酸共转运蛋白的发现,加快了HBV感染的机制研究。同时第二代测序技术的发展为CHB易感基因的发现提供了契机。因此今后的研究应将GWAS的发现与功能学研究相结合,以逐步揭示HBV感染的遗传机制。     

强直性脊柱炎家系全基因组扫描基因定位的荟萃分析

目的 综合分析强直性脊柱炎（ankylosing spondylitis,AS）家系的全基因组扫描基因定位的结果,探讨进一步研究和确定AS的遗传易感位点的思路和方法.方法 采用基因组寻证荟萃分析（genome search meta analysis,GSMA）法,对符合该方法分析的4个AS家系的全基因组扫描结果包括参数连锁分析和非参数连锁分析的结果进行分析.根据连锁分析的最大值被赋值并按降序排列,从而计算出总的等级分值（Rsumrnk）.根据每个研究的受累个体数进行加权GSMA对结果进行修正.本研究共有479个家系,1151例AS患者.总的等级分析概率（Psumrnk）和有序的等级分析概率（Pord）＜0.05被认为可能含有易感区域;GSMA Psumrnk＜0.000417时,被认为在全基因组连锁中有显著意义.结果 GSMA显示10组结果的Psumrnk和Pord均小于0.05,表明这些组内最可能含有AS的易感基因位点,这些组分别是6.2、16.3、6.1、3.3、6.3、16.4、10.5、17.1、2.5、2.9.GSMA生成的具有显著意义的全基因组连锁分析的证据位于6p22.3-p21.1（BIN6.2,Psumrnk＜0.000417）,包含HLA位点.结论 本GSMA研究进一步证实了HLA位点是AS的主要易感区域,并初步提供非HLA区域包括16 q,3 p,10 q,2 p,17 p和2 q证据.     

强直性脊柱炎家系全基因组扫描基因定位的荟萃分析

目的 综合分析强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)家系的全基因组扫描基因定位的结果,探讨进一步研究和确定AS的遗传易感位点的思路和方法.方法 采用基因组寻证荟萃分析(genome search meta analysis,GSMA)法,对符合该方法分析的4个AS家系的全基因组扫描结果包括参数连锁分析和非参数连锁分析的结果进行分析.根据连锁分析的最大值被赋值并按降序排列,从而计算出总的等级分值(Rsumrnk).根据每个研究的受累个体数进行加权GSMA对结果进行修正.本研究共有479个家系,1151例AS患者.总的等级分析概率(Psumrnk)和有序的等级分析概率(Pord)＜0.05被认为可能含有易感区域;GSMA Psumrnk＜0.000417时,被认为在全基因组连锁中有显著意义.结果 GSMA显示10组结果的Psumrnk和Pord均小于0.05,表明这些组内最可能含有AS的易感基因位点,这些组分别是6.2、16.3、6.1、3.3、6.3、16.4、10.5、17.1、2.5、2.9.GSMA生成的具有显著意义的全基因组连锁分析的证据位于6p22.3-p21.1(BIN6.2,Psumrnk＜0.000417),包含HLA位点.结论 本GSMA研究进一步证实了HLA位点是AS的主要易感区域,并初步提供非HLA区域包括16 q,3 p,10 q,2 p,17 p和2 q证据.     

鼻咽癌易感基因与HLA-DP位点连锁分析

目的通过对鼻咽癌家系的DPA1-DPB1单倍型分析,揭示鼻咽癌易感基因与HLA-DP位点是否存在连锁关系。方法用序列特异性寡核苷酸探针斑点杂交方法,对17个湖南籍汉族鼻咽癌家系样本进行DPA1、DPB1基因分型,根据孟德尔分离律分析获得每一家系受检成员的DPA1-DPB1单倍型。运用受累同胞共享单倍型方法进行统计分析。结果17个家系的19对受累同胞的DPA1-DPB1单倍型中,共享2、1和0条相同单倍型的同胞对数分别为7对、11对和1对。将此观察值与期望值比较,用χ     

全基因组扫描定位一个先天性全白内障家系的致病基因

目的定位一个先天性全白内障家系的致病基因。方法收集一个先天性全白内障家系中10个成员的外周血样本,提取基因组DNA。应用ABI-MD10试剂盒中的常染色体382个微卫星位点,对此家系进行全基因组扫描。MLINK软件进行两点连锁分析。结果发现在D13S263位点处提示存在连锁(最大LOD=1.20,重组率θ=0),进一步检测该位点附近若干其它的微卫星标记,经连锁分析其致病基因被定位到D13S175和D13S156之间的大约53.9厘摩(cM)区域上。结论该家系致病基因位点被定位到13号染色体的13q12.11-q22.1之间的大约53.9cM区域上。此研究为探讨遗传性全白内障的发病机制提供了有价值的信息,并为该家系今后开展产前诊断奠定了基础。     

糖尿病易感基因定位策略

糖尿病易感基因定位策略项坤三糖尿病有明显遗传倾向并存在显著遗传异质性。除为数不多的糖尿病患者是由单基因突变所致外，大部分胰岛素依赖型糖尿病及胰岛素非依赖型糖尿病（ＩＤＤＭ及ＮＩＤＤＭ）患者是多基因及环境因子共同参与及／或相互作用引起的多因子病，近年称...     

抽动障碍的易感基因定位研究进展

抽动障碍是发病于儿童时期的一种慢性神经精神疾病.研究表明遗传因素在抽动障碍的发病中具有重要作用,并且该病是受多基因影响的复杂疾病.近年来抽动障碍的易感基因定位取得了一定的进展,选择鉴定了许多候选基因并对这些基因与抽动障碍的关系进行了探讨.这些研究为抽动障碍发病机制理解和以后的研究工作提供了参考.作者对近年来抽动障碍易感基因定位的研究进展作了综述.     

DNA混合池技术全基因组关联研究筛查主动脉夹层易感基因的研究

目的筛选主动脉夹层发病机制相关的遗传易感基因。方法选取主动脉夹层患者为病例组（150例）,按照性别、年龄、是否吸烟、合并高血压、糖尿病情况与病例组匹配的原则入选排除主动脉夹层、重大心血管疾病及肿瘤的志愿者为对照组（250例）,均从外周血提取基因组DNA,采用DNA混合池技术为基础的Illumina Human660W—Quad芯片扫描,筛选主动脉夹层发病相关的遗传易感基因。结果对照组女性数量明显多于病例组（P〈0．01）;在年龄、吸烟、高血压、糖尿病人数方面差异均无统计学意义（P〉0．05）。根据芯片扫描结果,挑选silhouettewidth计算值大于0．7,最小等位基因频率（MAF）大于0．05,且SNPs位于已知名称基因上的前5个SNPs位点。结果发现,遗传变异位点SNP rs2970873（位于PPARGClA基因）、SNP rs12678080（位于SGCZ基因）、SNP rs489526（位于UNCl3C基因）、SNP rs6928665（位于TRAM2基因）和SNP rs17837003（位于ACCNl基因上）可能与主动脉夹层的发病机制有关。结论SNPsrs2970873、rs12678080、rs489526、rs6928665和rsl7837003可能与主动脉夹层发病机制相关。     

多基因遗传病易感基因的遗传定位

很多常见的慢性疾病具有遗传决定因素,这些疾病受多对基因及环境因素的共同影响,又称多基因遗传病。本文对于多基因遗传病的易感基因定位过程中所涉及的方法进行了综述     

多基因遗传病易感基因的遗传定位

很多常见的慢性疾病具有遗传决定因素,这些疾病受多对基因及环境因素的共同影响,又称多基因遗传病。本对于多基因遗传病的易感基因定位过程中所涉及的方法进行了综述。     

新疆地区原发性高血压疾病相关遗传基因分析及与易感相关性研究

目的分析新疆地区原发性高血压疾病相关遗传基因,并探讨其与原发性高血压易感的相关性。方法本文收集原发性高血压患者338例(维吾尔族175例,汉族163例)与健康人339例(各民族与高血压患者相匹配,分别为165例和174例)的血样,进行基因组DNA提取及质检,采用Massarray结合Taqman探针技术,对原发性高血压AGTR1、GNB3、ADD1、eNOS、EDN2、ADRB1六个基因位点进行基因分型,并通过统计分析确定基因综合评分风险模型,进行原发性高血压易感性评估。结果六个基因上的变异位点均得到成功检测,均符合Hardy-Weinberg平衡定律。六个变异位点基因型及等位基因频率在两组分布均无统计学差异(P0.05);表明六个基因分别单独分析与原发性高血压易感性没有明显相关性。同时与血压正常者相比,原发性高血压患者基因综合评分是明显升高的(P0.05),说明六个基因综合评分与原发性高血压易感性相关。维吾尔族与汉族的原发性高血压(EH)基因综合评分并无显著差异,维吾尔族与汉族的正常血压(NT)基因综合评分亦无显著差异,但是同一民族下的原发性高血压基因综合评分大于正常血压的基因综合评分,这一结果表明民族因素不是影响新疆地区原发性高血压遗传易感性的因素。结论原发性高血压相关单个基因单个变异位点与易感性无明显相关性,而综合分析六个相关基因可以预示原发性高血压易感性。同时不同民族高血压患病评分无显著差异表明在本研究条件下民族差异与原发性高血压遗传易感性没有明显相关性,本研究为原发性高血压的进一步研究提供了基础和依据。     

哮喘易感基因与染色体11q13的连锁分析

为研究过敏性哮喘与基因的关系，对３个家系中４０位成员进行调查。符合特异性体质（Ａｔｏｐｙ）诊断者２７人，占６７．５％，患哮喘１５人，占３７．５％。从系谱分析，表型ＩｇＥ反应性和过敏原皮试阳性均呈ＡＤ遗传。以ＩｇＥ反应性与多态Ｄ１１Ｓ５３３作遗传连锁分析，结果在重组率为０．０５时，Ｌｏｄｓ值＞１．０。不排出控制黄种人ＩｇＥ反应的基因可能位于１１ｑ１３．３～１３．４附近。     

脑瘫易感基因研究现状

脑性瘫痪(Cerebral palsy,CP)简称脑瘫,是自受孕开始至婴儿期的非进行性脑损伤和发育缺陷所导致的综合征,主要表现为运动发育障碍及姿势异常。伴发智力低下、癫痫、行为异常、感知觉障碍。已被证实大量的脑瘫高危因素包括:早产、宫内感染、宫内发育障碍及围生期窒息等,通过     

基因组错配扫描技术在疾病相关基因定位中的应用

基因组错配扫描技术在疾病相关基因定位中的应用林毅（中国协和医科大学,北京１００７３０）遗传图谱学与定位克隆技术的发展,使研究者在揭示符合孟德尔方式遗传的单基因病的遗传基因方面取得重大进展。与此同时,人类遗传学的焦点已集中在了不严格依照孟德尔方式遗传的...     

基因组扫描——遗传病相关基因定位的有力工具

基因组扫描——遗传病相关基因定位的有力工具况少青张宇舟陈竺遗传病相关基因定位和分离是人类基因组计划及当代医学遗传学研究的重点。在人基因组３×１０９碱基对中大约包含了５～１０万个基因，迄今为止，约有４０００个基因被定位，其中４００个为致病基因［１］。早...     

系统性红斑狼疮抗核抗体易感基因染色体定位

目的 :确定新西兰小鼠自身抗染色质抗体、抗DNA抗体、抗组蛋白抗体的遗传易感基因染色体定位。方法 :建立新西兰黑色品系 (NZB)和新西兰白色品系 (NZW)子代F1的回交小鼠模型 (NZB×NZW)×NZB和 (NZB×NZW)×NZW ,采用覆盖小鼠 19条染色体的微卫星遗传标记及数量性状位点 (QTL)分析进行基因定位。结果 :确定了自身抗染色质抗体产生的易感基因 ,位于NZW小鼠第 9染色体中段 30厘摩临近 (Lods=3 0 1) ;另外自身抗染色质抗体、抗DNA抗体、抗组蛋白抗体产生的共同易感基因 ,位于NZB及NZW小鼠第 17染色体 ,即H 2复合体及TNF α的基因区域 (Lods值 >4 )。结论 :(NZB×NZW)F1小鼠自身抗核抗体的产生受多基因调控 ,候选易感基因不仅来自于NZB ,也来自于NZW。