miR-542-3p对骨肉瘤细胞侵袭能力的影响及其靶基因预测

目的 明确miR-542-3p对骨肉瘤细胞系HOS和SAOS2细胞侵袭能力的影响,通过生物信息学建立miR-542-3p靶基因调控网络,并探讨其潜在作用靶点。方法 使用miR-542-3p mimics转染HOS和SAOS2细胞,同时设立正常组（未转染）及阴性对照组（转染miR-neg mimics）,Transwell小室试验检测转染后细胞的侵袭能力。通过美国国立生物信息中心（NCBI）基因表达共享数据库（GEO）联合GEO2R平台,获取并分析miRNA-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的基因表达谱数据及其差异表达基因,进而使用miRNA预测数据库及Cytoscape软件,预测并建立miR-542-3p靶基因调控网络。实时荧光定量PCR验证miR-542-3p转染HOS和SAOS2细胞后,部分预测目标靶基因的mRNA表达水平变化。结果 miR-542-3p干预组HOS和SAOS2细胞的侵袭能力较正常组和阴性对照组明显降低（P均＜0.05）。数据库差异基因分析表明,miR-542-3p与miR-neg转染的U2OS细胞的表达差异基因共有417个,其中185个基因表达下调。miRNA预测数据库预测的266个靶基因中,有14个与差异基因分析中得到的表达下调基因重合。实时荧光定量PCR分析得出,ILK、TBPL1、ETS1这3个预测靶基因在miR-542-3p干预组中的表达水平显著低于阴性对照组,差异均有统计学意义（P均＜0.05）。结论 miR-542-3p通过下调ILK、TBPL1、ETS1显著抑制骨肉瘤细胞的侵袭能力。     

长链非编码RNA LINC00313与miR-342-3p/膜联蛋白A2轴在肝细胞癌细胞中的作用与机制

背景与目的 肝细胞癌（HCC）是造成癌症相关性死亡的常见原因之一，研究表明长链非编码RNA（lncRNA）调控微小RNA（miRNA）的表达，进而通过抑制靶mRNA翻译或促进mRNA降解来参与肿瘤发生及进展过程。LINC00313作为一种具有致癌活性的lncRNA参与肿瘤发生及进展过程；膜联蛋白A2（ANXA2）在包括HCC的多种恶性肿瘤中表达上调，促进恶性表型的发生，并可能受上游miR-342-3p的调控。因此，本研究探讨LINC00313、miR-342-3p、ANXA2在HCC细胞中的表达及其相互关系。方法 用qRT-PCR与Western blot检测人肝实质细胞及HCC细胞系（Li-7、HuH-7、Hep3B2.1-7）中LINC00313、miR-342-3p及ANXA2表达。将体外培养的Li-7细胞分为空白对照组（无处理）、LINC00313 siRNA组（转染LINC00313 siRNA）、miR-342-3p模拟物组（转染miR-342-3p模拟物）、共转染阴性对照组（转染阴性siRNA序列与阴性miRNA序列）、共转染组（转染LINC00313 siRNA及miR-342-3p抑制物），用qRT-PCR与Western blot检测各组细胞LINC00313、miR-342-3p及ANXA2表达；MTT实验及平板集落形成实验检测各组细胞增殖；进行TUNEL染色检测各组细胞凋亡；Transwell侵袭及Western blot分别检测各组细胞侵袭数目及上皮-间充质转化（EMT）相关蛋白波形蛋白（vimentin）、E-钙黏蛋白（E-cadherin）表达；免疫荧光染色检测各组细胞Bcl-2关联X蛋白（Bax）/B淋巴细胞瘤-2（Bcl-2）；双荧光素酶报告实验分析Li-7细胞中LINC00313对miR-342-3p、miR-342-3p对ANXA2的靶向调控。建立皮下裸鼠异种移植瘤模型，验证LINC00313沉默对Li-7细胞体内生长的影响。结果 与人肝实质细胞比较，Li-7、HuH-7、Hep3B2.1-7细胞的LINC00313、ANXA2 mRNA及蛋白表达均明显升高，而miR-342-3p表达均明显降低（均P<0.05）。与对照组比较，LINC00313 siRNA组、miR-342-3p模拟物组细胞ANXA2 mRNA及蛋白表达、增殖率、集落生成率、侵袭细胞数目、vimentin蛋白表达均明显降低（P<0.05），miR-342-3p表达、凋亡率、E-cadherin蛋白表达、Bax/Bcl-2比值均明显升高（均P<0.05）；与LINC00313 siRNA组比较，共转染组细胞ANXA2 mRNA及蛋白表达、增殖率、集落生成率、侵袭细胞数目、vimentin蛋白表达均明显升高，而miR-342-3p表达、凋亡率、E-cadherin蛋白表达、Bax/Bcl-2比值均明显降低（均P<0.05）。Li-7细胞中，LINC00313可靶向下调miR-342-3p表达，miR-342-3p可靶向下调其ANXA2表达（均P<0.05）。体内实验结果显示，与无处理的Li-7细胞移植瘤比较，LINC00313敲低的Li-7细胞移植瘤的体积与质量均明显降低，肿瘤组织中LINC00313、ANXA2 mRNA及蛋白表达均明显降低，而miR-342-3p表达明显升高（均P<0.05）。结论 LINC00313在HCC细胞中的表达上调，LINC00313可能通过抑制miR-342-3p而增加后者靶基因ANXA2的表达，进而促进HCC细胞的恶性表型。     

长链非编码RNA PCAT19对胰腺癌细胞增殖与侵袭的影响及其作用机制

背景与目的 长链非编码RNA PCAT19（lncRNA PCAT19，简称PCAT19）在多种肿瘤中表达上调，且与恶性进展和不良预后密切相关。然而，PCAT19在胰腺癌中的表达、功能及作用机制尚无研究报道。笔者前期通过starBase数据库预测PCAT19可与miR-195-5p互补结合，因此，本研究探讨PCAT19在胰腺癌细胞中的表达与作用，及其与靶基因和相应miRNA的调控关系。方法 用qRT-PCR检测人胰腺导管上皮细胞系（HPNE）和胰腺癌细胞系（PANC-1、SW1990、HS766T、CFPAC-1）中PCAT19及miR-195-5p的表达。用双萤光素酶报告基因分析PCAT19与miR-195-5p的靶向结合作用。将PANC-1细胞分别转染PCAT19沉默序列si-PCAT19（si-PCAT19组）、阴性对照序列（si-NC组）、miR-195-5p抑制序列+si-PCAT19（共转染组）后，用MTT测定细胞增殖能力，Transwell测定细胞侵袭能力，Western blot检测Wnt/β-Catenin信号通路相关蛋白的表达。结果 各胰腺癌细胞系中PCAT19表达水平均明显高于HPNE细胞，而miR-195-5p的表达水平均明显低于HPNE细胞（均P<0.05）。双萤光素酶实验显示miR-195-5p是PCAT19的靶miRNA。与si-NC组PANC-1细胞比较，si-PCAT19组PANC-1中miR-195-5p表达水平明显升高，细胞增殖能力与侵袭能力明显降低，β-catenin、c-Myc和cyclin D1表达水平明显下调（均P<0.05），而共转染组以上各项指标与si-NC组差异均无统计学意义（均P>0.05）。结论 PCAT19在胰腺癌细胞中表达升高，其可促进胰腺癌细胞增殖和侵袭，机制可能与调控miR-195-5p并影响Wnt/β-Catenin信号通路有关。     

miR-204-5p/TNFRSF12A轴对甲状腺乳头状癌细胞侵袭能力的影响及机制

背景与目的 前期，笔者通过生物信息学分析和验证发现miR-204-5p在甲状腺乳头状癌（PTC）中呈低表达，并可能是PTC发生发展中的关键分子。因此，本研究进一步探讨miR-204-5p对PTC细胞侵袭能力的影响及机制。方法 采用Transwell实验检测miR-204-5p过表达和敲低对PTC细胞系TPC-1细胞的侵袭能力影响；通过miRDB网站预测miR-204-5p下游靶基因，并采用Western blot实验、Transwell实验、GEPIA数据库分析及双荧光素酶报告基因实验验证。结果 Transwell实验结果显示，过表达miR-204-5p的TPC-1细胞侵袭能力明显降低，而miR-204-5p抑制的TPC-1细胞侵袭能力明显增强（均P<0.05）。miRDB网站预测显示，TNFRSF12A可能为miR-204-5p下游靶基因；Western blot结果显示，过表达miR-204-5p的TPC-1细胞TNFRSF12A表达下调，而miR-204-5p抑制的TPC-1细胞TNFRSF12A表达上调；过表达TNFRSF12A的TPC-1细胞侵袭能力明显增强，TNFRSF12A抑制的TPC-1细胞的侵袭能力明显降低；TNFRSF12A可逆转miR-204-5p对TPC-1细胞侵袭能力的影响（均P<0.05）。GEPIA数据库分析显示，TNFRSF12A在PTC组织中高表达。双荧光素酶报告基因实验结果显示，TNFRSF12A是miR-204-5p的靶基因。结论 miR-204-5p可靶向结合TNFRSF12A mRNA的3''UTR抑制TNFRSF12A的表达，而PTC细胞中miR-204-5p表达下调，削弱了其对TNFRSF12A表达的抑制，从而导致PTC细胞侵袭能力增强。     

结直肠癌干细胞中miR-520c-3p的表达及其对丙酮酸代谢的调控机制研究

背景与目的 研究显示,丙酮酸代谢的改变在结直肠癌的发生发展中起重要作用,而结直肠癌干细胞中microRNA（miRNA）表达异常可能与丙酮酸代谢密切相关。笔者前期通过TCGA数据库分析发现,miR-520c-3p在结直肠癌中表达升高,且与预后相关。然而,miR-520c-3p是否参与了丙酮酸代谢尚不清楚。因此,本研究探讨结直肠癌干细胞中miR-520c-3p的表达与丙酮酸代谢的关系。方法 选择人结肠癌细胞株,并从中分离纯化结直肠癌干细胞。检测过表达或敲低miR-520c-3p后,结直肠癌干细胞及结直肠癌细胞增殖能力、丙酮酸氧化水平、乳酸产量的变化。用_D-［U-¹³C］葡萄糖孵育细胞,质量同位素分析追踪葡萄糖衍生碳的命运。通过miRNA序列分析和遗传学手段分析和鉴定miR-520c-3p的功能底物。结果 过表达miR-520c-3p后,结直肠癌干细胞的增殖能力明显增强、丙酮酸氧化水平明显下降、乳酸产量明显升高（均P<0.05）;用_D-（U-¹³C）葡萄糖培养后,未标记的柠檬酸盐（m+0）明显增加,而高阶柠檬酸盐标记（m+1、m+4和m+5）明显减少（均P<0.05）。在敲低miR-520c-3p后,结直肠癌干细胞的上述情况呈反向变化（均P<0.05）。过表达或敲低miR-520c-3p对结直肠癌细胞的上述指标均无明显影响（均P>0.05）。miR-520c-3p可以靶向线粒体丙酮酸载体1（MPC1）mRNA 3''UTR（P<0.05）。过表达miR-520c-3p后,结直肠癌干细胞中MPC1的mRNA与蛋白水平均明显下降,敲低miR-520c-3p后则相反（均P<0.05）。TCGA数据库分析结果显示,低表达MPC1的结直肠癌患者预后较差（P<0.05）。敲低MPC1后,结直肠癌干细胞的丙酮酸氧化水平明显降低、乳酸产量明显增高、增殖能力均明显增强（均P<0.05）;用_D-［U-¹³C］葡萄糖培养后,未标记的柠檬酸盐（m+0）在敲低MPC1的结直肠癌干细胞中明显增加,而高阶柠檬酸盐标记（m+1、m+4和m+5）明显减少（均P<0.05）。同时敲低miR-520c-3p和MPC1后,结直肠癌干细胞丙酮酸氧化水平、乳酸产量、增殖能力均无明显变化（均P>0.05）。结论 结直肠癌中miR-520c-3p的高表达与较差的预后相关,其机制可能是miR-520c-3p靶向MPC1调控结直肠癌干细胞中的丙酮酸代谢水平,促进了结直肠癌干细胞的增殖。     

MicroRNA-199a-3p在肾癌中的表达及作用

目的 检测microRNA-199a-3p(miR-199a-3p)在肾癌细胞株和组织中的表达情况并探究miR-199a-3p在肾癌细胞中的作用.方法 利用实时定量RT-PCR检测miR-199a-3p在肾癌细胞和组织中的表达水平;利用miR-199a-3p模拟物转染肾癌细胞786-0上调miR-199a-3p后,通过CCK-8、克隆形成、Transwell以及细胞周期检测来探究其在肾癌细胞中的作用.结果 miR-199a-3p在肾癌细胞中明显低表达,在78%(14/18)的肾癌组织中亦明显低表达;上调miR-199a-3p可显著抑制肾癌细胞的增殖、存活和侵袭并能诱导细胞周期G1期阻滞.结论 我们的研究显示在肾癌中miR-199a-3p明显低表达并参与肾癌的发生、发展,这表明miR-199a-3p具有作为肾癌诊断和治疗靶点的潜能.     

lncRNA MIR31HG和miR-101在分化型甲状腺癌组织中的表达及临床意义

背景与目的 研究表明长链非编码RNA（lncRNA）与微小RNA（miRNA）的表达异常以及两者的相互作用在恶性肿瘤的发生与发展中起了重要作用。本研究探讨分化型甲状腺癌患者癌组织lncRNA MIR31HG与miR-101的表达特点,以及两者表达与患者临床病理特征及预后的关系。方法 用qRT-PCR检测92例分化型甲状腺癌患者的癌组织及癌旁组织手术标本中lncRNA MIR31HG和miR-101表达水平,收集患者的临床资料与随访资料,分析两者表达与患者临床病理因素的关系,用Kaplan-Meier法分析患者生存率,采用Cox比例风险回归模型分析患者预后不良的影响因素。结果 分化型甲状腺癌组织中lncRNA MIR31HG相对表达量明显高于癌旁组织,而miR-101相对表达量明显低于癌旁组织（均P<0.01）。lncRNA MIR31HG和miR-101相对表达量均与患者的临床分期、分化程度、淋巴结转移明显有关（均P<0.05）。lncRNA MIR31HG高表达患者的累积生存率低于lncRNA MIR31HG低表达患者（84.7% vs. 94.6%,χ²=7.032,P=0.016）,miR-101低表达患者累积生存率低于miR-101高表达患者（78.3% vs. 95.6%,χ²=8.482,P=0.004）。临床分期Ⅲ~Ⅳ、分化程度高、癌组织lncRNA MIR31HG相对表达量>1.5和miR-101相对表达量<0.5是分化型甲状腺癌预后不良的危险因素（均P<0.05）。结论 分化型甲状腺癌组织中lncRNA MIR31HG表达上调与miR-101表达下调,是分化型甲状腺癌预后不良危险因素,两者可能成为分化型甲状腺癌预后不良标志物。     

磷酸丝氨酸磷酸化酶在肝细胞癌中的表达及其促进增殖和转移的作用机制

背景与目的 磷酸丝氨酸磷酸化酶（PSPH）在多种肿瘤中表达上调,发挥促进肿瘤生长和转移的作用,但其在肝细胞癌（HCC）中的作用尚未完全清楚。因此,本研究旨在探讨PSPH在HCC中的表达与作用及其作用机制。方法 分别用Western blot和qRT-PCR检测PSPH在HCC组织和癌旁组织中以及不同HCC细胞株（HepG2、Huh-7、HCCLM3）与正常肝细胞株（HL-7702）中的表达。HepG2细胞过表达或敲低PSPH后,分别用CCK-8、EdU染色、Transwell侵袭实验及Western blot法检测PSPH对HepG2细胞增殖、侵袭以及细胞增殖标记蛋白CCND1和Ki-67表达的变化;同时,用Western blot法检测自噬相关蛋白LC3-II/LC3-I、p62以及侵袭相关蛋白MMP-9的表达,用免疫荧光法检测p65蛋白入核情况。结果 与癌旁组织比较,HCC组织中PSPH蛋白的表达明显上调;与正常肝细胞比较,各HCC细胞株中的PSPH基因的表达明显升高（均P<0.05）。过表达PSPH后,HepG2细胞的增殖和侵袭能力明显增强,CCND1和Ki-67的表达明显上调,LC3-II/LC3-I表达上调而p62表达下调,p65蛋白核转位明显增加,MMP-9表达明显上调（均P<0.05）;敲低PSPH后,HepG2细胞的上述指标均呈相反变化（均P<0.05）。NF-κB通路抑制剂能抑制过表达PSPH对p65入核的促进作用和对MMP-9的上调作用,而NF-κB通路激动剂能逆转敲低shikonin对p65入核的抑制作用和对MMP-9的下调作用（均P<0.05）。结论 TNF-α在HCC中表达上调,PSPH高表达能增强HCC细胞增殖与转移能力,其作用机制可能涉及对自噬的抑制作用以及对NF-κB/MMP-9信号通路的活化作用。     

circRAD18/miR-516b/PDK1轴调节葡萄糖代谢重编程与结直肠癌增殖的关系

背景与目的 环状RNA circRAD18被发现在乳腺癌和甲状腺癌的进展中起了促进作用,但其在其他恶性肿瘤的表达及作用尚未被充分揭示。笔者前期通过生物信息学软件预测circRAD18可与miR-516b互补结合,而葡萄糖代谢关键调节酶丙酮酸脱氢酶激酶1（PDK1）可能是miR-516b的靶基因。因此,本研究初步探讨circRAD18在结直肠癌细胞中的表达及作用,及其对靶miRNA及下游靶基因的调控关系。方法 用qRT-PCR检测不同结直肠癌细胞系（SW480、SW620、HT-29）及正常结直肠上皮细胞（NCM460）中circRAD18的表达;用si-circRAD18沉默结直肠癌细胞中circRAD18的表达后,分别用CCK-8实验和相应的试剂盒检测细胞的增殖情况以及葡萄糖摄取量和乳酸产生量。用双荧光素酶报告基因实验与RNA免疫沉淀（RIP）实验分析circRAD18、miR-516b及PDK1之间的结合关系;最后,采用过表达/敲低实验进一步验证三者之间的关系。结果 与正常结直肠上皮细胞比较,circRAD18在各结直肠癌细胞系中的表达均明显上调（均P<0.05）;转染si-circRAD18后,结直肠癌细胞增殖能力、葡萄糖摄取及乳酸产生量均明显降低（均P<0.05）;双荧光素酶报告基因实验与RIP实验证实circRAD18可与miR-516b结合,而PDK1是miR-516b的下游靶基因。miR-516b模拟物及si-circRAD18的转染可明显抑制细胞葡萄糖摄取、乳酸产生及PDK1蛋白表达,且补充PDK1可逆转该抑制作用（均P<0.05）。结论 circRAD18在结直肠癌细胞中表达上调,并与结直肠癌细胞增殖能力的增强密切相关,作用机制可能与circRAD18通过海绵样吸附miR-516b后,上调PDK1表达,从而导致结直肠癌细胞葡萄糖代谢重编程有关。     

RUNX3在结直肠癌中的表达与作用及其与TGF-β/SMAD4信号通路的关系

背景与目的 转化生长因子β（TGF-β）/SMAD4信号传导通路在结直肠癌发生与发展中起了重要作用。runt相关转录因子3（RUNX3）在结直肠癌组织中的表达水平显著降低,且可能发挥抑癌作用。但RUNX3的作用与TGF-β/SMAD4通路的关系尚未见报道。因此,本研究旨在探讨RUNX3与SMAD4在结肠癌中的表达及作用,以及两者的关系。方法 收集98例结直肠癌组织和癌旁正常组织标本,分别用Western blot检测RUNX3和SMAD4蛋白的水平,qRT-PCR检测SMAD4 mRNA的水平,并分析两者表达的相关性。将人结直肠癌细胞SW480分别转染RUNX3过表达载体（RUNX3组）、SMAD4过表达载体（SMAD4组）、RUNX3+SMAD4过表达载体（RUNX3+SMAD4组）,以转染阴性对照质粒的SW480细胞为对照组,分别用Western blot与qRT-PCR检测各组细胞RUNX3与SMAD4表达的变化;用CCK-8实验与Transwell实验分析各组细胞的增殖与侵袭能力的差异。结果 结直肠癌组织中的RUNX3蛋白表达量明显低于癌旁正常组织,而SMAD4的mRNA与蛋白表达水平均明显高于癌旁正常组织（均P<0.05）;结直肠癌组织中RUNX3蛋白表达与SMAD4 mRNA和蛋白表达均呈负相关（r=0.511,P=0.004;r=0.487,P=0.009）。与对照组比较,RUNX3组的RUNX3蛋白水平均明显升高,但SMAD4 mRNA和蛋白水平明显降低（均P<0.05）;SMAD4组的RUNX3蛋白水平无明显变化（P>0.05）,但SMAD4 mRNA和蛋白的表达水平明显升高（均P<0.05）;RUNX3+SMAD4组的RUNX3蛋白水平均明显升高（P<0.05）,SMAD4 mRNA和蛋白水平变化不明显（均P>0.05）。RUNX3组细胞增殖与侵袭能力均明显低于对照组（均P<0.05）,SMAD4组的细胞增殖和侵袭能力均明显高于对照组（均P<0.05）,RUNX3+SMAD4组的细胞增殖和侵袭能力介于RUNX3组与SMAD4组之间,与对照组比较,差异无统计学意义（均P>0.05）。结论 RUNX3在结肠癌组织中表达降低,上调RUNX3的表达对结肠癌细胞的恶性生物学行为有抑制作用,其机制可能与抑制TGF-β/SMAD4通路的活性有关。     

miR-200a-3p在胆囊癌中的表达及其作用与机制

背景与目的:miR-200a-3p参与了多种肿瘤的生物学过程的调控,但在不同肿瘤中起着不同的作用(促癌基因或抑癌基因).目前,其在胆囊癌中的作用尚不清楚.因此,本研究探讨miR-200a-3p在胆囊癌中的表达及其对胆囊癌细胞生物学功能的影响与机制.方法:采用qRT-PCR法测定32例胆囊癌及癌旁组织、胆囊癌细胞系(GB...     

miR-181a-5p通过HOXB4抑制骨肉瘤细胞HOS增殖和迁移

目的：研究miR-181a-5p对HOS骨肉瘤细胞增殖、周期和迁移的影响及其机制。方法 ：采用实时定量PCR检测hFOB1.19成骨细胞和HOS、U2OS、MG63骨肉瘤细胞系中miR-181a-5p及HOXB4的表达情况。利用Lipofectamine 2000将miR-181a-5p mimics和miR-181a-5p inhibitor分别转染至人骨肉瘤HOS细胞中（分别为过表达组和抑制剂组）,并设置miR阴性对照组;CCK-8法检测各组细胞的增殖能力变化,流式细胞术检测各组细胞的细胞周期变化,划痕愈合实验以及Transwell迁移实验检测各组细胞的迁移能力变化。Targetscan网站预测miR-181a-5p的靶向基因,并通过双荧光素酶报告基因系统及Western blot验证靶向关系。结果：与成骨细胞hFOB1.19相比,miR-181a-5p在骨肉瘤细胞HOS、U2OS和MG63中低表达（P<0.05）,而HOXB4在骨肉瘤中高表达（P<0.05）。与阴性对照组相比,过表达miR-181a-5p抑制骨肉瘤HOS细胞的增殖和迁移能力,并且处于细胞周期S期的细胞...     

SIX4和miR-103a-3p在胆囊癌组织中的表达及其对胆囊癌细胞增殖和侵袭的影响

目的 探究SIX同源盒蛋白4(SIX4)、微小RNA(miR)-103a-3p在胆囊癌组织中的表达情况,以及二者对胆囊癌细胞增殖、侵袭的影响。方法 胆囊癌组织及癌旁组织取自永州市中心医院2019年10月至2021年9月32例接受手术治疗的胆囊癌患者,并将体外培养的胆囊癌细胞系GBC-SD分为对照组、mimic NC组、miR-103a-3p mimic组、miR-103a-3p mimic+pc DNA3.1组、miR-103a-3p mimic+SIX4组。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测SIX4 mRNA、miR-103a-3p水平;蛋白印迹法检测SIX4、增殖细胞核相关抗原Ki-67、增殖细胞核抗原(PCNA)以及基质金属蛋白酶(MMP)2、MMP9蛋白水平;CCK-8法检测细胞增殖情况;Transwell检测细胞侵袭情况。双荧光素酶验证SIX4 mRNA 3’UTR与miR-103a-3p的结合作用。结果 与癌旁组织相比,胆囊癌组织中SIX4 mRNA水平升高,miR-103a-3p水平降低(P<0.05)。miR-103a-3p靶向负调控SIX4。与对照组、mi...     

MicroRNA-106a-5p alleviated the resistance of cisplatin in lung cancer cells by targeting Jumonji domain containing 6

BackgroundCisplatin (DDP) is used for lung cancer therapy. MicroRNAs, small non-coding RNAs, may contribute to tumorigenesis as well as to drug resistance. We examined regulatory functions of miR-106a-5p in DDP-resistant lung cancer cells.MethodsDifferentially expressed miRNAs were provided by Gene Expression Omnibus (GEO) datasets and RT-qPCR examined RNA levels of miR-106a-5p and Jumonji domain-containing protein 6 (JMJD6), an enzyme causing lysine hydroxylation and arginine demethylation. Bindings were determined by luciferase reporter assay. Additionally, the half maximal inhibitory concentration (IC₅₀) of DDP was determined through Cell Counting Kit-8 (CCK-8) after treated by DDP (0, 6.25, 12.5, 25, 50 and 75 μM) and apoptosis rates were analyzed using flow cytometry. Besides that, migratory ability and invasiveness were examined by transwell. Western blot was for measuring protein levels of Bcl-2, Bax in apoptosis and E-cadherin, N-cadherin in epithelial-mesenchymal transition (EMT).ResultsThe IC₅₀ value of DDP-resistant A549 (A549/DDP) cells was higher, so were migration, invasion and N-cadherin in EMT while the apoptosis and E-cadherin in EMT were lower versus the parental A549 cells (no DDP resistance). MiR-106a-5p was low expressed in A549/DDP cells while its overexpression caused decreased migration, invasiveness and EMT but promoted apoptosis. JMJD6 was directly targeted and negatively regulated by miR-106a-5p. Inhibited JMJD6 decreased migratory ability, invasion and EMT but improved apoptosis. Moreover, knockdown of miR-106a-5p induced high level of JMJD6, migration, invasiveness and EMT but low apoptosis rates, which were restrained by JMJD6 suppression.ConclusionMiR-106a-5p/JMJD6 axis accelerated cell apoptosis and suppressed invasiveness, migration and EMT in A549/DDP cells.     

长链非编码RNA 909靶向调控miR-194-5p/DACH1轴对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响

背景与目的:长链非编码RNA 909(LINC00909)是一个新发现的长度约为2 kb的长链非编码RNA(lncRNA),在胶质瘤和白血病中被报道发挥癌基因的作用.然而LINC00909在胰腺癌中的作用鲜有报道.本研究旨探讨LINC00909在胰腺癌中的表达及其对患者预后的影响,以及LINC00909与其调控网络对胰...     

MiRNA-199a-3p in Plasma as a Potential Diagnostic Biomarker for Gastric Cancer

Background

MicroRNA (miRNA) has been shown the potential of cancer diagnosis. We investigated whether plasma miRNA expression could discriminate between patients with and without gastric cancer.

Methods

This study was divided into three steps: (1) miRNA microarray profiling on plasma samples from 20 gastric cancer patients and 20 healthy controls; (2) miRNA selection by real-time qRT-PCR on 30 pairs of plasma from patients and controls; and (3) qRT-PCR validation on an independent set of plasma from 180 gastric cancer patients, 80 healthy controls, and 20 patients with gastric precancerous diseases.

Results

Of the 959 human miRNAs analyzed by microarray, 37 up-regulated miRNAs and seven down-regulated miRNAs were found in gastric cancer plasma. Of the seven discrepant miRNAs validated on the plasma from 30 gastric cancer patients and 30 healthy controls, both miRNA-199a-3p and miRNA-151-5p were significantly elevated (p < 0.05) and were significantly reduced after surgery (p < 0.05) in gastric cancer patients. Further large-scale validation showed that these two miRNAs expressions in plasma were significantly higher in gastric cancer patients than healthy controls and patients with gastric precancerous diseases, respectively. However, only the expression of miRNA-199a-3p in plasma was significantly associated with tumor invasion and with lymph node metastasis and tumor, node, metastasis stage. This marker yielded an area under the receiver operating characteristic curve area of 0.837 with 80 % sensitivity and 74 % specificity in discriminating gastric cancer patients from healthy controls. In gastric cancer tissue, miRNA-199a-3p was expressed in the cytoplasm of tumor cells.

Conclusions

miRNA-199a-3p in plasma could be a novel potential diagnostic biomarker for gastric cancer detection.

     

Involvement of the insulin-like growth factor I receptor and its downstream antiapoptotic signaling pathway is revealed by dysregulated microRNAs in bladder carcinoma

ObjectiveUrothelial carcinoma is one of the most common pathological types of bladder cancer. Several studies have shown that dysregulated microRNAs (miRNAs) play an important role in bladder cancer progression. We performed the present miRNA microarray analysis in samples of urothelial carcinoma of the bladder and adjacent normal bladder tissue from Taiwanese patients to investigate dysregulated miRNAs.Materials and methodsTo detect dysregulated miRNAs in urothelial carcinoma of the bladder, samples of tumor and adjacent normal tissues were collected from 10 patients. Tissue samples from three patients were subjected to miRNA microarray analysis, and the remaining tissue samples from the other seven patients were used to validate the results obtained from the microarray data. Potential targets of these dysregulated miRNAs were identified using online databases, including MicroCosm and TargetScan.ResultsA panel of 30 differentially expressed miRNAs with at least fourfold differences in expression compared with normal controls, including 19 upregulated and 11 downregulated miRNAs, was generated. The expression levels of miR-30a-5p, miR-30a-3p, miR-99a, miR-130b, miR-133b, miR-135b, miR-145, miR-195, miR-204, and miR-214 were experimentally verified using real-time RT-PCR analysis. Using an online miRNA target database, we discovered that these dysregulated miRNAs potentially control components of the insulin-like growth factor 1 receptor (IGF1R) signaling pathway.ConclusionOur results indicate that dysregulated miRNAs may be involved in bladder cancer pathogenesis and are potential biomarkers.