顺铂诱导急性肾损伤关键基因的筛选和调控网络的构建

目的　通过生物信息学鉴定顺铂诱导的急性肾损伤中的关键基因和通路，为急性肾损伤的治疗提供潜在靶点。方法　数据提取时间：建库至2021年3月1日。我们先从基因表达综合数据库（GEO）下载了GSE106993和GSE153625数据集，并使用R语言筛选出差异基因，再采用基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组大百科全书数据库（KEGG）分析鉴定共同差异基因的主要功能，接着使用STRING数据库对共同的差异基因构建互作网络，并用Cytoscape筛选出关键基因。然后运用TransmiR v2.0数据库和miRWalk 2.0数据库构建转录因子（TF）/微小RNA（miRNA）/信使RNA（mRNA）调控网络。最后通过ETMC数据库筛选出靶向关键基因的中草药。结果　我们发现在顺铂诱导的急性肾损伤模型中上调基因有817个，下调基因有769个。肿瘤坏死因子信号通路、P53信号通路、代谢信号通路均是顺铂诱导的急性肾损伤的重要通路。通过蛋白互作网路，我们鉴定出8个关键基因（TrP53、EGF、Stat3、Jun、Casp3、Cdh1、Ptgs2、CAT）。并且构建了TF/miRNA/mRNA调控网络，TF 2个，miRNA 4个，mRNA 214个。ETMC数据库分析结果显示桑叶和半夏可用于顺铂诱导的急性肾损伤的治疗。结论　本研究通过生物信息学分析筛选出顺铂诱导的急性肾损伤中的8个关键基因和3个重要信号通路，为顺铂诱导急性肾损伤的治疗提供靶点。桑叶和半夏两味中药有望成为治疗急性肾损伤的中草药。

Key gene screening and regulation network construction in cisplatin-induced acute kidney injury