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| 宫颈癌相关基因的筛选及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 陈数珍,马文丽,郑文岭. 宫颈癌相关基因的筛选及生物信息学分析[J]. 南方医科大学学报, 2008, 28(4): 585-588 |
| 作者姓名： | 陈数珍 马文丽 郑文岭 |
| 作者单位： | 南方医科大学基因工程研究所,广东,广州,510515;南方医科大学基因工程研究所,广东,广州,510515;华南基因组研究中心,广东广州,510800 |
| 基金项目： | 广东省生物芯片实验室建设项目 |
| 摘 要： | 目的 从分子水平揭示官颈癌的发病机制,为临床诊疗提供新工具.方法 在公共基因芯片数据库GEO中找到宫颈癌的相关基因芯片数据,使用BRB-ArrayTools软件包对其进行统计学分析,找到官颈癌相关基因;利用Panther在线分析软件对这些基因进行生物学分析.结果 在宫颈癌组织共找到37条差异表达基因,上调23条,下调14条.这些基因的功能大致分为细胞骨架结构、转运载体、细胞信号转导、转录调控、细胞粘附、细胞凋亡等.结论 利用生物信息学的方法 能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,官颈癌的发生是由于多种基因表达改变所致,为确定宫颈癌的早期诊断标志与新治疗靶位开辟了新的思路. |
| 关 键 词： | 宫颈肿瘤 差异表达 基因芯片 GEO 生物信息学 |
| 文章编号： | 1673-4254(2008)04-0585-04 |
| 修稿时间： | 2007-12-18 |
Screening for cervical cancer-related genes and their bioinformatics analysis |
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| CHEN Shu-zhen,MA Wen-li,ZHENG Wen-ling. Screening for cervical cancer-related genes and their bioinformatics analysis[J]. Journal of Southern Medical University, 2008, 28(4): 585-588 | |
| Authors: | CHEN Shu-zhen MA Wen-li ZHENG Wen-ling |
| Affiliation: | CHEN Shu-zhen1,MA Wen-li1,ZHENG Wen-ling1,2 1Institute of Genetic Engineering,Southern Medical University,Guangzhou 510515,China,2Southern Genomics Research Center,Guangzhou 510800 |
| Abstract: | Objective To better understand the molecular pathogenesis of cervical cancer,and provide novel means for clinical diagnosis and treatment of this malignancy. Methods The gene chip data of cervical cancer were obtained from GEO database and statistically analyzed using BRB-ArrayTools to identify the genes related to cervical cancer with bioinformatics analysis using Panther software. Results Thirty-seven differentially expressed genes were identified in cervical,cancer samples,including 23 up-regulated and 1... |
| Keywords: | uterine cervical neoplasms differential expression gene chip GEO bioinformatics |
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