| 羌活药材ITS/ITS2条形码鉴定及其稳定性与准确性研究 |
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| 引用本文： | 辛天怡,姚辉,罗焜,向丽,马晓冲,韩建萍,林余霖,宋经元,陈士林.羌活药材ITS/ITS2条形码鉴定及其稳定性与准确性研究[J].药学学报,2012(8):1098-1105. |
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| 作者姓名： | 辛天怡 姚辉 罗焜 向丽 马晓冲 韩建萍 林余霖 宋经元 陈士林 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(81130069);国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2012AA021602);教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT1150) |
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| 摘 要： | 为验证DNA条形码鉴定的稳定性与准确性,本文选用羌活药材作为研究对象,对31份样本提取基因组DNA,通过聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增内部转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列并进行双向测序,所得序列经CodonCode Aligner拼接后,采用MEGA5.0软件与其混伪品进行序列比对,计算种内和种间距离,构建邻接树(neighbor-joining tree,NJ Tree)。ITS2序列采用基于隐马尔可夫模型(hidden Markov model,HMMer)的注释方法获得。结果表明,羌活药材ITS序列长度为603～604 bp,ITS2序列长度均为228 bp,羌活药材ITS/ITS2序列单倍型与其基原植物叶片序列一致。两种基原植物ITS/ITS2序列种内平均kimura 2-parameter(K2P)遗传距离均远远小于其与混伪品的种间平均K2P遗传距离;NJ树结果显示羌活、宽叶羌活与其混伪品均可明显区分,表现出良好单系性。因此ITS/ITS2序列作为DNA条形码能稳定、准确鉴别羌活药材,为保障临床安全用药提供了新的技术手段。
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| 关 键 词： | 羌活 ITS/ITS2 物种鉴定 稳定性 准确性 |
Stability and accuracy of the identification of Notopterygii Rhizoma et Radix using the ITS/ITS2 barcodes |
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| XIN Tian-yi,YAO Hui,LUO Kun,XIANG Li,MA Xiao-chong,HAN Jian-ping, LIN Yu-lin,SONG Jing-yuan,CHEN Shi-lin.Stability and accuracy of the identification of Notopterygii Rhizoma et Radix using the ITS/ITS2 barcodes[J].Acta Pharmaceutica Sinica,2012(8):1098-1105. |
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| Authors: | XIN Tian-yi YAO Hui LUO Kun XIANG Li MA Xiao-chong HAN Jian-ping LIN Yu-lin SONG Jing-yuan CHEN Shi-lin |
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| Institution: | (National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials,Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College,Beijing 100193,China) |
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