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基于多数据库综合分析胰腺癌中TRIM29基因表达及甲基化水平的预后价值
作者姓名:姚宇轩  邓正栋  梅洪亮  李翔宇  王剑明
作者单位:1武汉科技大学附属天佑医院肝胆胰外科,武汉 4300642华中科技大学同济医学院附属同济医院小儿外科,武汉 4300303湖北省先天性巨结肠及同源病临床医学研究中心,武汉 4300304中国人民解放军中部战区总医院普通外科,武汉 4300705华中科技大学同济医学院附属同济医院胆胰外科,武汉 430030
基金项目:国家自然科学基金资助项目(No.82072730)
摘    要:摘要:目的 探究三结构域蛋白29(TRIM29)作为胰腺癌患者预后标志物的价值。方法 通过生物信息学方法,利 用 TCGA、GEO、ICGC数据库探究 TRIM29mRNA 表达及甲基化水平在胰腺癌患者预后中的作用。结果 TRIM29在 胰腺癌组织中显著上调(P<0.05)。TRIM29高表达的胰腺癌患者总生存期(OS)显著低于 TRIM29低表达的胰腺癌患 者(P<0.05)。Meta分析验证了 TRIM29上调是胰腺癌患者 OS的不利预后因素。TRIM29表达水平与胰腺癌 T 分期 和病理分期密切相关(均P<0.05)。TRIM29表达水平是胰腺癌患者预后的独立危险因素(HR=1.19,95%CI=1.03 ~1.36,P<0.05)。列线图分析同样验证了 TRIM29的预测能力。GO 富集分析结果显示 TRIM29可能具有调节细胞 外基质结构成分,参与细胞间连接等分子功能;KEGG富集分析结果显示 TRIM29可能与粘着斑和PI3K-Akt等信号通路 相关。TRIM29甲基化水平和表达量呈负相关(r=-0.71,P<0.01),且 TRIM29低甲基化的胰腺癌患者 OS和无进展生 存期(PFS)显著低于 TRIM29高甲基化的胰腺癌患者(均P<0.05)。结论 TRIM29在胰腺癌组织中呈现高表达和低甲基 化水平,且与胰腺癌患者预后不良密切相关,甲基化调控可能在 TRIM29促进胰腺癌的发生发展中具有重要作用。

关 键 词:胰腺癌   TRIM29   甲基化   生物信息学   预后  
收稿时间:2022-07-06
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