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| 新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达验证及生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 邱洁,郭锡熔,李晓南,王玢,倪毓辉,张敏,吴伟玲,陈荣华.新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达验证及生物信息学分析[J].实用儿科临床杂志,2008,23(7):495-498. |
| 作者姓名： | 邱洁 郭锡熔 李晓南 王玢 倪毓辉 张敏 吴伟玲 陈荣华 |
| 作者单位： | 1. 南京医科大学附属南京妇幼保健院,儿科,南京,210004 2. 南京医科大学附属南京妇幼保健院,儿科,南京,210004;南京医科大学,儿科医学研究所,南京,210029 3. 南京医科大学,儿科医学研究所,南京,210029 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 江苏省高校自然科学基金 |
| 摘 要： | 目的 验证新基因NYGGF4在肥胖患儿脂肪组织中的表达,初步探讨NYGGF4的生物信息学特征.方法 采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术验证肥胖与健康儿童脂肪组织中NYGGF4基因的表达差异,应用DNA Star、Blast、ProtParam、SOPMA、TargetP、TMHMM、ProtScale、SOSUI、InterproScan和SMART等软件或数据库分析NYGGF4的核苷酸基本特征、蛋白质理化性质、二级结构、信号肽、跨膜结构域、疏水性/亲水性、可溶性、结构域及亚细胞定位等.采用SPSS 11.0软件进行统计学分析.结果 NYGGF4基因是一个未知的新基因,差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中,生物信息学分析该基因cDNA全长1 527 bp,开放阅读框(ORF)长753 bp,编码250个氨基酸,预测相对分子质量28 271,定位在胞质,蛋白序列分析显示无跨膜螺旋结构,为一非分泌、可溶的亲水性蛋白,蛋白结构域分析提示NYGGF4的N端有一较短的亲脂性靶向序列、C端有一PTB结构域.结论 NYGGF4基因是一差异高表达于肥胖患儿脂肪组织中的新基因,可能是胞质内一个信号转导分子,在肥胖的发生发展过程中发挥重要功能,有进一步研究的价值. |
| 关 键 词： | 肥胖症 NYGGF4基因表达 计算生物学 新基因 肥胖 患儿 脂肪组织 表达 验证 生物信息学分析 Obese Children Adipose Tissue Novel Gene Analysis Bioinformatics 价值 研究 重要功能 发展过程 发生 信号转导分子 序列分析 靶向 |
| 文章编号： | 1003-515X(2008)07-0495-03 |
| 修稿时间： | 2008年1月29日 |
Expression and Bioinformatics Analysis of A Novel Gene NYGGF4 in Adipose Tissue of Obese Children |
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| QIU Jie,GUO Xi-rong,LI Xiao-nan,WANG Bin,NI Yu-hui,ZHANG Min,WU Wei-ling,CHEN Rong-hua.Expression and Bioinformatics Analysis of A Novel Gene NYGGF4 in Adipose Tissue of Obese Children[J].Journal of Applied Clinical Pediatrics,2008,23(7):495-498. | |
| Authors: | QIU Jie GUO Xi-rong LI Xiao-nan WANG Bin NI Yu-hui ZHANG Min WU Wei-ling CHEN Rong-hua |
| Abstract: | |
| Keywords: | |
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