HLA-DRB1基因多态性与新疆汉族人群结核病易感性的研究

目的 探讨HLA-DRB1基因的多态性与新疆汉族人群结核病发生发展的关联.方法 采用PCR-SSP技术对228例新疆塔城地区和石河子地区的汉族肺结核患者及231例汉族健康志愿者的HLA-DRB1的13个等位基因分型,比较各等位基因的频率(GF),统计学分析采用χ2检验,研究不同等位基因与新疆汉族人群结核病易感性的关联.结果 结核病例组HLA-DRB1*12基因频率为9.92%,明显高于对照组的2.85%,两者差异有统计学意义(χ2=18.76,Pc＜0.01);而结核病例组中的HLADRB1*11等位基因的基因频率低于健康对照组(χ2=9.513,Pc＜0.05),差异有统计学意义.结论 HLA-DRB1*12基因可能是新疆汉族人群的结核病易感基因,HLA-DRB1*11可能是新疆汉族人群与结核病相关的保护性基因.     

浙江汉族人群HLA-DPA1和-DPB1基因多态性分析

目的 检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因及单倍型频率.方法 应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA-DPA1和HLADPB1等位基因分析.结果 在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19个HLA-DPB1等位基因.HLA-DPA1等位基因频率较高的依次为DPA1*020202(47.0%)、DPA1*010301(38.5%)和DPA1*020101(10.5%).HLA-DPB1等位基因中,频率较高的依次为DPB1*0501(39.5%)、DPB1*020102(13.5%)和DPB1*040101(13.0%).连锁分析发现共有44个HLA-DPA1-DPB1单倍型,单倍型频率最高为DPA1*020202-DPB1*0501(29.5%).结论 浙江地区汉族人群HLA-DPA1和DPB1基因座等位基因具有丰富的多态性,2个基因座呈现连锁不平衡.     

浙江汉族人群HLA-DPA1和-DPB1基因多态性分析

目的 检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因及单倍型频率.方法 应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA-DPA1和HLADPB1等位基因分析.结果 在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19个HLA-DPB1等位基因.HLA-DPA1等位基因频率较高的依次为DPA1*020202(47.0%)、DPA1*010301(38.5%)和DPA1*020101(10.5%).HLA-DPB1等位基因中,频率较高的依次为DPB1*0501(39.5%)、DPB1*020102(13.5%)和DPB1*040101(13.0%).连锁分析发现共有44个HLA-DPA1-DPB1单倍型,单倍型频率最高为DPA1*020202-DPB1*0501(29.5%).结论 浙江地区汉族人群HLA-DPA1和DPB1基因座等位基因具有丰富的多态性,2个基因座呈现连锁不平衡.     

浙江汉族人群HLA-DPA1和-DPB1基因多态性分析

目的 检测浙江地区汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1等位基因及单倍型频率.方法 应用PCR-直接测序分型法对100名健康、无血缘关系的浙江汉族人外周血标本进行HLA-DPA1和HLADPB1等位基因分析.结果 在100份标本中检出8个HLA-DPA1等位基因和19个HLA-DPB1等位基因.HLA-DPA1等位基因频率较高的依次为DPA1*020202(47.0%)、DPA1*010301(38.5%)和DPA1*020101(10.5%).HLA-DPB1等位基因中,频率较高的依次为DPB1*0501(39.5%)、DPB1*020102(13.5%)和DPB1*040101(13.0%).连锁分析发现共有44个HLA-DPA1-DPB1单倍型,单倍型频率最高为DPA1*020202-DPB1*0501(29.5%).结论 浙江地区汉族人群HLA-DPA1和DPB1基因座等位基因具有丰富的多态性,2个基因座呈现连锁不平衡.     

HLA-DQB1基因多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性的相关性研究

目的:探讨人类白细胞抗原(HLA)-DQB1基因多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性的关联.方法:采用病例一对照的研究方法,应用聚合酶链反应一序列特异性引物(PCR-SSP)技术对226例新疆维吾尔族肺结核病患者(肺结核病例组)和231例新疆维吾尔族健康对照者(健康对照组)进行HLA-DQB1基因分型,比较其等位基因频率(GF),并计算其比值比(OR).结果:肺结核病例组中HLA-DQB1*0201基因频率显著高于健康对照组,两组的GF分别为40.13%、19.15%,差异有统计学意义(P<0.05);肺结核病例组中HLA-DQB1*0301/4基因频率显著低于健康对照组,两组的GF分别为6.16%、10.27%,但P值经过校正后无显著性差异(P0.05).结论:HLA-DQB1*0201等位基因与新疆维吾尔族人群结核病强相关,DQB1*0201可能是其易感基因.     

山西汉族原发性干燥综合征与HLA-DQ基因多态性相关性的研究

目的:探讨山西汉族人群原发性干燥综合征(pSS)与HLA-DQ等位基因的相关性,从基因水平上探索pSS的发病机制。方法:应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)法对pSS患者与健康对照进行HLA-DQA1、HLA-DQB1基因的分型;采用χ2检验和Fisher’s精确检验比较两组各等位基因频率的差异。结果:(1)在100例山西汉族健康人及pSS患者中,HLA-DQA1*0501基因频率分别为12.0%和22.0%。与健康对照相比较,pSS患者中HLA-DQA1*0501基因频率显著增高(χ2=7.087,P<0.05,RR=2.068)。(2)pSS患者HLA-DQA1*0301/2等位基因频率为13.0%,显著低于健康对照组的24.5%(χ2=8.681,P<0.05,RR=0.460)。(3)pSS患者中HLA-DQB1*0201基因频率为28.5%,显著高于健康人的18.5%(χ2=5.563,P<0.05,RR=1.756)。结论:HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*0201等位基因可能是山西汉族pSS的易感基因,而HLA-DQA1*0301/2等位基因可能是其保护基因。     

新疆汉族HLA-DRB1基因多态性与再生障碍性贫血的相关性

目的探讨人类白细胞抗原(HLA)DRB1与再生障碍性贫血(AA)的相关性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)DNA分型技术对43例新疆汉族AA患者(AA病例组)和200例新疆汉族人群作为健康对照者(健康对照组)进行HLA-DRB1基因分型,研究HLA-DRB1基因多态性与新疆汉族AA患者的相关性。结果 AA病例组和健康对照组的等位基因频率有相同之处,均表现为DRB1*15表达最高,同时DRB1*4、DRB1*7、DRB1*9、DRB1*12表达均较高,频率最低的均为DRB1*17;AA病例组中DRB1*8等位基因频率(13.73%)显著高于对照组(6.99%),差异有统计学意义(OR=2.202,P0.05);AA病例组DRB1*12、DRB1*14等位基因频率低于对照组,差异无统计学意义。其中AA病例组女性等位基因DRB1*12(5.41%vs 10.00%,OR=0.2079,P0.05)和AA病例组男性DRB1*14等位基因频率(2.11%)显著低于对照组(7.53%),差异有统计学意义(OR=0.1403,P0.05);AA病例组女性DRB1*15等位基因频率(27.45%)显著高于对照组(14.56%),差异有统计学意义(OR=2.433,P0.05)。结论 DRB1*08可能是AA患者的易感基因;DRB1*12可能是女性AA患者拮抗基因;DRB1*14可能是男性AA患者的拮抗基因;DRB1*15可能是女性AA患者的易感基因。     

HLA-DQA1、-DQB1基因多态性与高原红细胞增多症的相关性研究

目的:探讨移居高原汉族男性人群HLA-DQA1、-DQB1基因多态性是否与其发生高原红细胞增多症(HAPC)的易感性相关联.方法:以60例移居高海拔地区男性HAPC患者和印例移居同地区健康男性为研究对象,应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)技术进行HLA-DQA1、-DQB1基因分型,并使用SPSS软件分析HLA-DQA1、-DQB1多态性的分布频率及其组问差异.结果:移居高海拔地区的HAPC患者组的HIA-DQA1*0401和*050 1分布频率分别为0.125 0和0.258 3;而同地区健康对照组HLA-DOA1*0401和*0501分布频率分别为0.041 7和0.158 3.与对照组相比,HAPC组HLA-DQA1*0401相对危险性为3.67,校正P值<0.05;*050l危险性为2.31,校正P值<0.05.而HAPC组和对照组在DQA1*0101/0104、DQA1*0103、DQB1*0201、DQB1*0601等位基因未显示显著性差异.结论:HLA-DQA1*0401、*0501位点町能与HAPC的易感性关联.     

湖南汉族人群HLA-DP、-DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性

目的 探讨湖南汉族人群HLA—DP、HLA—DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间的关系。方法 应用聚合酶链反应—特异性寡核苷酸探针基因分型技术对87例湖南汉族鼻咽癌患者与91名健康对照作HLA—DPAl、—DPBl、—DQAl及—DQBl的基因分型，采用x^2检验比较两组各位点等位基因频率，单倍型频率分布的差异。结果 发现鼻咽癌组DPAl*0201、DPBl*1901、DQAl*0201较对照组明显降低，DPBl*0402、DQAl*0101较对照组明显升高；单倍型DPAl*0201—DPBl*1401及DQAl*0201—DQBl*0201较对照明显降低；但P值经Bonferroni校正后，差异均无显著性(Pc＞0．05)。结论 湖南汉族人群HLA—DP和—DQ位点与鼻咽癌无明显相关，与以往用受累同胞对方法在鼻咽癌家系中未能证实鼻咽癌易感基因与HLA—DP和—DQ位点连锁的结果一致。     

人类白细胞抗原HLA-DPA1和HLA-DPB1基因高通量测序分型的研究

目的 建立可靠的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因HLA-DPA1和HLA-DPB1同步测序分型方法,研究南方汉族人群HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的多态性.方法 根据HLA-DPA1和HLA-DPBI等位基因的全长序列,分别采用位点特异性引物扩增HLA-DPA1和HLA-DPBI目的基因片段,涵盖完整的第2外显子.PCR产物经磁珠纯化,用自行设计的测序引物及优化的测序反应体系对HLA-DPA1和HLA-DPB1第2外显子进行双向测序.纯化的测序反应产物经ABI 3730测序仪测序,用Assign 3.5 SBT软件分析结果.结果 PCR扩增获得了清晰的HLA-DPA1和HLA-DPB1基因目的片段,对HLA-DPA1和HLA-DPB1基因的第2外显子进行的双向测序结果中,序列无背景信号和杂峰.在176名南方汉族健康无关个体中,共检出了4种HLA-DPA1等位基因,其频率分布依次为:DPAI* 02:02(0.589)＞DPAl* 01:03(0.284)＞ DPAI* 02:01(0.096)＞ DPAl* 04:01(0.031).HLA-DPB1检出了14种等位基因,其中频率大于5％的4种等位基因为:DPBl* 05:01、DPBl* 02:01、DPBl* 04:01和DPBl* 02:02,频率介于1％～5％的7种,其余3种等位基因的频率均为1％以下.HLA-DPB1测序分型的结果与用AtriaAlleleSEQR商品化测序分型试剂盒检测的结果一致.结论 建立了HLA-DPA1及HLA-DPB1测序分型的方法,在群体遗传学及疾病关联研究等领域具有广泛的实用价值.     

ECE-1基因多态性与原发性高血压的相关性

目的探讨内皮素转换酶-1(endothelin converting enzyme-1,ECE-1)基因多态性与中国北方汉族人群原发性高血压的相关性。方法采用病例-对照方法,在中国北方汉族人群中收集178例原发性高血压患者和194例健康对照者,应用聚合酶链式反应-连接酶检测方法测定ECE-1基因C-338A和T-839G位点的多态性。结果在原发性高血压组中,C-338A位点CA+AA基因型和A等位基因分布频率显著高于对照组(P=0.006;P=0.014);T-839G位点基因型和等位基因分布频率无显著差异。结论 ECE-1基因C-338A位点多态性与中国北方汉族人群原发性高血压的发病具有一定相关性。     

山东地区汉族人群中HLA-A、-B、-DRB1等位基因与原因不明卵巢早衰相关性研究

目的探讨HLA-A,-B和-DRB1位点等位基因多态性与原因不明卵巢早衰(premature ovarian failure,POF)的相关性。方法利用毛细管电泳测序技术(Capillary Electrophoresis),对36例汉族原因不明POF患者进行HLA-A,-B,-DRB1基因分型,并以865例山东健康汉族个体造血干细胞分型资料作为对照,分析HLA等位基因频率在两组中的分布差异。结果 POF组中HLA-A*33、HLA-B*07、HLA-B*52和HLA-B*55等位基因频率显著高于对照组(P<0.05)。HLA-A*33的等位基因频率POF组为19.44%,而正常对照组为10.17%,RR=2.18;HLA-B*07的等位基因频率POF组为12.50%,而正常对照组为5.32%,RR=2.65;HLA-B*52的等位基因频率POF组为11.11%,而正常对照组为4.10%,RR=3.06;HLA-B*55的等位基因频率POF组为5.56%,而正常对照组为1.50%,RR=4.23。结论山东汉族人群中HLA-A*33、HLA-B*07、HLA-B*52和HLA-B*55等位基因可能是POF的易感基因。     

内蒙古汉族人群多发性硬化与HLA-DRB1基因型的相关性研究北大核心CSCD

目的:探讨内蒙古汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-DRB1基因多态性与多发性硬化(MS)的关系。方法:采用基因测序法(SBT)检测40例内蒙古汉族MS患者和40例健康对照者的HLA-DRB1等位基因,并比较两组之间等位基因型频率的差异。结果:共检测到25个HLA-DRB1等位基因片段,其中MS组(45.0%)的DRB1*15:01等位基因频率显著高于健康对照组(12.5%)(P=0.001,Pc=0.011,RR=1.591);DRB1~04:05等位基因频率高于正常对照组,但差异无统计学意义(P>0.05)。对照组中DRB1*11:01等位基因和DRB1*12:02等位基因频率均高于MS组,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:我国内蒙古汉族人群MS与HLA-DRB1*15:01等位基因之间存在相关性。     

新疆地区汉族和维吾尔族部分人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因多态性与单倍型的比较

目的了解中国新疆维吾尔自治区汉族和维吾尔族人类白细胞抗原DRB1(HLA-DRB1)、HLA-DQB1、HLA-DPB1高分辨分型基础上的基因多态性和单倍型分布的特点。方法应用聚合酶链反应-直接测序基因分型(PCR-SBT)法对新疆地区188例汉族人群与90例维吾尔族人群进行HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1基因分型,直接计数法计算基因频率,应用Arlequin3.5软件以最大似然法获得单倍型频率。结果汉族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*09∶01(12.8%)、DQB1*03∶01(20.3%)和DPB1*05∶01(33.5%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*09∶01-DQB1*03∶03(8.8%)、DRB1*09∶01-DPB1*05∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*05∶01(9.6%)和DRB1*09∶01-DQB1*03∶03-DPB1*05∶01(6.3%)。维吾尔族人群频率最高的HLA-Ⅱ类基因分别是DRB1*07∶01(18.3%)、DQB1*03∶01(18.9%)和DPB1*04∶01(30.0%);三位点组成的单倍型频率最高的分别是DRB1*07∶01-DQB1*02∶02(16.1%)、DRB1*07∶01-DPB1*04∶01(5.0%)、DQB1*03∶01-DPB1*04∶01(7.3%)、DRB1*07∶01-DQB1*02∶02-DPB1*04∶01(7.4%)。两组人群中等位基因有显著差异的是∶DRB1*04∶04、DRB1*07∶01、DRB1*08∶03、DRB1*11∶04、DRB1*12∶02、DRB1*13∶01、DRB1*15∶01、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01、DPB1*04∶01和DPB1*05∶01。结论中国新疆汉族与维吾尔族人群HLA-DRB1、HLA-DQB1、HLA-DPB1等位基因频率、单倍型频率分布均有自己的多态性特征。     

人类白细胞Ⅱ类抗原DR、DQ基因型与妊娠期糖尿病的相关性研究

目的探讨人类白细胞II类抗原DR、DQ基因型与妊娠期糖尿病的相关性。方法对26例GDM孕妇及同期入院的42例正常健康孕妇,采用序列特异性引物聚合酶链反应技术(PCR-SSP)检测HLA-II类抗原DR和DQ的等位基因。结果研究中发现,DQA1*0101、DQA1*0201、DQB1*0609、DRB l*07-DQA1*0201-DQB1*0201基因频率在GDM中显著高于正常对照组,两组比较,统计学有差异(Ρ<0.05)。DQB1*0301基因频率在GDM中显著低于正常对照组,两组比较,有统计学差异(Ρ<0.05)。结论人类白细胞II类抗原DR、DQ基因型与GDM的易感性和保护性存在关联。DQA1*0101、DQA1*0201、DQB1*0609、DRB l*07-DQA1*0201-DQB1*0201基因是GDM的易感基因。DQB1*0301基因是GDM的保护基因。     

HLA-A*02等位基因与云南宣威肺癌相关性研究

目的:探讨HLA-A*02等位基因及其亚型在云南宣威肺癌患者中的分布频率,为肺癌高发区的防治研究提供群体遗传学资料。方法:选取宣威籍肺癌患者与健康对照组,运用序列特异性引物基因分型技术(PCR-SSP)进行HLA-A位点及其HLA-A*02亚型分型。按照病例-对照研究方法分析HLA-A等位基因在两组之间频率分布的差异及肺癌HLA-A*02亚型多态性分布。结果:肺癌组与健康对照组HLA-A*02阳性率分别为68.75%及47.50%,肺癌组HLA-A*02阳性率显著增加(P=0.004,OR=2.432,95%CI=1.314～4.500);两组间HLA-A*02等位基因频率分别为41.67%及25.00%,具有显著性差异(P0.05);宣威健康人群HLA-A等位基因分布频率总体特征与中国南方汉族人群一致;HLA-A*02阳性的肺癌组样本经高分辨检出HLA-A*0201、0203、0206、0207四种等位基因亚型,频率分别为29.73%、16.22%、13.51%、40.54%,符合中国南方汉族人群以A*0207为主的特征。结论:HLA-A*02可能与宣威肺癌易感相关,肺癌患者HLA-A*02亚型以A*0207为主,宣威地区人群属于南方汉族人群。     

慢性乙型肝炎病毒感染与HLA-DRB1基因的相关性研究

目的： 研究HLA-DRB1等位基因与HBV感染慢性化的相关性。 方法： 用PCR-SSP 方法对陕西地区汉族乙肝患者108例与正常对照108人以及慢性乙型肝炎表面抗原携带者32人，进行HLA-DRB1等位基因分型比较，并进行HLA-DRB1等位基因分型与HBV不同复制状态相关性分析。 结果： 陕西地区汉族人HLA-DRB1等位基因以DRB1*04（16.2%），DRB1*09（12.5%），DRB1*12（11.6%）, DRB1*15（13.4%）最为常见；病例组HLA－DRB1*03 的等位基因频率(10.6%)明显高于健康对照组(3.7%)，(OR=3.10; P<0.05)；HLA-DRB1*07等位基因频率病例组(17.6%)明显高于健康对照组(9.3%)(OR=2.09; P<0.05)；DRB1*07 基因位点在HBV高复制状态多见（OR=2.22; P<0.05）; HLA-DRB1*15对照组等位基因频率13.4%, 明显高于病例组6.9% (OR=0.48; P<0.05)。 结论： HLA－DRB1*03、HLA-DRB1*07与陕西地区汉族人HBV感染后的慢性化相关联，HLA-DRB1*15为陕西地区汉族人乙肝感染的抗性基因。本研究提示HLA-Ⅱ类基因是决定HBV感染后临床转归的重要因素。     

湖南汉族人群HLA-DR位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性研究

目的：探讨湖南汉族人群HLA-DR位点等位基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间的关系。 方法： 应用PCR/SSO基因分型技术对93例湖南汉族鼻咽癌患者和93例健康对照作HLA-DRB1、-DRB3、-DRB4、-DRB5基因分型，采用χ2检验比较两组各位点等位基因频率、单倍型频率分布的差异。 结果： NPC组DRB1*1101明显低于对照组，DRB1*0801明显高于对照组, 但P值经Bonferroni校正后，差异均无显著（Pc>0.05）。 结论： 湖南汉族人群HLA-DR位点与鼻咽癌无明显相关。     

云南昆明彝族和汉族儿童HLA-DRB1等位基因的多态性研究

目的研究昆明彝族和汉族儿童HLA-DRB1基因的多态性,探讨其在昆明彝族和汉族人群中的遗传特征。方法应用PCR-SSP基因分型技术,对云南昆明地区70名彝族和72名汉族健康儿童进行了HLA-DRB1位点的基因分型。结果昆明彝族儿童HLA-DRB1位点共检出了12种等位基因,其中以HLA-DRB1*12(33.57％)、DRB1*0901(11.43％)、DRB1*04(11.43％)较常见,其它基因频率大于5％的等位基因还有HLA-DRB1*01(8.57％)、DRB1*11(7.86％)、DRB1*14(7.14％)、DRB1*15(7.14％)、DRB1*08(5％);昆明汉族儿童HLA-DRB1位点共检出了12种等位基因,其中以HLA-DRB1*12(20.14％)、DRB1*0901(19.44％)、DRB1*04(18.06％)较常见,其他基因频率大于10％的等位基因还有HLA-DRB1*08(11.11％)、DRB1*15(10.42％);与北方汉族人群、南方汉族人群HLA-DRB1等位基因分布进行了比较,均有显著性差异(P<0.001)。结论昆明彝族和汉族HLA基因多态性分布有其特点,他们既不同于北方汉族人群也不同南方汉族人群,有其独特性。可能与复杂的民族迁移历史和民族融合及云南独特的地理环境有关。     

新疆柯尔克孜族HLA-DRB1基因的多态性

目的:旨在研究新疆柯尔克孜族HLA-DRB1位点等位基因的多态性.方法:采用聚合酶链反应-序列特异引物法(PCR-SSP)对新疆地区柯尔克孜族85名健康无关个体进行HLA-DRB1等位基因分型.结果:共检出HLA-DRB1位点等位基因14种,其中高频率的等位基因是HLA-DRB1*03 (0.3769)、 HLA-DRB1*11 (0.1391)、 HLA-DRB1*07 (0.1056),低频率的等位基因是HLA-DRB1*08 (0.0059)、 HLA-DRB1*01 (0.0178)、 HLA-DRB1*1302 (0.0178)、 HLA-DRB1*1401 (0.0118).柯尔克孜族的HLA-DRB1基因频率分布具有中国北方人群的特点,尤其与西北地区汉族和蒙古族人群最为接近(0.156 、 0.237). 结论:提供了新疆地区柯尔克孜族人HLA-DRB1的14种等位基因的基因频率,为该民族的人类学及疾病相关研究提供了参考数据.