PTPN22基因多态性与自身免疫性内分泌疾病

蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型22（PTPN22）基因位于染色体1p13．3-13．1,编码淋巴酪氨酸磷酸酶（LYP）。它通过与S忧酪氨酸激酶C端（Csk）相互作用,使已磷酸化的S忧家族Lck、Fyn和Zap-70激酶脱磷酸化,下调T细胞信号。另外,LYP还通过与Csk结合协同抑制T细胞信号,与转接分子——生长因子受体连接蛋白2（Grb2）相互作用,在T细胞信号中起负调节作用。研究发现,FTPN22基因C1858T位点错义突变,引起LYP蛋白620位密码子由精氨酸突变为色氨酸,与Csk亲和力明显降低,导致T细胞活性增强,可能诱发自身免疫性疾病。近来研究表明,该基因突变与1型糖尿病、Graves病和桥本甲状腺炎等多种自身免疫性内分泌疾病相关。     

IL-17基因多态性与新疆地区中老年人群骨性关节炎易感性的关系

目的探讨白细胞介素(IL)-17基因多态性与新疆地区中老年人群骨性关节炎易感性的关系。方法选取行全膝关节置换术的膝关节骨性关节炎患者400例为骨性关节炎组;另取年龄、性别相匹配的健康志愿者260例为健康对照组。采集两组受试者外周静脉血并提取DNA,采用等位基因聚合酶链反应-单链构型多态性(PCR-sscp)检测IL-17A G-289A基因rs3386824位点和IL-17F T-8599基因rs874891位点单核苷酸多态性,对组间有明显差异的基因型计算OR值和95%可信区间(CI)。结果 IL-17A G-289A(rs3386824)基因分布频率方面,骨性关节炎组与健康对照组之间差异有统计学意义(P0.01);其中各基因型OR值分析显示,携带G等位基因(G/A、G/G)的受试者骨性关节炎发生风险明显高于A/A基因型者。对基因频率在人群中分布情况进行H-W定律检验显示,骨性关节炎组基因遗传不平衡(P=0.000),健康对照组基因遗传平衡(P=0.358)。骨性关节炎组与健康对照组不同性别受试者的IL-17A G-289A基因多态性分布差异无统计学意义(P0.05)。低年龄组(≤65岁)中骨性关节炎组与健康对照组IL-17A G-289A基因型分布差异无统计学意义(P0.05);高年龄组中(65岁)骨性关节炎组与健康对照组基因型分布差异有统计学意义(P0.05);OR值分析显示,高年龄组人群携带IL-17A G-289A基因增加骨性关节炎发病率。IL-17F T-8599(rs874891)基因分布频率方面,骨性关节炎组各基因型及其等位基因分布频率与健康对照组之间差异均无统计学意义(P0.05)。结论新疆地区老年人群中,IL-17A G-289A多态性与骨性关节炎易感性相关,阳性位点rs3386824等位基因G/A、G/G是其高风险因素,A/A为低风险因素。     

KCNE1基因多态性与心房颤动易感性关系的Meta分析

目的 探讨心肌钾离子通道β亚单位（KCNE1）基因112 G＞A多态性与心房颤动（房颤）易感性的关系.方法 计算机检索PubMed、Embase、Web ofScience、Google学术、CBM、万方、维普、CNKI等中英文数据库,检索从建库开始至2013年6月,对相关资料进行Meta分析,计算优势比（OR）及其95％ CI.结果 共计纳入9个病例对照研究,包括1 792例房颤患者和1 924例健康对照者.Meta分析显示,KCNE1基因112 G＞A基因多态性与房颤易感性增加显著相关（等位基因模型：OR=0.74,95％ CI为0.67 ～0.82,P＜0.01;显性模型：OR=0.73,95％ CI为0.64 ～0.83,P＜0.01;隐性模型：OR =0.65,95％ CI为0.54 ～0.79,P＜0.01;纯合子模型：OR =0.57,95％ CI为0.46 ～0.70,P＜0.01）.结论 KCNE1基因112 G＞A多态性与房颤易感性增加可能存在相关性,可作为诊断房颤的重要生物标志物.     

XPA基因A23G多态性与食管癌易感性的Meta分析

目的:探讨人类着色素干皮病基因(xeroderma pigmentosum group A,XPA)A23G多态性与食管癌易感性的关系.方法:计算机检索Pub Med、EMBASE、The Cochrane Library、Web of Science、中国生物医学数据库、万方数据库、中国期刊全文数据库、中文科技期刊数据库多个数据库,收集XPA基因A23G多态性与食管癌易感性的病例-对照研究.根据纳入与排除标准筛选符合标准的文献,提取数据并进行质量评价,采用STATA12.1统计软件进行Meta分析.结果:符合入选标准的9个病例-对照研究,其中实验组食管癌患者2065例,对照组非肿瘤患者3552例.Meta分析结果显示:XPA基因A23G位点多态性的等位基因模型、显性基因模型、隐性基因模型及相加基因模型与食管癌罹患风险无相关性,分别为:(OR=1.0 1,9 5%CI:0.7 6-1.3 4)、(OR=0.8 7,9 5%CI:0.6 1-1.2 3)、(OR=0.9 7,95%CI:0.66-1.42)、(O R=1.12,95%CI:0.65-1.92),但共显性基因模型与罹患食管癌的风险增高有统计学相关性(OR=1.20,95%CI:1.07-1.35).根据种族进行亚组分析显示:亚洲人群共显性基因模型与罹患食管癌的风险增高有统计学相关性(OR=1.25,95%CI:1.10-1.44),其余基因模型无统计学意义,高加索人群食管癌易感性与各遗传基因模型均无统计学意义(P0.05).根据对照组纳入人群进行亚组分析显示:对照组来源人群的共显性基因模型与罹患食管癌的风险增高有统计学相关性(OR=1.26,95%CI:1.08-1.48),其余基因模型无统计学意义,对照组来源于医院的人群食管癌易感性与各遗传基因模型均无统计学意义(P0.05).结论:XPA A23G基因多态性的等位基因、显性基因模型、隐性基因模型、相加基因模型与食管癌易感性可能无相关性,共显性基因模型与食管癌易感性可能有相关性.     

IL-28B基因多态性与丙型肝炎易感性的关系

目的:探讨白介素-28B(interleukin-28B,IL-28B)单核苷酸多态性位点rs8099917与中国丙型肝炎易感性的关系.方法:采用TaqMan SNP基因分型的方法检测中国天津地区263名丙型肝炎患者和244名健康人IL-28B rs8099917基因型和等位基因分布情况,并统计分析rs8099917基因型和等位基因在2组中分布的差异.结果:在263名丙型肝炎患者中,TT基因型223人(84.8%),TG基因型39人(14.8%),GG基因型1人(0.4%).T等位基因频率为92.2%.244名健康对照者中,TT基因型222人(91.0%),TG21人(8.60%),GG1人(0.40%),T等位基因频率为95.3%.丙型肝炎患者和健康人群TG/GG基因型频率差异有统计学意义(OR=1.810,95%CI:1.042-3.145;P=0.033).丙型肝炎患者G等位基因频率也高于健康人(OR=1.709,95%CI:1.010-2.893;P=0.044).结论:中国人群IL-28B rs8099917基因多态性与丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)感染易感性相关联.G为HCV感染的风险等位基因.     

IL-8基因-251A/T多态性与急性胰腺炎遗传易感性的Meta分析

目的系统分析IL-8启动子-251A/T多态性(rs4073)与急性胰腺炎(acute pancreatitis,AP)遗传易感性的关系.方法按照统一的检索策略,检索Pub Med、EMASE、Web of Science、中国知网(CNKI)、万方数据库和V I P等数据库有关I L-8启动子-251A/T多态性与A P的相关文献,截止时间2017-06.按文献纳入和排除标准选择合格研究进行系统评价和Meta分析,包括等位基因遗传模式和基因型遗传模式(同质、异质、显性和隐性模式).结果共纳入8篇合格文献,病例组与对照组分别为1190例和1369例.Meta分析显示IL-8启动子-251A/T多态性T等位基因明显降低AP风险(OR=0.770,95%CI:0.686-0.865,P0.001);IL-8-251A/T多态性基因型与A P遗传易感性在四种遗传模式下均有统计学意义(同质:OR=0.543,95%CI:0.368-0.799,P0.001;异质:OR=0.755,95%CI:0.602-0.947,P=0.015;显性:OR=0.676,95%CI:0.547-0.835,P0.001;隐性:OR=0.738,95%CI:0.623-0.873,P0.001).结论 IL-8启动子-251A/T多态性可能是AP遗传易感性的保护因素.     

CDH1 C-160A基因多态性与胃癌易感性的Meta分析

目的:探讨CDH1 C-160A基因多态性与胃癌易感性的关系.方法:检索中国生物医学文献数据库、万方数据库、中国期刊网和PubMed,获取CDH1C-160A基因多态性与胃癌易感性的病例-对照研究.以胃癌组与对照组人群基因型分布的OR值为效应指标,采用固定或随机效应模型进行合并分析,并进行偏倚评估.应用STATA10.0软件进行统计学处理.结果:共纳入文献13篇,研究14项,累计胃癌病例3 144例,对照4 221例.与野生基因型CC相比,(CA+AA)合并的OR值(95%CI)为0.98(0.84-1.15).按人群进行分层分析,亚洲人群OR值为0.92(0.81-1.04),高加索人群OR值为1.21(0.88-1.67).结论:CDH1 C-160A基因多态性与胃癌易感性无关.     

EGF 61A/G基因多态性与结肠癌易感性的Meta分析

目的探讨表皮细胞生长因子(epidermal growth factor,EGF)基因61A/G多态性与结肠癌风险的相关性。方法计算机检索Pubmed、EMABSE、CJFD、CBM、CNKI、VIP及WanFang Data,检索时间截止至2013年2月28日,收集关于EGF 61A/G基因多态性与结肠癌易感性的病例-对照研究。由2位评价者按照纳入标准和排除标准独立选择文献、提取资料、评价质量,采用RevMan5.1和Stata 12.0软件进行Meta分析。结果共纳入5个病例-对照研究,839例患者和844例对照者。Meta分析结果显示,3个遗传模型中EGF基因61A/G多态性与结肠癌风险的相关性差异均有统计学意义[GG+AG vs AA:OR=1.43,95%CI:1.10~1.84;GG vs AG+AA:OR=1.67,67%CI:1.10~2.53;GG vs AA:OR=2.17,95%CI:1.54~3.06],而在AG vs AA遗传模型中,两者差异无统计学意义(OR=1.16,95%CI:0.89~1.53)。结论 EGF 61A/G基因多态性与结肠癌易感性相关,基因型GG和AG+GG可增加罹患结肠癌的风险。     

FGFR2基因多态性与乳腺癌易感性的Meta分析

目的综合分析中国汉族女性成纤维细胞生长因子受体2(fibroblast growth factor receptors2,FGFR2)基因rs2981582C/T、rs2981579C/T多态性与乳腺癌易感的相关性。方法电子检索Pubmed、CNKI等数据库中FGFR2基因多态性与乳腺癌易感性相关所有病例对照研究,进行meta分析,并对各研究数据进行统计处理及异质性检验,发表偏倚评估,合并OR值及95%置信区间。结果本文检索到符合要求的文献共12篇,10篇全文和2篇会议摘要,包括6126例病例和5329例正常对照,meta分析的结果表明rs2981582单核苷酸多态性中携带TT基因型的人群乳腺癌的患病风险增加30%(OR=1.30,95%Cl:1.14-1.48),携带CT基因型的人群乳腺癌的患病风险增加16%(OR=1.16,95%Cl:1.07-1.26),而携带CC基因型的人群患乳腺癌的风险却降低23%(OR=0.77,95%Cl:0.71-0.83);rs2981579单核苷酸多态性中携带TT基因型的人群乳腺癌的患病风险增加20%(OR=1.20,95%Cl:0.95-1.51),携带CT基因型的人群乳腺癌的患病风险降低7%(OR=0.93,95%Cl:0.77-1.13),而携带CC基因型的人群患乳腺癌的风险却降低13%(OR=0.87,95%Cl:0.71-1.08)。结论 FGFR2基因多态性中TT基因突变型可能是中国女性患乳腺癌的危险风险因子。     

T细胞调节基因CTLA-4与自身免疫性甲状腺疾病遗传易感性

自身免疫性甲状腺疾病(AITD)包括：Graves’病(GD)、桥本氏甲状腺炎(HT)、特发性黏液性水肿(IM)、产后无痛性甲状腺炎综合征(PPT)、甲状腺相关性眼病(TAO)、自身免疫性甲状腺功能减退(AIH)等。AITD是常见的自身免疫病，见于2％～4％的女性以及1％的男性。有研究表明，碘、雌激素、钠碘转运体等因素对AITD的发生均有影响。AITD的发生与遗传有着密切的关系，     

CYP17A1基因多态性与冠心病遗传易感性的研究

目的探讨CYP17A1(rs4409766,rs1004467)基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(冠心病)遗传易感性之间的关系。方法选取2014年6月~2016年2月于青岛大学附属医院心血管内科住院并行冠状动脉造影诊断为冠心病和非冠心病的患者为研究对象,应用实时荧光定量PCR(q RT-PCR)技术对冠心病患者88例(CHD组)和非冠心病患者89例(非CHD组),进行CYP17A1基因rs4409766,rs1004467的SNP分析,比较基因型频率及等位基因频率在2组间的分布。结果 CYP17A1基因rs4409766位点的基因型分布在CHD组和非CHD组之间无差别(P0.05),但是CC与CT+TT基因型分布比较两组间差异有统计学意义(P=0.038);rs1004467位点的基因型和等位基因分布在CHD组和非CHD组之间差异无统计学意义(P0.05)。结论 CYP17A1的rs4409766位点的基因多态性与冠心病的发生有关联。     

白介素-10基因多态性与肠易激综合征易感性关系的Meta分析

目的:评价白细胞介素-10(interleukin-10,IL-10)基因多态性与肠易激综合征(irritable bowel syndrome,IBS)遗传易感性的关系.方法:检索PubMed、EMBASE数据库、Cochrane图书馆(1966/2011-12)、中国学术期刊全文数据库(CNKI)、中国生物医学文献数据库(CBM)、万方数据库(1979/2011-12).应用RevMan5.0对各研究结果进行异质性检验和效应值合并.结果:8篇文献被纳入分析,其中涉及IL-10-592多态性的文献4篇、IL-10-819多态性的文献4篇、IL-10-1082多态性的文献7篇.-592位点A等位基因的OR值为1.26,95%CI:1.03-1.54,P=0.02;-592位点AA型基因的OR值为1.67,95%CI:0.71-3.93,P=0.24;-819位点T等位基因的OR值为1.24,95%CI:1.02-1.52,P=0.03;-819位点TT型基因的OR值为1.31,95%CI:0.59-2.91,P=0.50;-1082位点G等位基因的OR值为1.00,95%CI:0.86-1.17,P=0.98;-1082位点GG型基因的OR值为0.68,95%CI:0.51-0.92,P=0.01.分层分析显示:西方人种-1082位点GG型基因的OR值为0.71,95%CI:0.52-0.97,P=0.03;东方人种-1082位点GG型基因的OR值为0.42,95%CI:0.13-1.31,P=0.13.结论:西方人种-1082位点GG型基因与IBS遗传易感性相关,-592位点A等位基因和-819位点T等位基因可能会增加东方人种患IBS的危险性.     

血管紧张素转化酶基因多态性与结直肠癌易感性关系的Meta分析

目的探讨血管紧张素转化酶(angiotensin-converting enzyme,ACE)基因多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)易感性之间的关系。方法检索截至2017年4月各数据库发表的关于评价ACE基因多态性与CRC关系的研究,进行数据分析。结果有7篇文献符合纳入标准,共7 813例患者纳入研究,其中病例组908例,对照组6 905例。ACE基因的3种基因型包括:缺失纯合子型(DD型)、插入纯合子型(II型)、缺失与插入纯合子型(ID),隐性基因模型比值比(OR)为1.10(95%CI:0.91~1.33),差异无统计学意义(P=0.34)。显性基因模型OR为0.25(95%CI:0.08~0.81),差异有统计学意义(P=0.02)。结论在显性基因模型下,ACE基因对CRC的发生有抑制作用。     

雌激素受体基因多态性与肝细胞癌易感性的Meta分析

目的系统评价雌激素受体(estrogen receptor,ER)基因多态性与肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的关系.方法采用Coehrane系统评价方法,检索Conchrane Library、Pub Med,EMBASE及万方、维普、知网等数据库,筛选相关文献数据后,综合评价ER各基因型在HCC组与对照组中是否有差异.采用I~2对异质性进行定量分析,计数资料采用比值比(OR)及95%可信区间(95%CI)表示,应用Review Manager5.3软件包进行统计分析.结果共纳入7篇文献,累计样本量2343例;Meta分析结果表明,携带ERα的PvuⅡ及rs2077647基因多态性的三种基因型(T,TT,CC)与HCC有关,但各研究间存在明显异质性(P0.05),进行敏感性分析后,异质性明显减小(P0.05).携带ERα XbaI基因多态性的三种基因型(A、AA、GG)及ERβ AluI的两种基因型(G、GG)与HCC有关.ERβ AluI的隐性模型AA与HCC无关(P0.05).另两个位点(ERαrs1801132,ERβRsa I)基因多态性与HCC的相关性无统计学意义(P值分别为0.59及0.15).结论ERα的PvuⅡ、XbaI、rs2077647及ERβ的AluI位点基因多态性与HCC相关,ERαrs1801132和ERβRsaI基因多态性与HCC无关.     

SLC52A3基因多态性与鼻咽癌易感性的关系

目的探讨核黄素转运蛋白SLC52A3基因单核苷酸多态性(SNPs)与鼻咽癌易感性的关系。方法采用Haploview软件从国际人类基因组单体型图计划(Hap Map)公布的北京汉族人群基因型数据库中筛选出SLC52A3基因3个标签SNPs(rs13042395、rs3746803及rs3746804),收集147例鼻咽癌患者外周血标本并采用直接测序法进行基因分型,选取159例健康体检者的外周血作对比,采用Hardy-Weinberg平衡分析3个SNPs位点的遗传平衡情况,比较鼻咽癌患者与健康对照rs13042395、rs3746803及rs3746804基因型和等位基因的分布差异并计算比值比(OR)及其95%置信区间(CI)来评价以上SNPs与鼻咽癌易感性的关系,同时分析SLC52A3 SNPs与常见临床病理参数的关系。结果 147例鼻咽癌患者rs13042395、rs3746803及rs3746804基因型和等位基因的分布符合Hardy-Weinberg平衡。疾病组与对照组rs13042395基因型分布的差异无统计学意义(P>0.05),但疾病组等位基因C的比例高于对照组(P<0.05),其中以CC基因型为参照,TT及CT+TT基因型发生鼻咽癌的风险降低至0.522、0.575倍(P<0.05),T相对于C等位基因发生鼻咽癌的风险降低至0.719倍(P<0.05)。rs3746804分布上,疾病组TT基因型及等位基因T的比例均低于对照组,差异有统计学意义(P<0.05),其中以CC基因型为参照,CT、TT及CT+TT基因型发生鼻咽癌的风险降低至0.501、0.400和0.466倍(P<0.05);以C等位基因为参照,T发生鼻咽癌的风险降低至0.588倍(P<0.05)。rs3746803基因型及等位基因分布与鼻咽癌易感性无关。结论SLC52A3 rs13042395、rs3746804与鼻咽癌易感性及临床分期有关,其中携带等位基因T的鼻咽癌发生风险降低,在鼻咽癌早期筛查中有一定价值。     

甲状腺球蛋白基因与自身免疫性甲状腺疾病

甲状腺球蛋白在自身免疫性甲状腺疾病(AITD)的发生中起重要作用。近几年的连锁及相关分析发现,位于人类染色体8q24.2-q24.3区域的甲状腺球蛋白基因及其内部的微卫星标记不仅与AITD相连锁,还与其相关;同时,在动物及人体均发现甲状腺球蛋白基因的单核苷酸多态性与AITD具有相关性。因此认为,甲状腺球蛋白基因是AITD疾病相关抗原中第一个AITD易感基因。     

FcRL3基因多态性与自身免疫性甲状腺疾病相关

运用PCR-RFLP对506例Grayes病(GD)患者,80例桥本甲状腺炎(HT)患者和261名正常对照者的可结晶片段受体样因子3(FcRL3)基因外显子4进行多态性研究,结果提示FcRL3基因外显子4等位基因82G可能为重庆地区汉族GD男性患者的易感基因.