贵州三个主要民族人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性分析

目的：了解贵州汉族、苗族、布依族人群肿瘤坏死因子α（Tumour necrosis factor alpha,TNF-α）基因启动子区的基因多态性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和序列特异性引物-聚合酶链反应（SSP-PCR）方法,对贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率和单倍型及其组间差异。结果：贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,96%;A,4.0%）、-308（G,92%;A,8%）、-857（C,65.0%;T,35.0%）、-863（C,80.0%;A,20.0%）、-1031（T,48.0%;C,52.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占32.0%和28.0%;苗族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,85.0%;A,15.0%）、-308（G,94.0%;A,6.0%）、-857（C,74.0%;T,26.0%）、-863（C,96.0%;A,4.0%）、-1031（T,50.0%;C,50.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占50.0%和24.0%;布依族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,86.0%;A,14.0%）、-308（G,92.0%;A,8.0%）、-857（C,89.0%;T,11.0%）、-863（C,84.0%;A,16.0%）、-1031（T,50.0%;C,50.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC占54.0%,AA-GG-CC-CC-TC和GG-GG-CC-AA-TC各占12%。结论：贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料。     

中国汉族人群中TNF-α基因多态性与血脂关系的研究

目的研究肿瘤坏死因子-α(TNF-α)基因多态性与健康人群血脂谱改变的关系.方法随机选择182例湖北地区无血缘关系健康汉族人群,用聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测其TNF-α基因多态性,分析各基因型对血脂、脂蛋白、栽脂蛋白的影响.结果TNF-α-238位点基因型在中国正常人群中的分布仅与日本人群中的分布较为接近,TNF-α-863位点基因型的分布与日本人、高加索人中的分布差异无显著性.结论在汉族人群中存在TNF-α基因多态性,且与血脂水平无相关性(P＞0.05).     

中国汉族人群TNF-α基因启动子区的多态性研究

目的：研究中国汉族人群TNF-α基因启动子区的基因多态性。方法：采用PCR-SBT（PCR Sequencing Based Typing）方法进行TNF-α基因启动子区的多态检测。结果：采用PCR-SBT方法可以成功获得TNF-α基因启动子区的多态性结果并能够发现新的多态性位点；本次研究发现中国汉族人群TNF-α基因启动子区的多态性位点有：-1031、-863、-857、-572、-308、-238、-204和-163，其中-572和-204的多态性位点为首次报道；我国汉族人群该区域的核酸差异性为（11.00±0.46）×10-4，低于非洲人群；与Malawi人群相比，我国汉族人群-1031C、-308A、-238A出现频率较低，而-857T的频率却较高；与Gambian人群相比，-863A和-857T出现频率较高，-308A出现频率较低；我国汉族人群TNF-α基因启动子区的-1031C、-863A、-857T与-572C、-308A、-238、-204C、-163C有相关性。结论：采用PCR-SBT方法可以成功对TNF-α基因启动子区的基因多态性进行研究，我国汉族人群TNF-α基因启动子区的基因多态性可能存在独特的特点。     

TNF-α单核苷酸多态性与中国北方汉族人类风湿关节炎的相关性研究

目的:研究肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国北方汉族人类风湿性关节炎(RA)易感性的相关性。方法:选取98例RA和100例正常对照者作为研究对象,应用Sequenom飞行时间质谱技术,对TNF-α基因的SNP点rs1800629(-308 A/G)、rs361525(-238 A/G)、rs1799724(-850 C/T)和rs1800610(+489 C/T)进行基因分型,用SPSS 11.5软件对数据资料进行统计分析。结果:RA患者TNF-α多态性位点rs1799724、rs1800610和rs361525的基因型频率及等位基因频率与正常对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),而TNF-αrs1800629的基因型频率及等位基因频率与正常对照组比较有明显的统计学差异(P<0.05)。TNF-αrs1800629 G等位基因及GG基因型可以提高RA的发病风险性。结论:NF-α基因SNP位点rs1800629可能与北方汉族人RA发病易感性相关。     

TNF-α基因单核苷酸多态性与肺炎的相关性研究

目的： 以中国南方汉族人群为研究对象，探讨肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)基因启动子区单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)与肺炎易感性以及肺炎严重程度的相关性。方法: 以67例肺炎患者和50例健康人群为研究对象，应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对TNF-α基因启动子区5个位点(-1 031、-863、-857、-308、-238)进行基因分型，用SPSS统计软件分析各多态性位点与肺炎严重程度的相关性。结果: TNF-α基因启动子区总突变频率在肺炎患者中高于健康体检者(56.7%，38.0%，P<0.05)，-863A在重症肺炎患者与非重症肺炎患者中出现频率分别为〖JP2〗44.4%与15.5%，P<0.05；-308A在重症肺炎患者与非重症肺炎患者中出现频率分别为44.4%与12.1%，P<0.05，〖JP〗在死亡与存活病例中的频率分别为75.0%与12.7%，P<0.01。结论: TNF-α基因启动子区多态性可能是肺炎易感以及肺炎进展为重症肺炎、增加重症肺炎患者死亡率的因素。     

TNF-α基因多态性在中国人群中的分布及其与冠心病相关性的研究进展

除单核巨噬细胞可以分泌肿瘤坏死因子α（TNF-α）外,心肌细胞也可以合成并分泌TNF—α,当心肌缺血时可诱导心肌细胞表达TNF—α增强。TNF-α可以直接或间接损伤血管内皮细胞,产生促炎症、促凝血、抗纤溶反应,提示其参与冠心病的发生发展过程。TNF-α基因启动子区的多态性位点影响TNF—α基因的表达,TNF—α基因在不同种族和不同地区人群间的多态性分布使冠心病在不同种族、不同地区间具有不同的发病率和临床特点。     

内蒙古包头地区汉族人群TNF-α-308位点基因多态性与IgA肾病的相关性研究

目的：了解内蒙古包头地区汉族人群IgA肾病患者肿瘤坏死因子α（TNF-α）-308位点基因型的分布特点。方法：应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术检测97例IgA肾病患者和73例正常人的TNF-α基因型。结果：IgA肾病患者组中TNF-α基因G/A多态GG、GA、AA基因型频率分别为85.6%、11.3%和3.1%,其中G和A等位基因频率分别为91.2%和8.8%。正常对照组中,TNF-α基因G/A多态GG、GA、AA基因型频率分别为91.8%、5.5%和2.7%,其中G和A等位基因频率分别为94.5%和5.5%。IgA肾病患者组与正常对照组比较,基因型频率差异有显著性（χ^2=27.2,P〈0.05）,等位基因频率之间差异无显著性（χ^2=0.659,P〉0.05）。结论：TNF-α-308位点基因多态性与内蒙古包头地区汉族人群IgA肾病的发病有相关性,等位基因频率之间差异无显著性（χ^2=0.659,P〉0.05）。     

卵巢早衰患者血清TNF-α、TGF-β1水平及TNF-α基因308G/A位点多态性分析

为了解卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)患者TNF-α基因308G/A位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)的分布特征及其与TNF-α、TGF-β1水平之间的相关性,选取2017年4月-2019年5月来深圳龙华区人民医院妇产中心就...     

中国汉族人群中肿瘤坏死因子-α-238位点基因多态性与血糖、血脂关系的研究

目的 :了解肿瘤坏死因子 α(tumornecrosisfactor alpha,TNF α)启动子上游 -2 3 8位点基因多态性在中国汉族正常人群中的分布及其与血糖、血脂间的关系。方法 :应用聚合酶链反应 (PCR)和限制性片段长度多态性 (RFLP)方法对 182例正常个体基因组DNA中TNF α -2 3 8位点基因多态性进行了观察 ,同时检测血糖、血脂 ,探讨其与基因型间的关系。结果 :正常汉族人群中TNF α -2 3 8位点基因型以GG型发生频率最高 ( 96.7% ) ,GA型较少 ( 3 .3 % )。这种分布特点在正常男女间差异不显著 ,且基因型间血糖、血脂水平比较差异无显著性 (P >0 .0 5 )。与其它种族相比较 ,TNF α -2 3 8位点基因型在中国正常人群中的分布与日本人群中的分布较为接近 ,而与西班牙、西非、荷兰、意大利等人群中的分布差异显著。结论 :TNF α -2 3 8位点基因多态性与血糖、血脂水平无相关性 ,但不同种族间分布存在着一定的差异 ,这种差异有可能是导致一些疾病在不同种族间发病率和临床表现存在不同的因素之一     

TNF-α-238G/A基因多态性与原发性肝癌的关系

目的 探讨肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因启动子-238G/A多态性与原发性肝癌（PHC）的相关关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法（PCR-RFLP）检测100例PHC患者和150例健康对照者TNF-α基因启动子-238G/A多态性.结果 TNF-α-238基因型GG、GA频率在PHC组和对照组分别为95.3%和4.7%,88%和12%;等位基因G、A频率在PHC组和对照组分别为97.7%和4.7%,94%和6%.两组差异均有显著性（P＜0.05）,携带GA基因型个体患PHC的风险约是GG基因型的2.786倍（OR=2.786,95%CI=1.057～7.343）.结论 TNF-α-238G/A基因多态性与PHC的发病有相关性,A等位基因可能是PHC的遗传易感基因.     

TNFA基因启动子区多态性与HBV感染结局的关联研究

目的 在中国汉族人群中探讨TNFA基因启动子区单核苷酸多态性是否与HBV感染结局相关联。方法 以148例HBV自限性感染者和207例慢性乙肝患者为研究对象，应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和序列特异性引物-PCR方法对TNFA基因启动子区5个位点，-238G／A、-308G／A、-857C／T、-863C／A和-1031T／C进行基因型分型，用EPI和EH等统计学软件分析各位点等位基因、基因型、单倍型频率及其组问差异。结果 TNFA基因-238位GG基因型在慢性肝炎组的频率显著高于自限性感染组（P=0．02），-857TT基因型的频率在慢性肝炎组显著低于自限性感染组（P=0.02）。TNFA基因-238／-308／-857／-863／-1031组成的单倍型GGCCT的频率在慢性肝炎组显著低于自限性感染组（P=0．03），单倍型GGcAT与GGTAT在慢性肝炎组的频率显著高于自限性感染组（P=0．0001，P=0．004）。结论 TNFA基因启动子区多态性与HBV感染结局显著关联。     

内蒙古汉族IgA肾病患者TNF-β基因多态性研究

目的:探讨内蒙古地区汉族人群中IgA肾病(IgA nephropathy, IgAN)与肿瘤坏死因子-β(tumor necrosis factor beta, TNF-β)1069位点等位基因多态性的关系.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction with restriction fragment length poly-morphisms, PCR-RFLP)技术对内蒙古地区汉族107例IgA肾病患者及内蒙古地区汉族105例正常人的TNF-β基因的单碱基突变多态性进行分析.结果:IgA肾病患者的TNF-β*2等位基因频率(67.8%)较正常人(53.8%)明显升高(P＜0.01).结论:TNF-β*2等位基因可能为内蒙古汉族IgA肾病的易感基因.     

湖北地区汉族人群TNF基因多态性分布研究

目的 :了解TNF α和TNF β基因多态性在湖北地区汉族人群中的分布特点。方法 :应用聚合酶链反应限制性片段长度多态性法(PCR RFLP)检测 2 1 5例正常汉族人TNF α和TNF β基因型并与其它种族和地区的分布进行比较。结果 :TNF α基因型以TNF α1 /1型最为多见(8 7.0 % ) ,而TNF β基因型以TNF β1 / 2型出现频率最高 ( 5 0 .7% )。二种基因多态性分布在男女间均无显著差异 (P >0 .0 5 )。与其它种族和地区比较 ,发现不同种族和不同地区间TNF α和TNF β基因型分布及等位基因频率均存在显著差异 (P <0 .0 5 )。结论 :在湖北地区汉族人群中存在TNF基因多态性 ,但在不同种族和不同地区间分布有明显的差异 ,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族、不同地区间的发生、转归和预后不同的遗传因素之一。     

SLE患者TNF-β基因多态性分析

系统性红斑狼疮（SEE）是一种累及多系统、具有多种自身抗体的自身免疫性疾病,遗传因素在SLE发病机制中起重要作用。肿瘤坏死因子（TNn是具有多种生物学功能的细胞因子,体内外实验证实,TNF水平与SLE的活性指标密切相关。鉴于TNF基因的特殊位置及TNF的重要生物学活性,TNF的基因多态性与SLE的发病、病程及预后之间的关系已引起普遍关注。我们早期研究发现．TNF—α基因多态性与SLE发病相关,为探讨TNF-β基因的多态性与SLE的关系．     

中国北方汉族人群TNF-α、VDR基因间交互作用与HBV感染结局相关

目的 探讨肿瘤坏死因子α(TNF-α)和维生紊D受体(VDR)基因多态位点交互作用与2型肝炎病毒(HBV)感染慢性化的关系.方法 391例慢性乙型肝炎(CHB)患者为病例组和212例乙型肝炎病毒自限性感染者为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测TNF-α基因启动子区-238G/A、-857C/T、-863C/A、VDR-TaqⅠT/C和FokⅠC/T位点的基因型,采用相乘模型分析基因-基因问的交互作用.结果 TNF-α-238 GA与VDR-FokⅠCT/CC(ORint=4.04)、TNF-α-863 CC与-857CC(ORint=1.26)、VDR-FokⅠCT/CC与TNF-α-857CC的基因间(ORint=1.37)均为正交互作用,增加HBV感染发展为慢性乙型肝炎的风险;TNF-α-238 GA与-857 CC(ORint=0.92)、VDR-FokⅠCT/CC与TNF-α-863 CC基因间(ORint=0.95)为负交互作用,降低HBV感染发展为慢性乙型肝炎的风险.结论 TNF-α和VDR基因间交互作用可能影响HBV感染结局.     

检测HBV和HCV重叠感染患者血清中TNF-α及IFN-γ水平的意义

有研究表明,在HBV感染的患者中,约有10%以上的患者重叠HCV感染.重叠感染者的病情不论从肝脏组织学损伤还是临床表现上都较单纯感染者为重,且易发展为进行性肝功能衰竭,但发病机制目前尚未完全阐明.本实验通过检测HBV和HCV重叠感染患者血清TNF-α及IFN-γ水平,探讨这两种细胞因子与HBV和HCV重叠感染的关系,为临床免疫治疗及预后判断提供理论依据.     

湖北地区汉族人群TNF-β804C/A多态性研究

目的了解中国湖北地区汉族人群肿瘤坏死因子-β(TNF-β)基因第三外显子804位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)分布,并与其它种族进行比较.方法收集湖北地区257名无血缘关系健康个体的静脉血,提取DNA,应用套式PCR(nested PCR)和等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR),对TNF-β基因804C/A多态性进行分析,并与其它种族的分布进行比较.结果 TNF-β检测到3种基因型,基因型频率分别为CC型37.2%,CA型45.6%,AA型17.2%,基因型分布符合Hardy-Weinberg定律.统计分析显示湖北地区汉族人群TNF-β基因型分布与欧洲白种人及日本人有显著性差异(P<0.05),等位基因频率与欧洲白种人有显著性差异(P<0.05)而与日本人则无显著性差异(P>0.05).结论湖北地区汉族人群中存在TNF-β基因多态性,其突变率较高,与其它种族比较分布有明显的差异,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族间的表现有所不同的遗传因素之一.     

EZH2基因单核苷酸多态性对中国汉族人群散发性胃癌易感性的影响

目的 研究EZH2基因单核苷酸多态性与汉族人群散发性胃癌易感性关系以及胃癌临床病理特征与EZH2蛋白表达的关系.方法 采用基因测序仪对安徽地区311例胃癌患者及425例正常对照组血样EZH2 rs734004、rs734005、rs2072407、rs6464926和rs12670401多态性测序,用组织芯片技术和免疫组化检测238例同一来源胃癌组织和30例正常胃黏膜EZH2蛋白表达.结果 EZH2 rs12670401基因型CC以及rs6464926基因型TT在胃癌患者中比例较高,可增加胃癌发生风险(P=0.007,aOR=1.786,95% CI=1.172～2.723;P=0.013,aOR=1.721,95% CI=1.123～2.638).胃癌患者中EZH2杂合基因型rs2072407TC、rs734005TC、rs734004CG比例低于对照组,可降低胃癌发生风险.(P=0.034,aOR=0.712,95% CI=0.520～0.975;P=0.033,aOR=0.709,95% CI=0.518～0.972;P=0.035,aOR=0.711,95% CI=0.518～0.976).连锁不平衡分析LD进一步证实上述观察.胃癌不同组织学类型间以及不同临床参数间EZH2免疫组化染色强度差异无显著性.结论 EZH2基因单核苷酸多态性与中国汉民族人群散发性胃癌易感性相关.     

慢性乙肝患者HBV核心基因一组单核苷酸多态性与血清HBV DNA水平的相关性研究

目的 研究慢性乙肝患者HBV核心基因的单核苷酸多态性(SNP)与血清HBV DNA水平的相关关系.方法 采用PCR-RFLP和限制性内切酶Tsp509I榆测HBV核心基因的SNP,采用双脱氧终止法对核心基因进行序列测定,实时荧光PCR技术用于HBVDNA水平的定量检测.结果 慢性乙肝人群中发现5种典型的PCR-RFLP图谱,分别是RFLP-C、RFLP-D、RFLP-E、RFLP-G和RFLP-C/G,各种RFLP图谱的分布频率依次为61.5%、2.6%、9.6%、16.7%和9.6%.A165T、A336C、A336T、T337C和T385C等5种SNP与RFLP图谱的变化有关,但是只有SNP A336C和A336T会导致HBcAg第83位的Glu被Asp所替代.RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.02)和RFLP-C/G组(P=0 006),而且RFLP-C/G组患者血清ALT的阳性率显著低于RFLP-C、RFLP-E和RFLP-G组;当HBeAg阳性时,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组(P=0.015)和RFLP-C/G组(P=0.008).结论 本研究中使用的PCR-RFLP能够用于检测核心基因的SNP,RFLP-C组患者的血清HBV DNA水平显著高于RFLP-G组和RFLP-C/G组,可能与Glu83 Asp突变有关.

Abstract：

Objective To investigate the relation between a set of single nucleotide polymorphisms (SNP) in core gene of HBV in chronic hepatitis B patients and HBV DNA levels. Methods PCR restriction fragment length polymorphism(PCR-RFLP) assay and restriction enzyme Tsp509I were adopted to determine HBV SNP in HBV core gene. Nucleotide sequences of core gene were determined using the dideoxy chain termination method. HBV DNA levels were quantitated with real-time PCR. Results Five typical RFLP patterns, RFLP-C, RFLP-D, RFLP-E, RFLP-G and RFLP-C/G mixture were found and the distribution of HBV RFLP patterns was as follows: C, 61. 5% ; D, 2. 6% ; E, 9.6%; G, 16.7%; C/G mixture, 9.6%. Five SNPs, A165T, A336C, A336T, T337C and T385C, were found to be associated with RFLP patterns change and only SNP A336C or A336T caused the substitution of Glu-83 with Asp in HBcAg. The serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P =0. 02) and RFLP-C/G group(P = 0. 006) , respectively, furthermore, the positive rate of serum ALT in RFLP-C/G group was lower than that in RFLP-C, RFLP-E and RFLP-G group, respectively. Under the condition of HBeAg-positive, the serum HBV DNA levels in RFLP-C group were higher than that in RFLP-G (P = 0. 015) and RFLP-C/G group(P =0.008) , respectively. Conclusion PCR-RFLP used in this study can be adopted to determine HBV SNPs, not genotypes in Chinese patients with chronic hepatitis B. The serum HBV DNA level in RFLP-C group higher than that in RFLP-G or RFLP-C/G group maybe associated with amino acid mutation, Glu83 Asp.