小细胞肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测 |
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引用本文: | 杨梦霞,郭宵飞,朱世杰,芦殿荣,王宁军.小细胞肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测[J].河北医药,2023(2):165-169. |
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作者姓名: | 杨梦霞 郭宵飞 朱世杰 芦殿荣 王宁军 |
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作者单位: | 1. 中国中医科学院望京医院肿瘤科;2. 北京中医药大学研究生院 |
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基金项目: | 国家自然基金面上项目(编号:81973640); |
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摘 要: | 目的 对小细胞肺癌发生发展的关键基因和分子机制进行生物信息学分析,为诊疗提供潜在靶点和生物标志物。方法 从GEO数据库筛选小细胞肺癌基因表达数据集,并运用GEO2R分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库对DEG进行富集分析,并构建蛋白互作网络图,进一步筛选出小细胞肺癌关键基因并进行预后分析。结果 筛选出614个DEG,其中上调基因328个、下调基因286个。富集结果显示,DEG的功能主要与微管运动、DNA修复、驱动蛋白复合物及微管结合等有关。根据蛋白互作网络中的节点连接度(Degree≥40),筛选出CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因。预后生存分析发现,关键基因高表达水平与不良预后有关(P均<0.01)。结论 CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因可能是小细胞肺癌诊疗的潜在靶点和预后标志物。
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关 键 词: | 小细胞肺癌 生物信息学 差异表达基因 关键基因 预后 |
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