丙型肝炎病毒F蛋白研究新进展

丙型肝炎病毒(HCV)基因组长度约9.6kb,仅含有单个开放阅读框架(ORF),编码一个由约3010个氨基酸残基(aa)组成的多蛋白.在宿主细胞和病毒蛋白酶的作用下,多蛋白被加工成至少10个成熟的HCV蛋白质:C,E1,E2,p7,NS2,NS3,NS4A,NS4B,NS5A和NS5B.HCV C蛋白由191个aa组成,相对分子质量为23000,称为p23蛋白.p23羧基端aa被蛋白酶降解,就得到相对分子质量为21000的成熟C蛋白,称为p21蛋白.p21是HCV的重要结构蛋白,它与HCV RNA结合后形成病毒核心.Xu等[1]证实HCV C基因还可以编码产生一个新的蛋白--F蛋白.近年来F蛋白成为HCV研究的热点之一.     

庚型肝炎病毒多聚蛋白的翻译及基因变异研究进展

庚型肝炎病毒(HGV)是单股正链RNA病毒,其基因结构及保守序列类似于黄病毒科的成员。HGV基因组全长约9400个核苷酸(nt),与HCV相似,在5’端和3’端各有一段非翻译区(UTR),一个大开放读码框架(ORF)编码约2900个氨基酸的多聚蛋白前体,其氨基端(N端)和羧基端(C端)分别为结构蛋白(C、E1、E2)和非结构蛋白(NS2、NS3、NS4a/b、NS5a/b)。NS3区编码丝蛋白酶、解旋酶,NS5区编码RNA聚合酶。HGV与HCV全序列氨     

丙型肝炎病毒NS5A蛋白功能的研究进展

丙型肝炎病毒（HCV）可引起肝炎、肝硬化和肝癌等一系列肝脏疾病,且慢性化几率较高。目前全世界HCV感染人数仍呈增加趋势,因此科学家对HCV的研究高度重视。HCV有一个大的开放阅读框编码约三千多个氨基酸的多聚蛋白,经蛋白酶裂解为十个多肽片段;氨基末端为结构蛋白包括有核心蛋白、包膜蛋白E1和E2、P7蛋白;羧基末端为非结构蛋白包括有NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B蛋白。     

丙型肝炎免疫学研究新进展

1HCV新抗原丙型肝炎病毒(HCV)RNA表达结构蛋白,包括核心蛋白(C蛋白)、包膜蛋白1(E1)和2(E2)、p7和非结构蛋白(NS2、3、4A、4B、5A、5B)等。最近Bain等[1]认为HCVRNAC区除编码C蛋白外,还可通过核糖体移码机制编码另一种蛋白,称为F蛋白或选择性读码框蛋白(alternative reading fr     

丙型肝炎病毒致肝细胞癌的分子机制

丙型肝炎病毒（HCV）属黄病毒科,基因组为单股正链RNA,全长约9．6kb,编码4种结构蛋白（Core,E1,E2,p7）和6种非结构蛋白（NS2,NS3,NS4A,NS4B,NSSA,NSSB）。全球约有1．7亿人感染HCV。HCV感染是导致慢性肝炎、肝硬化及肝细胞癌（HCC）的主要原因之一。约70％急性HCV感染者可发展为慢性感染,其中约2．5％发展为HCC。     

丙型肝炎病毒NS5A蛋白的反式激活作用研究

0引言 丙型肝炎病毒(HCV)是一种单股正链RNA病毒,编码一种多蛋白分子,在病毒和宿主细胞蛋白酶的共同裂解作用下,至少裂解为3种结构蛋白(C、E1和E2)和6种非结构蛋白(NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B)[1,2].NS5 A是非结构蛋白的一种,哺乳动物细胞表达的NS5A蛋白以两种形式存在,分子量分别为56 kD和58 kD.HCV NS5A是HCV基因组编码的一种最为重要的具有多种生物学活性的非结构蛋白质[3-5],是HCV基因组编码的一种具有反式激活作用等多种生物学活性的非结构蛋白质.其基因序列的变异,决定部分HCV病毒株对于IFN-α治疗的疗效应答.HCV NS5A蛋白还具有结合双链RNA激酶(PKR)的生物学活性,对于HCV感染的靶细胞的细胞周期与细胞凋亡的分子生物学调节机制密切相关[6].     

生物信息学解读丙型肝炎病毒结构与免疫病理学改变的关联性

目的:分析丙型肝炎病毒(HCV)基因组编码序列结构特征及蛋白同源性,预测HCV非结构蛋白(NS)3序列的抗原表位。方法:以Envision免疫组织化学两步法检测肝移植受体肝组织内HCV抗原。从美国国立生物技术信息中心(NCBI)数据库中获取HCV编码序列,利用RPS-BLAST蛋白同源性比对软件进行序列分析;ProPred-Ⅰ软件预测NS3编码区段的T细胞抗原表位。结果:37%的受检病例肝细胞核对Tordji-22单克隆抗体起反应,33.3%的受检病例肝细胞核或细胞质对NS3抗体起反应。HCV编码产物HCV糖蛋白(gp)1的NS3区为保守区,与多种人类解旋酶具有同源性;其余各编码区未检测到与人类同源性。NS3区显示有CD4+和CD8+T细胞表位。结论:HCV NS3区含有与人类解旋酶同源的保守序列。解旋酶在细胞核参与核酸复制与DNA修复,故针对HCV NS3的抗原检测有可能与人类解旋酶起交叉反应。NS3的抗原表位特征可能是机体抗病毒同时破坏自身肝脏结构的分子基础。     

丙型肝炎病毒E2蛋白结合蛋白E2-BP3剪切体的基因克隆及生物信息学分析

HCV感染致肝细胞损伤的机制，很大程度上与病毒蛋白和肝细胞蛋白间的相互作用有关。因此，研究HCV各抗原成分与肝细胞内蛋白的相互作用及其机制能在一定程度上解释HCV的致病机制，为寻找有效防治HCV的方法提供新线索。HCV基因组含有1个长的开放阅读框架（ORF），编码一个约3010个氨基酸残基组成的多蛋白，它被细胞和病毒蛋白酶切至少产生10个病毒产物：核心蛋白（core）、E1、E2、p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B蛋白等。HCV包膜蛋白E2的生物学特性与HCV感染的慢性化和抗病毒免疫关系极为密切。张健等采用酵母双杂交系统，在酵母细胞融合蛋白表达型人肝cDNA文库中进行筛选，得到76个与E2特异性结合的阳性克隆，包括人类肝细胞癌相关抗原、硒结合蛋白、核苷传送系统、果糖磷酸激酶等26种已知的功能蛋白基因和14个未知的功能基因，包括E2-BP3基因，为揭示E2潜在的生物学功能提供依据。为进一步探讨未知的功能新基因E2-BP3的生物学功能及其作用，我们对该基因或其剪接体进行分子克隆，期望对其生物学功能进行预测分析，为今后更广泛深入地研究新基因的生物学功能打下基础，并为研究HCV E2的调节作用、丙型肝炎发病机制创造条件。     

丙型肝炎病毒非结构蛋白5A反式激活基因2的克隆化研究

目的：对丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白5A(NS5A)蛋白反式激活靶基因2(NS5A-TP2)的基因作克隆化研究。方法：依据我室构建的HCV NS5A反式激活基因差异表达的cDNA消减文库筛选结果，利用分子生物学与生物信息学技术相结合的方法获得新基因NS5-ATP2的编码序列，对其氨基酸序列进行分析比较，并对其进行克隆化研究。结果：NS5A-TP2基因编码区为615核苷酸(nt)，编码产物为204氨基酸残基(aa)。经核苷酸序列数据库(GenBank)和蛋白质一级结构序列数据库(SwissProt)同源序列的搜寻，与已知基因序列和蛋白序列之间没有显著同源性，说明我们克隆的NS5A-TP2基因属于未知功能新基因。结论：发现了HCV NS5A反式激活作用的新的靶基因，这一发现，为研究新基因的生物学功能及慢性丙型肝炎发病机制提供新的思路。     

丙型肝炎病毒非结构蛋白NS3抗原模拟表位的筛选和鉴定

目的 筛选丙型肝炎病毒(HCV)非结构蛋白NS3(HCV NS3)特异性噬菌体模拟表位，为抗—HCV的疫苗研究探索新途径。方法 以抗—HCV NS3的单克隆抗体作为固相筛选分子，对人工合成的噬菌体随机七肽库进行3轮“吸附—洗脱—扩增”的筛选过程，随机挑取60个克隆，经噬菌体酶联免疫吸附法(ELISA)鉴定并进行交叉反应实验以及竞争抑制性结合实验，最后对所选克隆进行DNA序列分析，以确定HCV NS3抗原的模拟表位。结果 经噬菌体富集后，从随机筛选的60个克隆中得到13个阳性克隆，确定氨基酸序列SRNTxKL为HCV NS3的模拟表位。结论 用噬菌体七肽库成功筛选得到HCV NS3的模拟表位。     

丙型肝炎病毒非结构区NS5A研究进展

0 引言目前全球各国丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染率为0.5%～4%,平均为3%左右,其中20%左右是急性肝炎,70%～80%转变成慢性肝炎,而慢性丙型肝炎一般经过20a～30a 发展为肝硬变或肝细胞癌(HCC),HCV 相关性终末期肝病已成为欧美一些国家进行肝移植的主要适应证,危害极大.HCV 是正单股 RNA 病毒,包括5′非编码区(5′non-coderegion,5′-NCR),一个长约9400bp 的单一开放阅读框(openreading frame,ORF)和3′非编码区(3′ non-encode region,3′-NCR),5′-NCR 其间有内源性核糖体进入位点(internal ribosomeentry site,IRES).其中 OFR 包括结构区(structural region)和非结构区(nonstructural region),在结构区中有 C,E1,E2,P7区,在非结构区中有 NS2,NS3,NS4A,NS5A 和 NS5B 区等.近年来,有关 HCV NS5A 区的结构与功能倍受关注,现就 HCVNS5A 作一综述.     

丙型肝炎病毒检测方法的研究进展及其临床意义（综述）

丙型肝炎病毒是单股正链RNA病毒。1991年，国际病毒命名委员会(ICTV)将其归为黄病毒科丙型肝炎病毒属，其基因组含有一个大约9033个核苷酸构成的大开放读码框(ORF)，可编码3010—3033个氨基酸的多蛋白前体，多蛋白N端的1／4依次为核心蛋白(C)和包膜蛋白(E1和E2)等结构蛋白，其余依次为NS2、NS3、NS4和NS5等非结构蛋白，核衣壳蛋白组成核酸，膜蛋白分布于病毒表面，NS3蛋白具有蛋白酶的功能，NS5蛋白为一依赖于RNA的RNA多聚酶。     

丙型肝炎

丙型肝炎病毒不同基因型NS3蛋白的抗原异质性分析——乔伟振等(江苏无锡市第一人民医院中心实验室214001)《中华微生物学和免疫学杂志》2005，25(1)：10-14（探讨不同基因型丙型肝炎病毒(HCV)NS3蛋白的抗原特性及其用于抗．HCV检测的意义。方法：分别构建和表达含有HCVl型和6型NS3基因片段的重组质粒和重组蛋白，以ELISA法和Westernblot分析不同基因型重组蛋白与已知抗．HCV阳性血清的抗原反应性。结果：HCV1型和6型NS3重组蛋白氨基酸序列的同源性为83．2％；85份抗-HCV阳性血清以此不同基因型HCVNS3单片段抗原检测，     

丙型肝炎病毒相似株的临床意义

HCV包膜糖蛋白E2/NS1基因区C端相对保守,N端含有两个高变区域(hypervariable region, HVR)HVR1和HVR2,分别定位于氨基酸序列的384aa～410aa/413aa及474aa～480aa;近年来研究发现HVR1含有病毒株特异的中和性抗原表位。HCV感染者体内可同时存在多种相似株,这种序列     

丙型肝炎病毒感染的血清学和病毒学诊断试验研究进展

一、HCV的基因结构及功能 目前从感染HCV的人和黑猩猩的血浆中分离出的病毒颗粒属于披膜病毒科黄病毒属。基因组为一大约10Kb单股正链RNA分子,含有一个跨越整个基因组,编码3011或3010个氨基酸的单一开放读码框(ORF)。HCV的ORF含有编码核壳蛋白(C),外膜蛋白(E),基质蛋白(M)及五种非结构蛋白(NS_(1-5))的基因,在基因组的5′和3′端分别有非编码区,它可能与基因的异源性和高度易变性有关。 二、血清学诊断方法 特异性抗体检测 1989年Kuo等建立了C_(100-3)抗原放射免疫方法(RIA)检测抗-C_(100-3)抗体,由于该法     

第二代抗HCV测定法

丙型肝炎病毒(HCV)的克隆化及其特异性血清学方法的确立,使我们对该病毒的认识及其检测能力有了明显提高。但是第一代抗 HCV 测定法仍缺少理想的敏感度和特异性,它的这一缺点迫使人们广瑟地寻找另外一种能更快、更易诱导免疫应答的病毒抗原。HCV 全基因组的序列分析和黄病毒属相关成员结构上的相似性促进了这种探索。黄病毒属包括黄病毒(登革热和黄热病毒)和瘟病毒(猪霍乱和牛腹泻病毒)它们都有相同的基因组结构,包括核(核衣壳)和基因组5端的蛋白外壳以及延伸到3′端的5个非结构蛋白(NS—1～NS—5)区,第一代抗 HCV 法检测的是针对位于 NS—3区,C100-3抗原的抗体,该抗原是来自5—1一1克     

戊型肝炎病毒抗原研究进展

戊型肝炎病毒(HEV)为线状单股正链RNA病毒,基因组全长约7.5kb(7.2～7.6kb),编码2 400～2 533个氨基酸,由5'端非结构区(NS)和3'端结构区(S)组成,3'端带一个由150～200个腺苷酸残基组成的poly A尾巴.HEV基因组含3个开放读码框架(ORFs),ORF1位于5'NS区,长5 079bp(第28～5107nt),编码HEV复制相关蛋白,包括甲基转移酶、木瓜酶样的蛋白酶、解旋酶、RNA依赖性RNA聚合酶(RDRP);ORF2从ORF1终止密码下游37个bp开始,长1 980bp(第5 147～ 7127nt),编码660个氨基酸,主要包括信号肽和衣壳蛋白;ORF3位于ORF1、ORF2之间(第5 106～5 478nt),与两者均有部分重叠,长369bp,编码一段123个氨基酸的多肽,功能不清.有学者认为ORF3编码的蛋白是一种与细胞骨架有关的磷蛋白,也有认为与转膜元件有关.本文仅就HEV抗原表位及ORF2抗原真核表达的研究进展简要综述如下.     

丙型肝炎病毒转基因小鼠模型的研究

0引言丙型肝炎病毒(HCV)是1989年美国Chooetal[1]利用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术分离鉴定的一种新型肝炎病毒,属黄病毒科丙型肝炎病毒属.其基因组为单股正链RNA,长9.4kb左右,两侧分别为5’和3’非编码区(NCR),中间为单一的开放读码框(ORF),可分为核壳蛋白区(C区)、包膜蛋白区(E区)和非结构蛋白区(NS区).其中,5’NCR区变异较小,内含内部核糖体进入位点(IRES),在病毒蛋白的翻译中有重要的调控功能.C区与E1/E2区构成结构基因,分别编码衣壳蛋白和包膜糖蛋白,内含重要的中和抗原表位与细胞免疫抗原表位,与HCV的免疫致病及防…     

登革病毒的检测技术研究进展

登革热病毒 (denguevirus,DV)属于黄病毒科黄病毒属 ,是有包膜的单股正链RNA病毒 ,基因组长约 11kb ,整个基因的编码顺序为 :5’Ⅰ型帽子结构、非编码区、AUC蛋白 (核衣壳蛋白 )基因、M蛋白 (膜蛋白 )基因、E蛋白 (包膜蛋白 )基因、NS1- 2a- 2b - 3- 4a - 4b - 5基因、非编码区 3’〔1〕。DV分为 4个血清型 (1～ 4 ) ,可引起隐性感染、登革热 (denguefever,DF)和登革出血热 (denguehemorrhagicfever,DHF) ,严重的还可导致登革休克综合征 (dengueshocksyndrome,DSS)。随着全球气候变暖和城市化进程的加快 ,登革热病例正在迅速增加 ,…     

丙型肝炎病毒非结构蛋白5A的研究进展

丙型肝炎是由丙型肝炎病毒(HCV)引起的非甲-非乙型肝炎,是慢性肝病的主要原因之一.HCV编码至少10种成熟蛋白,而非结构蛋白5A(NS5A)是其重要蛋白之一.磷酸化的NS5A与病毒的复制密切相关,参与病毒的产生和释放,并且能够通过病毒和宿主细胞的相互作用,干扰细胞内重要信号通路,影响细胞周期和免疫系统,最终促使HCV相关慢性肝病的发生与发展.本文就NS5A的生物学功能及其作用机制的研究进展作一综述.