我国汉族人群α1基因数目可变串联重复序列分布特征的研究 |
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作者姓名: | 古宏标 黄玮俊 杜勇 李彩霞 李幼姬 薛超 陈素琴 胡彬 王一鸣 |
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作者单位: | 1.中山大学1中山医学院医学遗传教研室,2附属第一医院肾脏内科,广东,广州,510089;2.广东药学院,广东,广州,510240 |
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基金项目: | 国家自然科学基金资助项目 (No.10 2 0 6 ,No .30 170 5 2 3),美国中华医学基金资助项目 (No .98- 6 77),广东省自然科学基金资助项目 (No.0 1314 0 ) |
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摘 要: | 目的:研究我国汉族人群免疫球蛋白α1基因中3个数目可变串联重复序列(VNTR)多态性分布特征,及其与已报道的高加索人群相比较的特点。方法:从现存数据库中寻找α1基因内的3个VNTR位点,即α1基因3’端的hs1,2增强子内的VNTR1、其上游6Kb的VNTR2和位于α1基因第5外显子的E5VNTR。提取201例广东汉族人基因组DNA,PCR分别扩增含上述3个VNTR位点片段,2%-3%凝胶电泳分带鉴定基因型,并以测序证实。结果:与高加索人群比较我国汉族人群α1基因VNTR1多态性分布特征表现为:C(3次重复)等位基因频率明显升高(10.0%vs1.0%),A(1次重复)等位基因频率偏低(30.3%vs36.1%-39.4%),差异显著(χ2=72.85,P<0.01)。基因型BB占37.8%,AB占32.3%,AA占12%,BC占11.4%,AC占4.5%,CC占2.0%,BC、AC基因型分布频率显著高于高加索人群,而AB型分布频率显著低于高加索人群(χ2=73.77,P<0.01)。另外两个数据库中报道的VNTR位点(VNTR2及E5VNTR)在我们所测人群中呈均一分布,PCR产物长度分别为136bp(VNTR2)和535bp(E5VNTR)。结论:我国汉族人群α1基因VNTR多态性分布与基因组数据库中基于高加索人群的资料不尽相同,其中Iα1hs1,2VNTR1多态性不同于高加索人群,突出表现为C等位基因频率及BC、AC基因型频率显著高于高加索人群。而VNTR2和E5VNTR在被检人群中未见多态性。本研究弥补了现存数据库中缺乏我国汉族人群相应数据的不足,同时为以α1基因为候选基因找寻疾病基因的研究提供了可靠的数据。
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关 键 词: | 免疫球蛋白A 可变数量串联重复 多态现象(遗传学) 中国人 |
文章编号: | 1000-4718(2005)04-0752-05 |
收稿时间: | 2004-08-12 |
修稿时间: | 2004-11-23 |
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