| 酒精性肝炎自噬关键基因的筛选及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 袁超, 练庆海, 尼贝贝, 等. 酒精性肝炎自噬关键基因的筛选及生物信息学分析[J]. 器官移植, 2024, 15(1): 90-101. doi: 10.3969/j.issn.1674-7445.2023163 |
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| 作者姓名： | 袁超 练庆海 尼贝贝 许燕 张彤 张剑 |
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| 作者单位： | 1.510630 广州,中山大学附属第三医院肝脏外科暨肝移植中心;2.疫苗研究所;3.生物治疗中心 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金面上项目（2019A1515011850、2022A1515012224）; |
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| 摘 要： | 
目的 筛选酒精性肝炎（AH）的自噬关键基因,探讨AH潜在的生物标志物和治疗靶点。 方法 采用基因表达综合数据库（GEO）中的2个AH基因芯片和从MSigDB、GeneCards数据库中获得的自噬相关数据集,通过加权基因共表达网络分析（WGCNA）获取关键基因。对筛选的关键基因进行基因本体（GO）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）功能富集分析,蛋白质相互作用（PPI）分析,免疫浸润分析,构建信使RNA（mRNA）-微小RNA（miRNA）网络,进行酒精性肝病不同分期的自噬相关关键基因的表达差异分析,并进一步通过实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-qPCR）在AH患者和小鼠肝脏组织中验证。
结果 本研究筛选得到了11个与AH自噬相关的基因（EEF1A2、CFTR、SOX4、TREM2、CTHRC1、HSPB8、TUBB3、PRKAA2、RNASE1、MTCL1、HGF）,均为上调基因。在AH患者和小鼠肝脏组织中,SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2在AH组中的相对表达量均高于对照组。 结论 SOX4、TREM2、HSPB8、PRKAA2可能是AH潜在的生物标志物和治疗靶点。
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| 关 键 词： | 酒精性肝炎 自噬 关键基因 生物信息学 加权基因共表达网络分析（WGCNA） 基因本体（GO） 京都基因和基因组百科全书（KEGG） 蛋白质相互作用（PPI） |
| 收稿时间： | 2023-08-24 |
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