呼吸科病房嗜麦芽窄食单胞菌的分子流行病学调查

目的 了解广州呼吸疾病研究所嗜麦芽窄食单胞菌分子流行病学与临床危险因素的关系.方法 回顾分析2008年3～4月呼吸科20株临床分离嗜麦芽窄食单胞菌的药敏结果.ERIC-PCR分析菌株的来源特征.分析患者的临床危险冈素包括基础疾病,抗生素治疗情况,机械通气史等.结果 20株嗜麦芽窄食单胞菌体外对亚胺培南、头孢噻肟、头孢吡肟、头孢曲松、氨曲南等100%耐药;对环丙沙星、阿米卡星、复方磺胺甲噁唑和米诺环素等的敏感性分别为65%、65%、85%和95%;ERIC-PCR显示20株嗜麦芽窄食单胞菌由17种不同克隆构成,药敏谱与基因型之间无显著相关性;患者临床资料显示其普遍具有易感性.结论 20株嗜麦芽窄食单胞菌分子流行病学调查显示其基因型多态性,未发现克隆株的传播;在严格的感染控制措施下,嗜麦芽窄食单胞菌小易出现克隆传播,降低临床危险因素对控制嗜麦芽窄食单胞菌发生至关重要.     

重症监护室嗜麦芽窄食单胞菌的分子流行病学研究

目的 了解重症监护室（ICU）中嗜麦芽窄食单胞菌的流行状况及来源。方法 （1）回顾1998～1999年呼吸科病房、外科ICU（SICU）内该菌的药敏结果。（2）收集1999年6月～2000年2月呼吸科ICU（RICU）和SICU该菌的临床分离株,用肠杆菌科基因间重复一致序列为引物的聚合酶链反应（ERIC-PCR）方法确定菌株之间的同源性。结果 （1）药敏结果显示其多重耐药现象严重。（2）ERIC-PCR基因型与药敏谱之间无显著相关性。（3）RICU内此菌显示多种亚型,而SICU的菌株显示A、B两种亚型。结论 嗜麦芽窄食单胞菌多重耐药性严重,治疗困难;在该菌分子流行病学研究中,ERIC-PCR有助于该菌的同源性分析,是一种简单、快速、有效、可靠的方法。     

嗜麦芽窄食单胞菌的耐药机制

嗜麦芽窄食单胞菌是院内具有易感因素患严重感染的重要致病菌之一，因其外膜渗透屏障、外排系统、各种酶类及迅速突变的靶位等原因对多种广谱抗菌药物包括泰能等碳青霉烯类先天耐药。目前嗜麦芽窄食单胞菌的临床分离率有逐年上升趋势，耐药性日益严重，抗菌药物选择有一定困难，因而引起临床医师的高度关注。     

嗜麦芽窄食单胞菌感染与耐药性分析

嗜麦芽窄食单胞菌即以前的嗜麦芽假单胞菌 ,后又称嗜麦芽黄单胞菌 ,1993年 Phlleroni和 Bradbury改为现名〔1〕,该菌是院内感染重要病原菌 ,且对多种抗生素耐药 ,已引起临床的密切关注 ,为了解嗜麦芽窄食单胞菌耐药特点 ,我们对 1997年～ 1999年分离的 88株菌株进行了耐药性测定和产诱导型β—内酰胺酶的检测 ,现分析报告如下。1　材料和方法1.1　材料1.1.1　菌株来源　 88株受试菌株均为我院 1997～ 1999年临床各类标本分离 ,其中痰 6 2例 ,咽拭子 10例 ,脓液 8例 ,尿液 5例 ,其他 3例。1.1.2　试剂　均为法国生物梅里埃产品。1.1.3　质控…     

嗜麦芽窄食单胞菌呼吸道感染35例分析

目的探讨嗜麦芽窄食单胞菌呼吸道感染的危险因素及耐药情况。方法对35例嗜麦芽窄食单胞菌呼吸道感染的临床分析。结果35例中对复方新诺明敏感率为85.71%,对左氧氟沙星的敏感率为74.29%,对亚胺培南100%耐药,对氨基糖苷类、头孢菌素类耐药率较高。结论高龄、严重基础疾病,应用多种抗生素,院内感染应用糖皮质激素等是嗜麦芽窄食单胞菌呼吸道感染的危险因素,且对多种抗生素耐药。     

AIDS合并嗜麦芽窄食单胞菌脓胸1例

患者,男,42岁。因发热伴右侧胸痛1月余,于2008年5月14日入院。既往有静脉吸毒史。体检：T38.5℃,P110次/分,R28次/分。消瘦,慢性衰竭状,右侧胸廓保满,叩浊音,呼吸音消失,肝、脾不大。实验室检查：血白细胞12.4×10^9/L,中性0.83,淋巴0.13,血红蛋白114g/L,血沉124mm/h;结核抗体（-）,肝、肾功能正常。由州疾病预防控制中心做抗-HIV蛋白印迹试验（＋）。胸水：外观脓性黄绿色,常规李凡他（＋＋＋）,白细胞191.0×10^9/L,中性0.82,淋巴0.18。生化检验：蛋白40.7g/L,乳酸100mg/ml,乳酸脱氢酶17599V/L。3次查抗酸杆菌（-）,     

12例嗜麦芽窄食单胞菌感染及其药敏研究

目的：研究嗜麦芽窄食单胞菌引起的感染危险因素及有效抗生素,方法分析１２例嗜麦芽窄食单胞菌感染的临床资料,应用Ｓｃｅｐｔｏｒ系统测定了１８株嗜麦芽窄食单胞菌对２０种抗性素的敏感度。结果嗜麦芽窄食单胞菌多见于呼吸道染,其次为菌血症及局部感当了菌株对大多数抗生素耐药,结论严重基础疾病,应用广谱抗生素及免疫抑制剂是嗜麦芽窄食单胞菌感染的危险因子,替卡西林、环丙沙星和阿米卡星为抗嗜麦芽窄食单胞菌有相对活性的     

我院医院获得性嗜麦芽窄食单胞菌的临床耐药分析

目的了解我院2006—2010年嗜麦芽窄食单胞菌的耐药情况,为临床合理选用抗生素提供依据。方法对2006—2010年120株院内嗜麦芽窄食单胞菌感染的分布及药敏结果进行回顾性分析。结果嗜麦芽窄食单胞菌在院内感染有逐年增加的趋势;120株嗜麦芽窄食单胞菌标本来源以呼吸道分泌物最多,占62.50%,科室分布以重症监护病房为主,占44.17%。药敏结果显示,大多数药物的耐药性较强。10种β-内酰胺类抗菌药物中除头孢哌酮/舒巴坦的耐药性〈33.4%,替卡西林/克拉维酸〈50.0%外,其余8种抗菌药物的耐药性均较高;对氨基糖苷类抗生素中的庆大霉素、阿米卡星也呈高度耐药,耐药性均〉85.0%;所有抗菌药物中米诺环素的耐药性最低（均〈7.0%）,其次为左氧氟沙星与复方新诺明（均〈25.0%）。结论嗜麦芽窄食单胞菌的院内感染率呈逐年上升的趋势,其耐药性广泛,感染后可选择的抗菌药物有限,临床应加强监测,尽早进行病原学检查,并根据药敏试验结果选用敏感药物,避免院内感染的暴发流行。     

嗜麦芽窄食单胞菌感染危险因素及RAPD基因分型研究

回顾性分析48株嗜麦芽窄食单胞菌（SMA）感染的危险因素,采用随机扩增多态性DNA技术（RAPD）对SMA进行同源性分析。结果本组SMA感染标本来源主要为痰（29株）,病区分布以ICU为主（31株）;患者多伴有严重基础疾病,35例曾行侵入性治疗,均有抗生素使用史。RAPD可将48株SMA分为46型,呈基因多态性分布。认为高龄、严重基础疾病、创伤性操作、广谱抗生素长期使用及免疫抑制剂使用等是SMA感染的危险因素;RAPD技术可用于SMA分子流行病学分析。     

114株嗜麦芽窄食单胞菌的药敏分析

目的了解嗜麦芽窄食单胞菌感染及耐药情况，以指导临床用药。方法常规分离5450份临床标本，并对分离出的114株嗜麦芽窄食单胞菌进行纸片扩散法药敏试验。结果5450份标本检出嗜麦芽窄食单胞菌114株，分离率2．1％，药敏试验表明该菌对碳青霉烯类抗生素天然耐药，氟喹诺酮类药（加替沙星、左氧氟沙星）、头孢哌酮／舒巴坦和复方新诺明有较高的敏感率，达50％以上。环丙沙星、马斯平（头孢吡肟）、头孢哌酮／舒巴坦（舒普深）、头孢他啶的耐药率上升明显，分别从2004年的46％、25．5％、31．5％、49％上升至2007年的81．6％、60％、72．2％、87％。结论该菌在临床标本中分离率较高，对抗生素产生了不同程度的耐药，且多重耐药，提示临床要重视该菌的检出，按照药敏试验来选择药物治疗。     

老年机械通气患者嗜麦芽窄食单胞菌感染的耐药性分析

目的:了解老年机械通气患者嗜麦芽窄食单胞菌(SMA)感染及其药敏分析。方法:对2000年1月～2003年12月机械通气患者分离出57株SMA致病菌的药物敏感试验进行分析。结果全部患者均使用过广谱抗菌药物，其中82．5％患者曾接受气管插管；药敏结果显示：SMA对亚胺培南高度耐药；对第一、二代头孢菌素大多耐药；对环丙沙星、复方磺胺甲恶唑有较高的体外敏感性，分别为87．7％币盯80．7％。结论:SMA感染的发生与严重的基础疾病、免疫功能低下、侵入性操作、广谱抗菌药物的应用密切相关；SMA对多种抗菌药物耐药，但是环丙沙星、复方磺胺甲恶唑对SMA体外呈现较好的抗菌活性，可以作为临床治疗SMA感染的有效抗菌药物。     

机械通气患者嗜麦芽窄食单胞菌暴发感染分子流行病学研究

目的 研究确定呼吸重症监护室(RICU)内机械通气患者连续发生嗜麦芽窄食单胞菌(pma)感染为暴发感染，并追踪其感染源。方法 收集2002年12月至2003年2月自RICU有创机械通气患者气道抽吸物中分离出的9株pma菌株，RICU工作人员手拭子分离的pma菌株2株，纤维支气管镜(已按常规消毒存放，用于气道管理)冲洗液分离的pma菌株2株，采用WHONET5软件通过耐药分析组合对菌株进行抗生素型分析，通过脉冲场凝胶电泳(PFGE)全DNA指纹图技术对菌株进行分子分型，确定菌株的亲缘关系。以1997年至2000年自多个科室收集的16株pma作对比。结果 9例机械通气患者感染的9株pma，有8株PFGE基因型相同，并与2株分离自RICU工作人员手拭子的pma和2株分离自纤维支气管镜的pma基因型一致。抗生素型则有7株分型相同。抗生素型与PFGE基因型的符合率为85％(11／13)。1997年至2000年收集的16株pma，PFGE基因型分为11型，抗生素型分为9型，呈现为多克隆构成模式。结论 8例机械通气患者感染的pma来自于同一克隆，RICU内存在着pma的暴发感染。消毒不彻底的纤维支气管镜和医护人员的手污染是引起本次暴发感染的重要感染源和感染途径。     

Stenotrophomonas maltophilia in cystic fibrosis: Incidence and prevalence

Stenotrophomonas maltophilia (SM) was recovered from 211 of 773 cystic fibrosis (CF) patients followed for at least one year, and seen between 1982 and 1994. Yearly prevalence (5.6% to 8.7%) and incidence rates (1.6% to 5.7%) showed no trends. SM persistence varied greatly and was unlike that of Pseudomonas aeruginosa. Fifty percent of SM-positive patients had only one positive culture and only 24 (11%) remained chronically infected. Although SM-positive patients were more likely to be hospitalized than SM-negative patients, for 55% of SM-positive patients, acquisition did not appear to follow hospitalization. Of 40 SM-positive patients who had a CF sibling, only 10 siblings were ever culture positive. When stratified by FEV₁, the two-year survival for SM-positive with mild/moderate disease (98%) and severe disease (78%) was similar to that of our SM-negative patients. Five-year survival was only 40% for SM-positive patients with initially severe pulmonary status, compared with 72% for the SM-negative patients. Seventy percent of the original SM isolates were panresistant (susceptible to no more than one antimicrobial agent). Ten years later, panresistance was 84%. Despite our reassuring experience with SM, including lack of sibling concordance, the fact that the majority of our patients had no hospital exposure prior to acquisition, the high incidence of transient infection, and the seemingly unaffected two-year survival, there are insufficient data to definitively conclude that segregation of these patients would be beneficial. The increasing prevalence of multiply resistant gram-negative pathogens in CF patients suggests the need for continued caution with any panresistant pathogen. Pediatr Pulmonol. 1998;25:304–308. © 1998 Wiley-Liss, Inc.     

Characterisation of Bacteriophage vB_SmaM_Ps15 Infective to Stenotrophomonas maltophilia Clinical Ocular Isolates

Recent acknowledgment that multidrug resistant Stenotrophomonas maltophilia strains can cause severe infections has led to increasing global interest in addressing its pathogenicity. While being primarily associated with hospital-acquired respiratory tract infections, this bacterial species is also relevant to ophthalmology, particularly to contact lens-related diseases. In the current study, the capacity of Stenotrophomonas phage vB_SmaM_Ps15 to infect ocular S. maltophilia strains was investigated to explore its future potential as a phage therapeutic. The phage proved to be lytic to a range of clinical isolates collected in Australia from eye swabs, contact lenses and contact lens cases that had previously shown to be resistant to several antibiotics and multipurpose contact lenses disinfectant solutions. Morphological analysis by transmission electron microscopy placed the phage into the Myoviridae family. Its genome size was 161,350 bp with a G + C content of 54.2%, containing 276 putative protein-encoding genes and 24 tRNAs. A detailed comparative genomic analysis positioned vB_SmaM_Ps15 as a new species of the Menderavirus genus, which currently contains six very similar globally distributed members. It was confirmed as a virulent phage, free of known lysogenic and pathogenicity determinants, which supports its potential use for the treatment of S. maltophilia eye infections.     

中国汉赛巴尔通体分离株的多位点序列分型分析

目的 了解中国汉赛巴尔通体的遗传背景和流行的常见亚型。方法 对分离到的汉赛巴尔通体应用多位点序列分型方法（Multilocus sequence typing, MLST）,分析它们的分子流行病学特征和系统发育情况。结果 80株汉赛巴尔通体一共分为3个序列型（sequence type, ST）,其中ST1占90% (72/80),ST9占8.75% (7/80),另一个序列型为仅包含一株细菌的ST30;所有3个序列型均属于克隆群1 （clonal complex 1）。结论 与国外汉赛巴尔通体多位点序列分型结果相比,中国的序列型相对集中,说明中国汉赛巴尔通体的变异度和多样性较低,提示其进化相对缓慢。     

Stenotrophomonas maltophilia: A marker of lung disease severity

Background

While the prevalence of Stenotrophomonas maltophilia lung infection in cystic fibrosis (CF) patients has increased in the last decades, its pathogenicity remains controversial. The aim of this study was to investigate the effects of S. maltophilia initial infection on the progression of lung disease in CF children.

Methods

This case‐control retrospective study took place in a pediatric CF center. A total of 23 cases defined by at least one sputum culture positive for S. maltophilia, were matched for age, sex, and CFTR mutations to 23 never infected CF controls. The clinical data were collected for 2 years before and after S. maltophilia initial infection and comprised lung function analyses, rates of exacerbations and of antibiotic courses.

Results

Compared with controls, cases had lower lung function (P = 0.05), more frequent pulmonary exacerbations (P = 0.01), hospitalizations (P = 0.02), and intravenous antibiotic courses (P = 0.04) before S. maltophilia acquisition. In the year following S. maltophilia initial infection, lung function decline was similar in cases and controls but cases remained more severe, with more frequent pulmonary exacerbations (P = 0.01), hospitalizations (P = 0.02) and intravenous antibiotic courses (P = 0.02).

Conclusions

S. maltophilia seems to be a marker of CF lung disease severity and international recommendations to reduce lung infection by this pathogen should rapidly emerge.

     

利用MLST技术对浙江省大肠杆菌O157的分子流行病学研究

目的对浙江省2005-2010年大肠杆菌O157分离株进行分子分型研究,了解菌株间的遗传进化关系,为浙江省大肠杆菌O157监测及爆发疫情的控制提供基础。方法选择Pasteur大肠杆菌多位点序列分型（Multilocus SequenceTyping,MLST）方案,对大肠杆菌O157分离株及882364菌株进行MLST分型,确定菌株序列型（Sequence type,ST）;采用DNAsp、eBURST、START2等软件进行分析。结果 30株菌中,27株O157∶H7菌株具备相同序列型（ST-284）,占90%（27/30）,其他3株菌序列型分别为ST-367、ST-125、ST-296。8个管家基因核苷酸多态性（Pi）范围为0.00119（polB）～0.00648（uidA）,putP基因多态性位点比例最高（4.6%）,trpA基因多态性位点比例最低（0.4%）。进化分析结果显示,这些序列型分别属于Group 1及Group 11群。结论浙江省动物源性大肠杆菌O157∶H7的主要序列型为ST-284,与江苏省病人株882364（ST-296）具有同一个进化祖先,提示应加强浙江省大肠杆菌O157病原学监测。     

致病性钩端螺旋体的多位点序列分型研究

目的 通过对致病性钩端螺旋体(简称钩体)多位点序列分型(MLST)分析,了解国内与全球致病性钩体种群结构及其分子进化.方法 应用16SrRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较,同时收集已公开的来自不同国家和不同时期1 238株致病性钩体...