代谢综合征患者肠道菌群特征探析

目的分析代谢综合征(MS)患者肠道菌群的特征。方法选取26例MS患者为观察组,32例健康人群为对照组,运用PCR技术检测研究对象的肠道菌群,分析两组研究对象肠道菌群的特征差异。结果两组样品肠道菌群β多样性具有差异。观察组的菌群多样性指数(Ace指数和Shonnon指数)、瘤胃球菌属及毛螺菌属丰度低于对照组,芽孢杆菌属、梭菌属、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属丰度高于对照组(均P<0.05)。结论 MS患者肠道菌群的多样性及特定菌群丰度与健康人群存在差异,差异菌群集中在厚壁菌门(包括芽孢杆菌属、梭菌属)、普雷沃氏菌属、巨单胞菌属、肠球菌属、瘤胃球菌属、毛螺菌属等,肠道菌群失调可能与MS的发生和发展有关。     

基于宏基因组学的慢性阻塞性肺疾病急性加重患者肠道菌群结构与功能相关性研究

目的研究慢性阻塞性肺疾病急性加重（acute exacerbation of chronic obstructive pulmonary disease, AECOPD）患者的肠道菌群结构与功能基因、耐药基因、毒力因子的表达差异,探索肠道菌群在AECOPD发生发展中的作用。方法2020年12月—2021年10月,入选符合AECOPD诊断的患者共15例,并选取年龄、吸烟史相匹配的健康对照组5例,收集所有肠道粪便标本,进行宏基因测序,结合临床数据,分析AECOPD与对照组肠道菌群结构及功能等方面的差异性。结果AECOPD患者肠道微生物α多样性与对照组无统计学差异,β多样性存在差异（P=0.022）。AECOPD组栖粪杆菌属（Faecalibacterium）、布劳特氏菌属（Blautia）、厌氧棒菌属（Anaerostipes）相对丰度低于对照组,肠球菌属（Enterococcus）、Lachnoclostridium相对丰度高于对照组（P<0.05）,AECOPD信号通路富集在糖酵解Ⅰ、Ⅱ通路,肠球菌属相关的耐药基因及毒力因子表达丰度增加。AECOPD在属水平表达相对丰度较高的肠道微生物菌群为肠球菌属（Enterococcus）,其表达相对丰度与年龄呈正相关（P<0.05）;肠球菌属表达丰度与耐药基因msrC、efmA表达丰度呈正相关（P<0.05）,与毒力因子acm、EcbA/fss3表达丰度呈正相关（P<0.05）。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与AECOPD用力肺活量（force vital capacity, FVC）呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与BMI呈正相关（P<0.05）;布劳特氏菌属、厌氧棒菌属两者的表达丰度呈正相关（P<0.05）;Lachnoclostridium属的表达丰度与血液中CD4+/CD8+T淋巴细胞比例呈正相关（P<0.05）。结论AECOPD患者肠球菌属（Enterococcus）相对丰度高,栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属相对丰度较低,信号通路富集在糖酵解相关代谢通路。栖粪杆菌属、布劳特氏菌属、厌氧棒菌属的表达丰度与临床指标FVC及T淋巴细胞比例存在一定的相关性,提示肠道微生态的失衡可能通过“肠-肺轴”参与AECOPD的发生发展。     

不同中医证型三阴性乳腺癌患者肠道菌群的多样性及差异性研究

目的 研究不同中医证型三阴性乳腺癌(Triple Negative Breast Cancer,TNBC)患者肠道菌群的多样性与差异性。方法 纳入符合标准的TNBC患者21例作为患者组,其中脾胃虚弱证组5例,肝肾阴虚证组8例,肝郁气滞证组8例,并纳入健康志愿者10例作为对照组,分别收集粪便标本,利用16S rDNA基因测序技术检测各组间肠道菌群的丰度和分布情况,并进行组间差异分析获得各组间的差异菌属(P＜0.05)。结果 TNBC患者组与正常组以及TNBC不同证型组之间的菌群多样性均无明显统计学差异(P＞0.05)。TNBC患者组较正常组显著减少（P＜0.05）的菌群包括毛螺菌属（Lachnospira）、光冈菌属 (Mitsuokella)、粪球菌属(Coprococcus)、臭气杆菌属(Odoribacter)、肠球菌属（Enterococcus）等。与健康对照组相比,脾胃虚弱证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括普雷沃氏菌属（Prevotella）、乳杆菌属（Lactobacillus）、（Tyzzerella）、成对杆菌属（Dyadobacter）、奇异球菌属（Deinococcus）、放线杆菌属（Actinobacillus）等,肝肾阴虚证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括（Tyzzerella）、戈登氏杆菌属（Gordonibacter）、亨盖特氏菌属（Hungatella）等。肝郁气滞证组显著富集（P＜0.05）的菌属包括解黄酮菌属（Flavonifractor）、变形菌属（Proteus）、水栖菌属（Enhydrobacter）、柠檬酸杆菌属（Citrobacter）、厌氧球形菌属（Anaeroglobus）、醋杆菌属 (Acetobacter)等。结论 TNBC患者与健康人群的肠道菌群存在显著差异,且不同证型TNBC患者的肠道菌群组成也显著不同。TNBC的发生与肠道内粪球菌属等有益菌的减少和Hungatella等有害菌的增加有关,不同中医证型的证候差异与其肠道内环境的菌群变化也存在一定的联系。     

睡眠障碍与非睡眠障碍维持性血液透析患者肠道菌群多样性分析

目的 分析睡眠障碍维持性血液透析（MHD）患者和非睡眠障碍MHD患者肠道菌群结构的差异,探讨MHD患者睡眠障碍与肠道菌群的关系。方法 选取2022年1至7月就诊于温州市中心医院根据匹兹堡睡眠质量指数量表评估为睡眠障碍和非睡眠障碍的MHD患者各30例。采集两组患者粪便标本,进行16S r DNA高通量测序及生物学信息分析,比较两组患者肠道菌群的差异。结果 睡眠障碍组患者肠道菌群的α多样性高于非睡眠障碍组患者（P<0.05）。经β多样性比较,两组患者肠道菌群的菌群结构差异有统计学意义（P<0.05）。进一步行LEfSe分析,相较于非睡眠障碍组患者,睡眠障碍组患者肠道菌群中拟杆菌属、大肠杆菌-志贺氏菌属、毛螺菌属、链球菌属、副拟杆菌属、巴恩斯氏菌属及颤杆菌克属的相对丰度显著升高（均P<0.05）,而双歧杆菌属、乳杆菌属及罗氏菌属的相对丰度显著降低（均P<0.05）。结论 睡眠障碍MHD患者和非睡眠障碍MHD患者在肠道菌群结构上存在显著差异。肠道菌群结构的变化可能在MHD患者睡眠障碍的发生、发展中起重要作用。     

溃疡性结肠炎患者肠道菌群分布特征分析

目的 分析溃疡性结肠炎(UC)患者肠道菌群分布特征。方法 收集2018年12月至2020年12月濮阳市油田总医院收治的100例UC患者的临床资料纳入A组;另收集同期在医院体检的100例健康体检者的临床资料纳入B组。采集所有入组者新鲜粪便进行菌群分析(测定双歧杆菌属、乳杆菌属、拟杆菌属、梭菌属、肠球菌属、大肠埃希菌属的菌群数量),比较两组患者肠道菌群数量及不同性别、年龄、病变部位、疾病分期、病情严重程度UC患者的肠道菌群数量。结果 A组双歧杆菌属、乳杆菌属、拟杆菌属、梭菌属数量均较B组低,肠球菌属、大肠埃希菌属数量较B组高(P<0.05);不同性别、年龄、病变范围UC患者肠道菌群比较,差异无统计学意义(P>0.05);活动期组患者的双歧杆菌属、乳杆菌属、拟杆菌属、梭菌属数量均低于缓解期组,肠球菌属及大肠埃希菌属数量均高于缓解期组(P<0.05);重度患者双歧杆菌属、乳杆菌属、拟杆菌属、梭菌属最低,中度患者次之,轻度患者最高,重度患者肠球菌属、大肠埃希菌属最高,中度患者次之,轻度患者最低(P<0.05)。有序回归分析结果显示,高水平双歧杆菌属、乳杆菌属、拟杆菌属、梭...     

基于高通道测序的肠道菌群与冠心病的相关性研究

背景　冠心病是发达国家及发展中国家最常见的死亡原因之一,肠道菌群的组成在冠心病的病理过程中起重要作用,越来越多证据表明,肠道菌群失调可导致脂质代谢紊乱、低度炎性反应、胰岛素抵抗、血压升高等,进而增加冠心病风险。目的　通过检测冠心病患者肠道菌群结构及多样性,了解其肠道菌群特点,进一步寻找冠心病危险因素,为冠心病患者提供新的诊疗方法。方法　选取2016年7月-2017年6月入住新乡医学院第一附属医院心血管内科及心脏重症监护病房（CCU）的冠心病患者62例,应用Gensini评分将其分为轻度组27例,中重度组35例;同时选取同期于本院体检的30例健康者作为对照组。采集研究对象的粪便样本,提取粪便样本的DNA并对其进行细菌16S rDNA V3区的聚合酶链式反应（PCR）扩增,对最终的PCR扩增产物进行生物信息学分析。结果　三组原始PE reads数目（PE_reads）、去除嵌合体后有效序列数目（Nochimera）、有效序列平均长度（AvgLen）、有效数据的GC百分比含量（GC）、Nochimera与PE_reads的百分比（Effective）比较,差异均无统计学意义（P>0.05）。三组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;其中,轻度组与中重度组ACE、Chao1、Shannon、Simpson指数均低于对照组（P<0.05）。三组拟杆菌门、变形菌门相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌门相对丰度低于对照组,变形菌门相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌纲、梭菌纲相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组拟杆菌纲相对丰度低于轻度组、梭菌纲相对丰度高于轻度组,轻度组拟杆菌纲相对丰度低于对照组、梭菌纲相对丰度高于对照组（P<0.05）;三组拟杆菌属相对丰度比较,差异有统计学意义（P<0.05）,其中中重度组相对丰度低于轻度组和对照组,轻度组相对丰度低于对照组（P<0.05）。Metastats差异分析结果显示对照组与轻度组拟杆菌属、巴斯德菌属、脱磷弧菌属、埃希杆菌-志贺杆菌属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;对照组与中重度组巴斯德菌属、Dialister属、黄杆菌属、Parasutterella属、考拉杆菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）;轻度组与中重度组脱磷弧菌属、Dialister属、埃希杆菌-志贺杆菌属、黄杆菌属、帕拉普菌属菌落相对丰度比较,差异均有统计学意义（P<0.05）。结论　肠道菌群多样性、结构的改变,是冠心病的危险因素,因此调节肠道菌群、粪菌移植等方法可能成为冠心病新的治疗方法。     

原发性干燥综合征患者肠道菌群特点分析

目的 探索原发性干燥综合征（pSS）与健康人之间肠道菌群是否存在差异。方法 收取18例符合纳入标准的女性pSS患者的粪便样本,其中9例为病情活动组（A组）、9例为病情不活动或低活动组（B组）,另外收取10例健康人的粪便（C组）。收集每份粪便样品的细菌总DNA,PCR扩增,针对16SrDNA基因的V3~V4区进行illumina hiseq 2500高通量测序,得到3组的肠道菌群生物信息数据,随后结合文献智库信息挖掘进行组间OTU分析、样品多样性分析、样品组间显著性差异分析及LEfSe分析。结果 肠道菌群多样性比较：α多样性（Alpha diversity）指数分析,Shannon指数在A组和B组间、Simpson指数在A组和B组间及A组和 C组间差异存在统计学意义（P<0.05）;菌群结构比较：将3组分别进行序列分析,在门水平上3组均主要有 4 个菌门组成,分别是：厚壁菌门（Firmicutes）,拟杆菌门（Bacteroidetes）,放线菌门（Actinobacteria）,变形菌门（Proteobacteria）,在属水平上3组均主要有4个菌属组成,分别是：大芬戈尔德菌属（Finegoldia）,普雷沃菌属（Prevotella）,链球菌属（Streptococcus）,棒状杆菌属（Corynebacterium_1）,在门水平和属水平上分析显示3组肠道菌群主要菌门和主要菌属两两比较差异无统计学意义（P>0.05）,但Streptococcus属在3组之间比较,差异具有统计学意义（P<0.05）;肠道菌群结构的差异分析：肠道菌群 16S V3~V4 区组间显著性差异分析,在属水平上,3 组间相比,在 Alloscardovia 属、Bacteroides 属、Barnesiella 属 、Butyricicoccus 属 、Facklamia 属 、Faecalibacterium 属 、Lachnospiraceae_FCS020_group 属 、 Lachnospiraceae_ND3007_group属、Lachnospiraceae_UCG-001属、Lachnospiraceae_UCG-004属、Lachnospiraceae_UCG-008属、Ruminococcaceae_UCG-002属、Streptococcus属之间存在统计学差异（P<0.05）;在Coprococcus_1属存在显著性差异（P=0.005,P<0.01）。3组间肠道微生物进行高维生物标识和揭示基因组特征的分析,差异存在统计学意义（P<0.05）。结论 pSS患者与健康人之间的肠道菌群多样性存在一定差异,在主要菌门水平和菌属水平上虽无显著性差异,但在Streptococcus属等一些特定细菌比例有显著差异;3组肠道菌群在16S V3~V4区组间差异具有统计学意义,提示菌群结构的差异在pSS的发病中起一定作用。     

亚健康状态人群肠道菌群结构明显失调：基于某医院150例护理人员分析

目的 探索亚健康状态人群（SHS）和健康人群之间肠道菌群是否存在差异。 方法 于2020年11月~2021年5月选取南方医科大学南方医院工作的护理人员150例作为研究对象,其中亚健康人群75例为亚健康组（SHS组）,选择75例同期健康人群作为对照组（H组）。针对16S rRNA基因的V3-V4区采用高通量测序技术,对测序结果进行多样性和物种组成差异分析。 结果 α多样性分析显示,Chao1指数在SHS组和H组间差异无统计学意义（P=0.619）,SHS组的Shannon指数升高且2组之间差异有统计学意义（P<0.001）;β多样性分析显示,2组间肠道菌群组成结构上差异具有统计学意义（R=0.227,P=0.001）;在门水平上2组均主要由拟杆菌门（Bacteroidota）、厚壁菌门（Firmicutes）、放线菌门（Actinobacteriota）组成;在属水平均主要由普雷沃菌属（Prevotella）、拟杆菌属（Bacteroides）、布劳特氏菌属（Blautia）、栖粪杆菌属（Faecalibacterium）组成;物种差异分析表明,2组在4个门3个纲3个目3个科3个属的相对丰度差异有统计学意义（P<0.05）。结论 与健康人群相比,亚健康状态人群肠道菌群结构明显失衡。     

食管鳞癌原位模型小鼠肠道菌群分析

背景随着肠道菌群高通量测序技术的应用与发展,越来越多的研究证实肠道菌群与多种肿瘤的发生、发展密切相关。食管鳞癌是威胁我国人民健康的常见肿瘤,其与肠道菌群的关系备受关注。目的分析比较食管鳞癌原位模型小鼠与正常小鼠肠道菌群的多样性,筛选出食管鳞癌特异性改变的菌属。方法2020年8月至2021年5月,将20只雌性SPF级C57BL/6小鼠适应性喂养1周后随机分为对照组（DZ组）和模型组（MX组）,每组10只。DZ组小鼠常规喂养并给予普通饮用水32周,MX组小鼠按照造模方法常规喂养并给予含0.1 mg/ml诱癌剂4-硝基喹啉-1-氧化物（4NQO）的饮用水喂养16周,之后给予普通饮用水喂养至32周。收集两组小鼠粪便,提取DNA,应用聚合酶链式反应（PCR）扩增后进行高通量测序,获得的测序数据聚类成为基于序列间相似度的分类操作单元（OTU）,并根据物种注释情况进一步分析Alpha多样性、Beta多样性、物种丰度。结果两组小鼠在实验过程中未出现死亡,MX组小鼠均造模成功。MX组与DZ组相比,拟杆菌门（Bacteroidota）及厚壁菌门（Firmicutes）比例升高,而疣微菌门（Verrucomicrobiota）及变形菌门（Proteobacteria）比例降低。Alpha多样性结果显示,MX组小鼠肠道菌群Shannon指数低于DZ组（P<0.05）。Beta多样性分析中PCoA图显示,MX组与DZ组样本分别聚集在不同的象限,相距较远,样本间多样性差异较大（t=22.444,P=0.004）。在门水平,MX组Unidentified_ Bacteria、蓝细菌（Cyanobacteria）、易感微生物（Elusimicrobia）、弯曲杆菌（Campilobacterota）丰度高于DZ组（P<0.05）。在属水平,MX组普雷沃菌科_UCG-003（Prevotellaceae_UCG-003）、拟杆菌属（Bacteroides）、毛螺菌科NK4A136组（Lachnospiraceae_NK4A136_group）、瘤胃球菌属（Ruminococcus）、普雷沃菌科_UCG-001（Prevotellaceae_UCG-001）、普雷沃菌属（Prevotella）、大肠埃希菌（Colidextribacter）、毛螺菌科_UCG-006（Lachnospiraceae_UCG-006）丰度高于DZ组,罗姆布茨菌（Romboutsia）、土杆菌属（Turicibacter）丰度低于DZ组（P<0.05）。LEfSe分析结果显示,在属水平上,Prevotellaceae_UCG-003、埃希菌-志贺菌属（Escherichia-Shigella）、Bacteroides、Lachnospiraceae_ NK4A136_group在MX组丰度增高（P<0.05）;而Romboutsia丰度在DZ组增高（P<0.05）。结论食管鳞癌原位模型小鼠与正常小鼠相比肠道菌群物种多样性降低,存在特异性差异菌属,其中Prevotellaceae_UCG-003、Bacteroides、Lachnospiraceae_NK4A136_group和Romboutsia可作为食管鳞癌诊断的生物标志物。     

首发抑郁症患者肠道菌群与认知情绪调节关系研究

背景　近年来抑郁症和肠道菌群的相关研究大多集中于动物实验,而人体肠道菌群的相关研究相对较少,结合心理特征的研究则更少。目的　了解首发抑郁症患者与健康人群在肠道菌群、认知情绪调节方面的差异,进一步探讨抑郁症、肠道菌群及认知情绪调节之间的关系。方法　选取2017年1-12月就诊于宁夏医科大学总医院心理卫生中心门诊的首发抑郁症患者30例（抑郁症组）,同期选取宁夏“十三五”科技重大项目流调体检健康志愿者31例（对照组）。完成一般情况调查问卷、汉密尔顿抑郁量表、认知情绪调节量表（CERQ）的评定与粪便的收集;采用高通量测序及生物信息学方法分析微生物群落多样性和丰度变化;探讨情绪调节策略、抑郁严重程度与肠道菌群的相关性。结果　抑郁症组和对照组一般情况（年龄、性别、BMI、吸烟、文化程度）比较,差异无统计学意义（P>0.05）。本研究以97%的相似性将所有样本的有效序列聚类为Operational Taxonomic Units（OTUs）,所得稀释曲线趋向平坦,说明测序数据量合理。抑郁症组与对照组肠道菌群多样性指数比较,差异无统计学意义（P>0.05）。与对照组相比,在门水平,抑郁症组厚壁菌门、放线菌门、柔壁菌门丰度降低,拟杆菌门丰度增高（P<0.05）;在属水平,抑郁症组Ruminococcus、Subdoligranulum、Enterobacter、Coprococcus、Bifidobacterium、Lactobacillus菌属减少,而Klebsiella、Flavonifractor、Bacteroides菌属增多（P<0.05）。LEfSe分析显示,抑郁症组肠道菌群中主要以拟杆菌、产碱菌科（Alcaligenaceae）,伯克菌目（Burkholderiales）,Β-变形菌纲、Erysipelotrichaceae、幽门螺杆菌等致病菌为主;对照组以厚壁菌门、双歧杆菌、Subdoligranulum、乳酸杆菌等有益菌为优势菌。抑郁症组自我责难、沉思、灾难化、责难他人分量表得分高于对照组,积极重新评价、理性分析分量表得分低于对照组（P<0.05）。CERQ分量表中自我责难得分与Enterobacter菌属呈正相关,与Odoribacter、Alistipes菌属呈负相关（P<0.05）;沉思分量表得分与Subdoligranulum、Alistipes、Faecalibacterium、Odoribacter菌属呈负相关（P<0.05）;重新关注计划、积极重新评价分量表得分与Weissella菌属呈正相关（P<0.05）;灾难化分量表得分与Dialister菌属呈负相关（P<0.05）。抑郁严重程度与拟杆菌门及Flavonifractor菌属呈正相关（P<0.05）,与Ruminococcus、Subdoligranulum、Coprococcus、Dialister、Odoribacter、Faecalibacterium、Butyricimonas菌属呈负相关（P<0.05）。结论　抑郁症患者与健康对照者在肠道菌群、认知情绪调节策略方面均有较大差异,情绪调节策略自我责难、沉思、灾难化,肠道菌群条件致病菌的增多及丁酸盐产生菌、益生菌的减少与抑郁症密切相关。     

腹主动脉瘤和动脉粥样硬化患者肠道菌群的多样性差异

目的 研究腹主动脉瘤和动脉粥样硬化患者菌群多样性差异。方法 2018年12月至2019年6月于北京协和医院血管外科收集腹主动脉瘤和动脉粥样硬化患者新鲜粪便样本各20例,采用16S rDNA高通量测序技术检测两组患者肠道菌群物种组成及丰度变化,分析α和β多样性差异,并确定显著性差异菌属。结果 两组间在菌群物种组成方面具有较大相似性,α多样性差异无统计学意义,β多样性两组间在某些菌群上仍有一定差异。LEfSe分析发现,腹主动脉瘤组明串珠菌科、瘤胃球菌科、魏斯氏菌属、粪杆菌属较动脉粥样硬化组为优势菌,而厚壁菌纲、Selenomonadales菌目、韦荣氏菌科含量减少,差异均具有统计学意义。结论 腹主动脉瘤和动脉粥样硬化患者在肠道菌群多样性方面存在差异,具体差异仍有待扩大样本量并通过基础实验予以验证。     

多系统萎缩患者肠道菌群的变化

目的:探讨多系统萎缩(MSA)患者肠道菌群的变化。方法:收集2020年6月至2022年1月于郑州大学第一附属医院招募的MSA患者(MSA组)22例及其健康配偶(HC组)21例的临床资料及粪便样本,基于粪便菌群16S rRNA的测序结果,分析MSA患者肠道菌群组成和丰度的变化。结果:MSA组菌群丰度及多样性小于HC组(P<0.05)。在门水平,MSA组变形菌门丰度高于HC组,而拟杆菌门丰度低于HC组(P<0.05)。在科水平,MSA组乳杆菌科、链球菌科、肠杆菌科、肠球菌科、拜叶林克氏菌科、鞘脂单胞菌科、韦荣球菌科相对丰度高于HC组,而拟杆菌科、瘤胃球菌科相对丰度降于HC组(P<0.05)。在属水平,MSA组克雷伯氏杆菌属、柠檬酸杆菌属和利莫西乳杆菌属相对丰度明显高于HC组,而拟杆菌属、粪杆菌属、另枝菌属、芽孢杆菌属、毛螺旋菌属、副杆菌属、罗氏菌属、链球菌属、丁酸球菌属相对丰度低于HC组(P<0.05)。结论:MSA患者肠道菌群结构在门、科及属水平上均有明显变化,这些变化可能与MSA的发生有关。     

靶向CD47的免疫治疗对口腔-肠道菌群影响的实验初探

  目的  比较靶向CD47的免疫治疗对于免疫健全小鼠口腔-肠道菌群的影响。  方法  构建免疫健全小鼠的结肠癌腹腔转移模型,经腹腔实验组给予抗CD47单克隆抗体或对照组给予PBS溶液进行治疗,用小动物活体成像技术记录肿瘤生长,采用16S rRNA基因测序技术进行口腔-肠道微生物群落组成及多样性分析。  结果  抗CD47单克隆抗体治疗组小鼠口腔微生物Alpha多样性降低,差异有统计学意义（P<0.05）;肠道微生物Alpha多样性则无显著改变;差异物种分析显示,接受治疗小鼠口腔葡萄球菌属（Staphylococcus）、Jeotgalicoccus、球菌属（Sporosarcina）较对照组丰度显著降低,肠道菌群拟杆菌属（Bacteroides）在接受靶向CD47免疫治疗组丰度显著增高。  结论  靶向CD47的免疫治疗对小鼠口腔菌群多样性有着较大的影响,而对肠道菌群物种多样性无显著影响。     

基于16S rDNA测序探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群特征

背景 食管癌是我国的高发肿瘤之一,其发病与死亡人数均为世界平均水平的2倍以上。在我国大多数食管癌发现时已是中晚期,预后较差,所以迫切需要早期诊断及干预治疗,目前肠道菌群在食管癌诊断及治疗中的作用备受关注。目的 探索食管鳞状细胞癌患者肠道菌群基本特征。方法 纳入2022年4—8月就诊于河北医科大学第四医院未经任何抗肿瘤治疗的食管鳞状细胞癌患者35例作为食管癌组,健康志愿者35例作为对照组。收集两组人群粪便标本,应用16S rDNA技术检测肠道菌群,根据检测结果物种注释情况分析两组人群肠道菌群的Alpha多样性、Beta多样性[主坐标分析（PCoA）]及菌群物种差异性[线性判别分析及影响因子（LEfSe）分析]。结果 两组人群肠道菌群Alpha多样性香农（Shannon）、辛普森（Simpson）、Chao1、ACE及Goods＿coverage指数比较均无明显差异（P>0.05）;而PCoA图显示两组样本整体上相距较远,群落结构存在差异（t=10.837,P<0.001）。两组人群肠道菌群T-test检验结果在属水平共有16类菌属的丰度存在明显差异,相对丰度较高的前8位菌属中...     

脑卒中后认知与非认知功能障碍患者肠道菌群特征的差异研究

目的 比较脑卒中后认知功能障碍（PSCI）与脑卒中后非认知功能障碍（non-PSCI）患者肠道菌群特征的差异。方法 对2022年2月至2023年2月嘉兴市第二医院康复中心收治的PSCI患者（观察组）及性别、年龄配对的non-PSCI患者（对照组）采用简易精神状态检查量表（MMSE）并根据患者的文化水平进行调整,各44例,收集其粪便样本,采用16S rRNA扩增子测序获得肠道菌群信息,对两组样本行α多样性分析和β多样性分析,同时在门和属分类层级对样本进行注释以及汇总计算相对丰度,比较两组患者门水平Top10和属水平Top30的肠道菌群。结果 两组患者粪便肠道菌群α多样性的差异均无统计学意义（均P>0.05）,β多样性的差异有统计学意义（P=0.048）。观察组中Bifidobacterium和Lachnospiraceae＿NK4A136＿group相对丰度分别为0.05(0.01,0.28)和0.03(0,0.31),低于对照组0.17(0.04,1.78)和0.18(0.03,0.81),Enterobacter、Lachnoclostridium和UBA1819相对丰度分别为...     

基于16S rDNA测序分析功能性便秘婴幼儿的肠道菌群组成

目的：探讨16S rDNA测序分析功能性便秘婴幼儿肠道菌群的结构与组成,为临床治疗提供依据。方法：选取2020 年1月至12 月湖州市妇幼保健院门诊就诊的功能性便秘婴幼儿17 例作为便秘组,正常婴幼儿15例作为对照组,收集粪便,采用16S rDNA扩增子测序的方法检测2组婴幼儿肠道菌群的组成并分析其结果。结果：2组肠道菌群Alpha多样性差异无统计学意义（P ＞0.05）,但Beta多样性差异有统计学意义（P ＜0.01）。在门水平中放线菌门、厚壁菌门、变形菌门是2组儿童肠道微生物群落中最丰富的菌群,其中疣微菌门在便秘组中丰度高于对照组（P ＜0.05）。在属水平中,双歧杆菌为2组优势菌种,乳酸菌属与阿克曼菌属在便秘儿童肠道中的丰度高于对照组（P ＜0.05）。便秘组中双歧杆菌种、疣微菌门、阿克曼菌属、副干酪乳杆菌的丰度差异有统计学意义,而对照组齿双歧杆菌、放线菌目、放线菌科、放线菌属、鼠李糖乳杆菌的丰度差异有统计学意义（均P ＜0.05）。结论：功能性便秘婴幼儿存在肠道菌群结构和多样性的改变,便秘与肠道菌群之间可能存在相关性。     

海军潜艇官兵代谢指标与肠道菌群关联研究

目的 调查某部海军潜艇官兵代谢性疾病的患病情况,并探讨其与肠道菌群多性性的关联。方法 随机抽取某部潜艇官兵30名作为研究组,选取年龄和体重指数（BMI）匹配的健康体检30人作为对照组,进行代谢指标检测及粪便肠道菌群多样性分析。结果 研究组舒张压低于对照组,而血尿酸、血红蛋白及总胆固醇（TC）等代谢指标均高于对照组（P<0.05）。2组肠道菌群在各细菌学分类水平差异有统计学意义（P<0.05）。研究组肠道菌群中的厚壁菌门、栖粪杆菌属和普氏栖粪杆菌丰度高于对照组,拟杆菌门、变形菌门则低于对照组（P<0.05）。其中拟杆菌属丰度与BMI和TC水平均呈现负相关,栖粪杆菌与血尿酸及TC水平呈现正相关（P<0.05）。结论 血尿酸、TC等代谢指标在海军潜艇官兵中有增高趋势,且与特定肠道菌群结构多样性改变有一定关联。     

类风湿关节炎合并肺间质疾病患者Treg/Th17免疫失衡与肠道菌群变化的关系

目的 探讨类风湿关节炎（RA）合并肺间质疾病（ILD）患者调节性T细胞（Treg细胞）/辅助性T细胞（Th17细胞）免疫失衡与肠道菌群变化的关系。方法 选取2021年6月-2022年6月于石家庄市人民医院收治的RA患者100例为研究对象,纳入RA组。根据临床症状、X射线及胸部HRCT检查评估结果,将RA组分为RA-ILD组39例和NO-ILD组61例。收集两组患者基线资料;检测Treg/Th17细胞及相关因子;对粪便DNA样本16S rRNA V3-V4区域进行生物信息学分析;使用Spearman相关性分析检验RA-ILD患者肠道菌群丰度与Treg/Th17相关性。结果 与NO-ILD组相比,RA-ILD组的Shannon指数、Observed_species指数及Chao1指数均明显较低,类杆菌属(Bacteroides)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、梭状芽孢杆菌属(Acuformics-Prevot)、厚壁菌门(Firmicutes)、真杆菌属(Eubacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)、韦荣球菌属(Veilonella)相对丰度均明显较低,拟杆菌门(Bacteridetes)、变形菌门(Proteobactena)、戈登菌属(Ciordonaspp)、放线菌门(Actinobacteri)、普雷沃菌属(Prerotella)相对丰度均明显较高,Treg细胞比例及Treg/Th17明显较低,IL-23、IL-17水平及Th17细胞比例明显较高,差异均有统计学意义（〖WTBX〗P〖WTBZ〗<0.05）。Treg/Th17与类杆菌属、嗜血杆菌属、韦荣球菌属、真杆菌属、厚壁菌门、乳杆菌属的相对丰度呈明显正相关（均P<0.05）,与普雷沃菌属、变形菌门、梭状芽胞杆菌属、放线菌门、戈登菌属、拟杆菌门呈明显负相关（均P<0.05）。结论 RA合并ILD患者存在Treg/Th17细胞比例失衡,而肠道菌群失衡可能是其失衡的主要原因     

清肺通络合剂对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎患者肠道菌群多样性的影响

目的 探讨中药清肺通络合剂（QFTLM）对气阴两虚兼痰热型社区获得性肺炎（CAP）患者肠道菌群多样性的影响。方法 采用前瞻性临床对照研究方法,根据患者采用的治疗方法不同,将23例气阴两虚兼痰热型CAP患者分为两组：予抗菌药物治疗组10例,予抗菌药物联合QFTLM治疗组13例。收集治疗前后患者粪便样本46份,利用PacBio测序平台进行16S rRNA测序,分析两组患者治疗前后样本中肠道菌群的组成、多样性和显著性差异物种。结果 （1）两组治疗前后肠道菌群的组成：在门水平为厚壁菌门、变形杆菌门、拟杆菌门、疣微菌门和放线菌门;在纲水平为梭菌纲、革兰阴性菌纲、芽孢杆菌纲、丹毒丝菌纲、拟杆菌纲、γ-变形杆菌纲、疣微菌纲和放线菌纲;在目水平为拟杆菌目、梭菌目、单胞菌目、肠杆菌目、乳杆菌目、丹毒丝菌目和颤螺菌目;在科水平为拟杆菌科、乳球菌科、肠杆菌科、韦荣球菌科、艾克曼菌科、毛螺菌科、喜热菌科、链球菌科、丹毒丝菌科和肠球菌科;在属水平为拟杆菌属、粪杆菌属、埃希氏菌属、罕见小球菌属、巨单胞菌属、艾克曼菌属、梭菌属、链球菌属和肠球菌属。（2）两组治疗前后梭菌纲的相对丰度抗菌药物组治疗前后为（0.48±0...     

帕金森病患者肠道菌群变化与临床特征的相关性研究

目的分析帕金森病患者肠道菌群的变化及与临床特征的相关性。方法选择2017年11月至2019年2月温州市人民医院神经内科诊治的帕金森病患者（PD组）和同期健康体检者（HC组）,各30例。对PD组进行统一帕金森病评分量表第三部分（UPDRSⅢ）、Hoehn＆Yahr分级量表（H-Y分级）、简易精神状态检查量表（MMSE）、汉密尔顿抑郁量表（HAMD）、汉密尔顿焦虑量表（HAMA）、帕金森病自主神经症状量表（SCOPA-AUT）、Wexner便秘评分等评估。采集两组对象血液、粪便样本,通过16S-rDNA测序确定微生物种类并进行微生物分类分析,利用生物信息学方法对比PD组和HC组之间的差异菌群,并对PD组患者菌群丰度和临床特征进行相关性分析。结果PD组和HC组菌群多样性比较,差异无统计学意义（P＞0.05）。PD组患者粪便中门水平疣微菌门、黏胶球形菌、异常球菌的丰度高于HC组,属水平毛螺旋菌属、链球菌属、克雷伯菌属、伯劳特菌属丰度低于HC组,埃希菌属、瘤胃球菌属、巨单胞菌属、阿克曼菌属、巨型球菌属、颤杆菌属、伯克菌属、埃森博格拉菌属、异味杆菌属、丹毒丝菌科未命名属、脱硫弧菌属、普雷沃菌属、单胞菌属、脱硫弧菌科未命名属、嗜胨菌属丰度高于HC组,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。UPDRSⅢ与脱硫弧菌呈正相关（rho=0.482,P＜0.05）。HAMA、HAMD与巨型球菌属呈正相关（rho=0.524、0.429,P＜0.05）。SCOPA-AUT与普雷沃菌属呈负相关（rho=-0.558,P＜0.05）。MMSE与埃森博格拉菌属呈负相关（rho=-0.547,P＜0.05）。结论PD组和HC组的菌群结构在门、属水平上均有明显的差异。PD组患者肠道菌群中条件致病菌的增多及短链脂肪酸产生菌减少。帕金森病菌群变化与临床特征有一定相关性。