| 高危前列腺癌患者基因表达谱的变化及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 郭亚收1,徐晓峰1,李 楠1,孙 娜2,段丽芳2. 高危前列腺癌患者基因表达谱的变化及生物信息学分析[J]. 现代肿瘤医学, 2019, 0(8): 1281-1284. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2019.08.001 |
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| 作者姓名： | 郭亚收1 徐晓峰1 李 楠1 孙 娜2 段丽芳2 |
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| 作者单位： | 1.咸阳市中心医院泌尿外科，陕西 咸阳 712000;2.陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室，陕西 咸阳 712046 |
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| 基金项目： | National Natural Science Foundation of China(No.81603420);国家自然科学基金青年项目(编号:81603420);咸阳市科学技术研究攻关项目(编号:2017k02-85) |
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| 摘 要： | 目的:分析高危前列腺癌(high-risk prostate cancer)患者前列腺癌组织基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白，为高危前列腺癌的诊断及治疗提供新的理论依据。方法:从基因芯片公共数据库(Gene Expression Omnibus，GEO)中下载来自于丹麦一个人群队列（正常前列腺14例，前列腺癌36例）的前列腺组织基因芯片数据，利用基因云，基因大数据分析(Gene-Cloud of Biotechnology Informs,GCBI)实验平台、GenClip2.0、Sytoscape 3.5.1等软件，筛选差异表达基因，探讨差异基因的蛋白交互作用网络和生物学通路，从转录组角度阐述高危前列腺癌发展的分子机制。结果:与正常前列腺组相比，高危前列腺癌组共有4 828个（8.83%）差异表达基因；主要涉及细胞黏附、细胞运动、细胞发育等功能。SOCS3、VEGFA、TOP2A和FGFR2基因为蛋白网络核心节点，均与高危前列腺癌的发生具有密切关系。结论:SOCS3、VEGFA、TOP2A和FGFR2基因为蛋白网络核心节点，在高危前列腺癌组中差异表达，其功能主要涉及P450细胞色素通路、β信号通路、血小板通路、细胞连接组织通路、ECM受体通路等9条通路。
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| 关 键 词： | 前列腺癌 基因表达 计算生物学 |
Changes in gene expression profiles and bioinformatics in prostate tissue of high-risk prostate cancer patients |
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| Guo Yashou1,Xu Xiaofeng1,Li Nan1,Sun Na2,Duan Lifang2. Changes in gene expression profiles and bioinformatics in prostate tissue of high-risk prostate cancer patients[J]. Journal of Modern Oncology, 2019, 0(8): 1281-1284. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2019.08.001 |
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| Authors: | Guo Yashou1 Xu Xiaofeng1 Li Nan1 Sun Na2 Duan Lifang2 |
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| Affiliation: | 1.Department of Urology,Xianyang Central Hospital,Shaanxi Xianyang 712000,China；2.Department of Epidemiology and Health Statistics,School of Public Health,Shaanxi University of Chinese Medicine,Shaanxi Xianyang 712046,China. |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | prostate cancer gene expression computational biology |
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