| 版纳微型猪近交系GHR基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 王淑燕,霍金龙,潘伟荣,施晨,曾养志. 版纳微型猪近交系GHR基因克隆及生物信息学分析[J]. 实验动物与比较医学, 2014, 22(1): 48-56 |
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| 作者姓名： | 王淑燕 霍金龙 潘伟荣 施晨 曾养志 |
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| 作者单位： | 云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;云南农业大学 动物科学技术学院, 昆明 650201;云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;云南农业大学 动物科学技术学院, 昆明 650201;云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;云南农业大学 动物科学技术学院, 昆明 650201;云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;云南农业大学 云南省版纳微型猪近交系重点实验室, 昆明 650201;云南农业大学 动物科学技术学院, 昆明 650201 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（No. 31160439）。 |
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| 摘 要： | 目的 获得版纳微型猪近交系（BMI）生长激素受体基因（GHR）序列，通过生物信息学分析预测GHR功能并进行GHR mRNA多组织表达谱分析。方法 以版纳微型猪近交系的肝脏组织为材料提取RNA，RT-PCR方法扩增GHR基因编码区序列，将序列连接至pMD18-T载体进行克隆、测序和生物信息学分析；半定量PCR检测GHR mRNA在BMI不同组织中表达量的差异。结果 克隆出了BMI GHR 编码区序列，提交GenBank获得登录号KC999114。该基因CDS长1917 bp，编码638个氨基酸。生物信息学分析表明，与长白猪的GHR序列相比BMI存在4处氨基酸替换，分别为p. E381D、p. A409S、p. L556V和p. A580G，均发生在胞内域。GHR基因多组织表达谱分析显示：GHR mRNA几乎在各组织中均有表达，在肌肉中表达量最高，在小肠、心、肝、神经纤维、脾、卵巢中表达量较高，在肺、胃、大脑、胰和肾中的表达量较低。结论 成功克隆了版纳微型猪近交系GHR全长编码区序列，进行了生物信息学功能分析和组织表达谱分析，为进一步阐明版纳微型猪近交系生长矮小机理奠定了基础。
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| 关 键 词： | 版纳微型猪近交系 生长激素受体 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2013-09-25 |
Cloning and bioinformatics analysis of GHR gene in Banna minipig inbred line |
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| WANG Shu-yan,HUO Jin-long,PAN Wei-rong,SHI Chen and ZENG Yang-zhi. Cloning and bioinformatics analysis of GHR gene in Banna minipig inbred line[J]. Laboratory Animal and Comparative Medicine, 2014, 22(1): 48-56 |
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| Authors: | WANG Shu-yan HUO Jin-long PAN Wei-rong SHI Chen ZENG Yang-zhi |
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| Affiliation: | Key Laboratory of Banna Mini-pig Inbred Line of Yunnan Province, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Faculty of Animal Science and Technology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Key Laboratory of Banna Mini-pig Inbred Line of Yunnan Province, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Faculty of Animal Science and Technology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Key Laboratory of Banna Mini-pig Inbred Line of Yunnan Province, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Faculty of Animal Science and Technology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Key Laboratory of Banna Mini-pig Inbred Line of Yunnan Province, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Key Laboratory of Banna Mini-pig Inbred Line of Yunnan Province, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China;Faculty of Animal Science and Technology, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Banna minipig inbred line (BMI) Growth hormone receptor (GHR) Bioinformatics analysis |
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