SHMT1基因启动子甲基化与缺血性卒中相关

目的探究丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT1)基因甲基化与缺血性卒中的关系。方法采用甲基化特异性实时定量PCR测定290名健康对照组和141例缺血性卒中病例组(卒中组)的SHMT1甲基化水平。结果卒中组SHMT1甲基化水平为24.87%(16.97～35.46)高于对照组的6.58%(2.43～15.14)(P<0.05)。在调整相关危险因素后,SHMT1甲基化是卒中的危险因素(OR=1.051, 95%CI=1.034～1.068)。受试者工作特征曲线下面积为0.804,95%CI=0.760～0.849 (P<0.01)。在对照组发现尿酸与SHMT1甲基化相关(r_s=0.17,P<0.01),在卒中组发现三酰甘油与SHMT1甲基化相关(r_s=0.18,P<0.05)。SHMT1甲基化表达与mRNA的表达呈负相关(r=-0.472,P<0.01)。结论缺血性卒中患者中SHMT1基因启动子呈高甲基化状态,SHMT1低表达,且SHMT1高甲基化是卒中的危险因素。     

IFITM1基因启动子甲基化与新疆维吾尔族妇女子宫颈癌的相关性

目的探讨IFITM1基因启动子甲基化与新疆维吾尔族妇女子宫颈癌的相关性以及早期诊断的可行性,分析IFITM1基因甲基化对mRNA表达的影响。方法采用甲基化特异性PCR方法和HPV16、HPV18特异的PCR方法分别检测了40例正常子宫颈组织和40例新疆维吾尔族妇女子宫颈癌组织的IFITM1基因启动子甲基化情况和高危险性HPV的感染情况,并分析两个指标的相关性。用RT-PCR方法检测10例甲基化阳性和10例甲基化阴性的组织IFITM1基因的mRNA表达情况。结果 31例子宫颈癌组织IFITM1基因启动子甲基化,3例子宫颈正常组织发生甲基化,在子宫颈癌中高危险性HPV的感染例数为27例,在正常组织中为5例。40例子宫颈癌组织中,HPV16、HPV18感染阳性的组织IFITM1基因甲基化的发生率增高(P0.05),在10例甲基化阳性的组织中IFITM1基因mRNA的表达水平明显低于10例甲基化阴性的组织(P0.01)。结论 IFITM1基因启动子甲基化是子宫颈癌发生的关键分子标志物,具有大规模临床筛选试验的价值。     

急性白血病p53基因P1启动子区域DNA甲基化研究

目的：通过检测急性白血病（AL）中p53基因P1启动子异常甲基化，探讨p53基因异常甲基化在急性白血病中的意义。方法:分别使用限制性内切酶MspⅠ、HpaⅡ、EcoRⅡ、BstNⅠ酶切提取基因组DNA，然后分别使用酶切后产物及基因组DNA为模板进行PCR扩增。产物电泳后在凝胶成像分析系统内观测电泳条带及摄像；部分标本的电泳条带经凝胶回收纯化后进行测序。结果:急性白血病患者p53基因第一启动子甲基化阳性率为38.7％，而急性淋巴细胞白血病（ALL）与急性非淋巴细胞白血病(ANLL)患者分别为45.5％、35.0％。正常对照标本中未检测到p53基因的异常甲基化。p53基因甲基化情况在急性白血病病人与正常人之间经过统计学检验，P<0.05；但急性淋巴细胞白血病与急性非淋巴细胞白血病患者之间无显著差异，P>0.05。分析急性白血病患者p53基因甲基化与患者临床资料之间的关系，其中，p53基因异常甲基化与肝脾淋巴结是否肿大之间的关系经统计学分析P<0.05。结论:①部分急性白血病患者存在p53基因第一启动子异常甲基化，正常对照中未检测到p53基因的甲基化；②p53基因第一启动子在急性淋巴细胞白血病与急性非淋巴细胞白血病均可发生异常甲基化，两者之间发生甲基化的概率无统计学差异；③p53基因异常甲基化与肝脾淋巴结肿大有显著差异，但p53基因异常甲基化与急性白血病治疗效果及预后的关系尚不能确定，须进一步研究确定。     

DNA甲基化与胃癌关系的研究进展

胃癌是我国最常见的恶性肿瘤 ,多种研究表明 ,ｐ5 3、ｐ2 1、ｃ ｅｒｂＢ 2、ｃ ｍｙｃ等基因的突变、缺失等遗传学改变与胃癌的发生、发展密切相关。然而 ,只有部分或少部分胃癌中检测到有重要基因的突变 ,最近人们逐渐认识到基因表达的异常与肿瘤关系甚为密切。 1999年 ,在《自然》杂志上发表了一篇题为“癌症的ｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｓ时代来临”[1] 。同年 ,在《科学》杂志上也发表了一篇关于ｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｓ的文章[2 ] ,由此可见ｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｓ已成为国际研究热点。ｅｐｉｇｅｎｅｔｉｃｓ是ｇｅｎｅｔｉｃｓ(遗传学 )的…     

乳腺癌相关基因启动子甲基化的研究进展

表基因的改变是乳腺癌发生发展过程中非常重要的机制。DNA甲基化是一种表观遗传修饰,是基因表达调控的一种方式。目前,已发现许多肿瘤相关基因启动子区CpG岛的甲基化异常与乳腺癌的发生密切相关。该文就乳腺癌相关基因甲基化的研究进展作一综述。     

DNA错配修复基因甲基化在肝细胞癌发生发展中的作用

目的探讨DNA错配修复基因(MMR)hMLH1,hMSH2和hMSH3甲基化在肝细胞癌(HCC)发生发展中的作用。方法采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)法对38例新鲜HCC组织,相应非肿瘤肝组织,2例正常的捐肝组织及6种肝癌细胞系的hMLH1,hMSH2和hMSH3基因启动子CpG岛甲基化进行检测;培养6种肝癌细胞系,MSP法检测加入5-aza-2‘-deoxycytidine前后hMSH2基因在HCC中的甲基化状态改变;逆转录．聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测加入5-aza-2’-deoxycytidine前后hMSH2在肝癌细胞株中的mRNA表达改变。结果HCC标本中13．2％(5／38)发生了hMLH1启动子甲基化,68．4％(26／38)发生了hMSH2启动子甲基化;相应的非肿瘤肝组织中hMLH1,hMSH2启动子甲基化阳性率分别为2．6％(1／38),55．3％(21／38);2例正常肝组织中未发现甲基化;6株肝癌细胞系中有5株发生了hMSH2启动子甲基化,而未发现有MLH1启动子甲基化。所有标本中均未发现有hMSH3启动子甲基化。5-aza-2‘-deoxycytidine处理细胞株后,可部分或完全逆转hMSH2启动子甲基化,各细胞株的mRNA均有不同程度的表达增加。结论hMSH3基因启动子CpG岛甲基化与HCC的发生发展关系不大。hMSH2基因甲基化与mRNA表达密切相关,是基因表达调节的一种重要方式。hMLH1和hMSH2基因启动子CpG岛的高甲基化在HCC中是一个常见的基因改变,DNA错配修复基因尤其是hMSH2基因启动子甲基化在HCC的发生中起了重要作用,是早期事件,其可能为临床诊断HCC提供新的检测指标。     

RUNX3基因启动子甲基化与胃癌关系的meta分析

目的采用meta分析的方法评价RUNX3基因启动子甲基化与胃癌发生的关系。方法检索公开发表在Pubmed、EMBASE、Ovid、中国期刊全文数据库（CNKI）关于RUNX3基因启动子甲基化与胃癌发生关系的研究。应用Statall．0统计软件分析RUNX3基因启动子甲基化与胃癌发生间的关联。结果共有19项研究纳入分析．meta分析结果显示：胃癌患者癌组织中RUNX3基因启动子甲基化发生率为P=55％（95％CI：45％～66％）：胃癌患者远癌正常胃组织中RUNX3基因启动子甲基化发生率为P=18％（95％CI：7％～29％）。与远癌正常胃组织相比,胃癌组织中RUNX3基因启动子甲基化发生优势比OR=7．85（95％CI：5．81～10．61）。结论胃癌患者癌组织中RUNX3基因启动子甲基化发生率明显高于远癌正常胃组织,RUNX3基因启动子甲基化可能与胃癌的发生密切相关。     

肾细胞癌RASSF1A基因启动子区甲基化状况与表达水平研究

目的检测19例肾细胞癌患者癌组织及癌旁组织Ras相关区域家族蛋白1A（RASSFlA）基因启动子区甲基化情况并检测其mRNA表达水平，探索两者之间的联系。方法收集肾细胞癌患者癌组织及相应癌旁组织19份，分别提取其基因组DNA，以甲基化特异性PCR（Methylation special PCR，MSP）法检测RASSFlA基因启动子区甲基化情况。并以QPCR法检测了RASSFlA基因的mRNA表达水平。结果19例中有lO例肾细胞癌患者癌组织存在高甲基化，mRNA表达水平表达降低，二者之间存在显著负相关性（r=-0．8734，P〈0．01）。结论肾细胞癌中RASSFlA基因启动子区存在高甲基化，并抑制该基因的表达。     

DNA甲基化与印记基因

[摘要] 遗传外修饰指不影响DNA遗传编码而调控基因组活性的过程,甲基化转移酶在该过程中发挥着重要的作用。配子的遗传外编程是印记建立的必要条件,与印记的形成机制有关,对基因组功能有重要影响。DNA甲基化、组蛋白乙酰化在印记基因表达过程中相互作用。印记基因可以解释肿瘤的发生以及一些遗传性疾病。有逐渐增多的证据表明,辅助生殖技术 (assisted reproductive technologies,ART)与印记基因存在联系,探索ART影响印记基因的机制将有助于ART技术的完善,防止ART相关并发症的发生。本文就DNA甲基化与印记基因研究进展进行综述。     

胃癌细胞株中NPRA基因启动子区CpG岛的甲基化分析

目的NPRA-cGMP信号通路系统可激活cGMP依赖的蛋白激酶,活化的蛋白激酶调控离子转运蛋白和转录因子的表达,从而最终影响细胞生长、凋亡、增殖和炎症反应。本研究旨在研究NPRA基因在胃癌细胞中的甲基化状态及其对下游mRNA表达的影响。方法应用亚硫酸氢钠处理基因组DNA后PCR并测序,我们分析了6株胃癌细胞株NPRA基因的甲基化状态及去甲基化试剂对下游mRNA表达的影响。结果在胃癌细胞中发现NPRA基因启动子区存在甲基化畸变并导致下游mRNA表达减少或沉默。去甲基化试剂可逆转mRNA表达沉默。结论胃癌细胞中存在NPRA基因甲基化畸变。     

宫颈鳞状细胞癌组织中hMSH2启动子甲基化及蛋白表达的研究

目的检测宫颈鳞癌组织中hMSH2启动子甲基化及蛋白表达，探讨hMSH2在宫颈鳞癌发生、发展中的作用。方法采用甲基化特异性PCR方法和免疫组织化学方法分别检测正常宫颈组织、宫颈鳞癌组织中hMSH2启动子甲基化状况及蛋白表达。结果正常组织中未见hMSH2启动子甲基化，其蛋白表达为阳性表达；宫颈鳞癌组织中可见启动子甲基化，蛋白表达也表现异常或缺失。结论错配修复基因的正常表达是保证基因稳定的重要因素，hMSH2启动子区域甲基化及蛋白表达缺失在宫颈鳞状细胞癌的发生、发展过程中起一定作用。     

Aberrant promoter methylation of the PAQR3 gene is associated with prostate cancer

Methylation markers are promising tools for diagnosis, prognosis and targeted treatment of cancer. In prostate carcinoma, aberrant promoter hypermethylation occurs earlier in the disease course and more consistently than recurrent somatic mutations. PAQR3, a tumor suppressor gene, was recently found to be downregulated in prostate cancer cell lines. We hypothesized that promoter methylation could be responsible for PAQR3 silencing in prostate cancer tissues. We aimed to investigate PAQR3 promoter methylation in prostate cancer by comparing it to benign prostatic hyperplasia (BPH). A total of 154 human prostate tissue samples, including 92 cases with prostate cancer and 62 cases with BPH, were examined by methylation-specific PCR. Clinicopathological correlation between PAQR3 promoter methylation and prognostically relevant variables was studied by statistical analysis. Promoter methylation of PAQR3 was significantly more frequent in prostate carcinoma compared to BPH (73.9% vs. 25.8%, p < 0.01). The high prevalence of PAQR3 methylation in cancer foci was also confirmed with microdissection technique in 12 samples of prostate adenocarcinoma. PAQR3 hypermethylation was associated with perineural invasion (p = 0.03), an adverse clinicopathological feature of prostate cancer. We concluded that PAQR3 can be a promising methylation marker candidate for the detection and monitoring of prostate cancer.     

Fibulin-1基因启动子区域甲基化与食管癌的关系研究

目的:检测食管癌Fibulin-1基因启动子区域甲基化的情况,探讨其相关的临床意义.方法:选取黄石市中心医院2014年1月至2016年2月收治的食管鳞状细胞癌患者96例,另取同期黄石市中心医院因食管良性病变手术切除的食管组织40例作为对照.Fibulin-1基因启动子甲基化使用亚硫酸盐修饰后PCR检测.免疫组织化学检测显示Fibulin-1蛋白表达.结果:食管癌患者中Fibulin-1基因启动子甲基化阳性率为36.5％,显著高于对照组的15.0％(x2=2.517,P=0.036).免疫组织化学检测显示Fibulin-1基因启动子甲基化标本中Fibulin-1蛋白阳性表达率为90.2％.食管癌患者男女性别和不同年龄之间Fibulin-1基因启动子甲基化率无显著性差异(P＞0.05).Ⅲ,Ⅳ临床分期患者Fibulin-1基因启动子甲基化率为43.1％,显著高于Ⅰ,Ⅱ临床分期患者的28.9％(x2=2.426,P=0.046).肿瘤有淋巴结转移患者Fibulin-1基因启动子甲基化率为44.4％,显著高于无淋巴结转移患者的26.2％(x2=2.438,P=0.041).肿瘤中、低分化患者Fibulin-1基因启动子甲基化率为42.6％,显著高于高分化患者的25.7％(x2=2.431,P=0.043).结论:Fibulin-1基因启动子在食管癌组织中高甲基化,Fibulin-1基因启动子高甲基化与食管癌的临床分期、肿瘤分化程度以及有无淋巴结转移密切相关.     

胃癌相关抑癌基因甲基化研究进展

DNA甲基化是一种表观遗传修饰,它与肿瘤的发生关系密切。DNA甲基化是基因表达调控的一种方式。抑癌基因启动子高甲基化可以使其表达失活,导致肿瘤发生。胃癌的发生与多基因异常表达密切相关,其中抑癌基因甲基化是胃癌发生发展的重要机制之一。     

粪便DNA中X染色体连锁凋亡抑制蛋白相关因子1基因启动子甲基化状态在结直肠癌筛查中的应用研究

目的以粪便DNA中x染色体连锁凋亡抑制蛋白相关因子（XAF）1基因启动子区域的甲基化状态为靶目标,建立新的有效的筛查结直肠癌的方法。方法收集需做肠镜检查患者自然排泄粪便,经肠镜或病理学检查确诊后,分为3组,结直肠正常组45例,结直肠腺瘤组30例,结直肠腺癌组24例。使用QIAampDNAStoolMiniKit自粪便抽提人DNA。应用甲基化特异性的PCR（MSP）检测粪便DNA中XAFl基因启动子区域甲基化状态。结果经genomic—DNAPCR,证实所提取DNA均含有人基因组DNA。经MSP检测,正常组存在高甲基化15例,阳性率33．33％;腺瘤组18例,阳性率60．00％;腺癌组15例,阳性率62．50％,腺瘤组、腺癌组与正常组比较差异有统计学意义（P〈0．05）,但腺瘤组与腺癌组差异无统计学意义（P〉0．05）。结论使用Qiagen试剂盒抽提粪便中人DNA的方法比较稳定。以粪便DNA中XAFl基因启动子区域甲基化状态为靶目标进行结直肠肿瘤的早期诊断,敏感度、特异度较高,但尚需要大样本研究进一步验证。     

DNA甲基化和组蛋白乙酰化与胃癌的研究进展

胃癌是我国最常见的恶性肿瘤，但其具体发病机制还不是很清楚。表遗传学改变，如DNA甲基化和组蛋白修饰改变可以调节基因的表达，在肿瘤的发生和发展中可能起关键作用。近年来一些胃癌相关基因的DNA甲基化和组蛋白乙酰化改变已经得到证实，这些基因改变涉及细胞凋亡、细胞周期阻滞、分化和增殖等。     

遗传性弥漫型胃癌家系上皮型钙黏素基因的分析

 摘要：目的 研究在遗传性弥漫型胃癌家系中是否存在上皮型钙黏素基因(CDH1)以及基因表达的异常。 方法 收集符合遗传性弥漫型胃癌(HDGC)诊断标准的1个家系中15例成员的外周血和组织标本。通过免疫组化和Western blot 的方法检测组织标本CDH1蛋白表达; 提取基因组DNA, 通过PCR扩增DNA直接测序检测CDH1基因16个外显子突变。用克隆测序法,鉴定CDH1基因启动子区CpG位点甲基化状况。 结果 先证者和另一胃癌患者(家系2号成员)的癌旁胃粘膜上皮细胞CDH1蛋白表达较正常胃粘膜减弱, 两者肿瘤组织的蛋白表达几乎为阴性。包括先证者在内的11例家系成员第14外显子mRNA水平2377位点存在一个C?T的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP), 但未检测到16个外显子的胚系突变。相对于正常胃粘膜, 先证者和家系2号成员的胃癌组织均有CDH1基因启动子的高甲基化, 其瘤旁粘膜也有高甲基化。结论 此HDGC家系中,CDH1基因表达丢失可能和胃癌发生有关, CDH1基因外显子突变不是其肿瘤组织上皮型钙黏素蛋白表达丢失的直接原因, 基因启动子区的甲基化可能是导致其失活的原因之一。     

Implication of Reprimo and hMLH1 gene methylation in early diagnosis of gastric carcinoma

DNA methylation has been recently recognized as a novel tumor marker. This study investigated the methylation status of Reprimo and hMLH1 gene in both plasma and tissue samples from gastric cancer patients, in an attempt to investigate their diagnostic implications in gastric cancer. A total of 180 tissue and plasma samples (including 50 cases of gastric cancer, 50 dysplasia, 50 chronic atrophic gastritis with intestinal metaplasia and 30 normal controls) were collected for detecting DNA methylation status of Reprimo and hMLH1 genes using MSP method. Tissue protein expression levels were further tested by immunohistochemical (IHC) staining. The positive rate of DNA methylation rate was, in ascending sequence, gastritis tissue, dysplasia tissue and gastric carcinoma tissue. All those tissues had significantly elevated DNA methylation level compared to normal group (P < 0.05). Expression level of Reprimo and hMLH1 proteins were, however, decreased in pathological tissues compared to normal ones (P < 0.05). A significantly negative relationship existed between protein level and promoter region methylation level. The DNA methylation occurred in promoter regions of both Reprimo and hMLH1 genes depressed the protein expression, and may participate in the occurrence and progression and gastric cancer. The combined assay of serum Reprimo and hMLH1 DNA methylation levels thus had critical importance in the early diagnosis and gastric cancer.