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利用条件错误发现率方法识别抑郁症和失眠症的多效性位点
作者姓名:宋文超  楚利君  马静
作者单位:天津市安定医院,天津 300222
基金项目:天津市卫生健康科技项目(项目名称:深部经颅磁刺激对双相抑郁患者认知功能的影响及其机制,项目编号:TJWJ2021QN065);天津市医学重点学科(专科)建设项目(项目编号:TJYXZDXK-033A)
摘    要:
背景 抑郁症和失眠症常共病存在,两者存在一些共同的发病机制,并可能受相同的多效性基因调控。既往全基因组关联研究(GWAS)一般采用单性状研究,在解释基因多效性方面存在一定的狭窄性。目的 识别与失眠症和抑郁症相关的遗传变异位点,检验抑郁症和失眠症是否存在共同的遗传因素。方法 抑郁症GWAS数据来自精神疾病遗传学联盟(PGC),共包含246 363例抑郁症患者和561 190例正常对照。失眠症GWAS数据来自睡眠障碍知识门户,共包含1 331 010例受试者。采用条件错误发现率(cFDR)和联合的条件错误发现率(ccFDR)方法筛选与抑郁症和失眠症相关的遗传位点,采用通路富集分析检验这些位点的生物学功能。
结果 抑郁症和失眠症存在显著的多效性富集现象。利用cFDR方法,以cFDR<0.01作为显著性阈值,鉴定出21个易感位点与抑郁症相关(其中17个是新识别的),38个易感位点与失眠症相关(其中28个是新识别的)。以ccFDR<0.05为显著性阈值,识别出16个多效性位点与抑郁症和失眠症均相关,其中15个是本研究新识别的。通路富集分析结果显示,与抑郁症和失眠症均关联的易感位点富集于突触传递相关通路,如突触后密度(GO:0014069,P=4.91E-04,FDR=4.84E-03)、不对称突触(GO:0032279,P=5.09E-0,FDR=4.84E-03)、突触后膜神经递质受体水平的调节(GO:0099072,P=5.11E-04,FDR=1.69E-02)。结论 失眠症与抑郁症之间存在多效性富集现象,其共病机制与突触传递有关。


关 键 词:抑郁症  失眠症  基因多效性  条件错误发现率  全基因组关联研究
收稿时间:2023-11-13
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