抵抗素基因多态性与华东地区2型糖尿病的相关性

目的：研究华东地区汉族人群中抵抗素基因的单核苷酸多态性（SNP）及其与2型糖尿病的相关性。方法：选取华东地区汉族2型糖尿病患者116例及正常对照组96例，采用直接测序法对抵抗素基因作SNP筛查，并作进一步的基因分型。结果：抵抗素基因启动子区发现4个SNP（－638G／A－537A／C，－420C／C，－358G／A），内含子区3个SNP（－167/, 157/，＋299G／A），这些SNP的等位基因频率在2型糖尿病和正常对照组之间无显著性差异（P＞0．05）。结论：抵抗素基因的SNP与华东地区汉族人群中2型糖尿病无显著相关性。     

脂联素基因多态性与2型糖尿病合并冠心病的关联研究

目的探讨脂联素(adiponectin,ADIPOQ)基因多态性与2型糖尿病合并冠状动脉粥样硬化性心脏病(以下简称冠心病)的关联。方法本研究分两步进行,首先预实验对ADIPOQ基因进行生物信息学分析,对20例2型糖尿病合并冠心病患者进行第2个外显子区域的测序,拼接后与参考数据库比对,筛选出候选单核苷酸多态性。大样本复制研究采用病例-对照研究设计,680例2型糖尿病患者入选,其中包括2007年2月至2009年5月首都医科大学附属北京安贞医院心内科2型糖尿病合并冠心病患者213例,以及2008年1月至2009年10月卫生部北京医院内分泌科门诊2型糖尿病患者467例。基于聚合酶链式反应-高分辨率熔解曲线(PCR-HRM)技术,观察候选单核苷酸多态性在2组间的分布差异。结果预实验结果筛选出5个单核苷酸多态性,包括:17366568G/A、9882205G/A、2241767A/G、1501299G/T、2241766T/G。其中2个单核苷酸多态性与2型糖尿病合并冠心病关联,包括rs2241766T/G(+45T/G)多态性[OR(95%CI)=2.78(1.20～8.65),P=0.015]和rs9882205G/A多态性[OR(95%CI)=3.9(1.78～13.61),P=0.000]。对rs2241766进行大样本复制研究后,未发现与2型糖尿病合并冠心病的关联或相关的趋势。结论 ADIPOQ基因rs2241766多态性可能不是与2型糖尿病合并冠心病关联的因素。     

ABCG2、SLC2A9、SLC17A3和PRKG2基因单核苷酸位点多态性与哈尼族人群痛风的关系

目的 探讨哈尼族和汉族人群ABCG2、SLC2A9、SLC17A3和PRKG2基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),研究这四个基因上的五个SNP位点(rs2231142、rs6855911、rs1014290、s1165205和rs7688672)在哈尼族和汉族痛风...     

胰岛素启动子因子1基因启动子区G3/G4多态性与鲁北地区糖尿病发病的关联研究

目的研究IPF1基因启动子区G3/G4多态性位点与鲁北地区汉族人群糖尿病的相关性。方法选择2型糖尿病96例、1型糖尿病36例及正常对照组100例作为研究对象,对IPF1基因启动子区G3/G4多态性位点进行PCR扩增,PCR产物纯化后,经ABI PRISM 3700 DNA全自动测序仪直接测序,然后进行基因分型,并通过相关分析,研究该位点与糖尿病的相关性。结果对照组与1型、2型糖尿病组的基因型频率和等位基因频率分布差异无统计学意义(χ2=8.566,P=0.073,χ2=5.944,P=0.051)。结论IPF1基因启动子区G3/G4多态性位点与中国汉族人群糖尿病无显著相关性,暂不能作为预测中国汉族人发生糖尿病危险性的遗传学标志。     

CXCR3单核苷酸多态性与肾移植急性排异关系的研究

目的:研究CXCR3基因rs 2280964单核苷酸多态性(gene single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肾移植急性排异(acute rejection,AR)发生的关系.方法:2005 - 08～ 2009 - 12行首次同种异体尸体肾移植(re-nal transplantation,RTx)手术、术后6mo内临床及病理均证实的AR或移植肾状态(RTx status,Ts)的受者共223例.总结两组受者术后6mo内AR的发生等流行病及临床资料,用Taqman荧光探针法对CXCR3基因SNPs( In-tron 1,c.12+ 234G＞A;dbSNP:rs2280964)进行基因分型.结果:RTx受者CXCR3基因rs 2280964的SNPs基因分型与术后6mo内AR的发生无明显相关性(男:P=0.36;女:P =0.98).结论:CXCR3基因rs 2280964的SNPs与肾移植受者术后半年内AR的发生无明显相关性.     

MYH9和ABI2基因SNP在2型糖尿病人群中与血糖、胰岛素抵抗和血压的相关性

目的:研究MYH9和ABI2基因的单核苷酸多态性(SNP)在2型糖尿病人群中与血糖、胰岛素抵抗及高血压的关系。方法:应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术,对773例天津地区的2型糖尿病患者的MYH9基因的8个SNP位点和ABI2基因的4个SNP位点进行基因分型,以PLINK软件进行数量性状的关联分析及基因型交互作用分析。结果:MYH9和ABI2基因SNP位点与血糖和胰岛素抵抗表型存在较广泛的关联,包括糖化血红蛋白、2 h血糖、空腹和2 h胰岛素及胰岛素抵抗指数(P<0.05)。ABI2基因SNP位点rs62183937(P=0.000),rs11675251(P=0.008)等均与血压相关。结论:MYH9和ABI2基因的多态性可能与2型糖尿病患者的血糖、胰岛素抵抗相关表型及2型糖尿病合并高血压的发病相关。     

等位基因特异性PCR检测脂联素基因SNP位点方法的建立

目的:建立等位基因特异性PCR检测脂联素基因与2型糖尿病相关SNP位点的方法.方法:针对脂联素基因G531A,G545C,G11963T,T12194G和T13320C 5个SNP位点设计野生型和突变型特异性引物,第一轮PCR的上游引物或下游引物与等位基因特异性引物进行半巢式PCR.在同一SNP位点如果野生型引物出现扩...     

广东汉族人群类风湿性关节炎患者TGF-β1与IL-1β基因多态性的研究

目的 探讨广东地区汉族人群TGF-β1（+915G/C）以及IL-1β（-31 C/T）基因多态性及其与RA相关性。方法 分别采用PCR-SSP技术（TGF-β1+915G/C的检测）和PCR-RFLP技术（IL-1β-31C/T的检测）检测120名健康体检者和111例RA患者基因型。结果 TGF-β1（+915）有GG、GC、CC三种基因型,健康体检者与RA患者间的基因型未有统计学意义（χ2 =0.05,P =0.975）;IL-1β（-31）有CT、CC和TT三种基因型,健康体检者和RA患者间的基因型有统计学意义（χ2 =8.86,P =0.012）,且RA患者的C等位基因频率明显高于健康对照组（χ2=6.34,P =0.012,OR=1.64,95%CI：1.11～2.41）;在RA患者组中,活动期患者的C等位基因频率亦明显高于缓解期的C等位基因频率（χ2=28.63,P =0.000,OR=6.87,95%CI：2.40～20.27）。结论 TGF-β1（+915）基因多态性与RA无相关性;IL-1β（-31）基因多态性与RA具有相关性,且C等位基因可能是RA疾病的易感基因,CC基因型的人患RA疾病的概率较高。     

T-STAR基因与儿童失神癫痫相关性研究

目的 研究T-STAR基因是否为中国儿童失神癫痫的易感基因。方法 选择48例北方汉族儿童失神癫痫病患儿和48名来自同一地区正常人作为对照,对位于染色体8q24区域的T-STAR基因的外显子进行聚合酶链反应(PCR)扩增,PCR产物纯化后进行测序以寻找可能的突变。结果 没有发现突变,找到3个新的单核苷酸多态性(SNP),选择其中2个SNP作为遗传标记,病例-对照研究结果表明,各SNP的等位基因频率在病例组和对照组之间差异无显著意义(SNP 1：χ^2=2．965,df=1,P=0．085;SNP2：χ^2=2．965,df=1,P=0．085);各SNP基因型频率在病例组和对照组之间差异无显著意义(SNP1：χ^2=3．185,df=2,P=0．203;SNP2：χ^2=3．185,df=2,P=0．203)。结论 T-STAR基因可能不是儿童失神癫痫的易感基因。     

血管紧张素Ⅱ-2型受体基因A1675 G多态性与原发性高血压的相关性研究

目的:研究血管紧张素Ⅱ-2型受体(AT2R)基因A1675G单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族人群原发性高血压(Essential Hypertension,EH)的关系,探讨AT2R基因在EH发病机制中的作用.方法:应用等位基因特异性引物PCR方法检测181例EH患者(EH组)和187例健康人(对照组)的AT2R基因型,比较各组间的等位基因频率及基因型分布差异,分析AT2R基因A1675G多态性与高血压的关系.结果:AT2R基因A1675G的A等位基因频率在EH组明显高于对照组(53.3%vs44.4%),但两组间差异无显著性意义(P＞0.05).在男性组中,EH组的A等位基因频率明显高于对照组(53.6%vs42.9%,P＞0.05);而在女性组中,EH组和正常对照组间各基因型(AA,AG,GG)频率及等位基因频率分布的差异均无显著性意义(P＞0.05).结论:AT2R的A等位基因频率在EH组的分布较正常对照组高,但无统计学意义,尚不能确定AT2R基因A1675G多态性与中国人原发性高血压的发生存在相关性.     

圆锥动脉干畸形患者TBX1基因单倍型分析

目的检测分析单核苷酸多态（SNP）位点在圆锥动脉干畸形患者和正常人群中的分布情况,以及与所构成单倍型与圆锥动脉干畸形的相关性.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析130例圆锥动脉干畸形患者及200名正常人3个SNP位点基因型;应用列联表法统计分析患者组和对照组各SNP位点基因型及等位基因频率;应用PHASE软件构建单倍型并统计分析患者组及对照组单倍型频率是否存在差异.结果 G2963A位点等位基因频率及基因型频率在患者组和对照组中的分布差异显著,患者组G等位基因频率明显高于对照组（χ^2=8.14, P〈0.005）;单倍型分析可见4种单倍型在患者组和对照组中的分布频率差异有统计学意义 （χ^2=22.39 P〈0.005）：G2857/G2963/A6571和G2857/G2963/T6571为人群中常见单倍型.患者组中G2857/G2963/A6571、C2857/A2963/T6571两种单倍型频率较对照组高.结论 TBX1基因编码区的SNP位点G2963A与圆锥动脉干畸形有明显的相关性,具有G等位基因的人发生圆锥动脉干畸形的危险性相对增高;3个SNP位点所构成的单倍型有一定意义,可能与圆锥动脉干畸形易感基因相连锁.     

12个单核苷酸多态性位点与儿童急性淋巴细胞白血病易感性的关系

目的：鉴定国外全基因组关联分析（GWAS）报道的13 个儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）易感性单核苷酸多态性（SNPs）位点与中国人群的关系,为我国儿童ALL预测及诊治提供新策略。方法：采用微流体动态芯片（IFC）,通过Fluidigm的JunoTM分析系统,对191例ALL患儿和191例健康志愿者的13个ALL易感性相关候选SNPs位点进行基因分型。对照组进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验后采用χ2检验及logistic回归分析。结果：rs10849033 位点不满足Hardy-Weinberg遗传平衡,将该位点剔除。病例组与对照组风险等位基因频率存在明显差异的位点有位于ARID5B 基因的rs10821936（风险等位基因C频率为0.489,P ＜0.001,OR =1.692,95%CI =1.265～2.264）、rs10994982（风险等位基因A频率为0.598,P =0.016,OR =1.425,95%CI =1.068～1.901）,位于ZNF230 基因的rs7554607（风险等位基因A频率为0.721,P =0.002,OR =1.599,95%CI =1.179～2.169）,位于IKZF1 基因的rs11978267（风险等位基因G频率为0.191,P =0.001,OR =1.965,95%CI =1.301～2.968）、rs4132601（风险等位基因G频率为0.175,P =0.003,OR =1.871,95%CI =1.225～2.857）。结论：ARID5B 基因的rs10821936与rs10994982、ZNF230 基因的rs7554607位点多态性与我国儿童ALL发病相关,IKZF1 基因的rs11978267及rs4132601为我国儿童ALL潜在易感性位点。     

原发性开角型青光眼患者小梁网糖皮质激素诱导反应蛋白基因单核苷酸多态性研究

目的 探讨中国汉族人中小梁网糖皮质激素诱导反应蛋白（TIGR）基因的单核苷酸多态性（SNP）及其与原发性开角型青光眼（POAG）发病的关系。方法 应用设爱量构象敏感性凝胶电脉（HTCSGE）和荧光标记自动测序法筛选和鉴定82例POAG患者TIGR基因的SNP,用限制性内切酶酶切分析技术检测150例对照组人群相应的SNP。结果 TIGR基因所有编码区及部分非编码区共检出6种SNP：1－83（G→A）、G12R、R46X、R76K、IVS2＋35（A→G）和T353I。其中,T353I的基因型TC和等位基因T在POAG患者和对照人群中的分布差异有显著意义,POAG患者中基因型TC和等位基因T的基因T在POAG患者和对照人群中的分布差异有显著意义,POAG患者中基因型TC和等位基因T的频率分别为12.2%和6.1%,均显著高于对照组的3.3%(x^2=6.885,P=0.009）和1.7%(x^2=6.655,P=0.010)。其余5种SNP各基因和等位基因频率在两组中差异均无显著意义。结论 TIGR基因T353I多态性可能与我国POAG发病相关,提示TIGR基因是中国汉族人POAG的相关基因。     

非Ca2+依赖型磷脂酶A2基因单核苷酸多态性与2型糖尿病发病的关联性分析

目的: 探讨非Ca²⁺依赖型磷脂酶A2(iPLA2)基因家族中的PLA2G6基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国北方汉族人群中2型糖尿病(T2DM)发病的关联性,阐明PLA2G6基因是否为T2DM的易感基因。 方法: 选择168例T2DM患者(病例组)和199名正常对照者(对照组),采用聚合酶链式反应(PCR)技术和限制性片段长度多态性(RFLP)的方法检测2组研究对象PLA2G6基因rs2235346、 rs2272831和 rs2284060的基因型及等位基因频数分布。 结果: PLA2G6基因rs2235346、 rs2272831和 rs2284060位点在病例组和对照组中的基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg 平衡定律(P>0.05);PLA2G6基因rs2235346、 rs2272831和 rs2284060位点的基因型及等位基因频数在病例组和对照组分布比较差异均无统计学意义(χ²=0.728,P>0.05)。 结论: PLA2G6基因rs2235346、 rs2272831和 rs2284060位点多态性与T2DM的发病可能无关联,PLA2G6基因可能不是T2DM的易感基因。     

ENA-78、IP-10和VEGF基因多态性与特发性肺纤维化的相关性

目的 探讨上皮中性粒细胞活化肽78(ENA-78)、干扰素诱导蛋白10(IP-10)和血管内皮生长因子(VEGF)的基因多态性与特发性肺纤维化(IPF)的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制片段长度多态性技术,检测60例住院IPF患者(IPF组)和60例年龄、性别、吸烟情况匹配的外伤、骨折住院患者(对照组)的ENA-78(-156G/C)、IP-10(-1596C/T)和VEGF(+405G/C)的基因多态性,以比值比(OR)和95%可信区间(CI)表示相对风险度.结果 IPF组ENA-78 GC+CC基因型频率(20.0%)和C等位基因频率(12.7%)均明显高于对照组[分别为6.7%(P=0.032)和3.3%(P=0.008)],携带C等位基因的个体患IPF的相对风险度明显增加(OR=4.23,95%C/为1.35～13.20);IP-10 CT+CT基因型频率(10.0%)和T等位基因频率(5.8%)均明显低于对照组[分别为26.7%(P=0.018)和14.2%(P=0.031)],携带T等位基因的个体患IPF的相对风险度降低(OR=0.38,95%C/为0.15～0.95).2组VEGF(+405G/C)基因型和等位基因频率分布差异无统计学意义.结论 ENA-78(-156C)等位基因是IPF的危险因素,IP-10(-1596T)等位基因是IPF的保护性因素,VEGF(+405G/C)基因多态性与IPF的发生可能无相关性.     

广东人AGTR2突变热区的SNPs位点分析

[目的]研究广东汉族人群中血管紧张素Ⅱ2型受体基因(AGTR2)是否存在特有的SNPs位点.[方法]收集121例祖籍广东的汉族人.取外周静脉血以酚/氯仿法分离白细胞提取基因组DNA,根据AGTR2基因已知的SNPs的位点分布特点设计两对引物,PCR扩增目的片段.对PCR产物进行SSCP分析,银染显色.根据染色结果,随机抽取部分带型不同的PCR产物直接测序,对测序结果通过B1ASTn软件和ClustalW软件在线分析.[结果]发现5个SNPs位点:G300663A,A300672T,A300818T,G301404T和A301410G,除A301410G与GenBank dbSNP数据库中的位点(rs5194)相同外,其余4个位点为新发现的SNPs位点.[结论]AGTR2是一个高突变的基因,广东人AGTR2的SNPs位点多,与其他人群显著不同.     

Hedgehog信号通路基因启动子区多态性与广西地区人群肝细胞癌易感性的关系

目的:探讨Hedgehog(Hh)信号通路基因启动子区多态性与广西地区人群肝细胞癌遗传易感性的关系?方法:采用以医院为基础的病例对照研究,以1 041例肝细胞癌患者和1 074例非肿瘤对照者为研究对象,应用Sequenom Mass Array基因分型技术检测Hh信号通路基因启动子区的9个潜在功能性多态性位点的基因型,并分析各多态性位点与肝细胞癌易感性的关系?结果:在调整年龄?性别?吸烟?饮酒以及HBV感染等因素后,携带STK36 基因rs34237608 AG基因型者罹患肝细胞癌的风险降低(OR=0.67,95%CI=0.47~0.95;P=0.025);GG基因型与肝细胞癌易感性之间的关系无统计学意义(P > 0.05);在显性模型下,rs34237608位点AG/GG基因型可降低罹患肝细胞癌的风险(OR=0.67,95%CI=0.48~0.95;P=0.025)?本研究未发现其他候选位点多态性与肝细胞癌易感性有统计学意义?结论:STK36 基因rs34237608位点多态性可能与广西人群肝细胞癌易感性有关联?     

云南省精神分裂症患者关联基因检测

目的:采用简易微列阵法检测谷氨酸递质系统中与精神分裂症相关联的基因。方法:采用简易微阵列法,即PCR-等位基因特异性引物延伸和硝酸纤维素膜杂交法分析云南省255例精神分裂症患者和262名对照4个候选基因的4个SNP位点[rs778293(G72/G30)、rs2299225(GRM3)、rs11146020(GRIN1)和rs2814351(GRID1)]与精神分裂症的关联性。结果:对照组谷氨酸递质系统中的4个基因的4个SNP位点均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律。4个位点中,rs778293位点与精神分裂症存在关联性(基因型频率χ2=14.017,等位基因频率χ2=14.951,P<0.05)。结论:G72/G30基因SNP多态性与精神分裂症有关。     

Association of a common haplotype of hepatocyte nuclear factor 1alpha with type 2 diabetes in Chinese population

Objective To analyze the association of variants of hepatocyte nuclear factor-1α （HNF-1α） gene with type 2 diabetes in Chinese population. Methods In 152 unrelated type 2 diabetes patients and 93 unrelated controls, eleven single nucleotide polymorphisms （SNPs） were identified and genotyped. Statistical analyses were performed to investigate whether these SNPs were associated with diabetes status in our samples. Results In the individual SNP study, no SNP differed significantly in frequency between type 2 diabetes patients and controls. In the haplotype analysis, two haplotype blocks were identified. In haplotype block 1, no evidence was found between common HNF-1α haplotypes and type 2 diabetes. However, in haplotype block 2, a common haplotype GCGC formed by four tagging SNPs （tSNPs） was found to be associated with decreased risk of type 2 diabetes （odds ratio [OR] 0.6011, 95% confidence interval [CI] 0.4138-0.8732, P=0.0073, empirical P=0.0511, permutation test）. A similar trend was also observed in the diplotype analysis, indicating that the increasing copy number of the haplotype GCGC was associated with the decreased frequency of diabetes （P=0.0193）. Conclusion The results of this study provide evidence that the haplotype of HNF-1α decreases the risk of type 2 diabetes in Chinese individuals.