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费氏链霉菌脱氢酶NeoE的生物信息学分析及其对产新霉素的影响
引用本文:王芳,周健,王珊,李闯,王洲,刘艳,薛正莲.费氏链霉菌脱氢酶NeoE的生物信息学分析及其对产新霉素的影响[J].中国抗生素杂志,2022,47(12):1260-1266.
作者姓名:王芳  周健  王珊  李闯  王洲  刘艳  薛正莲
摘    要:摘要:目的 NeoE是费氏链霉菌合成新霉素途径中一种重要的NAD(P)+依赖性脱氢酶,本研究的目的是预测其生物学性质 及其对新霉素合成能力的影响。方法 由NCBI网站蛋白质数据库获得NeoE氨基酸序列,利用生物信息学网站及软件分析预测 其特征。随后构建neoE过表达质粒,以接合转移方式得到高产重组菌株SF-neoE。最后经摇瓶发酵以及相关基因的转录分析探 究NeoE对新霉素生物合成的影响。结果 NeoE由340个氨基酸组成,理论相对分子质量约为35228.33 Da,理论pI值5.14,不存 在信号肽和跨膜区,是一个疏水性的稳定胞内蛋白。对含空载质粒菌株和重组菌株摇瓶发酵与RT-qPCR分析,结果表明第48小 时neoE的相对表达水平较对照菌株提高了2.1倍,且NeoE的过量表达使得新霉素效价提高42%。结论 该结果为提高新霉素效价 提供思路,并为后续定向改造NeoE探究其对费氏链霉菌生长代谢的影响奠定理论基础。

关 键 词:费氏链霉菌  新霉素  NeoE  生物信息学分析  过表达  

Bioinformatics analysis of Streptomyces fradiae dehydrogenase NeoE and its effect on neomycin production
Wang Fang,Zhou Jian,Wang Shan,Li Chuang,Wang Zhou,Liu Yan,Xue Zheng-lian.Bioinformatics analysis of Streptomyces fradiae dehydrogenase NeoE and its effect on neomycin production[J].Chinese Journal of Antibiotics,2022,47(12):1260-1266.
Authors:Wang Fang  Zhou Jian  Wang Shan  Li Chuang  Wang Zhou  Liu Yan  Xue Zheng-lian
Abstract:
Keywords:Streptomyces fradiae  Neomycin  NeoE  Bioinformatics analysis  Overexpression  
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