| 人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测 |
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| 引用本文： | 陈少英,郑坚,牛青霞.人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位的预测[J].海南医学,2014,0(8):1097-1099. |
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| 作者姓名： | 陈少英 郑坚 牛青霞 |
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| 作者单位： | 陈少英 (汕头大学医学院炎症与免疫性疾病研究所,广东 汕头,515041)； 郑坚 (汕头大学医学院炎症与免疫性疾病研究所,广东 汕头,515041)； 牛青霞 (汕头大学医学院炎症与免疫性疾病研究所,广东 汕头,515041)； |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(项目编号：81072941) |
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| 摘 要： | 目的预测并分析人白细胞介素-36α蛋白的二级结构及其潜在的B细胞抗原表位。方法以人IL-36α蛋白的氨基酸序列为基础，采用生物信息软件和互联网服务器预测人IL-36α蛋白的二级结构及其亲水性、可及性和柔韧性，根据预测结果综合分析IL-36α蛋白可能的B细胞抗原表位。结果IL-36α蛋白潜在的B细胞抗原表位位于N端8～12、33～38、111～116和143～149氨基酸区段。结论预测了IL-36α蛋白的二级结构和B细胞抗原表位，为进一步研究IL-36α的生物学活性部位及利用合成肽制备抗IL-36α的多克隆抗体提供了理论依据。
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| 关 键 词： | 白细胞介素-36α 生物信息学 二级结构 表位 |
Prediction of the secondary structure and B-cell epitopes of human interleukin-36 α. |
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| CHEN Shao-ying,ZHENG Jian,NIU Qing-xia.Prediction of the secondary structure and B-cell epitopes of human interleukin-36 α.[J].Hainan Medical Journal,2014,0(8):1097-1099. |
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| Authors: | CHEN Shao-ying ZHENG Jian NIU Qing-xia |
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| Institution: | . (Institute of Inflammation and Immune Diseases, Shantou University Medical College, Shantou 515041, Guangdong, CHINA) |
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| Abstract: | Objective To predict the secondary structure and B-cell epitopes of human interleukin （ IL）-36α. Methods Based on the IL-36α amino acid sequence, the secondary structure, hydrophilicity, flexibility and accessi- bility indexes of human IL-36α were analyzed with bioinformatics tool and network servers. Combined the results ac- cording to these methods, the B-ceU epitopes of IL-36α were predicted. Results The predicted B-cell epitopes of hu- man interleukin-36α were probably located in or adjacent to 8-12, 33-38, 111-116 and 143-149 aa in the N-terminal. Conclusion The secondary structure and B-cell epitopes predicted provide the basis for estimating the activity sites and developing antibodies against human IL-36α. |
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| Keywords: | Interleukin-36α Bioinformatics Secondary structure Epitope |
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