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蛋白质-RNA相互作用预测研究进展
引用本文:张凯宇,刘涛,李伍举.蛋白质-RNA相互作用预测研究进展[J].军事医学,2016(5):437-440.
作者姓名:张凯宇  刘涛  李伍举
作者单位:军事医学科学院基础医学研究所,北京,100850
基金项目:国家自然科学基金资助项目(31471244
摘    要:蛋白质-RNA相互作用(PRI)与基因表达调控等多种生物过程密切相关.目前一般从实验和计算机预测两方面研究PRI.虽然X射线晶体衍射和核磁共振等实验方法可获得蛋白质-RNA复合物结构,但这些方法具有耗时长与花费高等缺点,并且有些蛋白质-RNA复合物结晶很难获得.特别是,随着高通量测序技术的应用,有大量的PRI需要分析,实验方法已不能满足日益增长的分析需求.为此,现已发展了4类PRI预测方法,分别为结合RNA的蛋白质残基预测、结合蛋白质的RNA小片段预测、基于序列水平的PRI预测和基于结合位点水平的PRI预测.为使有关研究人员系统了解这些预测方法,该文对上述预测方法进行了评述,并探讨其进一步发展方向.

关 键 词:生物信息学  蛋白质类  RNA  相互作用  预测模型

Research progress in protein-RNA interaction prediction
Abstract:
Keywords:bioinformatics  proteins  RNA  interaction  prediction model
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