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非小细胞肺癌PC-9细胞厄洛替尼耐药潜在机制的RNA测序分析
引用本文:李凡妮,金凡琪,张浩为,佘军军,孙祺. 非小细胞肺癌PC-9细胞厄洛替尼耐药潜在机制的RNA测序分析[J]. 现代肿瘤医学, 2022, 0(1): 33-38. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2022.01.007
作者姓名:李凡妮  金凡琪  张浩为  佘军军  孙祺
作者单位:1.西安交通大学第一附属医院人才高地科研平台;2.普通外科,陕西 西安 710061
基金项目:国家自然科学基金(编号:81803026);陕西省重点研发计划(编号:2019KW-067)。
摘    要:目的:通过RNA测序分析比较亲本PC-9细胞和厄洛替尼获得性耐药PC-9细胞(PC-9/ER)表达谱的差异,揭示非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)耐药的潜在机制。方法:采用间歇诱导方法,建立PC-9/ER耐药细胞株,通过MTT实验绘制厄洛替尼药物浓度-细胞存活率曲线。通过RNA测序分析PC-9/ER细胞的差异表达基因并进行GO和KEGG功能富集分析;通过qRT-PCR进一步筛选可能参与EGFR-TKI耐药的潜在基因或可能的靶点。结果:厄洛替尼对PC-9/ER细胞增殖的抑制率显著低于PC-9细胞的抑制率,PC-9/ER细胞的耐药指数为41.92。与PC-9细胞相比,RNA测序PC-9/ER细胞筛选出1 028个差异表达基因,其中720个基因表达上调,308个基因表达下调,而且差异表达基因显著富集在PI3K-AKT通路和癌症通路。qRT-PCR验证差异表达基因的转录水平与测序结果基本一致。结论:ST6GALNAC3、CYP1A1、PAPPA2、INHBE和ACSS3等基因可能参与EGFR-TKI的耐药过程,针对PC-9/ER细胞差异表达基因的后续...

关 键 词:非小细胞肺癌  RNA测序  厄洛替尼  耐药

Potential mechanism for the resistance of non-small cell lung cancer PC-9 cells to erlotinib analyzed through RNA sequencing
LI Fanni,JIN Fanqi,ZHANG Haowei,SHE Junjun,SUN Qi. Potential mechanism for the resistance of non-small cell lung cancer PC-9 cells to erlotinib analyzed through RNA sequencing[J]. Journal of Modern Oncology, 2022, 0(1): 33-38. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2022.01.007
Authors:LI Fanni  JIN Fanqi  ZHANG Haowei  SHE Junjun  SUN Qi
Affiliation:1.Department of Talent Highland;2.Department of General Surgery,the First Affiliated Hospital of Xi'an Jiaotong University,Shaanxi Xi'an 710061,China.
Abstract:
Keywords:non-small cell lung cancer  RNA sequencing  erlotinib  drug resistance
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