HIV1膜蛋白PND编码基因自然变异株的发现

目的 对1例来自华东地区HIV1分离株（WWBH7）的前病毒env基因C2-V3区进行序列分析。方法 以HIV1感染者外周血单个核细胞基因组为模板进行套式PCR扩增HIV1env基因C2-V3区片段,将此扩增产物插入T-Vector,酶切鉴定重组质粒,使用AB1737自动DNA序列测定仪测定序列并用DNASIS软件进行分析。结果 DNA序列资料显示该毒株属于HIV1B亚型衍生株,但与HIV1B亚型的标准株如SF2株相比,该HIV1毒株的env基因V3区下游有192bp的重复插入突变,使得该毒株的膜蛋白PND编码基因呈现双V3区的变异该段DNA序列已登录于GenBank(AF220245)。结论 该分离株是1个在膜蛋白PND编码基因有大片段插入突变的HIV1变异株。     

国外乙型肝炎病毒变异株的研究进展

近年来，国内外发现许多非典型乙型肝炎病例，他们缺乏ＨＢＶ血清学标志，研究分析表明这样的病人感染的是一些ＨＢＶ变异株，有的Ｓ基因或Ｃ基因或Ｘ基因发生突变，有的则可能多个基因区域存在突变，而且突变的类型也是多种多样的，这给乙型肝炎的预防、诊断治疗提出了新的问题。最突出的是漏检，ＨＢＶ变异株缺乏常规血清学标志；其次是疫苗免疫失败，由ＨＢｓＡｇ主蛋白组成的疫苗是有效的。但对变异株的作用较差或不起作用。ＨＢ     

乙肝患者血清抗—HBe效价与HBeAg阴性变异株出现频…

利用多聚酶链反应结合寡核苷酸探针杂交的方法，对７７例抗－ＨＢｅ阳性的乙肝病人血清了乙肝病毒ＨＢｅＡｇ阴性变异的分析，同时研究了血清抗－ＨＢｅ滴度与ＨＢｅＡｇ阴性变异出现频率的关系。结果１４例单独野毒株感染的病人，抗－ＨＢｅ平均效价为４．７９±１４．４５；１９例野毒怀变异株混合感染的病人，抗－ＨＢｅ平均效价为１２８．８３±２３．４４；１８例单独变异株感染的病人，抗－ＨＢｅ平均效价为２８．１８±３７．     

黑龙江省乙型肝炎病毒拉米夫定耐药株YMDD变异与基因型、BCP区变异的相关性研究

目的 探讨黑龙江省乙型肝炎病毒(HBV)拉米夫定耐药株YMDD变异与基因型、HBV BCP变异之间的相关性.方法 对收集的245例经拉米夫定治疗的慢性乙型肝炎患者血清标本,采用多重PCR法检测HBV的基因型;荧光标记杂交双探针PCR融解曲线法(FH-PCR-MC)检测HBV YMDD变异及变异类型;巢式PCR法扩增HBV C基因区,测序分析BCP位点变异并进行统计学分析.结果 在HBV YMDD野生株、变异株中,基因型B、C、B与C混合型分别为8.8％、89.2％、2.0％;6.3％、93％、0.7％,基因型构成比无统计学的差异.HBV BCP的变异率在YMDD野生株与变异株分别为69.6％、76.9％,无统计学的差异.在HBV YMDD野生株中,HBV B基因型BCP的变异率22.2％,C基因型BCP的变异率73.6％存在统计学差异(P＜0.01),但在YMDD变异株中,无统计学的差异.在YIDD、YVDD变异株HBV BCP变异率分别为83.0％和64.6％,存在统计学的差异(P＜0.05).结论 在HBV YMDD野生株中,与B基因型相比,C基因型更易发生BCP变异;YMDD变异株中,BCP变异率在B、C基因型间无统计学差异,BCP变异在变异类型间(YIDD、YVDD)存在统计学差异;与YVDD变异株相比较,YIDD变异株易发生HBV BCP的变异.     

galE基因敲除后空肠弯曲菌变异株脂寡糖结构的改变

目的：研究galE基因敲除后空肠弯曲菌变异株脂寡糖结构改变。方法：提取空肠弯曲菌(CJ）HB9313及galE^-变异株脂寡糖，Tricine-SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分离后，分别进行银染、免疫印迹及霍乱毒素配体印迹检查。结果：与野生株比较变异株的脂寡糖分子量变小，电泳迁移速度快，不能与CJHB9313脂寡糖抗体结合，并失去与其配体结合的能力。结论：galE基因敲除变异株丧失了脂寡糖外核糖基及神经节苷脂CM1样结构，可能成为安全减毒活菌苗的有力候选者。     

贵阳地区GⅡ.4型诺如病毒变异株的初步研究

目的 了解贵阳地区GⅡ.4型诺如病毒变异株的组成及其点突变.方法 监测2010年6-11月于贵阳地区哨点医院就诊的急性胃肠炎病例,收集粪便标本,采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(real-time RT-PCR)初步鉴定,随机选取部分GⅡ型诺如病毒阳性标本,采用一步法RT-PCR对其VP1基因区克隆及测序,基因序列与国内外流行的GⅡ.4型诺如病毒进行系统进化及氨基酸位点的突变分析.结果 检测标本426份,有267份(62.68％)GⅡ型诺如病毒阳性,测序获得了9份GⅡ.4型诺如病毒VP1基因组序列,贵州省2010年流行的GⅡ.4型诺如病毒包括2个变异株(GⅡ.42008a和GⅡ.4 2008b新型变异株),亚型组闻的VP1基因的同源性为95.90％ ～ 96.72％,亚型组内同源性为99.45％ ～ 100％,有2个氨基酸位点易发生突变.结论 贵阳地区2010年夏秋季急性胃肠炎以诺如病毒GⅡ型为主,并且变异株具有多样性.     

2021年河南省新型冠状病毒Delta变异株肺炎流行病学及分子特征研究

目的:分析总结2021年河南省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus, SARS-CoV-2)Delta变异株肺炎流行病学及分子特征,为疫情防控提供依据。方法:依据中国疾病预防控制中心(Chinese Centre for Disease Control...     

一株HIV1变异株的发现

我们在进行序列分析过程中发现一株不同于以往国内外报道的新型ＨＩＶ1的变异毒株。现报道如下 :1　材料和方法1.1　前病毒ＤＮＡ的提取　某ＨＩＶ1感染者 30 0 μｌＥＤＴＡ抗凝血 ,使用Ｐｒｏｍｅｇａ公司的ＤＮＡ提取试剂盒 (ＷｉｚａｒｄＧｅｎｏｍｉｃＤＮＡＰｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎＫｉｔ)提取ＨＩＶ1前病毒ＤＮＡ。1.2　ＨＩＶｅｎｖ基因ｃ2 -ｖ3区的套式ＰＣＲ扩增　以所提的ＨＩＶ1前病毒ＤＮＡ为模板 ,利用一对外侧引物ＥＰ1,ＥＰ2 (序列为 ,ＥＰ1:5′ -ＧＧＣＡＧＴＣＴＡＧＣＡ ＧＡＡＧＡＡＧＡＧＧ - 3′ ;ＥＰ2 :5′ -ＣＣ…     

从抗-HEV阴性的戊型肝炎病人血清中检测到1株HEV变异株

Objective　To investigate genotypes of hepatitis E viruses isolated from hepatitis E patients with negative anti-HEV. Methods　Acute-phase sera of 22 hepatitis patients with negative anti-HAV IgM, HBsAg, anti-HBc IgM, anti-HCV and anti-HEV were detected for HEV RNA using a RT-nPCR based on a set of degenerate primers derived from open reading frame 2 of HEV. The positive PCR products were directly sequenced. Results　Among 22 acute hepatitis patients, 9(40.9%) were HEV RNA positive. Six PCR products of 9 sera were directly sequenced. Five of them shared the same subtype with HEV Chinese strain (L25595), with the nucleotide identity of 98.0% and the amino acid identity of 99.0%. The remainder, designated HEV LZ-105, was a variant of HEV. The nucleotide and amino acid homology of HEV LZ-105 with HEV(China),HEV(Burma),HEV(Mexico),and the newly identified HEV US-1 and swine HEV was 77.4%,78.1%,74.3%,77.4%,77.1% and 91.0%,91.0%,89.0%,93.0%,93.0%,respectively. Conclusion　A variant of HEV was isolated from a hepatitis E patient with negative anti-HEV.     

变异银环蛇的蛇毒及DNA分析研究

目的 比较变异与正常银环蛇蛇毒及DNA的差异，为进一步研究银环蛇在自然界的生存、进化、分类，提供分子生物学的研究基础。方法 ①利用聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）分析蛇毒蛋白的组分；②利用随机引物扩增（Bandom Amplified Polymorphie DNA，RAPD）的方法对1例变异银环蛇和10例华南常见银环蛇的DNA进行扩增。结果 SDS-PAGE结果发现变异银环蛇毒的蛋白组分与正常银环蛇基本相同，但在43KD大小的一条蛋白带含量明显减少；RAPD扩增的DNA条带有明显差异。结论 ①变异银环蛇的蛇毒蛋白组分含量发生改变；②该变异银环蛇与正常银环蛇DNA差异显著。     

新型冠状病毒英国变异株的核酸检测试剂有效性和敏感性评估

目的:评估三种商用试剂盒对新型冠状病毒英国B.1.1.7变异株的检测效果。方法:收集2021年1月北京市某区新冠肺炎聚集性疫情期间的10份鉴定为B.1.1.7变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本,同时收集2020年6—12月北京市监测发现的10份鉴定为非变异株的咽拭子、鼻咽拭子样本做为对照。用三种可检测该变异株的商业化试剂盒分...     

24例新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染的临床特征分析

目的 分析新生儿新型冠状病毒Omicron变异株感染病例的临床特点。方法 收集新型冠状病毒Omicron变异株感染新生儿24例为感染组,非感染组29例为对照组。分析感染患儿的临床特征及转归,比较两组患儿的炎症指标和其他实验室指标水平。结果 感染患儿在生后均有新型冠状病毒感染阳性家庭成员密切接触史。临床分型均为轻型,21例(87.50%)患儿出现发热,多伴有1种或几种其他症状。感染组结果显示4例(16.67%)白细胞计数降低,8例(33.33%)淋巴细胞计数降低;2例(9.52%)天冬氨酸氨基转移酶升高,21例(100%)前白蛋白均降低;5例(26.32%)胱抑素C升高;1例(4.76%)肌酸激酶升高,19例(90.48%)乳酸脱氢酶升高。与对照组比较,感染组血白细胞、淋巴细胞、淋巴细胞/单核细胞比值(LMR)、前白蛋白水平均显著降低(P<0.01﹚,血小板/淋巴细胞比值(PLR)、天冬氨酸氨基转移酶、胱抑素C、肌酸激酶、乳酸脱氢酶水平均显著升高(P<0.05﹚。所有患儿对症治疗后均痊愈出院,住院时间中位数为5d。结论Omicron变异株感染新生儿病例表现为轻型,临床症状主要...     

变异银环蛇的蛇毒及DNA分析研究

目的比较变异与正常银环蛇蛇毒及DNA的差异,为进一步研究银环蛇在自然界的生存、进化、分类,提供分子生物学的研究基础.方法①利用聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)分析蛇毒蛋白的组分;②利用随机引物扩增(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)的方法对1例变异银环蛇和10例华南常见银环蛇的DNA进行扩增.结果 SDS-PAGE结果发现变异银环蛇毒的蛋白组分与正常银环蛇基本相同,但在43KD大小的一条蛋白带含量明显减少;RAPD扩增的DNA条带有明显差异.结论①变异银环蛇的蛇毒蛋白组分含量发生改变;②该变异银环蛇与正常银环蛇DNA差异显著.     

变异链球菌luxS基因缺陷突变株生物学性状的初步观察

目的 为研究口腔主要致龋菌变异链球菌的种属间密度感应(quorum sensing)相关基因luxS对口腔生态的影响,构建此菌的luxS基因缺失突变株.方法 采用同源重组的方法,利用红霉素耐药基因erm置换变异链球菌基因组中的luxS基因,并在含抗性标记的选择性培养基上筛选出阳性克隆.初步研究该基因的缺失突变对变异链球菌在生长与生物被膜成熟分化中的作用.结果经PCR鉴定,luxS基因的置换突变位置正确,并能在体外稳定传代,突变株与野生株相比在达静止期后总菌数量上有明显差别,但在生物被膜的形成与分化上并未发现显著差异.结论 通过此研究建立了可稳定传代的变异链球菌luxS基因的缺失突变株,生长表型和生物被膜的形成与野生株无显著差异,为进一步研究此基因功能与调控机制提供了技术平台.     

waaF空肠弯曲菌变异株神经节苷脂表位的改变

目的:探索waaF空肠弯曲菌(CJ)变异株是否失去神经节苷脂模拟结构,不再能诱导抗神经节苷脂抗体产生,为CJ诱发Guillain-Barr啨综合征的分子腄饫砺厶峁┲ぞ荨7椒?将26只日本大耳兔随机分为CJ亲代株组(10只)、waaF变异株组(10只)、对照组(6只),分别用弗氏佐剂加入亲代株CJ、waaF变异株及生理盐水,对三组动物皮下注射免疫。ELISA动态检测三组动物免疫前及免疫后2周和4周血清中CJ脂寡糖(LOS)及多种神经节苷脂(GM1、GD1a、GD1b、GD3、GT1b)抗IgG抗体水平的变化。结果:免疫后2周,亲代株及waaF变异株组动物血清抗LOS-IgG抗体滴度(0.758±0.136及0.744±0.125)较免疫前(0.250±0.101及0.226±0.083)明显增高(P0.05),4周进一步增高为(0.971±0.214及0.975±0.172),亲代株及waaF变异株两组间无明显差异(P0.05),对照组免疫前后LOS-IgG抗体水平无明显改变;免疫后2周,亲代株组动物血清抗GM1-IgG、GD1a-IgG及GT1b-IgG抗体水平(0.661±0.290、0.487±0.041及0.457±0.071)较免疫前(0.173±0.081、0.151±0.038及0.182±0.101)明显增高(P0.05),4周进一步增高为(0.984±0.025、0.541±0.178及0.574±0.156),waaF变异株组及对照组免疫后未见神经节苷脂抗体增高。结论:CJ的LOS外核上神经节苷脂样结构是诱导抗神经节苷脂抗体产生的关键结构,为CJ感染后GBS的分子模拟机制提供证据,waaF变异株丧失了多种神经节苷脂模拟的抗原表位,但保留LOS免疫原性,可能成为安全减毒活菌苗的候选株。     

差别PCR及在癌相关基因扩增和缺失研究中的进展

基因的扩增与缺失是癌基因等活化、抑制基因等失活的常见机制之一，差别－ｄ－ＰＣＲ为上述遗传学改变了提供了简便并较敏感的非同位数技术，本文简述了近年严ｄ－ＰＣＲ方法学和用于肿瘤研究的进展。     

中国人家族性结直肠癌错配修复基因大片段变异分析

目的分析中国人家庭性结直肠癌错配修复基因大片段变异的特点。方法 采用多重连接探针扩增技术，分析32例具有家庭史结直肠癌、20例散发性结直肠癌患者错配修复基因MSH2的16个外显子、MLH1的19个外显子及7个其它基因外显子的拷贝数。研究工作包括：（1）双盲法分析阴性和阳性对照样本，完成方法学可靠性检验；（2）分析结直肠癌患者外周血细胞DNA，筛查MSH2和MLH1基因大片段变异。结果 多重连接探针扩增技术分析系统稳定检出阳性对照样本的DNA大片段缺失；在3/32（9.4%）具有家庭聚集性结直肠癌患者中检出遗传性MSH2基因DNA大片段缺失。而在20例散发性结直肠癌患者未检出这类突变。结论 中国人家族性结直肠癌患者中错配修复基因的大片段变异是频发事件，对此类患者的遗传检测应包含错配修复基因大片段变异的筛查。     

乙型肝炎病毒前C/C基因准种与变异特点的研究

近年来的研究提出ＨＢＶ感染者体内存在有准种的假说 ,我们以前Ｃ/Ｃ基因为研究靶区域 ,应用多聚酶链反应(ＰＣＲ)技术扩增慢性乙型肝炎患者血清中的靶序列 ,随机选择克隆测序 ,比较其结果 ,证明了ＨＢＶ准种的存在 ,并发现多种基因突变形式。试验用 4例患者诊断为病毒性肝炎 ,乙型、慢性 ,临床检测ＨＢｓＡｇ、ＨＢｅＡｇ、抗 ＨＢｃ阳性。提取 2 0 0 μｌ血清中的ＨＢＶＤＮＡ ,用于多聚酶链反应 (ＰＣＲ)。以甘人宝等发表的ＨＢＶａｄｒ亚型序列为依据 ,设计引物序列。其上游引物为 :5′ＡＣＴＧＣＡＧＧＣＡＣＣＡＴＧＣＡＡＣＴＴＴＴ…     

乙型肝炎病毒变异及其意义

乙型肝炎病毒（hepatitis Bvirus，rmv）在其慢性感染过程中，可以发生基因变异。引起变异的原因，一是由HBV自身分子生物学的特性决定，二是由宿主的特异性免疫应答及抗病毒药物选择所致。HBV变异可引起对宿主的影响，特别是对HBV感染的自然过程，病毒的清除及抗病毒药物反应等产生影响。近年国内外有关乙型肝炎病毒的研究成果不断涌现，现将乙型肝炎病毒变异及其意义做一综述。