2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析

目的分析2021—2022年流感监测季北京市乙型Victoria系流感病毒(BV)的血凝素(hemagglutinin, HA)基因特性、抗原性及与流感疫苗组分株的匹配性。方法采集2021—2022年流感监测季流感样病例(influenza like-illness, ILI)咽拭子样本经MDCK和鸡胚培养分离流感病毒, 提取病毒核酸后测序。应用MEGA5.0进行病毒HA基因的核苷酸和氨基酸变异, 采用maximum likelihood方法构建HA基因的遗传进化树, 在线预测N-糖基化位点。SWISS-MODEL同源建模, 建立BV毒株HA的蛋白质三维空间模拟图。通过血凝抑制(hemagglutination inhibition, HI)试验, 进行毒株的抗原性分析。结果共收集402株BV毒株, 选取58株测序获得HA基因全长序列, 与本年度的疫苗组分BV株(B/Washington/02/2019)HA基因相比较显示, 有27个氨基酸位点发生变异, 其中11个变异位点位于4个不同的抗原决定簇。遗传进化树分析显示:3个进化分支的毒株共同流行, 其中54株(54/58, 93.10%...     

2004-2008年我国流行的A型流感病毒抗原性及HA1基因特性的研究

目的 了解我国2004-2008年A(H1N1、H3N2)型流感病毒流行情况、抗原性和基因特性变异关系,了解疫苗株与我国流行株之间抗原性变化情况.方法 选择2004年以来我国分离的A(H1N1、H3N2)型流感病毒进行抗原性及HA1区基因序列,通过比对HA1蛋白位点变异情况,分析我国流感病毒抗原性及基因特性变化情况.结果 A(H1N1)亚型流感毒株抗原性2004-2007年分离的A(H1N1)亚型流感病毒的抗原性与疫苗株A/New Caledonia/20/1999(H1N1)类似;2008年我国流行的A(H1N1)亚型毒株的抗原性与2008-2009年北半球的流感疫苗株A/Brisben/59/2007(H1N1)类似.2004-2005年分离的A(H3N2)亚型流感病毒的抗原性与疫苗株A/Fujian/411/12002(H3N2)比较发生了变异;2006-2007年我国流行的H3N2毒株与A/Wiscansin/67/2006(H3N2)类似,2008年我国流行的H3N2毒株与疫苗株A/Brisben/10/2006(H3N2)类似.结论 2004-2008年我国流行的A(H1N1、H3N2)亚型流感病毒的抗原性和基因特性发生了改变.     

我国猪群中H9N2亚型毒株HA和NA基因特性的研究

目的 了解我国内地从猪中分离到H9N2亚型毒株HA和NA基因来源及它们使猪致病的原因。方法 用PCR扩增目的基因，与P^GEM-T Easy Vector4℃过夜连接，重组质粒转化DH-10β细菌，筛选阳性菌落，酶切鉴定，测序。然后，进行进化树分析。结果 两株猪H9N2毒株HA蛋白分子上第226位上氨基酸为L，这与从人和猪所分离出的H9N2毒株相同，其连接肽属对禽致病的毒株，但它们的序列为R-L-S-R，而不是R-S-S-R；其NA蛋白茎区第62～64位存在掉失，这与A／Shaoguarn/408／98，A／Swine／Hong Kong／9／98及A／Duck／Hong Kong／y280／97(H9N2)毒株相同；HA与NA基因进化树分析表明，两株猪H9N2毒株的HA基因接近于A／Chicken／Hong Kong／G23／97和A／Chicken／Hong Kong／G9／97．而NA基因接近于A／Shaoguan／408／98毒株。结论 两株猪H9N2亚型毒株的HA和NA基因可能性最大来自禽H9N2毒株。由于其HA蛋白分子上连接肽氨基酸序列发生替换，可能造成了它们对猪具有致病性。禽H9N2毒株NA蛋白茎区氨基酸掉失，造成了它们能直接感染猪。     

北京市2021—2022年流行季首起乙型流感疫情的血凝素基因分析

目的:分析2021—2022年流行季北京市首起乙型流感Victoria系（BV）疫情的病毒血凝素（HA）的基因变异和进化特征以及与流感疫苗株的匹配性。方法:采集北京市朝阳区某小学乙型流感疫情流感样病例的咽拭子标本,提取核酸后利用二代测序技术进行测序分析。应用BioEdit分析HA基因的核苷酸和氨基酸变异位点,采用Meg...     

2000～2002年我国流行的甲3(H3N2)亚型流感病毒抗原性及基因特性的研究

目的 了解2000～2002年我国流行的甲3流感病毒HA基因突变及其抗原变异情况。方法 鸡胚传代流感病毒，收获尿囊液作为抗原性分析抗原并提取病毒的RNA，进行逆转录—聚合酶链反应(RT-PCR)，扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序，用MegAlign软件进行基因种系发生树分析。结果 与A/武汉/359/1995(H3N2)、A／Sydney／5／1997(H3N2)相比，2000～2002年我国分离到的甲3亚型流感病毒的血凝素重链区氨基酸序列存在差异。2001～2002年分离到的甲3毒株与2000年分离出的毒株的血凝素蛋白重链区(HA2)氨基酸序列有4个位点差异，它们分别位于83、186、202和222位，其中83和186分别位于抗原决定簇E和B区，其余均位于受体结合位点(RBS)的左臂。结论 2000～2002年分离到的甲3亚型流感病毒的基因特性发生突变并导致其抗原性发生漂移。     

2001年中国新分离维多利亚系乙型流感病毒的抗原性及基因特性分析

目的：研究2001年中国新分离维多利亚（Victoria)系乙型流感病毒的抗原性及基因特性。方法：鸡胚传代流感病毒，从尿囊液中提取流感病毒的RNA，进行逆转录－聚合酶链反应（RT－PCR），扩增产物用纯化试剂盒纯化后测序，然后用MegAlign软件进行基因种系发生树分析。结果：B／Sichuan/63/2001和B／Zhejiang/2/2001毒株的抗原性与B／Shandong/7/97毒株间存在有差异，编码血凝素重链区基因已发生了突变并导致了HA1蛋白抗原性表位两个位点（197和199）氨基酸不同于B／Shandong/7/97毒株，基因种系发生树分析同样也证明了它们的HA1基因不同于B／Shandong/7/97病毒。然而，B／Sichuan/63/2001与B／Zhejiang/2/2001毒株间无论抗原性还是HA1基因特性均很相似。结论：2001年我国人群中流行的乙型流感病毒维多利亚毒株系的抗原性已发生进一步的漂移。     

2018—2019监测年度上海市A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及HA基因特性分析

目的 了解上海市在2018—2019流感监测年度中分离的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒抗原性及血凝素(hemagglutinin,HA)基因变异情况。方法 利用血凝抑制试验,对2018年4月至2019年3月上海市分离的84株A(H1N1)pdm09亚型流感毒株进行了抗原性分析,并对其中65株病毒的HA基因进行了序列测定及分析。结果 2018—2019流感监测年度上海市主要流行6B.1分支的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒,少数流行株属于6B.2分支。抗原性分析结果显示监测毒株中97.62%为疫苗株A/Michigan/45/2015鸡胚株的类似株;核苷酸序列分析显示,6B.1分支毒株的HA基因核苷酸序列与疫苗株A/Michigan/45/2015的同源性为97.1%～98.8%,与WHO推荐的2019-2020年度的疫苗株A/Brisbane/02/2018的同源性为97.5%～99.4%;氨基酸序列分析显示,HA蛋白主要发生了15个位点改变,其中S91R、S181T及T202I位点变异分别涉及到Cb区、Sa区及Sb区3个抗原决定簇,提示病毒发生了抗原漂移。结论 本监测年度上...     

2006年中国流感病毒抗原性及基因特性研究

目的分析2006年中国季节性流感的流行状况，以及病毒的抗原性和基因变异情况。方法对来自流感监测网络的毒株进行单向血凝抑制试验，在此基础上选择不同时间、地点分离的毒株进行血凝素基因的序列测定，然后分析其基因特性。结果2006年我国同时流行A型（H1N1亚型、H3N2亚型）和B型流感病毒。H1N1亚型毒株和B型Victoria系流感病毒为优势毒株。对H1N1亚型毒株的HA1区序列比较发现，2006年分离的毒株与A，湖北洪山／53／2005（H1N1）比较，在192、193、196、198位发生氨基酸替换的毒株．这些位点位于抗原决定簇的B区。H3N2亚型毒株与A，云南，1145／2005（H3N2）比较，在142、144位发生氨基酸替换。我国流行的B型流感毒株无论是Victoria系和Yamagata系毒株的抗原性均没有发生变异，与2005--2006年我国的流行株B／shenzhen／155／2005、B／tianjin／144／2005类似。结论2006年中国流行的H1N1亚型和H3N2亚型流感病毒的抗原性及基因特性已经发生改变；B型流感病毒的抗原性和基因特性没有改变。     

2004年中国甲3亚型流感病毒(H3N2)抗原性及基因特性研究

目的阐明2004年中国流行的甲3亚型流感病毒血凝素抗原性及其基因变异情况。方法对2004年分离的甲3亚型毒株先进行单向血凝抑制试验及交叉血凝抑制试验;在此基础上选取不同时间、地点的甲3亚型流感毒株进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因进化特性分析。结果单向血凝抑制实验结果表明,2004年共有52.3%毒株与A/Fujian/411/2002(H3N2)(20042005毒株)有4倍或以上的血凝抑制滴度差异,交叉血凝抑制实验结果表明,它们间的抗原比为4。HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,我国从2004年2月分离的甲3亚型毒株开始出现了与A/Fujian/411/2002(H3N2)和A/Wellington/1/2004(H3N2)(2005年国际代表株)相比较,在其HA1蛋白分子上存在有4个氨基酸位点(159位Y>F,189位S>N,145位K>N,226位V>I)发生了替换。此类毒株首发于我国南方,然后到我国北方。结论我国2004年2月份以后所分离的甲3亚型流感毒株已经发生抗原性及基因特性的改变。     

不同抗原性甲3 (H3N2) 亚型流感病毒的鉴定及分子生物学研究

目的：对不能用当年标准血清进行鉴定的甲3（H3N2）亚型流感病毒进行抗原性分析及分子生物学研究。方法：用交互血凝抑制试验对毒株进行抗原性分析,提取病毒RNA,用一步法逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）扩增HA1（血凝素重链区）基因片段,产物纯化后测序并分析结果。结果：发现两株从鸡胚分离到的甲3（H3N2）亚型“D”相毒株与2株从MDCK细胞分离到的“0”相毒株抗原性已明显不同;其中1999年分离的“D”相与“0”相2毒株的抗原比大于256,氨基酸序列同源性为93％,抗原决定簇A区和B区氨基酸位点相差分别为50％及35％;受体结合部位（RBS）有6个氨基酸位点发生变异（左侧壁1个、前壁3个、右壁2个）。结论：人群中存在没有发生“0”相变异的甲（H3N2）亚型“D”相毒株,其抗原性与当前流行的“O”相变异株已明显不同,提示今后在鉴定甲3（H3N2）亚型毒株时,需根据毒株的来源和相特性选择适合的标准血清进行鉴定。     

2009年泉州市H1N1流感监测及基因特性分析

目的 了解2009年泉州地区H1N1流感监测情况,分析泉州市H1N1流感病毒的HA和NA基因特征,探讨该病毒的遗传变异及分子特性.方法 对泉州市H1N1流感监测期间的病人咽拭子采用real-time RT-PCR方法检测病毒核酸,MDCK细胞培养进行病毒分离、鉴定,并提取其中2株代表性毒株病毒RNA;采用RT-PCR扩增病毒HA和NA基因,纯化产物进行核苷酸序列测定;用DNAStar Megalign软件进行序列分析.结果 1020份咽拭子中有200份为H1N1流感病毒核酸阳性,70份季节性流感病毒核酸阳性,其中53份为H3N2亚型,14份为H1N1亚型,3份为B型,并分离到29株甲型H1N1流感病毒株.HA基因经核苷酸序列测定显示,该毒株与北美流行株高度同源,由HA基因核苷酸序列推导的氨基酸系列与疫苗株A/Brisbane/59/2007相比,有22个位于抗原决定簇的氨基酸位点发生变异,但受体结合特异性仍为人样受体.NA基因耐药性位点分析,显示对达菲药物依然敏感.结论 2009年泉州市H1N1流感流行毒株与北美流行株高度同源,相对于疫苗代表株出现了HA蛋白抗原性的改变.     

Genetic analysis of HAV strains in Tunisia reveals two new antigenic variants

To evaluate the genetic variability of hepatitis A virus (HAV) isolates in Tunisia, serum samples were collected from 99 patients in different Tunisian areas in 2003 containing 92 cases with acute hepatitis, five with severe acute hepatitis and two with fulminant hepatitis. The entire VP1 gene was amplified and sequenced. Sequences were then aligned and a phylogenetic analysis was performed. Additionally, the amino acid (aa) sequence of the VP1 was determined. The analysis of Tunisian HAV isolates revealed that all the isolates were sub-genotype IA with 96.4%–99.8% of identity and showed the emergence of two novel antigenic variants. The Tun31-03 antigenic variant, with a 38 aa deletion containing Met156, Val171, Leu174 and Ala176 and located between 150 and 187 aa of the VP1 protein where neutralization escape mutations, was found. The second antigenic variant, Tun36-03, was isolated from a patient with fulminant hepatitis and presented a substitution of Thr by Pro at position 10 of the VP1 protein. This amino acid is located in a peptide presenting an antigenically reactive epitope of the VP1 protein. This substitution has never been described previously.     

丁型肝炎病毒抗原的原核表达及抗原性分析

目的 利用含T7启动子和His纯化标签pRSET B质粒构建丁型肝炎病毒抗原（HDAg）重组表达质粒（pRSETB-HDAg）,转化宿主菌,表达并纯化,获得生物活性高抗原性强的基因工程重组抗原.方法 将中国河南株HDAg基因片段插入pRSET B表达质粒,转化BL21宿主菌,经IPTG诱导表达.表达产物经Chelating亲和层析纯化后,采用EIA方法分析HDAg的抗原性.结果 重组HDAg稀释1000倍（10 ng/ml）仍与抗体有较强的反应.经与美国HDAg和华美公司生产的HDV诊断试剂同时检测26份HDV阳性参比血清,三者结果比较,除美国抗原漏检1份,检出率为96.15%（25/26份）外,病毒CDC和华美试剂均无漏检,检出率为100%,三者检测结果具有很高的符合率.结论 成功构建了丁型肝炎病毒抗原重组表达质粒（pRSETB-HDAg）,在原核细胞获得稳定高效表达,EIA 检测证明HDAg抗原性好,可用于组装HDV诊断试剂,用于临床丁型肝炎患者的诊断和我国丁型肝炎病毒感染流行病学的调查.     

Assessment of genetic, antigenic and pathotypic criteria for the characterization of IBDV strains.

The aim of this work was the selection and comparison of representative infectious bursal disease virus (IBDV) strains. Nine strains of IBDV, isolated at different times and from different geographic regions of Europe and China, were characterized. Batches of all strains were prepared following standardized protocols and checked for the absence of contaminating viruses. Criteria used for their characterization were: (i) the nucleotide sequence of the VP2 variable region, (ii) binding to a panel of neutralizing monoclonal antibodies in antigen capture enzyme-linked immunosorbent assays, and (iii) virulence in specific pathogen free chickens after infection with a standardized number of median embryo infective doses. Based on the first two criteria, two of nine strains were classified as classical virulent (cv) IBDV (F52/70, Cu-1wt), and five as very virulent (vv) IBDV (849VB, 96108, HK46, GX, Harbin). Remarkably, although a clear-cut difference was demonstrable between European cvIBDV (F52/70 and Cu-1wt) and vvIBDV (849VB and 96108) strains, there was a continuum in the pathogenicity of Chinese vvIBDVs. Our results indicate the probable existence of differences in virulence within IBDV lineages determined on the basis of antigenic typing using monoclonal antibodies and the alignment of the VP2 sequences. This indicates limitations in the analysis of IBDV pathotypes based on the VP2 variable region and emphasizes that these criteria may not be sufficient for the classification of IBDV strains.