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基于高通量测序数据的微生物检测算法研究进展
引用本文:李江域,王小磊,毛逸清,赵东升.基于高通量测序数据的微生物检测算法研究进展[J].军事医学科学院院刊,2015(1).
作者姓名:李江域  王小磊  毛逸清  赵东升
作者单位:军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所,北京,100850
基金项目:全军医学科技青年培育资助项目
摘    要:新一代高通量测序技术的发展,推动了多个相关研究领域的发展。国际上许多研究机构正在研究利用高通量测序数据进行微生物检测的算法,目前已有一些基于高通量测序数据的微生物检测算法流程设计成功并公开发布。该文通过调研利用高通量测序数据进行微生物检测的相关文献,研究已发布的基于高通量测序数据的微生物检测算法的功能和实现流程,分析几个有代表性算法的优点和不足。最后,对这些检测算法的设计思路进行总结和分类,提出基于高通量测序数据的微生物检测算法的改进设想。

关 键 词:高通量测序  微生物检测  生物信息学  算法

Progress in algorithms of microorganism detection based on high throughput sequencing data
LI Jiang-yu,WANG Xiao-lei,MAO Yi-qing,ZHAO Dong-sheng.Progress in algorithms of microorganism detection based on high throughput sequencing data[J].Bulletin of the Academy of Military Medical Sciences,2015(1).
Authors:LI Jiang-yu  WANG Xiao-lei  MAO Yi-qing  ZHAO Dong-sheng
Abstract:
Keywords:high throughput sequencing  microorganism detection  bioinformatics  algorithms
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