Relationship between tagSNPs and haplotype of TNF-A gene and gastric cancer in Uygur and Han ethnic groups in Xinjiang

目的:探讨新疆维吾尔族(维族)和汉族胃癌患者肿瘤坏死因子-α基因(TNF-A)rs 1800629和rs361525位点多态性及其单体型与胃癌易感性的关系.方法:采用Snapshot技术分析322例胃癌患者(其中维族93例,汉族229例)和作为对照的487例非胃癌患者(其中维族231例,汉族256例)TNF-A基因rs1800629和rs361525位点基因型的分布;利用SHEsis软件分析其构成的单体型在病例组和对照组中的分布频率,比较基因型和单体型在病例组和对照组间的分布差异.结果:在维族人群中,TNF-A基因rs1800629和rs361525位点不论是等位基因位点、基因型还是单体型在病例组和对照组中的分布频率差异均无统计学意义(P＞0.05).在汉族人群中,TNF-A基因rs361525位点AA+GA基因型在病例组和对照组之间的分布差异有统计学意义(X2=4.56,P=0.03),即携带A等位基因者发生胃癌的风险增加(OR=2.41,95％ CI:1.06～5.49);rs1800629位点基因型与胃癌之间未发现明显关联;A-A单体型在病例组及对照组分布频率分别为0.92％和0.86％,差异有统计学意义(X2=7.03,P=0.01).结论:TNF-A基因单核苷酸多态性与汉族人群胃癌发病风险相关,这种相关性具有民族差异.     

新疆维吾尔族晚期非小细胞肺癌GSTP1、ABCC2基因多态性与含铂方案化疗敏感性的研究

目的 探讨谷胱甘肽S转移酶P1（GSTP1）和三磷酸腺苷结合盒转运体C2（ABCC2）基因多态性与新疆维吾尔族晚期非小细胞肺癌（NSCLC）患者化疗疗效的关系。方法 采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR-RFLP）技术检测112例以含铂方案化疗的新疆维吾尔族晚期NSCLC患者外周血DNA中GSTP1 rs1695和ABCC2 rs717620、rs2273697、rs3740066基因多态性;112例患者中采用紫杉醇联合顺铂方案32例,吉西他滨联合顺铂方案29例,培美曲塞联合顺铂方案51例,化疗2周期后评价疗效,并分析各基因型与化疗敏感性的关系。结果 112例维吾尔族NSCLC患者GSTP1基因rs1695和ABCC2 rs717620、rs2273697、rs3740066位点基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。112例获PR 32例、SD 61例、PD 19例,化疗敏感率为28.6%。年龄、性别、病理类型、分期、ECOG评分及化疗方案与化疗敏感性均无关。GSTP1 rs1695和ABCC2 rs717620基因多态性与铂类药物化疗敏感性有关,而ABCC2 rs2273697、rs3740066基因多态性与化疗敏感性无关（P>0.05）。GSTP1 rs1695与ABCC2 rs717620基因联合多态性分析显示,同时携带GSTP1 rs1695 AA和ABCC2 rs717620 CT+TT基因型患者化疗敏感率达50.0%,与携带GSTP1 rs1695 AA和ABCC2 rs717620 CC基因型（16.7%）相比,差异有统计学意义（P<0.05）。结论 GSTP1 rs1695和ABCC2 rs717620多态性可用于预测新疆维吾尔族晚期NSCLC患者对含铂方案化疗的疗效。     

TNF-A基因多态性及其单体型与新疆维、汉民族胃癌的关系

目的:探讨新疆维吾尔族(维族)和汉族胃癌患者肿瘤坏死因子-α基因(TNF-A)rs1800629和rs361525位点多态性及其单体型与胃癌易感性的关系。方法:采用Snapshot技术分析322例胃癌患者(其中维族93例,汉族229例)和作为对照的487例非胃癌患者(其中维族231例,汉族256例)TNF-A基因rs1800629和rs361525位点基因型的分布;利用SHEsis软件分析其构成的单体型在病例组和对照组中的分布频率,比较基因型和单体型在病例组和对照组间的分布差异。结果:在维族人群中,TNF-A基因rs1800629和rs361.525位点不论是等位基因位点、基因型还是单体型在病例组和对照组中的分布频率差异均无统计学意义(P>0.05)。在汉族人群中,TNF-A基因rs361525位点AA+GA基因型在病例组和对照组之间的分布差异有统计学意义(χ=4.56,P=0.03),即携带A等位基因者发生胃癌的风险增加(OR=2.41,95%CI:1.06～5.49);rs1800629位点基因型与胃癌之间未发现明显关联;A-A单体型在病例组及对照组分布频率分别为0.92%和0.86%,差异有统计学意义(χ~2=7.03,P=0.01)。结论:TNF-A基因单核苷酸多态性与汉族人群胃癌发病风险相关,这种相关性具有民族差异。     

CYP1B1基因rs1056836位点多态性与新疆维吾尔族乳腺癌易感性的研究

目的 探讨CYP1B1基因rs1056836单核苷酸位点多态性与新疆维吾尔族乳腺癌易感性的关系。方法 应用聚合酶链反应-限制片段长度多态性（PCR-RFLP）检测125例维吾尔族女性乳腺癌患者（乳腺癌组）和160例体检的健康维吾尔族女性（对照组）CYP1B1基因rs1056836位点多态性,分析该位点多态性在不同群体中的分布情况。采用问卷调查和病例查询的方法收集乳腺癌相关危险因素的资料,用Logistic回归模型分析rs1056836位点多态性与乳腺癌患病风险的相对危险度。结果 CYP1B1基因rs1056836位点中存在CC、CG、GG 3种基因型,其在乳腺癌组和健康女性对照组中的分布频率分别为432％、512％、5.6％和60.6％、34.4％、5.0％,两组基因型分布的差异有统计学意义（P＜0.05）;乳腺癌组C、G等位基因的分布频率分别为68.8％、31.2％,对照组分别为77.8％、22.2％,差异有统计学意义（P＜0.05）。Logistic回归模型分析显示携带CC基因型维吾尔族女性的乳腺癌发病风险降低。乳腺癌相关危险因素的分层分析显示初潮早、有肿瘤家族病史、未绝经妇女中携带CG、GG基因型者乳腺癌患病风险明显增加。结论 CYP1B1基因rs1056836位点多态性与维吾尔族乳腺癌的发生有关,其突变基因型增加了维吾尔族女性乳腺癌的患病风险。     

hCHK2基因tagSNPs位点及单体型与新疆哈、汉族食管癌关系的研究

目的：探讨新疆哈萨克族、汉族食管癌患者hCHK2基因rs2278022、rs2602431和rs29700773个tagSNPs位点及其单体型与食管癌易感性的关系。方法：以聚合酶链式反应-连接酶检测反应（PCR-LDR）技术,分析239例食管癌患者（其中哈族132例,汉族107例）和作为对照的513例非食管癌患者（其中哈族309例,汉族204例）hCHK2基因rs2278022、rs2602431和rs29700773个tagSNPs位点基因型的分布;利用SHEsis软件分析其构成的单体型在病例组和对照组中的分布频率,比较基因型和单体型在病例组和对照组间的分布差异。结果：在哈族和汉族人群中,hCHK2基因rs2278022、rs2602431和rs2970077位点基因型和等位基因的频率分布在病例组和对照组间的差异无统计学意义（P均〉0.05）,其3个tagSNPs位点及其单体型,在哈族和汉族的病例组与对照组中的频率分布的差异均无统计学意义（P均〉0.05）。结论：hCHK2基因rs2278022、rs2602431和rs2970077等3个tagSNPs位点及其单体型与哈萨克族和汉族食管癌易感性无关。     

TNF-α 基因308 位点单核苷酸多态性与原发性肺癌相关性研究*

目的:肿瘤坏死因子- α（tumor necrosis factor- α ,TNF-α）基因启动子单核苷酸多态性与某些炎性疾病、肿瘤的发生有关。本研究就TNF-α - 308G/A 位点基因多态性与中国人群原发性肺癌易感性进行探讨。方法:应用高通量TaqMan-MGB 探针技术对TNF-α - 308G/A 位点,即rs 1800629 位点进行基因分型,分析比较447 例健康对照者和250 例原发性肺癌患者的基因类型。采用SPSS18.0 软件对数据资料进行统计分析。结果:TNF-α - 308G/A 位点GG基因型在病例组和对照组中的频率分别为73.2%和90.8% 。A/G 基因型在病例组和对照组中频率分别为26.8% 和8.7% 。基因型A/G+AA频率分别为26.8% 和9.2% ,该位点多态性在病例组和对照组中的分布频率差异具有统计学意义（P < 0.05）。 此外,A/G 基因型在男性、吸烟、小细胞肺癌或非小细胞肺癌患者相对于GG型均为危险因素,但在女性中无统计学意义（P > 0.05）。 结论:TNF-α - 308G/A 位点基因多态性与中国原发性肺癌发病易感性显著相关。      

端粒酶逆转录酶基因多态性与胃癌遗传易感性的研究

目的探讨端粒酶逆转录酶（TERT）基因rs2736098 和 rs2736100位点单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性和幽门螺杆菌（Hp）感染的关系。方法 采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应（PCR RFLP）检测297例胃癌患者（病例组）和306例非萎缩性胃炎患者（对照组）中TERT基因rs2736098和rs2736100位点的多态性;采用病理学诊断和13C尿素酶呼气试验检测Hp感染。结果 rs2736098位点各基因型频率在病例组和对照组中的分布差异无统计学意义（P＞0.05）,病例组rs2736100位点仅GG基因型频率显著高于对照组（27.0％ vs. 16.4％,P＜0.05）。Logistic回归分析显示,携带GG基因型个体罹患胃癌的风险是携带TT基因型个体的1.371倍（OR=1.371,95％CI：1.063～1.775,P=0.005）;在Hp阴性者中,GG型罹患胃癌的风险较TT型增加（OR=1.421,95％CI：0.988～2.042,P=0.046）;而在Hp阳性者中,未发现rs2736100位点的基因型与罹患胃癌的风险有关。结论 TERT基因rs2736100位点基因多态性可能与胃癌遗传易感性相关,而与Hp感染无关。     

CHRNA3基因多态性与肺癌易感相关性分析

目的：探讨尼古丁乙酰胆碱受体基因CHRNA3多态性与肺癌易感性的关系。方法：采用以医院患者为基础的病例一对照研究方法,对2008-01-01-2011-06-30在江苏省肿瘤医院就诊原发性肺癌患者600例（病例组）和健康体检人员600名（正常对照组）,以TaqMan-MGB探针技术检测CHRNA3上的SNPs位点rs3743073（T〉G）基因型,比较组间基因型分布频率的差异。结果：肺癌患者CHRNA3rs3743073（T〉G）的TT、TG和GG基因型频率分别为20．7％、43．0％和36．3％,正常对照人群分别为31．0％、48．5％和20．5％,差异均有统计学意义,P〈0．05。肺癌患者CHRNA3rs3743073（T〉G）的A、G等位基因频率分别为42．2％和57．8％,正常对照人群分别为53．3％和44．8％,差异均有统计学意义,P〈0．05。与TT基因型患者相比,TG和GG基因型患者发生肺癌的风险分别增加1．132倍（95％CI：1．004～1．277,P=0．048）和1．663倍（95％CI：1．406～1．968,P=0．001）;rs3743073G（TG和GG）患者发生肺癌的风险增加1．290倍（95％CI：1．150～1．447,P=0．001）。年龄〉60岁、男性、吸烟的患者中,rs3743073G变异基因型的患者发生肺癌的危险性显著增加,P=0．05。结论：CHRNA3基因rs3743073G变异基因型发生肺癌的危险明显增加,尤其在年龄〉60岁、男性和吸烟患者中更为显著。     

肿瘤坏死因子基因多态性与湖北汉族人群非霍奇金淋巴瘤发病的相关性

目的：研究我国湖北汉族人群TNF的基因多态性与非霍奇金淋巴瘤（NHL）发病的关系。方法：采用病例对照研究和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测160例NHL患者和214例健康对照者中TNFα-308、LTα-252基因型分布。结果：NHL组与健康对照组TNFα-308基因型、等位基因频率总体分布差异无统计学意义（P均〉0.05）;NHL组与健康对照组相比LTα-252 AA基因型频率相比明显减低,差异有统计学意义（19%比29%,χ2=4.513,P=0.034,OR=1.697,95%CI：1.039-2.773）,而LTα-252 GG、AG基因型及等位基因频率总体分布差异无统计学意义（P均〉0.05）;TNFα-308、LTα-252基因型与NHL患者的病理类型、临床分期及进展无明显相关性（P均〉0.05）。结论：LTα-252位点基因型与湖北汉族人群NHL发病有相关性。     

潮汕地区汉族人群MTHFR基因rs1801131多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的：研究5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因rs1801131位点多态性与潮汕地区汉族人群非综合征型唇腭裂（NSCL/P）的相关性。方法：收集潮汕地区汉族人群NSCL/P患儿357名、患儿父亲199名、患儿母亲198名及健康对照者354名的外周血,提取基因组DNA,应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测MTHFR基因rs1801131位点的基因多态性。采用卡方检验对病例组与正常对照组基因型、等位基因频率进行比较分析。在核心家庭中进行等位基因的传递不平衡检验。家系分析由FBAT2.0.2软件完成。结果：病例组及正常对照组MTHFR基因rs1801131位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。病例-对照研究发现rs1801131位点基因型多态性和等位基因多态性与NSCL/P的发病风险无显著相关关系（P > 0.05）,核心家庭等位基因A或C均不存在传递不平衡（P > 0.05）,家系分析显示该人群NSCL/P的发病与rs1801131位点等位基因的分布频率无显著相关关系（P > 0.05）。结论：MTHFR基因rs1801131位点多态性与潮汕地区汉族人群NSCL/P发病无显著相关。     

谷胱甘肽转移酶P1基因多态性与儿童ALL HD-MTX不良反应的关系

  目的  研究谷胱甘肽转移酶P1(glutathione S-transferase pi, GSTP1)基因多态性与儿童急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia, ALL)使用大剂量甲氨蝶呤(high-dose methotrexate, HD-MTX)化疗后不良反应的关系。  方法  应用巢式PCR (Nest PCR)、变性梯度凝胶电泳(denaturing gel gradient electrophoresis, DGGE)和DNA直接测序技术检测51例儿童ALL GSTP1基因型和等位基因分布频率, 按美国国立癌症研究所的常规毒性判定标准(NCICTCAE)对HD-MTX不良反应进行统计分析。  结果  筛查出3个GSTP1 SNPs位点即rs1695(A313G)、rs1138272(G439T)和rs4891(T555C)。rs1695/rs4891多态性位点包括32例(62.7%)野生型、16例(31.4%)杂合型和3例(5.9%)纯合型, rs1138272多态性位点仅包括1例(2.0%)杂合型和1例(2.0%)纯合型。3个SNPs位点等位基因频率分别为21.6%、2.9%和21.6%。GSTP1 rs1695/rs4891多态性位点中AG+GG/TC+CC基因型与外周血血红蛋白减少有关(OR=0.25, 95% CI=0.06~1.00, P=0.049), GSTP1 rs1695/rs4891多态性位点中AG+GG/TC+CC基因型与高危组患儿胃肠毒性发生有关(OR=0.125, 95% CI=0.02~0.78, P=0.026)。  结论  GSTP1 rs1695/rs4891多态性与ALL儿童HD-MTX化疗后外周血血红蛋白降低以及中高危组ALL儿童发生胃肠毒性有关。      

新疆地区汉族、维吾尔族晚期非小细胞肺癌患者血清中CEA表达的差异性研究

目的：通过对晚期非小细胞肺癌患者血清中CEA的监测,探讨在维吾尔族、汉族晚期非小细胞肺癌患者之间其表达是否有差异性。方法：新疆维吾尔自治区人民医院2005年5月-2010年5月确诊的晚期非小细胞肺癌患者101例,其中维吾尔族50例,汉族51例,采用全自动免疫化学发光仪检测血清CEA的水平,与我院体检中心体检合格的汉族及维吾尔族健康者各50例进行比较。结果：汉族、维吾尔族健康组CEA与同民族晚期非小细胞肺癌组CEA结果比较差异均有统计学意义（P〈0.05）;汉族Ⅲ期、Ⅳ期非小细胞肺癌组CEA与维吾尔族同期别非小细胞肺癌组CEA结果比较差异均无统计学意义（P〉0.05）;汉族与维吾尔族晚期肺鳞癌组、肺非鳞癌组CEA结果比较差异均无统计学意义（P〉0.05）。结论：CEA在汉族、维吾尔族健康人群与同民族晚期非小细胞肺癌患者血清中的表达有差异;CEA在汉族与维吾尔族Ⅲ期、Ⅳ期非小细胞肺癌及肺鳞癌、肺非鳞癌患者血清中的表达无差异。     

DICER基因多态性与食管癌遗传易感性研究

目的：研究中国汉族人DICER基因rs3742330A〉G多态性与食管癌易感性的关系。方法：本研究以病例一对照研究为基础,收集2008—10—01—20091130镇江第一人民医院和江苏大学附属人民医院380例食管癌患者和380例非肿瘤患者,采用质谱（MALDI—TOFMS）技术对DICER基因多态性位点rs3742330A〉G进行分型,计算不同基因型与食管癌的发生风险及95％CI。结果：DICER多态性位点rs3742330A〉G基因型AA、AG和GG在食管癌组频率分别为33．9％、51．6％和14．5％,在非肿瘤对照组的频率分别为38．1％、48．4％和13．5％。Logistic回归分析结果表明,相对于AA基因型的个体,AG基因型与食管癌的发病风险无明显相关,OR=1．19,95％CI=0．87～1．62;与AA＋AG基因型相比较,GG基因型与食管癌的发病风险无明显相关,OR=1．09,95％CI=0．72～1．65。结论：DICER基因rs3742330A〉G多态性可能不是食管癌发生的危险因素。     

MCP-1基因多态性与食管癌易感性的关系

目的：研究 MCP-1-2518位点基因多态性与济南地区汉族食管鳞状细胞癌（esophageal squamous cell carcinoma,ESCC）易感性的关系。方法应用聚合酶链反应（PCR）和 DNA 直接测序方法对202例 ESCC 患者和265例健康对照进行 MCP-1-2518位点基因多态性检测。结果ESCC 患者 MCP-1-2518位点的多态性基因型和等位基因分布与健康对照组差异无统计学意义,P ＞0．05。根据吸烟状况的分层分析发现,与 GG 基因型相比,携带 AA 基因型可显著增加吸烟者的 ESCC 发病风险,经性别和年龄校正的 OR 值为3．064,95％CI 为1．397～6．718;而在非吸烟的患者和健康对照组之间差异无统计学意义,P ＞0．05。结论MCP-1-2518位点的多态性基因型和等位基因不单独影响 ESCC 的发生和发展, MCP-1-2518位点的 AA 基因型可增加吸烟人群 ESCC 易感性。     

rs9904341多态性与肺癌易感性和铂类药物化疗敏感性的相关性

[目的]探讨survivin基因启动子区rs9904341位点多态性与肺癌发生风险和晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者铂类药物化疗疗效的关系。[方法]通过聚合酶链反应—限制性酶切片断多态性方法(PCR-RFLP)检测289例健康对照组和289例肺癌患者的rs9904341多态性的基因型;其中130例晚期NSCLC仅接受铂类药物化疗,分析经2个周期化疗后的疗效及基因型与铂类药物化疗疗效和生存期的关系。[结果]基因型CC、CG、GG在肺癌组的分布频率分别为29.07%、47.05%、23.87%,在对照组的分布频率分别为20.42%、51.9%、27.68%,两组无显著性差异(P=0.053)。肺癌组中C等位基因和CC基因型的分布均显著高于对照组(P<0.05)。rs9904341多态性与晚期NSCLC患者铂类药物化疗有效率无显著相关性,但与临床受益率相关,GG基因型携带者的临床受益率是CC基因型者的2.06倍(95%CI:0.71～5.97,P=0.184)。对289例肺癌患者生存分析显示,CC基因型肺癌患者较CG+GG基因型预后差(95%CI:1.11～2.6,P=0.015)。[结论]rs9904341多态性与肺癌的发病风险、预后及晚期NSCLC患者铂类药物化疗临床受益率相关。     

Genotypes of glutathione transferase M1 and P1 and their significance for lung DNA adduct levels and cancer risk

The A-G polymorphism at codon 104 in the glutathione S-transferase P1 (GSTP1) gene was examined in 138 male lung cancer patients and 297 healthy controls. The patients had significantly higher frequency of the GG genotype (15.9%) and a lower frequency of AA (38.4%) than the controls (9.1% and 51.5%, respectively). The level of hydrophobic DNA- adducts were determined in lung tissue from 70 current smokers. Patients with the GG genotype had a significantly higher adduct level than patients with AA (15.5 +/- 10.2 vs 7.9 +/- 5.1 per 10(8) nucleotides, P = 0.006). We also analyzed the deletion polymorphism in the GSTM1 gene in 135 male patients and 342 controls. The patients were stratified according to histology, smoking dose, age, adduct level and mutational types found in the tumors (Ki-ras and p53 genes). The results consistently indicated that the GSTM1 null genotype was associated with a slightly increased lung cancer risk. When the combined GST M1 and P1 genotypes were examined, patients with the combination null and AG or GG had significantly higher adduct levels than all other genotype combinations (P = 0.011). The distribution of combined genotypes was also significantly different in cases and controls, mainly due to increased frequency of the combination GSTM1 null and GSTP1 AG or GG among patients.      

An association between glutathione S-transferase P1 gene polymorphism and younger age at onset of lung carcinoma

BACKGROUND: Among the genes that encode the glutathione S-transferase (GST) superfamily of Phase 2 metabolizing enzymes, GSTP1 has the highest expression in the lung. The polymorphic GSTP1 gene encodes glutathione S-transferase pi, which is an enzyme that detoxifies cigarette carcinogens, such as benzo-[a]-pyrene. The variant GSTP1 GG genotype is associated with lower enzymatic activity and higher DNA adduct levels in human lymphocytes compared with the AA genotype. METHODS: The authors evaluated the association of GSTP1 genotypes with lung cancer in 1921 cases and 1343 controls of Caucasian descent by using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism techniques. The results were analyzed with multiple logistic regression adjusting for age, gender, smoking status, and pack-years. To investigate specifically the subset of younger lung cancer patients and controls, the effect of age (either as a dichotomous or continuous variable in separate models) was analyzed as a modifying factor of the association between the GSTP1 polymorphism and lung cancer. RESULTS: The GSTP1 GG genotype was not associated with an overall increased risk of lung cancer (adjusted odds ratio, 1.02; 95% confidence interval [95% CI], 0.78-1.34) compared with the GSTP1 AA genotype. In both models that evaluated the gene-age interaction, an overall statistically significant interaction (P < .01) was observed between age and the GG genotype. However, for the model that included age as a dichotomous variable, the odds ratio of lung cancer risk with the GG genotype compared with the AA among individuals age 相似文献