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| 人糖皮质激素受体调控靶基因的生物信息学分析 | |
| 作者姓名： | 曾灵 顾玮 严军 王海燕 周建云 蒋建新 |
| 作者单位： | 第三军医大学大坪医院野战外科研究所创伤、烧伤、复合伤国家重点实验室第四研究室,重庆400042 |
| 基金项目： | 国家重点基础研究发展计划(973计划)(项目编号：2005CB522602) |
| 摘 要： | 目的分析糖皮质激素受体（GR）靶基因在人类基因组的分布及功能,明确其生物学意义。方法通过生物信息学的方法,在人类基因组中找出所有含有糖皮质激素反应元件（GRE）保守序列的基因。通过NCBI的基因注释得到基因名称、功能、基因的蛋白产物及其对应的基因本体学（Gene Ontology,GO）号等,然后对这些基因的功能进行GO分类,最后重点分析这些基因在免疫、炎症反应中的作用。结果含有GRE-1保守序列（5′-AGAACAnnnTGTTCT-3′）的基因共有225个,其中有18个位于基因启动子区域,10个位于基因外显子区域,197个位于内含子区域;含有GRE-2保守序列的基因有94个,其中有13个位于基因启动子区域,5个位于基因外显子区域,76个位于内含子区域。结论含有GRE的基因中F2R、DAXX、PAG1、ULBP3、OR8D4、RIMS1、NPY2R与激素代谢、免疫以及应激响应相关。 |
| 关 键 词： | 糖皮质激素 糖皮质激素受体 糖皮质激素反应元件 GRE的保守序列 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2008-01-31 |
| 修稿时间： | 2008-03-13 |
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